Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3144
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3144, 575 aa
1>>>pF1KB3144 575 - 575 aa - 575 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7423+/-0.000819; mu= 0.4773+/- 0.049
mean_var=222.9676+/-45.971, 0's: 0 Z-trim(116.0): 23 B-trim: 623 in 1/53
Lambda= 0.085892
statistics sampled from 16563 (16585) to 16563 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.509), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14315.3 TFE3 gene_id:7030|Hs108|chrX ( 575) 3711 472.3 7.4e-133
CCDS64425.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 ( 490) 1126 151.9 1.7e-36
CCDS4858.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 ( 476) 1109 149.8 7.2e-36
CCDS43106.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 520) 1018 138.5 1.9e-32
CCDS54607.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 468) 940 128.8 1.4e-29
CCDS46865.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 504) 940 128.9 1.5e-29
CCDS43107.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 413) 918 126.1 8.6e-29
CCDS46866.2 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 357) 915 125.7 9.8e-29
CCDS2913.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 419) 893 123.0 7.4e-28
CCDS5762.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 ( 347) 772 108.0 2.1e-23
CCDS64424.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 ( 391) 737 103.6 4.6e-22
CCDS59076.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 ( 280) 688 97.5 2.3e-20
CCDS34738.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 ( 318) 688 97.5 2.6e-20
>>CCDS14315.3 TFE3 gene_id:7030|Hs108|chrX (575 aa)
initn: 3711 init1: 3711 opt: 3711 Z-score: 2498.7 bits: 472.3 E(32554): 7.4e-133
Smith-Waterman score: 3711; 100.0% identity (100.0% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSHAAEPARDGVEASAEGPRAVFVLLEERRPADSAQLLSLNSLLPESGIVADIELENVLD
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CCDS14 MSHAAEPARDGVEASAEGPRAVFVLLEERRPADSAQLLSLNSLLPESGIVADIELENVLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PDSFYELKSQPLPLRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDSFYELKSQPLPLRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 MRAQAQEQERRERREQAAAAPFPSPAPASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MRAQAQEQERRERREQAAAAPFPSPAPASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 THLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPASAQPLPAPEAAHTTGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 THLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPASAQPLPAPEAAHTTGPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQAN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFHVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFHVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEEGVVGGLSGGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEEGVVGGLSGGA
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB3 LSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
550 560 570
>>CCDS64425.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 (490 aa)
initn: 1059 init1: 553 opt: 1126 Z-score: 768.6 bits: 151.9 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1220; 46.0% identity (69.7% similar) in 511 aa overlap (97-573:2-486)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LKSQPLPLRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQ
.:... :: ... .::. ::.:::: :::
CCDS64 MTASSGWEPAPAATMASRIGLRMQLMREQAQ
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EQERRERREQAAAAPFPSPAPASPAISVVG-----VSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQT
..:.::: .: :. . . . .. : ... : : ::: :: ::::::.
CCDS64 QEEQRERMQQQAVMHYMQQQQQQQQQQLGGPPTPAINTPVHFQS-PPP--VPGEVLKVQS
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230
pF1KB3 HLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPASAQPLPAP--EAAH--TT
.::::: :::::...:.:..::: : : :.:.. ..: : . : .: .:.: ..
