Result of FASTA (omim) for
pF1KB3243
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3243, 935 aa
1>>>pF1KB3243 935 - 935 aa - 935 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7215+/-0.000484; mu= 18.6203+/- 0.030
mean_var=71.7329+/-14.202, 0's: 0 Z-trim(108.7): 63 B-trim: 173 in 1/54
Lambda= 0.151431
statistics sampled from 16704 (16762) to 16704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 9.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005947 (OMIM: 172460,601634) C-1-tetrahydrofola ( 935) 6086 1339.9 0
XP_016866196 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 868) 3247 719.7 1.6e-206
XP_016866195 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 869) 3247 719.7 1.6e-206
XP_016866193 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 912) 3247 719.7 1.7e-206
NP_001229697 (OMIM: 611427) monofunctional C1-tetr ( 913) 3247 719.7 1.7e-206
NP_056255 (OMIM: 611427) monofunctional C1-tetrahy ( 978) 3247 719.7 1.8e-206
XP_016866191 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 979) 3247 719.7 1.8e-206
NP_001229696 (OMIM: 611427) monofunctional C1-tetr ( 979) 3247 719.7 1.8e-206
XP_016866192 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 979) 3247 719.7 1.8e-206
XP_011534031 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 955) 3059 678.6 4e-194
XP_016866194 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 876) 3058 678.4 4.3e-194
XP_011534036 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 876) 3058 678.4 4.3e-194
XP_011534035 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 877) 3058 678.4 4.3e-194
XP_011534034 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 877) 3058 678.4 4.3e-194
XP_011534033 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 920) 3058 678.4 4.5e-194
XP_011534032 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 921) 3058 678.4 4.5e-194
XP_005266964 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 986) 3058 678.4 4.8e-194
XP_005266967 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 987) 3058 678.4 4.8e-194
XP_016866197 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 752) 1912 428.0 8.8e-119
XP_011534040 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 710) 1902 425.8 3.8e-118
XP_011534039 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 712) 1902 425.8 3.8e-118
XP_005266968 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctio ( 607) 1320 298.6 6.3e-80
NP_001138450 (OMIM: 614047) probable bifunctional ( 347) 522 124.1 1.2e-27
NP_006627 (OMIM: 604887) bifunctional methylenetet ( 350) 518 123.3 2.2e-27
NP_001004346 (OMIM: 614047) probable bifunctional ( 289) 509 121.3 7.2e-27
XP_016863713 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 327) 492 117.6 1e-25
XP_016863707 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 456) 492 117.6 1.4e-25
XP_016863714 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 295) 479 114.7 6.9e-25
XP_016863715 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 295) 479 114.7 6.9e-25
XP_005265747 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 295) 479 114.7 6.9e-25
XP_006711987 (OMIM: 604887) PREDICTED: bifunctiona ( 248) 428 103.5 1.3e-21
NP_001229698 (OMIM: 611427) monofunctional C1-tetr ( 275) 414 100.5 1.2e-20
XP_016863709 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 389) 385 94.2 1.3e-18
XP_016863710 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 389) 384 94.0 1.5e-18
XP_016863718 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 228) 372 91.3 6e-18
XP_016863720 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 228) 372 91.3 6e-18
XP_016863721 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 228) 372 91.3 6e-18
XP_016863708 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 408) 375 92.1 6.3e-18
XP_016863712 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 376) 374 91.8 6.8e-18
XP_016863719 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 228) 371 91.1 7e-18
XP_016863711 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 386) 374 91.8 7e-18
XP_016863724 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 220) 364 89.5 1.9e-17
XP_016863717 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 247) 362 89.1 2.9e-17
XP_016863723 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 225) 361 88.9 3.1e-17
XP_016863722 (OMIM: 614047) PREDICTED: probable bi ( 226) 208 55.5 3.6e-07
>>NP_005947 (OMIM: 172460,601634) C-1-tetrahydrofolate s (935 aa)
initn: 6086 init1: 6086 opt: 6086 Z-score: 7180.2 bits: 1339.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6086; 99.8% identity (100.0% similar) in 935 aa overlap (1-935:1-935)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAP
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EKDVDGLTSINAGKLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 MHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACVRQPSQGPTFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACVRQPSQGPTFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADQIALKLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
NP_005 SAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADRIALKLVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 PEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 KAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHGAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 DAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAGFL
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KB3 YPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
910 920 930
>>XP_016866196 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctional (868 aa)
initn: 3616 init1: 3201 opt: 3247 Z-score: 3828.7 bits: 719.7 E(85289): 1.6e-206
Smith-Waterman score: 3642; 63.6% identity (84.0% similar) in 877 aa overlap (60-935:9-868)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 QVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLN
::: :.. ::: :: ..:.:.. : ..:
XP_016 MQEINQNLAEEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKIN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 EDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTP
::. :::. .:. ::: . ...:.::. :::::::.:.:: :.:.::: ..::. .
