Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3281
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3281, 787 aa
1>>>pF1KB3281 787 - 787 aa - 787 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3493+/-0.00114; mu= 10.7182+/- 0.068
mean_var=136.3745+/-27.051, 0's: 0 Z-trim(105.9): 51 B-trim: 47 in 1/52
Lambda= 0.109827
statistics sampled from 8649 (8688) to 8649 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11423.1 STAT5B gene_id:6777|Hs108|chr17 ( 787) 5262 846.3 0
CCDS11424.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 794) 4851 781.1 0
CCDS74067.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 764) 4080 659.0 8.4e-189
CCDS74066.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 763) 2857 465.2 1.8e-130
CCDS8931.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 847) 1456 243.2 1.3e-63
CCDS53804.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 737) 1451 242.4 2e-63
CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 770) 916 157.6 6.9e-38
CCDS59288.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 722) 908 156.4 1.6e-37
CCDS32657.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 769) 907 156.2 1.9e-37
CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 750) 828 143.7 1.1e-33
CCDS42793.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 712) 817 141.9 3.4e-33
CCDS2310.1 STAT4 gene_id:6775|Hs108|chr2 ( 748) 775 135.3 3.6e-31
CCDS55836.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 847) 606 108.6 4.6e-23
CCDS8917.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 851) 583 104.9 5.7e-22
>>CCDS11423.1 STAT5B gene_id:6777|Hs108|chr17 (787 aa)
initn: 5262 init1: 5262 opt: 5262 Z-score: 4515.1 bits: 846.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5262; 99.9% identity (100.0% similar) in 787 aa overlap (1-787:1-787)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDSVDLDNPQENIKATQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDSVDLDNPQENIKATQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 REANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 REANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNDYSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNDYSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LKRIKRSDRRGAKSVTEEKFTILFESQFSVGGNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDNNATA
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LKRIKRSDRRGAESVTEEKFTILFESQFSVGGNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDNNATA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 GDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPCESATAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPCESATAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 GSATYMDQAPSPAVCPQAHYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLEDTMDVARRVEELLGRPMDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSATYMDQAPSPAVCPQAHYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLEDTMDVARRVEELLGRPMDSQ
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 WIPHAQS
:::::::
CCDS11 WIPHAQS
>>CCDS11424.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 (794 aa)
initn: 4858 init1: 4344 opt: 4851 Z-score: 4163.1 bits: 781.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4851; 93.7% identity (97.0% similar) in 779 aa overlap (1-779:1-774)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDSVDLDNPQENIKATQL
:: :::::::::.::.:::.::::::::::::::.:::::: ::..::::::. .::::
CCDS11 MAGWIQAQQLQGDALRQMQVLYGQHFPIEVRHYLAQWIESQPWDAIDLDNPQDRAQATQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQKTYDRCPLELVRCIRHILYNEQRLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 REANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
::::: ::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 REANNCSSPAGILVDAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIQAQFAQLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNDYSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNECSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LKRIKRSDRRGAKSVTEEKFTILFESQFSVGGNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDNNATA
::::::.:::::.::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS11 LKRIKRADRRGAESVTEEKFTVLFESQFSVGSNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDHNATA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNK
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS11 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGWNYTFWQWFDGVMEVLKKHHKPHWNDGAILGFVNK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: .::: ::::::::::::::::
CCDS11 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSPERNLWNLKPFTTRDFSIRSLADRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 GDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPCESATAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGG
:::.::::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GDLSYLIYVFPDRPKDEVFSKYYTPV-----LAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGG
670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 GSATYMDQAPSPAVCPQAHYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLEDTMDVARRVEELLGRPMDSQ
.::::::::::::::::: ::::::::: ::: ::.:::..::::::.::::: :::::
CCDS11 SSATYMDQAPSPAVCPQAPYNMYPQNPDHVLDQDGEFDLDETMDVARHVEELLRRPMDSL
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 WIPHAQS
CCDS11 DSRLSPPAGLFTSARGSLS
780 790
>>CCDS74067.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 (764 aa)
initn: 4648 init1: 3573 opt: 4080 Z-score: 3503.1 bits: 659.0 E(32554): 8.4e-189
Smith-Waterman score: 4588; 90.2% identity (93.3% similar) in 779 aa overlap (1-779:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDSVDLDNPQENIKATQL
:: :::::::::.::.:::.::::::::::::::.:::::: ::..::::::. .::::
CCDS74 MAGWIQAQQLQGDALRQMQVLYGQHFPIEVRHYLAQWIESQPWDAIDLDNPQDRAQATQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS74 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQ-----C-------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 REANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ------SSPAGILVDAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RIQAQFAQLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNDYSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNECSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LKRIKRSDRRGAKSVTEEKFTILFESQFSVGGNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDNNATA
::::::.:::::.::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS74 LKRIKRADRRGAESVTEEKFTVLFESQFSVGSNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDHNATA
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNK
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS74 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGWNYTFWQWFDGVMEVLKKHHKPHWNDGAILGFVNK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: .::: ::::::::::::::::
CCDS74 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSPERNLWNLKPFTTRDFSIRSLADRL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 GDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPCESATAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGG
:::.::::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GDLSYLIYVFPDRPKDEVFSKYYTPV-----LAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGG
640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 GSATYMDQAPSPAVCPQAHYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLEDTMDVARRVEELLGRPMDSQ
