FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3200, 679 aa
1>>>pF1KB3200 679 - 679 aa - 679 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9772+/-0.00122; mu= 16.9763+/- 0.073
mean_var=99.8421+/-19.944, 0's: 0 Z-trim(103.9): 42 B-trim: 59 in 1/48
Lambda= 0.128356
statistics sampled from 7616 (7641) to 7616 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 ( 679) 4326 812.5 0
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 ( 654) 2010 383.6 4.9e-106
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 646) 1932 369.1 1.1e-101
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 ( 639) 1923 367.5 3.4e-101
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 ( 641) 1910 365.1 1.8e-100
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 ( 641) 1910 365.1 1.8e-100
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 ( 643) 1906 364.3 3.1e-100
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 ( 641) 1881 359.7 7.5e-99
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 493) 1609 309.2 9e-84
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 509) 856 169.8 8.7e-42
CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 814) 789 157.5 6.8e-38
CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 858) 789 157.6 7e-38
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 839) 753 150.9 7e-36
CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 860) 721 145.0 4.3e-34
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 ( 840) 717 144.2 7.1e-34
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 813) 685 138.3 4.2e-32
CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs108|chr21 ( 471) 649 131.4 2.8e-30
CCDS8408.1 HYOU1 gene_id:10525|Hs108|chr11 ( 999) 366 79.3 3e-14
CCDS73559.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 782) 361 78.3 4.7e-14
>>CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 (679 aa)
initn: 4326 init1: 4326 opt: 4326 Z-score: 4334.7 bits: 812.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4326; 100.0% identity (100.0% similar) in 679 aa overlap (1-679:1-679)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MISASRAAAARLVGAAASRGPTAARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MISASRAAAARLVGAAASRGPTAARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 YLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 AVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 DNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AAIQGGVLAGDVTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AAIQGGVLAGDVTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 QVEIKVCQGEREMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QVEIKVCQGEREMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 REQQIVIQSSGGLSKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKKERVEAVNMAEGIIHDTETKMEEFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 REQQIVIQSSGGLSKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKKERVEAVNMAEGIIHDTETKMEEFK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DQLPADECNKLKEEISKMRELLARKDSETGENIRQAASSLQQASLKLFEMAYKKMASERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DQLPADECNKLKEEISKMRELLARKDSETGENIRQAASSLQQASLKLFEMAYKKMASERE
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB3 GSGSSGTGEQKEDQKEEKQ
:::::::::::::::::::
CCDS42 GSGSSGTGEQKEDQKEEKQ
670
>>CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 (654 aa)
initn: 1029 init1: 682 opt: 2010 Z-score: 2017.1 bits: 383.6 E(32554): 4.9e-106
Smith-Waterman score: 2010; 52.0% identity (77.3% similar) in 635 aa overlap (53-677:28-653)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 AARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAE
:.::::::::: :::.:... ..... : .
CCDS68 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQ
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 GARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPF
: : ::: :::: .::::.: :: : ..::.:: . .:::::: ..:: ::.::: .::
CCDS68 GNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPF
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 KIV-RASNGDAWVEAHG---KLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFN
:.: . .. :. : : ..: .:.:.:: ::::::: :::. . .::.:::::::
CCDS68 KVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFN
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 DSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSE-DKVIAVYDLGGGTFDISILEI
:.::::::::: :.::::.:.::::::::.:::::: : .: : :.::::::::.:.: :
CCDS68 DAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTI
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 QKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKC
..::::: .::::: :::::::: ...:..: .:..:: :. ::: :.:..:. .::::
CCDS68 DNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKR
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 ELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSK
:::. :. :.. . . .. ::::.:: . ::.: :. : ::...:....:
CCDS68 ALSSQHQARIEIESFYEG----EDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKK
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 SDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLF-GRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGD--VTD
::: :..:::: ::.::.:: :...: :. ::...::::::: :::.:.:::.:: . :
CCDS68 SDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGD
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 VLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQGEREMA
..:::: ::.:::::.:::.:::: :::..::::::.::::.:.: : ::: .::: ..
CCDS68 LVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLT
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 GDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTGREQQIVIQSSGG-L
::.::: : : ::::::::::::::::.::.:::..:.:.::::: ...:.: .. . :
CCDS68 KDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRL
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 SKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKKERVEAVNMAEGIIHDTETKMEEFKDQLPADECNKLKE
. ..:: ::..:::.::::.. :::... : :. .. .... . :..: . .. ::
CCDS68 TPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGD-KEKLGGKLSSEDKE
540 550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 EISKMRELLARKDSETGENIRQAASSLQQASLKLFEMAYKKMASEREGS-GSSGTGEQKE
. : : . : :. ..: .:. : .: . . :. :: : :::.
