Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3243
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3243, 935 aa
1>>>pF1KB3243 935 - 935 aa - 935 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5959+/-0.00114; mu= 19.4146+/- 0.068
mean_var=66.0107+/-13.063, 0's: 0 Z-trim(102.3): 31 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.157858
statistics sampled from 6861 (6875) to 6861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 4.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9763.1 MTHFD1 gene_id:4522|Hs108|chr14 ( 935) 6086 1395.7 0
CCDS75536.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 ( 913) 3247 749.1 8.5e-216
CCDS5228.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 ( 978) 3247 749.2 9e-216
CCDS75535.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 ( 979) 3247 749.2 9e-216
CCDS47075.1 MTHFD2L gene_id:441024|Hs108|chr4 ( 347) 522 128.4 2.4e-29
CCDS1935.2 MTHFD2 gene_id:10797|Hs108|chr2 ( 350) 518 127.5 4.5e-29
CCDS56457.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 ( 275) 414 103.8 4.9e-22
>>CCDS9763.1 MTHFD1 gene_id:4522|Hs108|chr14 (935 aa)
initn: 6086 init1: 6086 opt: 6086 Z-score: 7481.9 bits: 1395.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6086; 99.8% identity (100.0% similar) in 935 aa overlap (1-935:1-935)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAP
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EKDVDGLTSINAGKLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 MHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACVRQPSQGPTFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACVRQPSQGPTFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADQIALKLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS97 SAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADRIALKLVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 PEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 KAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHGAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 DAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAGFL
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KB3 YPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 YPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
910 920 930
>>CCDS75536.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 (913 aa)
initn: 3621 init1: 3201 opt: 3247 Z-score: 3987.7 bits: 749.1 E(32554): 8.5e-216
Smith-Waterman score: 3704; 62.5% identity (83.3% similar) in 917 aa overlap (21-935:17-913)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAA
:. .. :.:. :.: : :::.:.: :.::. ... . :
CCDS75 MQSRRARPRREVIQNSKEVLSLLQEKNPAFKPVLAIIQAG---DDNLMQEINQNLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAP
:: :.. ::: :: ..:.:.. : ..:::. :::. .:. ::: . ...:.::. :
CCDS75 EEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKINEDTRVHGLALQI---SEN-LFSNKVLNALKP
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB3 EKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELI-KETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGA
::::::.:.:: :.:.::: ..::. . :. .::. : .:: . :.. .::: . :
CCDS75 EKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSVGVNLDGKKILVVGAHGSLEA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 PMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGIN
.. :. ... . . . :: .:. .....::.:... .:: . ::.::. :..:. .
CCDS75 ALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHEADIVVLGSPKPEEIPLTWIQPGTTVLNCSHD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 YVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVP-GGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKF
.. .:. :. : : . : ...:. .:. : :..:.:..
CCDS75 FL------SGKVGCGS-------PRIHFGGLIEEDDVILLAAALRIQNMVSSGRRWLREQ
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 KPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLS
. .: .. .:. .::::::.:::. :: . ::.:::::..:.:.::..:::: ::
CCDS75 QHRRWRLHCLKLQPLSPVPSDIEISRGQTPKAVDVLAKEIGLLADEIEIYGKSKAKVRLS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 ALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACVRQPSQGPTF
.::::: . :::::.:.:::::::::::::.:::::::: ::: : :::.:::::::::
CCDS75 VLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKSTVTIGLVQALTAHLNVNSFACLRQPSQGPTF
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 GIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNR
:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.::.:: :::::::.::
CCDS75 GVKGGAAGGGYAQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLLAAAIDTRILHENTQTDKALYNR
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 LVPSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTND
::: :::::.::.::. :::.:::.::::.:::.::...:::::::: ::::::::::::
CCDS75 LVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDPSTLTEEEVSKFARLDIDPSTITWQRVLDTND
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 RFLRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGE
::::::::::. ::::: : :::::.:::::::::::: :: ::. :::.:::::.:.:.
