Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3206
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3206, 795 aa
1>>>pF1KB3206 795 - 795 aa - 795 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5990+/-0.00103; mu= 18.5026+/- 0.062
mean_var=70.4742+/-14.368, 0's: 0 Z-trim(103.9): 196 B-trim: 30 in 2/48
Lambda= 0.152777
statistics sampled from 7442 (7645) to 7442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 4.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 5157 1146.5 0
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 4568 1016.7 0
CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 3962 883.1 0
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 3883 865.7 0
CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 3875 864.0 0
CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 3866 862.0 0
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 3854 859.3 0
CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 3853 859.1 0
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 3852 858.9 0
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 3809 849.4 0
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 3805 848.5 0
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 3794 846.1 0
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 3764 839.5 0
CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 3724 830.7 0
CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 3700 825.4 0
CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 658) 3212 717.8 1.4e-206
CCDS4243.1 PCDHB1 gene_id:29930|Hs108|chr5 ( 818) 2589 580.5 3.7e-165
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 2117 476.5 8.6e-134
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 2109 474.7 2.6e-133
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 2109 474.8 2.9e-133
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2106 474.1 4.1e-133
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2106 474.1 4.6e-133
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2092 471.0 3.5e-132
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 2092 471.0 3.9e-132
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 2075 467.2 4.7e-131
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 2075 467.3 5.3e-131
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2069 465.9 1.3e-130
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2067 465.5 1.7e-130
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2067 465.5 1.8e-130
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2057 463.3 7.7e-130
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 2057 463.3 8.5e-130
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 2055 462.8 1e-129
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 2055 462.8 1.1e-129
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2051 461.9 1.9e-129
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 2051 462.0 2.1e-129
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 2049 461.5 2.5e-129
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 2049 461.5 2.8e-129
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2047 461.1 3.4e-129
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 2047 461.1 3.8e-129
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2046 460.8 4e-129
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 2046 460.9 4.4e-129
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 2034 458.2 2.4e-128
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 2034 458.2 2.8e-128
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2016 454.2 4e-127
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 2016 454.3 4.4e-127
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 2011 453.1 8.3e-127
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 2011 453.2 9.3e-127
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 2002 451.1 3.3e-126
CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 929) 2002 451.2 3.7e-126
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 1996 449.8 8.3e-126
>>CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 (795 aa)
initn: 5157 init1: 5157 opt: 5157 Z-score: 6137.7 bits: 1146.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5157; 100.0% identity (100.0% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPWAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPWAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB3 SEVEENPPFQNNLGF
:::::::::::::::
CCDS42 SEVEENPPFQNNLGF
790
>>CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 (797 aa)
initn: 4568 init1: 4568 opt: 4568 Z-score: 5436.1 bits: 1016.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4568; 88.8% identity (95.3% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
::: :. : :::::::.::::::::::::: .: : ::.::::::::::: :::.: :::
CCDS42 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
::::::::::.:. :::: ::::::: : ::::::::: :::::..::::.:::::::::
CCDS42 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV
:::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS42 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
:.:: ::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
::::::::::: ::::::::.. :::::::::::.:. :::::::::::::::::::::.
CCDS42 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
::: ::::::.:::::::::::::::::::::: :.:.::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
:::::::: :.: ::::::..:::::::.::::::::.::::::::::::::: ::::::
CCDS42 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYYTLETERPLDRESTAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
::::::: :::::::: ::::::::::::.::::::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS42 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA
:::::::::::: :: :::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::::.::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPWAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
:: ::::.::::::::::::::::::::.::::.::::..:.::::::.:::. .. :
CCDS42 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB3 SEVEENPPFQNNLGF
.. ::: :.:..::
CCDS42 KNSEENSTFRNSFGFNF
790
>>CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 (798 aa)
initn: 4157 init1: 3941 opt: 3962 Z-score: 4714.2 bits: 883.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3962; 76.0% identity (90.8% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
:: :: :. ::::.:.::::.:.::.:.... : :: . ::::.:::. ::: : :::
CCDS42 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
:: :::::.:::. :.:: ::.::: : :::.:::::.:::::.:::...:: ::...:
CCDS42 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV
: :.:::::::.::.::.:..: :.. :::.::.:::.::::: :....:::.:::::..
CCDS42 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
:: . : . :::::::.:::::.. :: . :::.::::::.:::.:: . :.:::::.:
CCDS42 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
:: :..:::.. :. ::: ..:.:: :::.:. ...:::: ::::::::::::: ::.
CCDS42 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
..: .:::::.:.::.: ::::::::: :: :. ..:::.::: ::.:.::::. ::::.
CCDS42 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::.: .: : :.::::::.:.::: ...:: :: . .:..:: .:. :::::.::::::
CCDS42 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
370 380 390 400 410 420
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:::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::.::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG
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790
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.. : :.:..:.
CCDS42 RNMGEIENFRNSFGLNIQ
790
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.::.:.::..: . : :.. :::::: : :::::::: ::::: ::.:...: :... :
CCDS42 ARGTRIVSDQNMQILLLSSLTGDLLLNEKLDREELCGPREPCVLPFQLLLEKPFQIFRAE
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... . .. ::::::...:: :: ::.:. ::::::::::::::::::..:.:.:::.:
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:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::::
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CCDS42 REVEENRPFQNNLGF
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CCDS42 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE
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CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB3 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
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pF1KB3 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
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CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE
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790
pF1KB3 SEVEENPPFQNNLGF
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CCDS42 RVSEANPSFRKSFEFS
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CCDS42 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELA
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CCDS42 SRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGE
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CCDS42 LLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHI
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CCDS42 LTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAP
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CCDS42 EFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
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CCDS42 ILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENA
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
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CCDS42 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
:.:::::::::::..:::: ::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS42 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::.:.::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPA
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:::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
540 550 560 570 580 590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB3 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
660 670 680 690 700 710
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pF1KB3 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
::::::::::::::::::::::::::::.::::.:: : ...:::::::.::.: :.::
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTG
720 730 740 750 760 770
790
pF1KB3 SEVEENPPFQNNLGF
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CCDS42 REVKENPKFRNSLVFS
780 790
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pF1KB3 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
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CCDS42 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
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CCDS42 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
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CCDS42 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV
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pF1KB3 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
. :.::::::::::::: :::::::. :::::::.::::::. .:.::.: :::.:
CCDS42 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
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CCDS42 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDE-VTQPFVIDEKTAE
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CCDS42 EEIGKTAAFRNSFGLN
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CCDS42 ELAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFF
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CCDS42 QAELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFH
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CCDS42 NVPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAK
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CCDS42 SGELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIP
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CCDS42 ENLQDTLIAVFSVSDPDSGDNGRMVCSIQDDLPFFLKPSVENFYTLVISTALDRETRSEY
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CCDS42 GAERVSEANPSFRKSFEFT
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CCDS42 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
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CCDS42 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
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CCDS42 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
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CCDS42 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
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CCDS42 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTTFPLKNAEDLDVGQNNIENYIISPNSYFR
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CCDS42 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVLDVNDNA
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CCDS42 PEFEQPFYRVQISEDSPVGFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASEEIGKTFKINPLTG
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CCDS42 EIELKKQLDFEKLQSYEVNIEARDAGTFSGKCTVLIQVIDVNDHAPEVTMSAFTSPIPEN
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CCDS42 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLKSA-ENFYTLLTERPLDRESRAEYNI
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CCDS42 TITVTDLGTPMLITQLNMTVLIADVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIRSVSATDRD
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pF1KB3 GSEVEENPPFQNNLGF
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CCDS42 GKEIQGNSTFPNNFGFNIQ
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795 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]