CCDS64 YLENPTSYHLQQSQHQKVREYLSETYGNKFAAH-ISPAQGSPKPPPAASPGVRAGHVLSS
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 GPTGSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLP
. .::::::::.: :::. :.:.:::::.:. : :..:.:. . .:.:.:::
CCDS64 SAGNSAPNSPMAMLHIGSNPERELDDVIDNIMRL-----DDVLGYI---NPEMQMPNTLP
150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 VSGNLLDVYSSQGVATPAIT--VSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIE
.:.. :.::::. .: ... .:.::::.: . :::....:..:: :::::::::::::
CCDS64 LSSSHLNVYSSDPQVTASLVGVTSSSCPADLTQ-KRELTDAESRALAKERQKKDNHNLIE
200 210 220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 RRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRS
::::::::::::::: ::::..: ..::::::::::::::::..::. :.:..::...:
CCDS64 RRRRFNINDRIKELGMLIPKANDLDVRWNKGTILKASVDYIRRMQKDLQKSRELENHSRR
260 270 280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 LEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAA
::..:..: :::::::.::..::::. .:. ...: :.. .: : . ::: :: :
CCDS64 LEMTNKQLWLRIQELEMQARVHGLPTT-SPSGMNMAEL-AQQVVKQELPS--EEG-PGEA
320 330 340 350 360 370
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFHVGGGPAQNAPHQQPPAPPSDAL-LDLHFPSD-HLGDLGDPFHLGLEDILMEEEEGVV
. : :. : ::. : : . :: : :.. . .: .:.::
CCDS64 LML---GAEVPDPEPLPALPPQAPLPLPTQPPSPFHHLDFSHSLSFG-----GREDEGPP
380 390 400 410 420
540 550 560 570
pF1KB3 G---GLSGGALSP------------------LRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSME
: :. : :: : :::::::..:: .:::::::::::::
CCDS64 GYPEPLAPGHGSPFPSLSKKDLDLMLLDDSLLPLASDPLLSTMSPEASKASSRRSSFSME
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EES
:
CCDS64 EGDVL
490
>>CCDS4858.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 (476 aa)
initn: 1051 init1: 553 opt: 1109 Z-score: 757.4 bits: 149.8 E(32554): 7.2e-36
Smith-Waterman score: 1203; 46.8% identity (69.1% similar) in 502 aa overlap (111-573:2-472)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 SLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQEQERRERREQAAAA
.::. ::.:::: :::..:.::: .: :.
CCDS48 MASRIGLRMQLMREQAQQEEQRERMQQQAVM
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB3 PFPSP----------APASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYH
. . .: .:::.. : : ::: :: ::::::..::::: ::
CCDS48 HYMQQQQQQQQQQLGGPPTPAINT-----PVHFQS-PPP--VPGEVLKVQSYLENPTSYH
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240
pF1KB3 LQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPASAQPLPAP--EAAH--TTGPTGSAPNS
:::...:.:..::: : : :.:.. ..: : . : .: .:.: ... .:::::
CCDS48 LQQSQHQKVREYLSETYGNKFAAH-ISPAQGSPKPPPAASPGVRAGHVLSSSAGNSAPNS
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSGNLLDVY
:::.: :::. :.:.:::::.:. : :..:.:. . .:.:.:::.:.. :.::
CCDS48 PMAMLHIGSNPERELDDVIDNIMRL-----DDVLGYI---NPEMQMPNTLPLSSSHLNVY
150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SSQGVATPAIT--VSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNIND
::. .: ... .:.::::.: . :::....:..:: ::::::::::::::::::::::
CCDS48 SSDPQVTASLVGVTSSSCPADLTQ-KRELTDAESRALAKERQKKDNHNLIERRRRFNIND
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQ
:::::: ::::..: ..::::::::::::::::..::. :.:..::...: ::..:..:
CCDS48 RIKELGMLIPKANDLDVRWNKGTILKASVDYIRRMQKDLQKSRELENHSRRLEMTNKQLW
260 270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFHVGGGPA
:::::::.::..::::. .:. ...: :.. .: : . ::: :: : . :
CCDS48 LRIQELEMQARVHGLPTT-SPSGMNMAEL-AQQVVKQELPS--EEG-PGEALML---GAE
320 330 340 350 360
490 500 510 520 530
pF1KB3 QNAPHQQPPAPPSDAL-LDLHFPSD-HLGDLGDPFHLGLEDILMEEEEGVVG---GLSGG
:. : ::. : : . :: : :.. . .: .:.:: : :. :
CCDS48 VPDPEPLPALPPQAPLPLPTQPPSPFHHLDFSHSLSFG-----GREDEGPPGYPEPLAPG
370 380 390 400 410 420
540 550 560 570
pF1KB3 ALSP------------------LRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
:: : :::::::..:: .::::::::::::::
CCDS48 HGSPFPSLSKKDLDLMLLDDSLLPLASDPLLSTMSPEASKASSRRSSFSMEEGDVL
430 440 450 460 470
>>CCDS43106.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (520 aa)
initn: 1398 init1: 824 opt: 1018 Z-score: 695.9 bits: 138.5 E(32554): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1476; 50.4% identity (69.0% similar) in 564 aa overlap (46-573:4-515)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 AEGPRAVFVLLEERRPADSAQLLSLNSLLPESGIVADIELENVL--DPDSFYELKSQPLP
::::: :.:. . . .: ..:::::::
CCDS43 MQSESGIVPDFEVGEEFHEEPKTYYELKSQP--
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 LRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQEQERRER
:.:: :.. :.:. : ::: .::.:::::::: : :::::::.
