Result of FASTA (omim) for
pF1KB3236
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3236, 572 aa
1>>>pF1KB3236 572 - 572 aa - 572 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6463+/-0.000421; mu= 16.7116+/- 0.026
mean_var=67.5729+/-13.868, 0's: 0 Z-trim(109.8): 30 B-trim: 18 in 1/53
Lambda= 0.156023
statistics sampled from 18065 (18085) to 18065 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 9.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002386 (OMIM: 154250) NADP-dependent malic enzy ( 572) 3772 858.6 0
XP_011534138 (OMIM: 154250) PREDICTED: NADP-depend ( 497) 3266 744.7 1.6e-214
NP_006671 (OMIM: 604626) NADP-dependent malic enzy ( 604) 2840 648.8 1.4e-185
NP_001014811 (OMIM: 604626) NADP-dependent malic e ( 604) 2840 648.8 1.4e-185
NP_001155058 (OMIM: 604626) NADP-dependent malic e ( 604) 2840 648.8 1.4e-185
XP_005273774 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-depend ( 604) 2840 648.8 1.4e-185
XP_016872625 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-depend ( 724) 2840 648.9 1.7e-185
NP_002387 (OMIM: 154270) NAD-dependent malic enzym ( 584) 2199 504.5 3.7e-142
XP_016872626 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-depend ( 467) 2134 489.9 7.8e-138
XP_016872627 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-depend ( 403) 2008 461.5 2.4e-129
NP_001161807 (OMIM: 154270) NAD-dependent malic en ( 479) 1861 428.4 2.5e-119
>>NP_002386 (OMIM: 154250) NADP-dependent malic enzyme [ (572 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 4586.8 bits: 858.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3772; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFTLEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFTLEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTAC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 YKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFV
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB3 RSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVDQ
550 560 570
>>XP_011534138 (OMIM: 154250) PREDICTED: NADP-dependent (497 aa)
initn: 3266 init1: 3266 opt: 3266 Z-score: 3972.2 bits: 744.7 E(85289): 1.6e-214
Smith-Waterman score: 3266; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (76-572:1-497)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 PSFNSQEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPT
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPT
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 VGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCN
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 GMGIPVGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GMGIPVGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAAL
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 RITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGRA
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 SLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFA
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 LSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 VACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEK
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570
pF1KB3 TATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVDQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVDQ
460 470 480 490
>>NP_006671 (OMIM: 604626) NADP-dependent malic enzyme, (604 aa)
initn: 2836 init1: 2836 opt: 2840 Z-score: 3452.7 bits: 648.8 E(85289): 1.4e-185
Smith-Waterman score: 2840; 71.6% identity (92.1% similar) in 567 aa overlap (2-568:37-603)
10 20 30
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFT
.: : ..::: .:::::::: .:::
NP_006 TGTRLAPWPGRACGALPRWTPTAPAQGCHSKPGPARPVPLKKRGYDVTRNPHLNKGMAFT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 LEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLT
:::: ::.::::.:: : ::..:.::... .:. .::.:.:..:: ::::::::::::::
NP_006 LEERLQLGIHGLIPPCFLSQDVQLLRIMRYYERQQSDLDKYIILMTLQDRNEKLFYRVLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVT
::.:::::::::::::::::.:.:.::.::::::::::.::.:..::.:::: :::.:::
NP_006 SDVEKFMPIVYTPTVGLACQHYGLTFRRPRGLFITIHDKGHLATMLNSWPEDNIKAVVVT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 DGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGL
::::::::::::: :::::::::::::::::.:::.::::.:::::.:::::.:::::::
NP_006 DGERILGLGDLGCYGMGIPVGKLALYTACGGVNPQQCLPVLLDVGTNNEELLRDPLYIGL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 RQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQ
...::.:. :::.:::::.::..:.:.:::::::::::.:::::::::::.:: ::::::
NP_006 KHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 GTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKI
:::::::::.::::::::::::.....::::::::.:::::.::::::::.:: .: .::
NP_006 GTASVAVAGILAALRITKNKLSNHVFVFQGAGEAAMGIAHLLVMALEKEGVPKAEATRKI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 WLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQIL
:.:::::::::::. :..::: ::..: :...:: .:. .::::.::::::.:::.::::
NP_006 WMVDSKGLIVKGRSHLNHEKEMFAQDHPEVNSLEEVVRLVKPTAIIGVAAIAGAFTEQIL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 KDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQ
.:::.:.:::::::::::::::::.::.::..:.::.:::::::: ::: .:.:. :::
NP_006 RDMASFHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYRVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGKTFIPGQ
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 GNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSL
:::.::::::::::.: :.:.: :.::: ::: :::.::..:: .:::::::.:::::::
NP_006 GNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 KIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVD
.:: :.. ::... :. ::::..::::::: .:. :::.. : :.::.:....::
NP_006 RIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTLDSYTWPKEAMNVQTV
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 Q
>>NP_001014811 (OMIM: 604626) NADP-dependent malic enzym (604 aa)
initn: 2836 init1: 2836 opt: 2840 Z-score: 3452.7 bits: 648.8 E(85289): 1.4e-185
Smith-Waterman score: 2840; 71.6% identity (92.1% similar) in 567 aa overlap (2-568:37-603)
10 20 30
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFT
.: : ..::: .:::::::: .:::
NP_001 TGTRLAPWPGRACGALPRWTPTAPAQGCHSKPGPARPVPLKKRGYDVTRNPHLNKGMAFT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 LEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLT
:::: ::.::::.:: : ::..:.::... .:. .::.:.:..:: ::::::::::::::
NP_001 LEERLQLGIHGLIPPCFLSQDVQLLRIMRYYERQQSDLDKYIILMTLQDRNEKLFYRVLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVT
::.:::::::::::::::::.:.:.::.::::::::::.::.:..::.:::: :::.:::
NP_001 SDVEKFMPIVYTPTVGLACQHYGLTFRRPRGLFITIHDKGHLATMLNSWPEDNIKAVVVT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 DGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGL
::::::::::::: :::::::::::::::::.:::.::::.:::::.:::::.:::::::
NP_001 DGERILGLGDLGCYGMGIPVGKLALYTACGGVNPQQCLPVLLDVGTNNEELLRDPLYIGL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 RQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQ
...::.:. :::.:::::.::..:.:.:::::::::::.:::::::::::.:: ::::::
NP_001 KHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 GTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKI
:::::::::.::::::::::::.....::::::::.:::::.::::::::.:: .: .::
NP_001 GTASVAVAGILAALRITKNKLSNHVFVFQGAGEAAMGIAHLLVMALEKEGVPKAEATRKI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 WLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQIL
:.:::::::::::. :..::: ::..: :...:: .:. .::::.::::::.:::.::::
NP_001 WMVDSKGLIVKGRSHLNHEKEMFAQDHPEVNSLEEVVRLVKPTAIIGVAAIAGAFTEQIL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 KDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQ
.:::.:.:::::::::::::::::.::.::..:.::.:::::::: ::: .:.:. :::
NP_001 RDMASFHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYRVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGKTFIPGQ
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 GNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSL
:::.::::::::::.: :.:.: :.::: ::: :::.::..:: .:::::::.:::::::
NP_001 GNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 KIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVD
.:: :.. ::... :. ::::..::::::: .:. :::.. : :.::.:....::
NP_001 RIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTLDSYTWPKEAMNVQTV
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 Q
>>NP_001155058 (OMIM: 604626) NADP-dependent malic enzym (604 aa)
initn: 2836 init1: 2836 opt: 2840 Z-score: 3452.7 bits: 648.8 E(85289): 1.4e-185
Smith-Waterman score: 2840; 71.6% identity (92.1% similar) in 567 aa overlap (2-568:37-603)
10 20 30
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFT
.: : ..::: .:::::::: .:::
NP_001 TGTRLAPWPGRACGALPRWTPTAPAQGCHSKPGPARPVPLKKRGYDVTRNPHLNKGMAFT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 LEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLT
:::: ::.::::.:: : ::..:.::... .:. .::.:.:..:: ::::::::::::::
NP_001 LEERLQLGIHGLIPPCFLSQDVQLLRIMRYYERQQSDLDKYIILMTLQDRNEKLFYRVLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVT
::.:::::::::::::::::.:.:.::.::::::::::.::.:..::.:::: :::.:::
NP_001 SDVEKFMPIVYTPTVGLACQHYGLTFRRPRGLFITIHDKGHLATMLNSWPEDNIKAVVVT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 DGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGL
::::::::::::: :::::::::::::::::.:::.::::.:::::.:::::.:::::::