CCDS75 RFLRKITIGQGNTEKGHYRQAQFDIAVASEIMAVLALTDSLADMKARLGRMVVASDKSGQ
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 PVSAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADQIALKL
::.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::.:::::
CCDS75 PVTADDLGVTGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSVLADKIALKL
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 VGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLP
:: ::::::::::::::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::.::::.:
CCDS75 VGEEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRASGLVPNVVVLVATVRALKMHGGGPSVTAGVP
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 LPKAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDLISRLSREHG
: : : .::..:: : ::.:::. ...::.:::::.:.:::::..:.::. .:... :
CCDS75 LKKEYTEENIQLVADGCCNLQKQIQITQLFGVPVVVALNVFKTDTRAEIDLVCELAKRAG
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 AFDAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADD
::::: : ::. ::::.. ::.::..::. : ::.:::...:. :::: ::: .::: :
CCDS75 AFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAASKRSRFQFLYDVQVPIVDKIRTIAQAVYGAKD
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 IELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIRDIRASVGAG
::: :::: : . ::.:::::::::::::::::::.:..:::: ::::: :.:::.:::
CCDS75 IELSPEAQAKIDRYTQQGFGNLPICMAKTHLSLSHQPDKKGVPRDFILPISDVRASIGAG
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930
pF1KB3 FLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
:.::::::::::::::::::::::::: :::::.:::
CCDS75 FIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDTETEQVKGLF
880 890 900 910
>>CCDS5228.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 (978 aa)
initn: 3625 init1: 3201 opt: 3247 Z-score: 3987.3 bits: 749.2 E(32554): 9e-216
Smith-Waterman score: 3715; 62.4% identity (83.5% similar) in 916 aa overlap (21-935:83-978)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSN
:. .. :.:. :.: : :::.:.: :.:
CCDS52 QDGQARSSCSPGGRTPAARDSIVREVIQNSKEVLSLLQEKNPAFKPVLAIIQAG---DDN
60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSIN
:. ... . ::: :.. ::: :: ..:.:.. : ..:::. :::. .:. ::: .
CCDS52 LMQEINQNLAEEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKINEDTRVHGLALQI---SEN-LF
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 TEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVV
...:.::. :::::::.:.:: :.:.::: ..::. . :. .::....:: . :.. .:
CCDS52 SNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSGVNLDGKKILV
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 VGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPG
:: . : .. :. ... . . . :: .:. .....::.:... .:: . ::.::
CCDS52 VGAHGSLEAALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHEADIVVLGSPKPEEIPLTWIQPG
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280
pF1KB3 AIVIDCGINYVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVP-GGVGPMTVAMLMQSTVE
. :..:. ... .:. :. : : . : ...:. .:. :
CCDS52 TTVLNCSHDFL------SGKVGCGS-------PRIHFGGLIEEDDVILLAAALRIQNMVS
290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 SAKRFLEKFKPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYG
:..:.:.. . .: .. .:. .::::::.:::. :: . ::.:::::..:.:.::
CCDS52 SGRRWLREQQHRRWRLHCLKLQPLSPVPSDIEISRGQTPKAVDVLAKEIGLLADEIEIYG
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 ETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFACV
..:::: ::.::::: . :::::.:.:::::::::::::.:::::::: ::: : :::.
CCDS52 KSKAKVRLSVLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKSTVTIGLVQALTAHLNVNSFACL
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 RQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELT
::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.::.:: :
CCDS52 RQPSQGPTFGVKGGAAGGGYAQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLLAAAIDTRILHENT
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 QTDKALFNRLVPSVNGVRRFSDIQIRRLKRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETIT
::::::.::::: :::::.::.::. :::.:::.::::.:::.::...:::::::: :::
CCDS52 QTDKALYNRLVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDPSTLTEEEVSKFARLDIDPSTIT
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 WQRVLDTNDRFLRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKM
:::::::::::::::::::. ::::: : :::::.:::::::::::: :: ::. :::.:
CCDS52 WQRVLDTNDRFLRKITIGQGNTEKGHYRQAQFDIAVASEIMAVLALTDSLADMKARLGRM