CCDS43 LKSS---------------SSAEHPGASKPPISSSSMTSRILLRQQLMREQMQEQERREQ
40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 REQAAAAPFPS---PAPASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYH
... :: : . :. .:::.: .: . :: : .::: :::::::::::::.::
CCDS43 QQKLQAAQFMQQRVPVSQTPAINV-SVPT---TL--PSATQVPMEVLKVQTHLENPTKYH
80 90 100 110 120 130
200 210 220 230 240
pF1KB3 LQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPP-PGPASAQPLPAPEAAHTTGPTGSAPNSPMA
.:::.::::::::::::. : :.:.:. : :. . . .: : : .::::::::
CCDS43 IQQAQRQQVKQYLSTTLANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMP-PV------PGSSAPNSPMA
140 150 160 170 180
250 260 270 280
pF1KB3 LLTIGSSSEKE----------------------------IDDVIDEIISLESSYNDEMLS
.::..:. ::: .:::::.:::::::::.:.:.
CCDS43 MLTLNSNCEKEGFYKFEEQNRAESECPGMNTHSRASCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILG
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 YLPGGTTGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKAL
. .::. .::::::::.:.:..::. :..:.::::::.:::::::..:.::.::
CCDS43 LMD---PALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTESEARAL
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::.
CCDS43 AKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQR
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 EQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKP
::::.:.::.::..::.::: : :::::::.::. ::: . :. :: : .. . .:
CCDS43 EQQRAKELENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRIIKQEP
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 EQLDIEEEGRPGAATFHVGGGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLG-
. :. :. . . . .. .: .. . : ..:
CCDS43 ----VLENCSQDLLQHHADLTCTTTLDLTDGTITFNN---NLGTGTEANQAYSVPTKMGS
430 440 450 460 470
530 540 550 560 570
pF1KB3 -LEDILMEEEEGVVGGLSGGALSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
::::::.. .:::. ...:::::::::..::.::::::.::::
CCDS43 KLEDILMDD-----------TLSPV-GVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEETEHTC
480 490 500 510 520
>>CCDS54607.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (468 aa)
initn: 1392 init1: 824 opt: 940 Z-score: 644.3 bits: 128.8 E(32554): 1.4e-29
Smith-Waterman score: 1385; 52.1% identity (70.8% similar) in 497 aa overlap (111-573:2-463)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 SLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQEQERRERREQAAAA
.::.:::::::: : :::::::.... ::
CCDS54 MTSRILLRQQLMREQMQEQERREQQQKLQAA
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB3 PFPS---PAPASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQ
: . :. .:::.: .: . :: : .::: :::::::::::::.::.:::.::
CCDS54 QFMQQRVPVSQTPAINV-SVPT---TL--PSATQVPMEVLKVQTHLENPTKYHIQQAQRQ
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 QVKQYLSTTLGPKLASQALTPP-PGPASAQPLPAPEAAHTTGPTGSAPNSPMALLTIGSS
::::::::::. : :.:.:. : :. . . .: : : .::::::::.::..:.