NP_001 DGERILGLGDLGCYGMGIPVGKLALYTACGGVNPQQCLPVLLDVGTNNEELLRDPLYIGL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 RQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQ
...::.:. :::.:::::.::..:.:.:::::::::::.:::::::::::.:: ::::::
NP_001 KHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 GTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKI
:::::::::.::::::::::::.....::::::::.:::::.::::::::.:: .: .::
NP_001 GTASVAVAGILAALRITKNKLSNHVFVFQGAGEAAMGIAHLLVMALEKEGVPKAEATRKI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 WLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQIL
:.:::::::::::. :..::: ::..: :...:: .:. .::::.::::::.:::.::::
NP_001 WMVDSKGLIVKGRSHLNHEKEMFAQDHPEVNSLEEVVRLVKPTAIIGVAAIAGAFTEQIL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 KDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQ
.:::.:.:::::::::::::::::.::.::..:.::.:::::::: ::: .:.:. :::
NP_001 RDMASFHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYRVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGKTFIPGQ
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460 470 480 490 500 510
pF1KB3 GNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSL
:::.::::::::::.: :.:.: :.::: ::: :::.::..:: .:::::::.:::::::
NP_001 GNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 KIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVD
.:: :.. ::... :. ::::..::::::: .:. :::.. : :.::.:....::
NP_001 RIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTLDSYTWPKEAMNVQTV
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 Q
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Smith-Waterman score: 2840; 71.6% identity (92.1% similar) in 567 aa overlap (2-568:37-603)
10 20 30
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFT
.: : ..::: .:::::::: .:::
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40 50 60 70 80 90
pF1KB3 LEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLT
:::: ::.::::.:: : ::..:.::... .:. .::.:.:..:: ::::::::::::::
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100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVT
::.:::::::::::::::::.:.:.::.::::::::::.::.:..::.:::: :::.:::
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160 170 180 190 200 210
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::::::::::::: :::::::::::::::::.:::.::::.:::::.:::::.:::::::
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pF1KB3 RQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQ
...::.:. :::.:::::.::..:.:.:::::::::::.:::::::::::.:: ::::::
XP_005 KHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQ
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:::::::::.::::::::::::.....::::::::.:::::.::::::::.:: .: .::
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pF1KB3 WLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQIL
:.:::::::::::. :..::: ::..: :...:: .:. .::::.::::::.:::.::::
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pF1KB3 KDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQ
.:::.:.:::::::::::::::::.::.::..:.::.:::::::: ::: .:.:. :::
XP_005 RDMASFHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYRVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGKTFIPGQ
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460 470 480 490 500 510
pF1KB3 GNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSL
:::.::::::::::.: :.:.: :.::: ::: :::.::..:: .:::::::.:::::::
XP_005 GNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSL
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pF1KB3 KIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVD
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XP_005 RIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTLDSYTWPKEAMNVQTV
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pF1KB3 Q
>>XP_016872625 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-dependent (724 aa)
initn: 2836 init1: 2836 opt: 2840 Z-score: 3451.4 bits: 648.9 E(85289): 1.7e-185
Smith-Waterman score: 2840; 71.6% identity (92.1% similar) in 567 aa overlap (2-568:157-723)
10 20 30
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFT
.: : ..::: .:::::::: .:::
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pF1KB3 LEERQQLNIHGLLPPSFNSQEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLT
:::: ::.::::.:: : ::..:.::... .:. .::.:.:..:: ::::::::::::::
XP_016 LEERLQLGIHGLIPPCFLSQDVQLLRIMRYYERQQSDLDKYIILMTLQDRNEKLFYRVLT
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pF1KB3 SDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVT
::.:::::::::::::::::.:.:.::.::::::::::.::.:..::.:::: :::.:::
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::::::::::::: :::::::::::::::::.:::.::::.:::::.:::::.:::::::
