Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3304
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3304, 381 aa
1>>>pF1KB3304 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8253+/-0.000767; mu= 14.9620+/- 0.047
mean_var=81.7050+/-15.932, 0's: 0 Z-trim(109.4): 38 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.141889
statistics sampled from 10796 (10831) to 10796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 ( 381) 2472 515.4 3.2e-146
CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 ( 337) 2107 440.7 9.1e-124
CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7 ( 381) 2088 436.8 1.5e-122
CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 ( 404) 777 168.5 9.6e-42
CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7 ( 418) 775 168.1 1.3e-41
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 671) 555 123.2 7e-28
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 686) 544 120.9 3.4e-27
CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 ( 382) 504 112.6 6.1e-25
CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 733) 478 107.4 4.2e-23
CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 762) 478 107.4 4.3e-23
>>CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 (381 aa)
initn: 2472 init1: 2472 opt: 2472 Z-score: 2738.5 bits: 515.4 E(32554): 3.2e-146
Smith-Waterman score: 2472; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
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CCDS11 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
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CCDS11 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
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CCDS11 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB3 PCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
:::::::::::::::::::::
CCDS11 PCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
370 380
>>CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 (337 aa)
initn: 2232 init1: 2107 opt: 2107 Z-score: 2335.5 bits: 440.7 E(32554): 9.1e-124
Smith-Waterman score: 2107; 98.8% identity (99.7% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
:::::::::::::::::::::::::.. .
CCDS62 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGHLIISRRSIPLG
310 320 330
>>CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7 (381 aa)
initn: 2342 init1: 2082 opt: 2088 Z-score: 2313.7 bits: 436.8 E(32554): 1.5e-122
Smith-Waterman score: 2088; 81.4% identity (94.2% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
: : . ::: .::. :::::: :.:: .::: ::.:: ..::::: ::::.::.::::
CCDS34 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
: .:: ::.....::...:.:: :::::::.:::::..::::::::::.:::::::::
CCDS34 ENRQILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
:::::.:::::: :::::.::::::::::::::: :. ::::::::::.:::::::.:::
CCDS34 DYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
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CCDS34 EVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.:.:: ::.:
CCDS34 RKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
.:::::: :::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVLQRRSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB3 PCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
:::.:::::::.::::.::.:
CCDS34 PCSEILKRNIQRYNSFISLTV
370 380
>>CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 (404 aa)
initn: 779 init1: 350 opt: 777 Z-score: 863.0 bits: 168.5 E(32554): 9.6e-42
Smith-Waterman score: 790; 39.6% identity (65.2% similar) in 379 aa overlap (30-373:13-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
::. :.. .: . : ::: ::.
CCDS27 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLR--
10 20 30 40
70 80 90
pF1KB3 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPP-PNPV----VKGRR-----------------RRG
::. .. :.: :.. ::: :.: .:: ::
CCDS27 EARAPASVLPAAT---PRQSLGHPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRV
50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 AISAEVYT--EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSV
.. ::.:. ::. . : . :: . : .: . .::..::... :...::::
CCDS27 SVCAETYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFER
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 SFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWAT-SVGEG---GSFGELALIYGTPRA
: : ::.:::.:::::::..: :. :... : :::. ::::::::.:.::::
CCDS27 IVKADEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRA
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 ATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALE
::. : .. .:::.:: ..:::.. .. .::::.: :. .: .:.::. ::. ..:..
CCDS27 ATIVATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIG
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320
pF1KB3 PVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQR-RSE------NEEFVEVGRLGPSDYFG
..::..:..::: .: :.:: : ...: : :.. :.: ::..: ..:::
CCDS27 EKIYKDGERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQE-VEIARCHKGQYFG
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 EIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
:.::. :.::::.. : : .::. .: :::.:::: ::.::::..:
CCDS27 ELALVTNKPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSV
340 350 360 370 380 390
CCDS27 DLGNLGQ
400
>>CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7 (418 aa)
initn: 757 init1: 353 opt: 775 Z-score: 860.5 bits: 168.1 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 786; 43.2% identity (69.2% similar) in 315 aa overlap (76-373:87-399)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 PMAFLREYFERLEKEEAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPN----PVVKGRRRRGAIS
:..:.: .: . ::.. ::...
CCDS57 TWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVC
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB3 AEVYT----EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVS
::.:. :.:: : : . :: : .: . .::..:: .. :...::::
CCDS57 AEAYNPDEEEDDAES--RIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 FIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWA-TSVGEG---GSFGELALIYGTPRAA
:: ::.:::.::::::::.: :.::. . . ::. ::::::::.:.:::::
CCDS57 VKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 TVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEP
:. : . :::.:: ..:::.. .. .:::::: :. .. .:.::. ::: :.:..
