Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3222
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3222, 979 aa
1>>>pF1KB3222 979 - 979 aa - 979 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5429+/-0.00104; mu= 20.3406+/- 0.062
mean_var=78.9580+/-16.053, 0's: 0 Z-trim(104.7): 64 B-trim: 97 in 1/49
Lambda= 0.144336
statistics sampled from 7976 (8040) to 7976 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44346.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 ( 979) 6616 1388.2 0
CCDS44347.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 ( 979) 6180 1297.4 0
CCDS1632.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 (1036) 5990 1257.9 0
CCDS1633.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 ( 922) 5367 1128.1 0
CCDS62784.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1004) 1776 380.4 1e-104
CCDS12864.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1061) 1776 380.4 1.1e-104
CCDS62785.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1062) 1776 380.4 1.1e-104
CCDS7776.1 NLRP14 gene_id:338323|Hs108|chr11 (1093) 1313 284.0 1.1e-75
CCDS12936.1 NLRP4 gene_id:147945|Hs108|chr19 ( 994) 1155 251.1 8.5e-66
CCDS7784.1 NLRP10 gene_id:338322|Hs108|chr11 ( 655) 1097 238.9 2.6e-62
CCDS82402.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19 (1029) 1042 227.5 1.1e-58
CCDS12937.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19 (1048) 1042 227.5 1.1e-58
CCDS60680.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11 ( 891) 985 215.6 3.5e-55
CCDS7693.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11 ( 892) 985 215.6 3.5e-55
CCDS32537.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1375) 976 213.9 1.8e-54
CCDS58508.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1399) 976 213.9 1.8e-54
CCDS42245.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1429) 976 213.9 1.9e-54
CCDS42244.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1443) 976 213.9 1.9e-54
CCDS42246.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1473) 976 213.9 1.9e-54
CCDS33109.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19 ( 980) 838 185.0 6.2e-46
CCDS12912.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19 (1009) 838 185.0 6.4e-46
CCDS46183.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19 (1037) 838 185.1 6.5e-46
CCDS7697.1 RNH1 gene_id:6050|Hs108|chr11 ( 461) 673 150.5 7.5e-36
CCDS12934.1 NLRP9 gene_id:338321|Hs108|chr19 ( 991) 634 142.6 3.8e-33
CCDS12938.1 NLRP5 gene_id:126206|Hs108|chr19 (1200) 581 131.6 9.4e-30
CCDS54318.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1039) 562 127.6 1.3e-28
CCDS54319.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1040) 562 127.6 1.3e-28
CCDS12913.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1062) 562 127.6 1.3e-28
CCDS74458.1 NLRP11 gene_id:204801|Hs108|chr19 ( 934) 555 126.1 3.3e-28
CCDS12935.1 NLRP11 gene_id:204801|Hs108|chr19 (1033) 555 126.1 3.6e-28
CCDS82401.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19 (1036) 512 117.2 1.8e-25
CCDS33119.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19 (1043) 512 117.2 1.8e-25
CCDS73817.1 NLRC3 gene_id:197358|Hs108|chr16 (1065) 480 110.5 1.8e-23
CCDS10544.1 CIITA gene_id:4261|Hs108|chr16 (1130) 351 83.7 2.3e-15
CCDS73826.1 CIITA gene_id:4261|Hs108|chr16 (1131) 351 83.7 2.3e-15
CCDS5427.1 NOD1 gene_id:10392|Hs108|chr7 ( 953) 345 82.4 4.9e-15
CCDS8416.1 NLRX1 gene_id:79671|Hs108|chr11 ( 975) 310 75.1 7.7e-13
>>CCDS44346.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 (979 aa)
initn: 6616 init1: 6616 opt: 6616 Z-score: 7440.6 bits: 1388.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6616; 100.0% identity (100.0% similar) in 979 aa overlap (1-979:1-979)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVNSGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVNSGLT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SVCCSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVCCSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 CWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB3 LETLQEEKPELTVVFEPSW
:::::::::::::::::::
CCDS44 LETLQEEKPELTVVFEPSW
970
>>CCDS44347.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 (979 aa)
initn: 6180 init1: 6180 opt: 6180 Z-score: 6949.9 bits: 1297.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6180; 93.8% identity (96.7% similar) in 979 aa overlap (1-979:1-979)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
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pF1KB3 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
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pF1KB3 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