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pF1KB3 RQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQ
...::.:. :::.:::::.::..:.:.:::::::::::.:::::::::::.:: ::::::
XP_016 KHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQ
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pF1KB3 GTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKI
:::::::::.::::::::::::.....::::::::.:::::.::::::::.:: .: .::
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pF1KB3 WLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQIL
:.:::::::::::. :..::: ::..: :...:: .:. .::::.::::::.:::.::::
XP_016 WMVDSKGLIVKGRSHLNHEKEMFAQDHPEVNSLEEVVRLVKPTAIIGVAAIAGAFTEQIL
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pF1KB3 KDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQ
.:::.:.:::::::::::::::::.::.::..:.::.:::::::: ::: .:.:. :::
XP_016 RDMASFHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYRVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGKTFIPGQ
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pF1KB3 GNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSL
:::.::::::::::.: :.:.: :.::: ::: :::.::..:: .:::::::.:::::::
XP_016 GNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSL
610 620 630 640 650 660
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pF1KB3 KIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVD
.:: :.. ::... :. ::::..::::::: .:. :::.. : :.::.:....::
XP_016 RIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTLDSYTWPKEAMNVQTV
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 Q
>>NP_002387 (OMIM: 154270) NAD-dependent malic enzyme, m (584 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MEPEAPRRRHTHQRGYLLTRNPHLNKDLAFTLEERQQLNIHGLLPPSFNS
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pF1KB3 QEIQVLRVVKNFEHLNSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPTVGLAC
:.::.:: .:.....: ...:. .: .:.::::::::.: .:::..:::::::::::::
NP_002 QDIQALRFHRNLKKMTSPLEKYIYIMGIQERNEKLFYRILQDDIESLMPIVYTPTVGLAC
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pF1KB3 QQYSLVFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCNGMGIP
.::. .::.:.::::.: ::::. :... :::. .::.::::::::::::::: :::::
NP_002 SQYGHIFRRPKGLFISISDRGHVRSIVDNWPENHVKAVVVTDGERILGLGDLGVYGMGIP
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pF1KB3 VGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFLDEFME
:::: :::::.:. :..:::: .::::.: :::::.:.:: :.: : ..:::..::::.
NP_002 VGKLCLYTACAGIRPDRCLPVCIDVGTDNIALLKDPFYMGLYQKRDRTQQYDDLIDEFMK
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pF1KB3 AVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITKN
:....:: : :::::::.: ::::.: :::..::::::::::::.::.:::::: .. ..
NP_002 AITDRYGRNTLIQFEDFGNHNAFRFLRKYREKYCTFNDDIQGTAAVALAGLLAAQKVISK
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pF1KB3 KLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGR-ASLTQ
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NP_002 PISEHKILFLGAGEAALGIANLIVMSMVENGLSEQEAQKKIWMFDKYGLLVKGRKAKIDS
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pF1KB3 EKEKFAHEHEEM--KNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFALS
.: :.: : ..: :. .::...::::. : :. .... ::..::::.:::::
NP_002 YQEPFTHSAPESIPDTFEDAVNILKPSTIIGVAGAGRLFTPDVIRAMASINERPVIFALS
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:::..:::.::. : .:.:: .::::::: :: : .:... :::::: :.::::::.:.
NP_002 NPTAQAECTAEEAYTLTEGRCLFASGSPFGPVKLTDGRVFTPGQGNNVYIFPGVALAVIL
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pF1KB3 CGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEKTA
:. :.:.:..:: .:.....:..:..: .::::::: .:..::..:: :... : .: :
NP_002 CNTRHISDSVFLEAAKALTSQLTDEELAQGRLYPPLANIQEVSINIAIKVTEYLYANKMA
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pF1KB3 TVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVDQ
::::..: .:. . . ..::..::: : :::
NP_002 FRYPEPEDKAKYVKERTWRSEYDSLLPDVYEWPESASSPPVITE
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>>XP_016872626 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-dependent (467 aa)
initn: 2134 init1: 2134 opt: 2134 Z-score: 2595.6 bits: 489.9 E(85289): 7.8e-138
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pF1KB3 VFRKPRGLFITIHDRGHIASVLNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLA
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pF1KB3 LYTACGGMNPQECLPVILDVGTENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSK
:::::::.:::.::::.:::::.:::::.:::::::...::.:. :::.:::::.::..:
XP_016 LYTACGGVNPQQCLPVLLDVGTNNEELLRDPLYIGLKHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDK
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pF1KB3 YGMNCLIQFEDFANVNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQ
.:.:::::::::::.:::::::::::.:: :::::::::::::::.::::::::::::..