580 590 600 610 620 630
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 VVASSKKGEPVSAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSI
::::.:.:.::.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS52 VVASDKSGQPVTADDLGVTGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSV
640 650 660 670 680 690
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 IADQIALKLVGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHGG
.::.::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::
CCDS52 LADKIALKLVGEEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRASGLVPNVVVLVATVRALKMHGG
700 710 720 730 740 750
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 GPTVTAGLPLPKAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELDL
::.::::.:: : : .::..:: : ::.:::. ...::.:::::.:.:::::..:.::
CCDS52 GPSVTAGVPLKKEYTEENIQLVADGCCNLQKQIQITQLFGVPVVVALNVFKTDTRAEIDL
760 770 780 790 800 810
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 ISRLSREHGAFDAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRII
. .:... :::::: : ::. ::::.. ::.::..::. : ::.:::...:. :::: :
CCDS52 VCELAKRAGAFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAASKRSRFQFLYDVQVPIVDKIRTI
820 830 840 850 860 870
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 AQKIYGADDIELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPIR
:: .::: :::: :::: : . ::.:::::::::::::::::::.:..:::: :::::
CCDS52 AQAVYGAKDIELSPEAQAKIDRYTQQGFGNLPICMAKTHLSLSHQPDKKGVPRDFILPIS
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930
pF1KB3 DIRASVGAGFLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
:.:::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.:::
CCDS52 DVRASIGAGFIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDTETEQVKGLF
940 950 960 970
>>CCDS75535.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 (979 aa)
initn: 3621 init1: 3201 opt: 3247 Z-score: 3987.3 bits: 749.2 E(32554): 9e-216
Smith-Waterman score: 3704; 62.5% identity (83.3% similar) in 917 aa overlap (21-935:83-979)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSN
:. .. :.:. :.: : :::.:.: :.:
CCDS75 QDGQARSSCSPGGRTPAARDSIVREVIQNSKEVLSLLQEKNPAFKPVLAIIQAG---DDN
60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQLPLDSENSIN
:. ... . ::: :.. ::: :: ..:.:.. : ..:::. :::. .:. ::: .
CCDS75 LMQEINQNLAEEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKINEDTRVHGLALQI---SEN-LF
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160
pF1KB3 TEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELI-KETGVPIAGRHAV
...:.::. :::::::.:.:: :.:.::: ..::. . :. .::. : .:: . :.. .
CCDS75 SNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSVGVNLDGKKIL
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 VVGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKP
::: . : .. :. ... . . . :: .:. .....::.:... .:: . ::.:
CCDS75 VVGAHGSLEAALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKLHEADIVVLGSPKPEEIPLTWIQP
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230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GAIVIDCGINYVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVP-GGVGPMTVAMLMQSTV
:. :..:. ... .:. :. : : . : ...:. .:. :
CCDS75 GTTVLNCSHDFL------SGKVGCGS-------PRIHFGGLIEEDDVILLAAALRIQNMV
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290 300 310 320 330 340
pF1KB3 ESAKRFLEKFKPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELY
:..:.:.. . .: .. .:. .::::::.:::. :: . ::.:::::..:.:.:
CCDS75 SSGRRWLREQQHRRWRLHCLKLQPLSPVPSDIEISRGQTPKAVDVLAKEIGLLADEIEIY
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pF1KB3 GETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLYQNVFAC
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CCDS75 GKSKAKVRLSVLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKSTVTIGLVQALTAHLNVNSFAC
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pF1KB3 VRQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHEL
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CCDS75 LRQPSQGPTFGVKGGAAGGGYAQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLLAAAIDTRILHEN
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:::::::.::::: :::::.::.::. :::.:::.::::.:::.::...:::::::: ::
CCDS75 TQTDKALYNRLVPLVNGVREFSEIQLARLKKLGINKTDPSTLTEEEVSKFARLDIDPSTI
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::::::::::::::::::::. ::::: : :::::.:::::::::::: :: ::. :::.