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pF1KB3 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
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pF1KB3 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
550 560 570 580 590 600
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pF1KB3 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRC
:. : . :::..:.:.:::::::.::: :.:.:: :.: ::...::: :
CCDS44 GRCGLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVSC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVNSGLT
:. :: :.. :::....:..: ...::::: :. .:: :. :::.:: :::::::
CCDS44 CLTSACCQDLASVLSTSHSLTRLYVGENALGDSGVAILCEKAKNPQCNLQKLGLVNSGLT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SVCCSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVCCSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 CWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB3 LETLQEEKPELTVVFEPSW
:::::::::::::::::::
CCDS44 LETLQEEKPELTVVFEPSW
970
>>CCDS1632.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 (1036 aa)
initn: 5990 init1: 5990 opt: 5990 Z-score: 6735.8 bits: 1257.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6331; 94.4% identity (94.4% similar) in 1011 aa overlap (1-954:1-1011)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB3 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLV-----
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVSCCLT
790 800 810 820 830 840
840
pF1KB3 ----------------------------------------------------NSGLTSVC
::::::::
CCDS16 SACCQDLASVLSTSHSLTRLYVGENALGDSGVAILCEKAKNPQCNLQKLGLVNSGLTSVC
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850 860 870 880 890 900
pF1KB3 CSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHCCWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 CSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHCCWD
910 920 930 940 950 960
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 LSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSALET
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSALET
970 980 990 1000 1010 1020
970
pF1KB3 LQEEKPELTVVFEPSW
CCDS16 LQEEKPELTVVFEPSW
1030
>>CCDS1633.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 (922 aa)
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Smith-Waterman score: 6104; 94.2% identity (94.2% similar) in 979 aa overlap (1-979:1-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATLMID
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 FNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEWMGL
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQ
130 140 150 160 170 180
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pF1KB3 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QEREQELLAIGKTKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMM
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVALEKLQH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLVCWIVCT
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEK
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
550 560 570 580 590 600
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pF1KB3 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIEINLSTR
610 620 630 640 650 660
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pF1KB3 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQCVLPSSSHAACSHGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRC
:::
CCDS16 ---------------------------------------------------------GRC
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pF1KB3 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVNSGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GLSHECCFDISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVNSGLT
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SVCCSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SVCCSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHC
790 800 810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 CWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 CWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSA
850 860 870 880 890 900
970
pF1KB3 LETLQEEKPELTVVFEPSW
:::::::::::::::::::
CCDS16 LETLQEEKPELTVVFEPSW
910 920
>>CCDS62784.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1004 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATL
:.:. :::.:: :.:::::..: . : .: :. ::: ...: :
CCDS62 MLRTAGRDGLCRLSTYLEELEAVELKKFKLYL-GTATELGEGKIPWGSMEKAGPLEMAQL
10 20 30 40 50
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pF1KB3 MIDFNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEW
.: : :.:: .:. : :::.::.:...:. : .: . : .:. ..