CCDS54 QVKQYLSTTLANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMP-PV------PGSSAPNSPMAMLTLNSN
90 100 110 120 130
260 270 280
pF1KB3 SEKE----------------------------IDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTT
::: .:::::.:::::::::.:.:. .
CCDS54 CEKEGFYKFEEQNRAESECPGMNTHSRASCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLM---DP
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 GLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKK
.::. .::::::::.:.:..::. :..:.::::::.:::::::..:.::.:: ::::::
CCDS54 ALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTESEARALAKERQKK
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 DNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKD
::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::.::::.:.
CCDS54 DNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKE
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 LESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEE
::.::..::.::: : :::::::.::. ::: . :. :: : .. . .: . :
CCDS54 LENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRIIKQEP----VLE
320 330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 EGRPGAATFHVGGGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLG--LEDILM
. :. . . . .. .: .. . : ..: ::::::
CCDS54 NCSQDLLQHHADLTCTTTLDLTDGTITFNN---NLGTGTEANQAYSVPTKMGSKLEDILM
380 390 400 410 420
530 540 550 560 570
pF1KB3 EEEEGVVGGLSGGALSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
.. .:::. ...:::::::::..::.::::::.::::
CCDS54 DD-----------TLSPV-GVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEETEHTC
430 440 450 460
>>CCDS46865.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (504 aa)
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Smith-Waterman score: 1429; 51.7% identity (70.5% similar) in 516 aa overlap (92-573:19-499)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DSFYELKSQPLPLRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLM
::.. :.:. : ::: .::.:::::::
CCDS46 MEALRVQMFMPCSFESLYLSSAEHPGASKPPISSSSMTSRILLRQQLM
10 20 30 40
130 140 150 160 170
pF1KB3 RAQAQEQERRERREQAAAAPFPS---PAPASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLK
: : :::::::.... :: : . :. .:::.: .: . :: : .::: ::::
CCDS46 REQMQEQERREQQQKLQAAQFMQQRVPVSQTPAINV-SVPT---TL--PSATQVPMEVLK
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 VQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPP-PGPASAQPLPAPEAAHTT
:::::::::.::.:::.::::::::::::. : :.:.:. : :. . . .: :
CCDS46 VQTHLENPTKYHIQQAQRQQVKQYLSTTLANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMP-PV-----
110 120 130 140 150
240 250 260
pF1KB3 GPTGSAPNSPMALLTIGSSSEKE----------------------------IDDVIDEII
: .::::::::.::..:. ::: .:::::.::
CCDS46 -PGSSAPNSPMAMLTLNSNCEKEGFYKFEEQNRAESECPGMNTHSRASCMQMDDVIDDII
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 SLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNI
:::::::.:.:. . .::. .::::::::.:.:..::. :..:.::::::.::::
CCDS46 SLESSYNEEILGLM---DPALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNI
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 KREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTIL
:::..:.::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::
CCDS46 KRELTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTIL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 KASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLS
:::::::::::.::::.:.::.::..::.::: : :::::::.::. ::: . :. :: :
CCDS46 KASVDYIRKLQREQQRAKELENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCS
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 LATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFHVGGGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDH
.. . .: . :. :. . . . .. .: ..