XP_016 EDTRVHGLALQI---SEN-LFSNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 KGCLELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKG
:. .::....:: . :.. .::: . : .. :. ... . . . :: .:. .....
XP_016 KAVIELLEKSGVNLDGKKILVVGAHGSLEAALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHEA
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINYVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFIT
::.:... .:: . ::.::. :..:. ... .:. :. : :
XP_016 DIVVLGSPKPEEIPLTWIQPGTTVLNCSHDFL------SGKVGCGS-------PRIHFGG
160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 PVP-GGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKP
. : ...:. .:. : :..:.:.. . .: .. .:. .::::::.:::. :
XP_016 LIEEDDVILLAAALRIQNMVSSGRRWLREQQHRRWRLHCLKLQPLSPVPSDIEISRGQTP
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 KPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKST
: . ::.:::::..:.:.::..:::: ::.::::: . :::::.:.:::::::::::::
XP_016 KAVDVLAKEIGLLADEIEIYGKSKAKVRLSVLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKST
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 TTIGLVQALGAHLYQNVFACVRQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHA
.:::::::: ::: : :::.::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::
XP_016 VTIGLVQALTAHLNVNSFACLRQPSQGPTFGVKGGAAGGGYAQVIPMEEFNLHLTGDIHA
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 ITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLVPSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPT
:::::::.:::::.::.:: :::::::.::::: :::::.::.::. :::.:::.::::.
XP_016 ITAANNLLAAAIDTRILHENTQTDKALYNRLVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDPS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 TLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRFLRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASE
:::.::...:::::::: ::::::::::::::::::::::. ::::: : :::::.::::
XP_016 TLTEEEVSKFARLDIDPSTITWQRVLDTNDRFLRKITIGQGNTEKGHYRQAQFDIAVASE
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 IMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPVSAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLE
:::::::: :: ::. :::.:::::.:.:.::.:.::::.::::::::::::::::::::
XP_016 IMAVLALTDSLADMKARLGRMVVASDKSGQPVTADDLGVTGALTVLMKDAIKPNLMQTLE
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 GTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADQIALKLVGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYS
::::::::::::::::::::..::.::::::: ::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 GTPVFVHAGPFANIAHGNSSVLADKIALKLVGEEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRAS
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 GLCPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLPKAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMF
:: :.::::::::::::::::::.::::.:: : : .::..:: : ::.:::. ...:
XP_016 GLVPNVVVLVATVRALKMHGGGPSVTAGVPLKKEYTEENIQLVADGCCNLQKQIQITQLF
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 GIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHGAFDAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQA
:.:::::.:.:::::..:.::. .:... :::::: : ::. ::::.. ::.::..::.