CCDS62 LITHFGPEEAWRLALSTFERINRKDLWERGQRE------DLVRDTPPG---GPSSLGNQS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 MGLLEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEH
::: .:. .:: .. :: ::: .:. .::::::::: :.:..::::: :.:::
CCDS62 TCLLE----VSLVTPRKDPQETYRDYVRRKFRLMEDRNARLGECVNLSHRYTRLLLVKEH
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RSQQEREQELLAIGK--TKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTIL
. .. .:.:: :. ..: .::::.: ::.::.:. :: .:::.::::::::..:
CCDS62 SNPMQVQQQLLDTGRGHARTVGHQASPIKIETLFEPDEERPEPPRTVVMQGAAGIGKSML
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 ARKMMLDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSL-VTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKP
:.:.:::::.: :.: ::::::::.:::.. .:. :. :::.:: :.:. :.....: :
CCDS62 AHKVMLDWADGKLFQGRFDYLFYINCREMNQSATECSMQDLIFSCWPEPSAPLQELIRVP
230 240 250 260 270 280
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pF1KB3 SRILFLMDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVA
:.::..::::::. .: . :: : :.. . ..::.:::::::::: ::::::::.:
CCDS62 ERLLFIIDGFDELKPSFHDPQGPWCLCWEEKRPTELLLNSLIRKKLLPELSLLITTRPTA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LEKLQHLLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLV
::::..::.:::::::::::::.:::::.::: . :: .:. ...:: ::::::.:::
CCDS62 LEKLHRLLEHPRHVEILGFSEAERKEYFYKYFHNAEQAGQVFNYVRDNEPLFTMCFVPLV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 CWIVCTGLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAA
::.::: :.::.:.: : :::.::::::...: ::.::. :. . . :::::::
CCDS62 CWVVCTCLQQQLEGGGLLRQTSRTTTAVYMLYLLSLMQPKPGAPRLQPPPNQRGLCSLAA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 DGIWNQKILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYY
::.:::::::::.:::.:::. :::::: ::.:::...::..:::::..::::::::::
CCDS62 DGLWNQKILFEEQDLRKHGLDGEDVSAFLNMNIFQKDINCERYYSFIHLSFQEFFAAMYY
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 LLEEEKEGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEK
.:.: . : : :..::: :: .:. :...: .. ::::::.:.: :.:::
CCDS62 ILDEGEGG----AG-----PDQDVTRLLTEYAFSERSFLALTSRFLFGLLNEETRSHLEK
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 KLSCKISQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIE
.: :.: .:...::.::. ::.. .: ..::.: ::::.:::.:.:.:...: :
CCDS62 SLCWKVSPHIKMDLLQWIQSKAQSDGSTLQQGSLEFFSCLYEIQEEEFIQQALSHFQVIV
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700
pF1KB3 I-NLSTRMDHMVSSFCIENCHRVESLSL-GFLHNMPKEEEEEEKEGRHLDMVQ-------
. :....:.:::::::.. :. .. : : : .. :.. . . : : .::
CCDS62 VSNIASKMEHMVSSFCLKRCRSAQVLHLYGATYSADGEDRARCSAGAHTLLVQLPERTVL
640 650 660 670 680 690
710 720
pF1KB3 ------------CVLPSS----------------------SHAACSHG---LVNSHLTSS
:. :. : :. : ...::
CCDS62 LDAYSEHLAAALCTNPNLIELSLYRNALGSRGVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKRCRISSS
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 FCRGLFSVLSTSQSLTELDLSDNSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLSHECCF
:. : ..: ....::..::: :..: ::: .::: :.:: : .. . : .: : :
CCDS62 ACEDLSAALIANKNLTRMDLSGNGVGFPGMMLLCEGLRHPQCRLQMIQLRKCQLESGACQ
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 DISLVLSSNQKLVELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVNSGLTSVCCSALS
... ::..: .::::::. ::: :.:.:::: ::.: .: :. ::: ::.. :. :.
CCDS62 EMASVLGTNPHLVELDLTGNALEDLGLRLLCQGLRHPVCRLRTLWLKICRLTAAACDELA
820 830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDNCNLTSHCCWDLSTLL
:.::.::.: .: : : ::: :. :::::: :: ::::.:.::.:.::.. : .: :
CCDS62 STLSVNQSLRELDLSLNELGDLGVLLLCEGLRHPTCKLQTLRLDSCGLTAKACENLYFTL
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 TSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLLQNLGLSEMYFNYETKSALETLQEEK
.:.: : : :: ::: :: ..:. :.. .: :. : : : .: :.: : .:. :
CCDS62 GINQTLTDLYLTNNALGDTGVRLLCKRLSHPGCKLRVLWLFGMDLNKMTHSRLAALRVTK
940 950 960 970 980 990
970
pF1KB3 PELTVVFEPSW
: : .