XP_016 FGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQGTASVAVAGILAALRITKNKLSNH
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pF1KB3 TILFQGAGEAALGIAHLIVMALEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFA
...::::::::.:::::.::::::::.:: .: .:::.:::::::::::. :..::: ::
XP_016 VFVFQGAGEAAMGIAHLLVMALEKEGVPKAEATRKIWMVDSKGLIVKGRSHLNHEKEMFA
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pF1KB3 HEHEEMKNLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFALSNPTSKAEC
..: :...:: .:. .::::.::::::.:::.::::.:::.:.:::::::::::::::::
XP_016 QDHPEVNSLEEVVRLVKPTAIIGVAAIAGAFTEQILRDMASFHERPIIFALSNPTSKAEC
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pF1KB3 SAEQCYKITKGRAIFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGVVACGLRQITD
.::.::..:.::.:::::::: ::: .:.:. ::::::.::::::::::.: :.:.: :
XP_016 TAEKCYRVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGKTFIPGQGNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPD
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pF1KB3 NIFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQN
.::: ::: :::.::..:: .:::::::.:::::::.:: :.. ::... :. ::::..
XP_016 EIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSLRIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKD
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pF1KB3 KEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEVQKIQTKVDQ
::::::: .:. :::.. : :.::.:....::
XP_016 KEAFVRSLVYTPDYDSFTLDSYTWPKEAMNVQTV
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>>XP_016872627 (OMIM: 604626) PREDICTED: NADP-dependent (403 aa)
initn: 2008 init1: 2008 opt: 2008 Z-score: 2443.3 bits: 461.5 E(85289): 2.4e-129
Smith-Waterman score: 2008; 71.9% identity (93.0% similar) in 402 aa overlap (167-568:1-402)
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pF1KB3 LNAWPEDVIKAIVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGMNPQECLPVILDVG
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XP_016 MGIPVGKLALYTACGGVNPQQCLPVLLDVG
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pF1KB3 TENEELLKDPLYIGLRQRRVRGSEYDDFLDEFMEAVSSKYGMNCLIQFEDFANVNAFRLL
:.:::::.:::::::...::.:. :::.:::::.::..:.:.:::::::::::.::::::
XP_016 TNNEELLRDPLYIGLKHQRVHGKAYDDLLDEFMQAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLL
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pF1KB3 NKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITKNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMA
:::::.:: :::::::::::::::.::::::::::::.....::::::::.:::::.:::
XP_016 NKYRNKYCMFNDDIQGTASVAVAGILAALRITKNKLSNHVFVFQGAGEAAMGIAHLLVMA
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pF1KB3 LEKEGLPKEKAIKKIWLVDSKGLIVKGRASLTQEKEKFAHEHEEMKNLEAIVQEIKPTAL
:::::.:: .: .:::.:::::::::::. :..::: ::..: :...:: .:. .::::.
XP_016 LEKEGVPKAEATRKIWMVDSKGLIVKGRSHLNHEKEMFAQDHPEVNSLEEVVRLVKPTAI
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pF1KB3 IGVAAIGGAFSEQILKDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKITKGRAIFASGSPF
::::::.:::.::::.:::.:.:::::::::::::::::.::.::..:.::.::::::::
XP_016 IGVAAIAGAFTEQILRDMASFHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYRVTEGRGIFASGSPF
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 DPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGVVACGLRQITDNIFLTTAEVIAQQVSDKHLEE
::: .:.:. ::::::.::::::::::.: :.:.: :.::: ::: :::.::..:: .
XP_016 KSVTLEDGKTFIPGQGNNAYVFPGVALGVIAGGIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQ
280 290 300 310 320 330
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pF1KB3 GRLYPPLNTIRDVSLKIAEKIVKDAYQEKTATVYPEPQNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDC
:::::::.:::::::.:: :.. ::... :. ::::..::::::: .:. :::.. :
XP_016 GRLYPPLSTIRDVSLRIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTLDS
340 350 360 370 380 390
560 570
pF1KB3 YSWPEEVQKIQTKVDQ
:.::.:....::
XP_016 YTWPKEAMNVQTV
400
572 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 04:53:33 2016 done: Sat Nov 5 04:53:34 2016
Total Scan time: 9.240 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]