XP_016 GVPVVVALNVFKTDTRAEIDLVCELAKRAGAFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAASK
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KB3 PSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTH
: ::.:::...:. :::: ::: .::: :::: :::: : . ::.::::::::::::::
XP_016 RSRFQFLYDVQVPIVDKIRTIAQAVYGAKDIELSPEAQAKIDRYTQQGFGNLPICMAKTH
750 760 770 780 790 800
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 LSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAGFLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPET
:::::.:..:::: ::::: :.:::.::::.::::::::::::::::::::::::: ::
XP_016 LSLSHQPDKKGVPRDFILPISDVRASIGAGFIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDTET
810 820 830 840 850 860
930
pF1KB3 EQVNGLF
:::.:::
XP_016 EQVKGLF
>>XP_016866195 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctional (869 aa)
initn: 3612 init1: 3201 opt: 3247 Z-score: 3828.7 bits: 719.7 E(85289): 1.6e-206
Smith-Waterman score: 3631; 63.7% identity (83.8% similar) in 878 aa overlap (60-935:9-869)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 QVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLN
::: :.. ::: :: ..:.:.. : ..:
XP_016 MQEINQNLAEEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKIN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 EDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTP
::. :::. .:. ::: . ...:.::. :::::::.:.:: :.:.::: ..::. .
XP_016 EDTRVHGLALQI---SEN-LFSNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 KGCLELI-KETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNK
:. .::. : .:: . :.. .::: . : .. :. ... . . . :: .:. ....
XP_016 KAVIELLEKSVGVNLDGKKILVVGAHGSLEAALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 GDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINYVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFI
.::.:... .:: . ::.::. :..:. ... .:. :. : :
XP_016 ADIVVLGSPKPEEIPLTWIQPGTTVLNCSHDFL------SGKVGCGS-------PRIHFG
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pF1KB3 TPVP-GGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCK
. : ...:. .:. : :..:.:.. . .: .. .:. .::::::.:::.
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pF1KB3 PKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKS
:: . ::.:::::..:.:.::..:::: ::.::::: . :::::.:.::::::::::::
XP_016 PKAVDVLAKEIGLLADEIEIYGKSKAKVRLSVLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKS
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::::::::.:::::.::.:: :::::::.::::: :::::.::.::. :::.:::.::::
XP_016 AITAANNLLAAAIDTRILHENTQTDKALYNRLVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDP
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XP_016 EGTPVFVHAGPFANIAHGNSSVLADKIALKLVGEEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRA
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::: :.::::::::::::::::::.::::.:: : : .::..:: : ::.:::. ...
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::.:::::.:.:::::..:.::. .:... :::::: : ::. ::::.. ::.::..::.
XP_016 FGVPVVVALNVFKTDTRAEIDLVCELAKRAGAFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAAS
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pF1KB3 APSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKT
: ::.:::...:. :::: ::: .::: :::: :::: : . ::.:::::::::::::
XP_016 KRSRFQFLYDVQVPIVDKIRTIAQAVYGAKDIELSPEAQAKIDRYTQQGFGNLPICMAKT
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pF1KB3 HLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAGFLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPE
::::::.:..:::: ::::: :.:::.::::.::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 HLSLSHQPDKKGVPRDFILPISDVRASIGAGFIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDTE
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930
pF1KB3 TEQVNGLF
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XP_016 TEQVKGLF
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pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
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pF1KB3 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
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pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
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pF1KB3 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
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pF1KB3 EKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELI-KETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGA
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NP_001 EKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSVGVNLDGKKILVVGAHGSLEA
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pF1KB3 PMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGIN
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NP_001 ALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHEADIVVLGSPKPEEIPLTWIQPGTTVLNCSHD
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pF1KB3 YVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVP-GGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKF
.. .:. :. : : . : ...:. .:. : :..:.:..
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pF1KB3 KPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLS
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pF1KB3 LVPSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTND
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NP_001 LVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDPSTLTEEEVSKFARLDIDPSTITWQRVLDTND
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pF1KB3 RFLRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGE
::::::::::. ::::: : :::::.:::::::::::: :: ::. :::.:::::.:.:.