CCDS62 PYLDIGC
1000
>>CCDS12864.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1061 aa)
initn: 3664 init1: 1193 opt: 1776 Z-score: 1993.2 bits: 380.4 E(32554): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 2910; 47.4% identity (71.7% similar) in 990 aa overlap (8-948:11-977)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKADHVDLATL
:.:. :::.:: :.:::::..: . : .: :. ::: ...: :
CCDS12 MLRTAGRDGLCRLSTYLEELEAVELKKFKLYL-GTATELGEGKIPWGSMEKAGPLEMAQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 MIDFNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNARVSNPTVICQEDSIEEEW
.: : :.:: .:. : :::.::.:...:. : .: . : .:. ..
CCDS12 LITHFGPEEAWRLALSTFERINRKDLWERGQRE------DLVRDTPPG---GPSSLGNQS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 MGLLEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQCIEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEH
::: .:. .:: .. :: ::: .:. .::::::::: :.:..::::: :.:::
CCDS12 TCLLE----VSLVTPRKDPQETYRDYVRRKFRLMEDRNARLGECVNLSHRYTRLLLVKEH
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RSQQEREQELLAIGK--TKTCESPVSPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTIL
. .. .:.:: :. ..: .::::.: ::.::.:. :: .:::.::::::::..:
CCDS12 SNPMQVQQQLLDTGRGHARTVGHQASPIKIETLFEPDEERPEPPRTVVMQGAAGIGKSML
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 ARKMMLDWASGTLYQDRFDYLFYIHCREVSL-VTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKP
:.:.:::::.: :.: ::::::::.:::.. .:. :. :::.:: :.:. :.....: :
CCDS12 AHKVMLDWADGKLFQGRFDYLFYINCREMNQSATECSMQDLIFSCWPEPSAPLQELIRVP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SRILFLMDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITTRPVA
:.::..::::::. .: . :: : :.. . ..::.:::::::::: ::::::::.:
CCDS12 ERLLFIIDGFDELKPSFHDPQGPWCLCWEEKRPTELLLNSLIRKKLLPELSLLITTRPTA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LEKLQHLLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQENEVLFTMCFIPLV
::::..::.:::::::::::::.:::::.::: . :: .:. ...:: ::::::.:::
CCDS12 LEKLHRLLEHPRHVEILGFSEAERKEYFYKYFHNAEQAGQVFNYVRDNEPLFTMCFVPLV
350 360 370 380 390 400
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pF1KB3 CWIVCTGLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSLLQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAA
::.::: :.::.:.: : :::.::::::...: ::.::. :. . . :::::::
CCDS12 CWVVCTCLQQQLEGGGLLRQTSRTTTAVYMLYLLSLMQPKPGAPRLQPPPNQRGLCSLAA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 DGIWNQKILFEESDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYY
::.:::::::::.:::.:::. :::::: ::.:::...::..:::::..::::::::::
CCDS12 DGLWNQKILFEEQDLRKHGLDGEDVSAFLNMNIFQKDINCERYYSFIHLSFQEFFAAMYY
470 480 490 500 510 520
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pF1KB3 LLEEEKEGRTNVPGSRLKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEK
.:.: . : : :..::: :: .:. :...: .. ::::::.:.: :.:::
CCDS12 ILDEGEGG----AG-----PDQDVTRLLTEYAFSERSFLALTSRFLFGLLNEETRSHLEK
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 KLSCKISQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYFPKIE
.: :.: .:...::.::. ::.. .: ..::.: ::::.:::.:.:.:...: :
CCDS12 SLCWKVSPHIKMDLLQWIQSKAQSDGSTLQQGSLEFFSCLYEIQEEEFIQQALSHFQVIV
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700
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CCDS12 -------MKVMRERTGYTKTYQAHAKQKF-------SRLWSS----KSVTEIHLYFEEEV
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CCDS12 DQVTISEIYQPRGFNESDRLVYFCCFFKDPKRAMEAFNLVRESEQLFSICQIPLLCWILC
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