CCDS46 PDLVNRIIKQEP----VLENCSQDLLQHHADLTCTTTLDLTDGTITFNN---NLGTGTEA
400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 LGDLGDPFHLG--LEDILMEEEEGVVGGLSGGALSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRS
. : ..: ::::::.. .:::. ...:::::::::..::.:::::
CCDS46 NQAYSVPTKMGSKLEDILMDD-----------TLSPV-GVTDPLLSSVSPGASKTSSRRS
450 460 470 480 490
570
pF1KB3 SFSMEEES
:.::::
CCDS46 SMSMEETEHTC
500
>>CCDS43107.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (413 aa)
initn: 1337 init1: 824 opt: 918 Z-score: 630.4 bits: 126.1 E(32554): 8.6e-29
Smith-Waterman score: 1209; 52.0% identity (71.0% similar) in 427 aa overlap (178-573:11-408)
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 ASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTL
.:::::::::.::.:::.::::::::::::
CCDS43 MLEMLEYNHYQVQTHLENPTKYHIQQAQRQQVKQYLSTTL
10 20 30 40
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 GPKLASQALTPP-PGPASAQPLPAPEAAHTTGPTGSAPNSPMALLTIGSSSEKE------
. : :.:.:. : :. . . .: : : .::::::::.::..:. :::
CCDS43 ANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMP-PV------PGSSAPNSPMAMLTLNSNCEKEGFYKFE
50 60 70 80 90
270 280 290
pF1KB3 ----------------------IDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPV
.:::::.:::::::::.:.:. . .::. .::::
CCDS43 EQNRAESECPGMNTHSRASCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLMD---PALQMANTLPV
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SGNLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRR
::::.:.:..::. :..:.::::::.:::::::..:.::.:: ::::::::::::::::
CCDS43 SGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTESEARALAKERQKKDNHNLIERRR
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 RFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQ
::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::.::::.:.::.::..::.
CCDS43 RFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKELENRQKKLEH
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 ANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFH
::: : :::::::.::. ::: . :. :: : .. . .: . :. :
CCDS43 ANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRIIKQEP----VLENCSQDLLQHH
280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 VGGGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLG--LEDILMEEEEGVVGGL
. . . . .. .: .. . : ..: ::::::..
CCDS43 ADLTCTTTLDLTDGTITFNN---NLGTGTEANQAYSVPTKMGSKLEDILMDD--------
330 340 350 360 370
540 550 560 570
pF1KB3 SGGALSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
.:::. ...:::::::::..::.::::::.::::
CCDS43 ---TLSPV-GVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEETEHTC
380 390 400 410
>>CCDS46866.2 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (357 aa)
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Smith-Waterman score: 1039; 49.0% identity (68.1% similar) in 398 aa overlap (178-573:11-352)
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 ASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTL
.:::::::::.::.:::.::: .
CCDS46 MLEMLEYNHYQVQTHLENPTKYHIQQAQRQQGFYKFEEQ-
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 GPKLASQALTPPPGPASAQPLPAPEAAHTTGPTGSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDE
..: . :: . :. .: ..:::::.
CCDS46 -----NRAESECPGMNT----------HSR------------------ASCMQMDDVIDD
40 50 60
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 IISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELP
:::::::::.:.:. . .::. .::::::::.:.:..::. :..:.::::::.::
CCDS46 IISLESSYNEEILGLMD---PALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLP
70 80 90 100 110 120
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 NIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGT
:::::..:.::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS46 NIKRELTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGT
130 140 150 160 170 180
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 ILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGL
:::::::::::::.::::.:.::.::..::.::: : :::::::.::. ::: . :. ::
CCDS46 ILKASVDYIRKLQREQQRAKELENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGL
190 200 210 220 230 240
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 LSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFHVGGGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPS
: .. . .: . :. :. . . . .. .: .