.::::::::::::::::: ::::::::: ::: ::.:::..::::::.::::: :::::
CCDS74 SSATYMDQAPSPAVCPQAPYNMYPQNPDHVLDQDGEFDLDETMDVARHVEELLRRPMDSL
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 WIPHAQS
CCDS74 DSRLSPPAGLFTSARGSLS
750 760
>>CCDS74066.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 (763 aa)
initn: 4649 init1: 2857 opt: 2857 Z-score: 2455.8 bits: 465.2 E(32554): 1.8e-130
Smith-Waterman score: 4584; 89.9% identity (93.1% similar) in 779 aa overlap (1-779:1-743)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDSVDLDNPQENIKATQL
:: :::::::::.::.:::.::::::::::::::.:::::: ::..::::::. .::::
CCDS74 MAGWIQAQQLQGDALRQMQVLYGQHFPIEVRHYLAQWIESQPWDAIDLDNPQDRAQATQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS74 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQKTYDRCPLELVRCIRHILYNEQRLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 REANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
::::: ::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 REANNCSSPAGILVDAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RIQAQFAQLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNDYSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKNENTRNECSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::.:::::.::::::::.:::::::::.::::::::
CCDS74 LKRIKRADRRGAESVTEEKFTVLFESQFSVGSNELVFQVK--------------------
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 -----------GRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNN
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::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS74 SSSHLEDYSGLSVSWSQFNRENLPGWNYTFWQWFDGVMEVLKKHHKPHWNDGAILGFVNK
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: .::: ::::::::::::::::
CCDS74 QQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSPERNLWNLKPFTTRDFSIRSLADRL
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:::.::::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
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.::::::::::::::::: ::::::::: ::: ::.:::..::::::.::::: :::::
CCDS74 SSATYMDQAPSPAVCPQAPYNMYPQNPDHVLDQDGEFDLDETMDVARHVEELLRRPMDSL
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:: ::.:: .. .: :: . .:. : .: :.. :.: :..:: .:.:: .:..
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: : :..: . . ..::: .. .
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:: .: . : . : : . . . . ::::.. .. :. .. :: :.:
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:. ....: . :: :::.:::::::.: : :: :: ::.:..: : .:.. :
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: . :.. .:: :.: ...:.::. :. .. .. . .:::.:: .: . :
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: :.:. ::.::: .:.:..:::::: ..:: ..:..: ..: .:...::::.::::::.
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::::: ::.::::::.: ::::.: ..: : ..::.::.:: ::: .:::: :...::
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:::.::..: .: .. ::::::::.: : ::..:::::::::... :. :. .:.:
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:.::..:: . .::.:.:::::::::::::::::::: . .:. .. :..::...:.
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:::::.::. :: : ..: .::::.. ..: : .: ::: ::..:
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::. . : : : . . :.. .: . :: .:: . :. .: ..
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. :. .. .. . .:::.:: .: . :: :.:. ::.::: .:.:..::::
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:: ..:: ..:..: ..: .:...::::.::::::.::::: ::.::::::.: ::::.
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CCDS53 VAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQ
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::.: : ::..:::::::::... :. :. .:.: :.::..:: . .::.:.:::::::
CCDS53 FNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLL
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::::::::::::: . .:. .. :..::...:.:::::.::. :: : ..: .::
CCDS53 RFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPK
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::.. ..: : .: ::: ::..: ::. . : : : .
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. :.. .: . :: .:: . :. .: .. :....: .:
CCDS53 SSMSMQLGPDMVPQ----VYPPHSHSIPPYQG-LSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQM
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pF1KB3 HAQS
CCDS53 SLPFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFP
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. : .... .:. : ....:. ...: ....: .:: :...: ... :. : ..:
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pF1KB3 QESLRIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKT
. .:. : : . .:. .. ... .::. .:: : .:.:.: .. .
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:. .. : . :.:: .::::::.: ::::. :: :..: .::: :.::::..
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:.: :.. : :. . .. :.... :. :.:..:.:: : :.:: ..
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.... :.:::.:....:.. . :.. .. :::: : ::.. : : ...
CCDS32 EESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGNGGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQG--LKIDL
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.: ::::::: . : :: :..:: : ... : : : . : : :. :.:. .:..
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..:::. :.:. ::.::.. . .::: ...:..: .::. :....:: :.:..
CCDS32 --TTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGV----NYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNI
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....::.. ::.: :.::..:.. . .: .:: ::::::::.: . ::.:..: :
CCDS32 IDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDI
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pF1KB3 SQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLAD-----RLGD-----LNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYT
: . .. .. :.: .... :.:. .. : .. :.:..:: ::.:...::
CCDS32 SGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCR
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pF1KB3 PVPCESATAK--AVDGYVKPQIKQVVPEFVNASADAGGGSATYMDQAPSPAVCPQAHYNM
: : : .. :.: .. :.: . . :
CCDS32 PESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSNTIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSA
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CCDS32 GGQFESLTFDMELTSECATSPM
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CCDS59 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYA---ASKES-HATLV
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CCDS59 FHNLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLL
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pF1KB3 QESLRIQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKT
. .:. : : . .:. .. ... .::. .:: : .:.:.: .. .
CCDS59 K-TLKSQ---GDMQDLNGNN----QSVTRQKMQQLEQMLT----ALDQMRRSIVSELAGL
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:. .. : . :.:: .::::::.: ::::. :: :..: .::: :.::::..
CCDS59 LSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKL
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:.: :.. : :. . .. :.... :. :.:..:.:: : :.:: ..
CCDS59 EELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQ
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CCDS59 FTTKVRLLVKFPELNYQL---KIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFN-----ILGTNTKVMNM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]