Result of FASTA (omim) for
pF1KB3292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3292, 559 aa
1>>>pF1KB3292 559 - 559 aa - 559 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6673+/-0.000433; mu= 16.5229+/- 0.027
mean_var=73.1307+/-14.590, 0's: 0 Z-trim(110.6): 111 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149977
statistics sampled from 18878 (18989) to 18878 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 9.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalac ( 559) 3856 844.2 0
XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 3856 844.2 0
XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 3856 844.2 0
NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalac ( 556) 3334 731.3 1.9e-210
XP_016858750 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 556) 3334 731.3 1.9e-210
XP_011508839 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 3225 707.7 2.5e-203
XP_016858748 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 3225 707.7 2.5e-203
XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 3225 707.7 2.5e-203
XP_016858749 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 561) 3102 681.1 2.5e-195
NP_001288556 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylga ( 561) 3102 681.1 2.5e-195
XP_016858752 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 375) 2387 526.3 6.6e-149
XP_011508840 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 390) 2278 502.7 8.5e-142
XP_016858751 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 380) 2155 476.1 8.6e-134
NP_001278795 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylga ( 533) 1554 346.2 1.6e-94
NP_004472 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylgalac ( 571) 1554 346.2 1.7e-94
XP_016874234 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_016874233 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_005268664 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
NP_009141 (OMIM: 605148) polypeptide N-acetylgalac ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_011536124 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_011536121 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_006719277 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
NP_003765 (OMIM: 603565) polypeptide N-acetylgalac ( 578) 1491 332.5 2.2e-90
NP_078918 (OMIM: 608812,610290) polypeptide N-acet ( 581) 1446 322.8 1.9e-87
XP_011509231 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
XP_016859259 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
NP_004473 (OMIM: 601756) polypeptide N-acetylgalac ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
XP_005246506 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
XP_016856454 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 598) 1424 318.0 5.2e-86
XP_016856453 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 605) 1424 318.1 5.2e-86
XP_016856452 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 636) 1424 318.1 5.4e-86
XP_016856455 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 569) 1418 316.7 1.2e-85
NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalac ( 940) 1397 312.3 4.4e-84
XP_016870622 (OMIM: 608812,610290) PREDICTED: poly ( 497) 1386 309.8 1.3e-83
XP_011517320 (OMIM: 608812,610290) PREDICTED: poly ( 507) 1386 309.8 1.3e-83
XP_016858726 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 956) 1389 310.6 1.5e-83
NP_001316024 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 517) 1361 304.4 5.8e-82
NP_001316025 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1361 304.4 5.9e-82
NP_001240756 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1361 304.4 5.9e-82
NP_078848 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylgalac ( 552) 1361 304.4 6.1e-82
XP_016860395 (OMIM: 608225) PREDICTED: polypeptide ( 563) 1361 304.4 6.2e-82
XP_006716147 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
XP_006716146 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
XP_006716145 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
NP_071370 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylgalac ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
NP_001291443 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylga ( 527) 1332 298.1 4.6e-80
NP_938080 (OMIM: 608043) polypeptide N-acetylgalac ( 603) 1323 296.2 2e-79
NP_001240755 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 557) 1297 290.6 9.1e-78
NP_001030017 (OMIM: 615138) polypeptide N-acetylga ( 601) 1289 288.8 3.2e-77
XP_016863733 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 609) 1289 288.8 3.3e-77
>>NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalactosa (559 aa)
initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856 Z-score: 4509.5 bits: 844.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
:::::::::::::::::::
NP_065 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
550
>>XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide N-a (559 aa)
initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856 Z-score: 4509.5 bits: 844.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
:::::::::::::::::::
XP_016 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
550
>>XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide N-a (559 aa)
initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856 Z-score: 4509.5 bits: 844.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
:::::::::::::::::::
XP_005 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
550
>>NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalactosa (556 aa)
initn: 3336 init1: 3097 opt: 3334 Z-score: 3899.2 bits: 731.3 E(85289): 1.9e-210
Smith-Waterman score: 3334; 84.7% identity (96.9% similar) in 556 aa overlap (1-555:1-554)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: :: .. ... .::::
NP_443 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
:::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
NP_443 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
:::::::::::::::::.:::::::.... :..:::::::::::: ::.:::.:.:::.
NP_443 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
.::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
NP_443 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
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..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: : ::..:.::::::::::::
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:::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
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:::::::.::::: ::::::..:::::::: .:::.:::::::::. .:::..::...:
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..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: : ::..:.::::::::::::
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10 20 30 40 50
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:::::::::::::::::.:::::::.... :..:::::::::::: ::.:::.:.:::.
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pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
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pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
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pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
:::::::::::::::::.:::::::.... :..:::::::::::: ::.:::.:.:::.
XP_016 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
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pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
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XP_016 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
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pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
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XP_016 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
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pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
:::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 PDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTD
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEED-SQVPSIR
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XP_016 DLCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAETHTLLHIITQSCLSVNKVADGSQHPTVE
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pF1KB3 DCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
:: : :.::::: : :::
XP_016 TCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
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pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: :: .. ... .::::
XP_016 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
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pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
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XP_016 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
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pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
:::::::::::::::::.:::::::.... :..:::::::::::: ::.:::.:.:::.
XP_016 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
.::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
XP_016 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
180 190 200 210 220 230
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
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pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
:.::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
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pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
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XP_016 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
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pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
:::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 PDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTD
420 430 440 450 460 470
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEED-SQVPSIR
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XP_016 DLCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYD----------AESCLSVNKVADGSQHPTVE
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pF1KB3 DCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
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XP_016 TCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]