CCDS68 TMEKAVE----EKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDT
600 610 620 630 640
pF1KB3 DQKEEKQ
.:.:
CCDS68 AEKDEL
650
>>CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 (646 aa)
initn: 1777 init1: 539 opt: 1932 Z-score: 1939.1 bits: 369.1 E(32554): 1.1e-101
Smith-Waterman score: 1932; 50.6% identity (76.7% similar) in 632 aa overlap (52-668:3-629)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 TAARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENA
:: .:::::::: :::.:.. ..... :
CCDS84 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIAND
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 EGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVP
.: ::::: :::: : :::.: :: :.. ::.:: . .:::::::.:: ::.:.:. :
CCDS84 QGNRTTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWP
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KB3 FKIVR-ASNGDAWVEAHG--KLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFN
: .: :. . :: .: : . : .....:: :::: :: :::.:. :::.:::::::
CCDS84 FMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFN
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 DSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKS--EDKVIAVYDLGGGTFDISILE
::::::::::: :.::::::.::::::::.::::::. .. . ..::::::::.:::
CCDS84 DSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 IQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAK
:. :.:::::: ::: :::::::. .. :.. ::::. :..... :..:.: : :.::
CCDS84 IEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAK
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 CELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVS
::::.:..:.. : . . ..:::.:: . .::.: :. : .::..::...
CCDS84 RTLSSSTQASIEIDSLYEGID----FYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLD
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 KSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLF-GRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGD----
::.: ...:::: ::.::.:. .::.: :. .:..::::::: :::.:...:.::
CCDS84 KSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSEN
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 VTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQGER
: :.:::::::::::::: :::.: ::.::::::::..:.:.: .:.: : :.: .:::
CCDS84 VQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGER
390 400 410 420 430 440
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pF1KB3 EMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTGREQQIVIQSSG
:. ::.:::.: : :::::::::::::::::::::::..::: ::.::.:..:.: ..
CCDS84 AMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDK
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 G-LSKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKKERVEAVNMAEGIIHDTETKMEEFKDQLPADECNK
: :::.::: ::..:::: ::......: . : :. . .. .:. : : .. .:
CCDS84 GRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDK
510 520 530 540 550 560
620 630 640 650 660
pF1KB3 LK--EEISKMRELLARKDSETGENIRQAASSLQQASLKLFEMAYKKMASEREG--SGSSG
: .. ... . : .... :.... . :... .. :.. .. : .: :
CCDS84 QKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPG
570 580 590 600 610 620
670
pF1KB3 TGEQKEDQKEEKQ
:
CCDS84 GGAPPSGGASSGPTIEEVD
630 640
>>CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 (639 aa)
initn: 1238 init1: 540 opt: 1923 Z-score: 1930.2 bits: 367.5 E(32554): 3.4e-101
Smith-Waterman score: 1923; 49.3% identity (76.8% similar) in 641 aa overlap (52-677:4-637)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 TAARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENA
.: ..::::::: :::.:.. ..... :
CCDS97 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIAND
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 EGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVP
.: ::::: :::: : :::.: :: :.. ::.::.. .::::::...: ::.:.:. :
CCDS97 QGNRTTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWP
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KB3 FKIV-RASNGDAWVEAHG--KLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFN
:..: .... . :: .: : . : .:...:: :::: :: ::: ...::::::::::
CCDS97 FRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFN
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 DSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSE----DKVIAVYDLGGGTFDISI
::::::::::: :.::::::.::::::::.::::::. .: . ..::::::::.::
CCDS97 DSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSI
160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 LEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEK
: :. :.:::::: ::: :::::::. .. :...::::. :. .. :..:.: : :.
CCDS97 LTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACER
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 AKCELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAE
:: ::::.:..:.. : . . ..:::.:: . .::.: :. : .::..::.
CCDS97 AKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVD----FYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAK
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLF-GRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGD--
..:..: :..:::: ::.::.:. .::.: :. .:..::::::: :::.:...: ::
CCDS97 LDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKS
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480
pF1KB3 --VTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQG
: :.:::::::::::::: :::.: ::.::::::::..:.:.: .:.:..: ..: .:
CCDS97 ENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEG
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EREMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTGREQQIVIQS
:: :. ::.:::.: : :::::::::::::::::::::::..:.: ::.::.:..:.: .
CCDS97 ERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITN
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SGG-LSKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKKERVEAVNMAEGIIHDTETKMEE--FKDQLPAD
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CCDS34 KAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEK
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CCDS34 VQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGER
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CCDS34 AMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKVNKITITNDK
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pF1KB3 NKLKEEISKMRELLARKDSETGENIRQAASSLQQASLKLFEMAYKKMASEREGSGSSGTG
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CCDS34 NKI---LDKCNELLSWLEVNQLAEKDEFDHKRKELEQMCNPIITKLYQGGCTGPACGTGY
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CCDS44 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIAND
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CCDS44 FMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFN
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