CCDS46 CSPDLVNRIIKQEP----VLENCSQDLLQHHADLTCTTTLDLTDGTITFNN---NLGTGT
250 260 270 280 290
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 DHLGDLGDPFHLG--LEDILMEEEEGVVGGLSGGALSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSR
. . : ..: ::::::.. .:::. ...:::::::::..::.:::
CCDS46 EANQAYSVPTKMGSKLEDILMDD-----------TLSPV-GVTDPLLSSVSPGASKTSSR
300 310 320 330 340
570
pF1KB3 RSSFSMEEES
:::.::::
CCDS46 RSSMSMEETEHTC
350
>>CCDS2913.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (419 aa)
initn: 1313 init1: 601 opt: 893 Z-score: 613.6 bits: 123.0 E(32554): 7.4e-28
Smith-Waterman score: 1187; 51.3% identity (70.0% similar) in 433 aa overlap (178-573:11-414)
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 ASPAISVVGVSAGGHTLSRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTL
.:::::::::.::.:::.::::::::::::
CCDS29 MLEMLEYNHYQVQTHLENPTKYHIQQAQRQQVKQYLSTTL
10 20 30 40
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 GPKLASQALTPP-PGPASAQPLPAPEAAHTTGPTGSAPNSPMALLTIGSSSEKE------
. : :.:.:. : :. . . .: : : .::::::::.::..:. :::
CCDS29 ANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMP-PV------PGSSAPNSPMAMLTLNSNCEKEGFYKFE
50 60 70 80 90
270 280 290
pF1KB3 ----------------------IDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPV
.:::::.:::::::::.:.:. . .::. .::::
CCDS29 EQNRAESECPGMNTHSRASCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLMD---PALQMANTLPV
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SGNLLDVYSSQGVATPAITVSNSCPAELPNIKREIS------ETEAKALLKERQKKDNHN
::::.:.:..::. :..:.::::::.:::::::.. :.::.:: ::::::::::
CCDS29 SGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHN
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESR
::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::.::::.:.::.:
CCDS29 LIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKELENR
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 QRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRP
:..::.::: : :::::::.::. ::: . :. :: : .. . .: . :.
CCDS29 QKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRIIKQEP----VLENCSQ
280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 GAATFHVGGGPAQNAPHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLG--LEDILMEEEE
:. . . . .. .: .. . : ..: ::::::..
CCDS29 DLLQHHADLTCTTTLDLTDGTITFNN---NLGTGTEANQAYSVPTKMGSKLEDILMDD--
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570
pF1KB3 GVVGGLSGGALSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
.:::. ...:::::::::..::.::::::.::::
CCDS29 ---------TLSPV-GVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEETEHTC
390 400 410
>>CCDS5762.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 (347 aa)
initn: 794 init1: 614 opt: 772 Z-score: 533.8 bits: 108.0 E(32554): 2.1e-23
Smith-Waterman score: 873; 46.9% identity (70.3% similar) in 360 aa overlap (222-573:17-343)
200 210 220 230 240
pF1KB3 QQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPASAQPLPAPEAAHTT--GPTGSAPNSPMA
:: . : . :::: . .: . :
CCDS57 MTLDHQIINPTLKWSQPAVPSGGPLVQHAHTTLDSDAGLTENPLTK
10 20 30 40
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LLTIGSSSEK---EIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSGNLLDVY
::.::. ... ...:::..::..:::...: :. . : . :: ::..::::
CCDS57 LLAIGKEDDNAQWHMEDVIEDIIGMESSFKEE------GADSPLLMQRTL--SGSILDVY
50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SS-QGVATPAITV-SNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNIND
:. ::.. . . : :::. :: .::::.::...:: :::::::::::::::::.:::
CCDS57 SGEQGISPINMGLTSASCPSSLP-MKREITETDTRALAKERQKKDNHNLIERRRRYNINY
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQ
::::::::::::.::.:::::::::::::.::. :::::::...:: ::..:::::: :
CCDS57 RIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVEYIKWLQKEQQRARELEHRQKKLEQANRRLL
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDIEEEGRPGAATFHVGGGPA
:::::::.::. ::::. . : ..:.. .... .::: ...
CCDS57 LRIQELEIQARTHGLPTLASLGTVDLGAHVTKQQSHPEQNSVDY---------------C
220 230 240 250 260
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pF1KB3 QNAPHQQPPAPP-SDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEEGVVGGLSGGALSP
:. .: :.: : . . : ... ::. : .:. ::. . : : ..::
CCDS57 QQLTVSQGPSPELCDQAIAFSDPLSYFTDLS--FSAALK-----EEQRLDGMLLDDTISP
270 280 290 300 310
550 560 570
pF1KB3 LRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES
. ..:::::..:::::: :::::::: ..
CCDS57 F--GTDPLLSATSPAVSKESSRRSSFSSDDGDEL
320 330 340
575 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 00:11:12 2016 done: Sat Nov 5 00:11:13 2016
Total Scan time: 3.140 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]