CCDS75 TWQRVLDTNDRFLRKITIGQGNTEKGHYRQAQFDIAVASEIMAVLALTDSLADMKARLGR
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:::::.:.:.::.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MVVASDKSGQPVTADDLGVTGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSS
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pF1KB3 IIADQIALKLVGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVATVRALKMHG
..::.::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::: :.:::::::::::::::
CCDS75 VLADKIALKLVGEEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRASGLVPNVVVLVATVRALKMHG
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pF1KB3 GGPTVTAGLPLPKAYIQENLELVEKGFSNLKKQIENARMFGIPVVVAVNAFKTDTESELD
:::.::::.:: : : .::..:: : ::.:::. ...::.:::::.:.:::::..:.:
CCDS75 GGPSVTAGVPLKKEYTEENIQLVADGCCNLQKQIQITQLFGVPVVVALNVFKTDTRAEID
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pF1KB3 LISRLSREHGAFDAVKCTHWAEGGKGALALAQAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRI
:. .:... :::::: : ::. ::::.. ::.::..::. : ::.:::...:. ::::
CCDS75 LVCELAKRAGAFDAVPCYHWSVGGKGSVDLARAVREAASKRSRFQFLYDVQVPIVDKIRT
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830 840 850 860 870 880
pF1KB3 IAQKIYGADDIELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFILPI
::: .::: :::: :::: : . ::.:::::::::::::::::::.:..:::: :::::
CCDS75 IAQAVYGAKDIELSPEAQAKIDRYTQQGFGNLPICMAKTHLSLSHQPDKKGVPRDFILPI
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890 900 910 920 930
pF1KB3 RDIRASVGAGFLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF
:.:::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.:::
CCDS75 SDVRASIGAGFIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDTETEQVKGLF
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>>CCDS47075.1 MTHFD2L gene_id:441024|Hs108|chr4 (347 aa)
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10 20 30
pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPG
: :..: :.. .:. ... : . .. .
CCDS47 LGRSTAPSVRAPGEPGSAFRGFRSSGVRHEAIIISGTEMAKHIQKEIQRGVESWV-SLGN
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40 50 60 70 80 90
pF1KB3 FTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDST
:.:.:. ::. :. :. :..:: .:: . : :. ... :.. .:: :
CCDS47 RRPHLSIILVGDNPASHTYVRNKIRAASAVGICSELILKPKDVSQEELLDVTDQLNMDPR
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pF1KB3 VHGFLVQLPLDSENSINTEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCL
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CCDS47 VSGILVQLPL--PDHVDERTICNGIAPEKDVDGFHIINIGRLCLDQHS--LIPATASAVW
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pF1KB3 ELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAPMHDLLLWN--------NATVTTCHSKTAHLDEE
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CCDS47 EIIKRTGIQTFGKNVVVAGRSKNVGMPIAMLLHTDGEHERPGGDATVTIAHRYTPKEQLK
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pF1KB3 VNK--GDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINYVPDDKKPNGR-KVVGDVAYDEAK
.. .::..::.: :... .. .: :: ::: ::::: : .:. :.:::: .. .:
CCDS47 IHTQLADIIIVAAGIPKLITSDMVKEGAAVIDVGINYVHDP--VTGKTKLVGDVDFEAVK
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pF1KB3 ERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKPGKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDI
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CCDS47 KKAGFITPVPGGVGPMTVAMLLKNTLLAAKKIIY
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330 340 350 360 370 380
pF1KB3 SRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPL
>>CCDS1935.2 MTHFD2 gene_id:10797|Hs108|chr2 (350 aa)
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pF1KB3 MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPG
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40 50 60 70 80 90
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CCDS19 KRPHLSVILVGENPASHSYVLNKTRAAAVVGINSETIMKPASISEEELLNLINKLNNDDN
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CCDS19 VDGLLVQLPL--PEHIDERRICNAVSPDKDVDGFHVINVGRMCLDQYS--MLPATPWGVW
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CCDS19 EIIKRTGIPTLGKNVVVAGRSKNVGMPIAMLLHTDGAHERPGGDATVTISHRYTPKEQLK
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pF1KB3 EEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINYVPDD--KKPNGRKVVGDVAYDEA
... .::.. :.: :... .. :: :: ::: ::: : : :: :.:::: .. .
CCDS19 KHTILADIVISAAGIPNLITADMIKEGAAVIDVGINRVHDPVTAKP---KLVGDVDFEGV
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CCDS19 RQKAGYITPVPGGVGPMTVAMLMKNTIIAAKKVLRLEEREVLKSKELGVATN
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pF1KB3 ISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTP
>>CCDS56457.1 MTHFD1L gene_id:25902|Hs108|chr6 (275 aa)
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CCDS56 LMQEINQNLAEEAGLNITHICLPPDSSEAEIIDEILKINEDTRVHGLALQI---SEN-LF
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CCDS56 SNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVAKAVIELLEKSGVNLDGKKILV
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pF1KB3 VGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTAHLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPG
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CCDS56 VGAHGSLEAALQCLFQRKGSMTMSIQWKTRQLQSKTESRSVTRLECRRVI
230 240 250 260 270
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]