CCDS57 TITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB3 VQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRR---SENEE--FVEVGRLGPSDYFGEIA
..::..:..::. .: :::. : . . ..: :: :: ::..: . ..::::.:
CCDS57 KVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELA
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 LLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
:. :.::::.. : : .::. .: :::.:::: .:.:::: :
CCDS57 LVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIV
360 370 380 390 400 410
CCDS57 EPTA
>>CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 (671 aa)
initn: 533 init1: 456 opt: 555 Z-score: 614.1 bits: 123.2 E(32554): 7e-28
Smith-Waterman score: 555; 33.0% identity (63.4% similar) in 339 aa overlap (31-365:4-331)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERL-EK
:....... . :: ..: .:: ::
CCDS44 MSELEEDFAKILMLKEER----IKELEKRLSEK
10 20
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 EEAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEE---DAASYVRK
:: .::.:.. . .: . : : . . : .:::: : . : . ::
CCDS44 EE--EIQELKRKLHKCQS----VLPVPSTHIGPRTTRAQGISAEPQTYRSFHDLRQAFRK
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 VIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYV
. :. .. . .:: : ....:. .. ..: : :. : . .:..:: :. ::
CCDS44 -FTKSERSKDLIKEAILDNDFMKNLELSQIQEIVDCMYPVEYGKDSCIIKEGDVGSLVYV
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 IDQGETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILM
...:...: .. ..: : :::::..:. :.::::. .:::::.:::. .. :.:
CCDS44 MEDGKVEVTKEGVKLCTMGPGKVFGELAILYNCTRTATVKTLVNVKLWAIDRQCFQTIMM
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 GSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIIL
. : :. : :::..: ..:: . .::.:: ...:.:. :. :: :: ::::
CCDS44 RTGLIKHTEYMEFLKSVPTFQSLPEEILSKLADVLEETHYENGEYIIRQGARGDTFFIIS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 EGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFE
.:.. : .. : .:. : . :: .:.::: :: . :.:.:.: . :. .:: :.
CCDS44 KGTVNVTREDSPSEDPVFLRTLGKGDWFGEKALQGEDVRTANVIAAEAVTCLVIDRDSFK
270 280 290 300 310 320
360 370 380
pF1KB3 RVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
...: .:.
CCDS44 HLIGGLDDVSNKAYEDAEAKAKYEAEAAFFANLKLSDFNIIDTLGVGGFGRVELVQLKSE
330 340 350 360 370 380
>>CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 (686 aa)
initn: 595 init1: 518 opt: 544 Z-score: 601.8 bits: 120.9 E(32554): 3.4e-27
Smith-Waterman score: 552; 32.7% identity (63.9% similar) in 321 aa overlap (55-365:26-346)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 HNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKEEAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISP
..:: : .. . .:: .. :. .. : :
CCDS72 MGTLRDLQYALQEKIEELRQRDALIDELELELDQKDELIQKLQNELDKYRSVIRP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130
pF1KB3 PPPNP------VVKG--RRRRGAISAE--VYTEEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEK
. ...: : .: ::::: .. .: . . ::. .. . .::
CCDS72 ATQQAQKQSASTLQGEPRTKRQAISAEPTAFDIQDLSHVTLPFYPKSPQSKDLIKEAILD
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 NVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWATSV
: ....:. .. ..: : :. : . .:..:: :. ::...:...: .. ..
CCDS72 NDFMKNLELSQIQEIVDCMYPVEYGKDSCIIKEGDVGSLVYVMEDGKVEVTKEGVKLCTM
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 GEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVS
: : :::::..:. :.::::. .:::::.:::. .. :.: . : :. : :::..:
CCDS72 GPGKVFGELAILYNCTRTATVKTLVNVKLWAIDRQCFQTIMMRTGLIKHTEYMEFLKSVP
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 ILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVE
..:: . .::.:: ...:.:. :. :: :: :::: .:.. : .. : .:. :
CCDS72 TFQSLPEEILSKLADVLEETHYENGEYIIRQGARGDTFFIISKGTVNVTREDSPSEDPVF
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 VGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYN
. :: .:.::: :: . :.:.:.: . :. .:: :....: .:.
CCDS72 LRTLGKGDWFGEKALQGEDVRTANVIAAEAVTCLVIDRDSFKHLIGGLDDVSNKAYEDAE
300 310 320 330 340 350
380
pF1KB3 SFVSLSV
CCDS72 AKAKYEAEAAFFANLKLSDFNIIDTLGVGGFGRVELVQLKSEESKTFAMKILKKRHIVDT
360 370 380 390 400 410
>>CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 (382 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS64 FGEKALISDDVRSANIIAEENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANLNRDDEK
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CCDS64 RHAKRSMSNWKLSKALSLEMIQLKEKVKVKNENVAFAMKCIRKKHIVDTKQQEHVYSEKR
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>>CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 (762 aa)
initn: 527 init1: 416 opt: 478 Z-score: 528.1 bits: 107.4 E(32554): 4.3e-23
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10 20 30
pF1KB3 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQL
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CCDS35 MGNGSVKPKHSKHPDGHSGNLTTDALRNKVTELERELRRKDAEIQEREYH--LKELREQL
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CCDS35 --SKQTVAIAELTEELQNKCIQLNKLQDVVHMQ-GGSPLQASPDKVPLEVHRKTSGLVSL
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pF1KB3 RRRRGA---ISAEVYT------EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDN
. :::: .::: : . :. . . :: . .. :..:: ....:: .
CCDS35 HSRRGAKAGVSAEPTTRTYDLNKPPEFSFEKARVRKDSSEKKLITDALNKNQFLKRLDPQ
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 ERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELA
. .:. . :.. .. : .:.::. :....:. .:. .:. ... .:. .:::::
CCDS35 QIKDMVECMYGRNYQQGSYIIKQGEPGNHIFVLAEGRLEVFQGEKLLSSIPMWTTFGELA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWER
..:. :.:.::: :::: :..::. .. :. .. . ..:..:: .::.:..: . ..
CCDS35 ILYNCTRTASVKAITNVKTWALDREVFQNIMRRTAQARDEQYRNFLRSVSLLKNLPE-DK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 LT-VADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDY
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CCDS35 LTKIIDCLEVEYYDKGDYIIREGEEGSTFFILAKGKVKVTQSTEGHDQPQLIKTLQKGEY
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CCDS35 FGEKALISDDVRSANIIAEENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANLNRDDEK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]