NP_001 RFLRKITIGQGNTEKGHYRQAQFDIAVASEIMAVLALTDSLADMKARLGRMVVASDKSGQ
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::.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::.:::::
NP_001 PVTADDLGVTGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSVLADKIALKL
580 590 600 610 620 630
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:: ::::::::::::::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::.::::.:
NP_001 VGEEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRASGLVPNVVVLVATVRALKMHGGGPSVTAGVP
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pF1KB3 LPKAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHG
: : : .::..:: : ::.:::. ...::.:::::.:.:::::..:.::. .:... :
NP_001 LKKEYTEENIQLVADGCCNLQKQIQITQLFGVPVVVALNVFKTDTRAEIDLVCELAKRAG
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pF1KB3 AFDAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADD
::::: : ::. ::::.. ::.::..::. : ::.:::...:. :::: ::: .::: :
NP_001 AFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAASKRSRFQFLYDVQVPIVDKIRTIAQAVYGAKD
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pF1KB3 IELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAG
::: :::: : . ::.:::::::::::::::::::.:..:::: ::::: :.:::.:::
NP_001 IELSPEAQAKIDRYTQQGFGNLPICMAKTHLSLSHQPDKKGVPRDFILPISDVRASIGAG
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pF1KB3 FLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
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NP_001 FIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDTETEQVKGLF
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>>NP_056255 (OMIM: 611427) monofunctional C1-tetrahydrof (978 aa)
initn: 3625 init1: 3201 opt: 3247 Z-score: 3827.9 bits: 719.7 E(85289): 1.8e-206
Smith-Waterman score: 3715; 62.4% identity (83.5% similar) in 916 aa overlap (21-935:83-978)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSN
:. .. :.:. :.: : :::.:.: :.:
NP_056 QDGQARSSCSPGGRTPAARDSIVREVIQNSKEVLSLLQEKNPAFKPVLAIIQAG---DDN
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pF1KB3 LYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSIN
:. ... . ::: :.. ::: :: ..:.:.. : ..:::. :::. .:. ::: .
NP_056 LMQEINQNLAEEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKINEDTRVHGLALQI---SEN-LF
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pF1KB3 TEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVV
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NP_056 SNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSGVNLDGKKILV
170 180 190 200 210 220
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pF1KB3 VGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPG
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NP_056 VGAHGSLEAALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHEADIVVLGSPKPEEIPLTWIQPG
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pF1KB3 AIVIDCGINYVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVP-GGVGPMTVAMLMQSTVE
. :..:. ... .:. :. : : . : ...:. .:. :
NP_056 TTVLNCSHDFL------SGKVGCGS-------PRIHFGGLIEEDDVILLAAALRIQNMVS
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pF1KB3 SAKRFLEKFKPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYG
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NP_056 SGRRWLREQQHRRWRLHCLKLQPLSPVPSDIEISRGQTPKAVDVLAKEIGLLADEIEIYG
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pF1KB3 ETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACV
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NP_056 KSKAKVRLSVLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKSTVTIGLVQALTAHLNVNSFACL
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pF1KB3 RQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELT
::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.::.:: :
NP_056 RQPSQGPTFGVKGGAAGGGYAQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLLAAAIDTRILHENT
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pF1KB3 QTDKALFNRLVPSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETIT
::::::.::::: :::::.::.::. :::.:::.::::.:::.::...:::::::: :::
NP_056 QTDKALYNRLVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDPSTLTEEEVSKFARLDIDPSTIT
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>>XP_016866192 (OMIM: 611427) PREDICTED: monofunctional (979 aa)
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pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSN
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pF1KB3 LYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSIN
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XP_016 SNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSVGVNLDGKKIL
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XP_016 GGPSVTAGVPLKKEYTEENIQLVADGCCNLQKQIQITQLFGVPVVVALNVFKTDTRAEID
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XP_016 LVCELAKRAGAFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAASKRSRFQFLYDVQVPIVDKIRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]