Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3125
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3125, 594 aa
1>>>pF1KB3125 594 - 594 aa - 594 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9379+/-0.000988; mu= 14.9495+/- 0.060
mean_var=61.9481+/-12.512, 0's: 0 Z-trim(103.6): 24 B-trim: 9 in 1/47
Lambda= 0.162952
statistics sampled from 7466 (7487) to 7466 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2239.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 ( 594) 3997 948.6 0
CCDS7149.1 GAD2 gene_id:2572|Hs108|chr10 ( 585) 2618 624.4 1.2e-178
CCDS58235.1 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 ( 493) 1781 427.6 1.8e-119
CCDS8848.2 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 ( 520) 1781 427.6 1.9e-119
CCDS2649.2 GADL1 gene_id:339896|Hs108|chr3 ( 521) 1732 416.1 5.5e-116
CCDS2240.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 ( 224) 1409 340.1 1.7e-93
CCDS5511.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 480) 453 115.4 1.6e-25
CCDS56485.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 402) 443 113.1 7.1e-25
CCDS75598.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 442) 439 112.1 1.5e-24
CCDS10134.1 HDC gene_id:3067|Hs108|chr15 ( 662) 416 106.8 9.4e-23
CCDS56487.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 338) 362 94.0 3.2e-19
CCDS76754.1 HDC gene_id:3067|Hs108|chr15 ( 629) 354 92.2 2.2e-18
CCDS75599.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 432) 350 91.2 2.9e-18
CCDS56486.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 387) 336 87.9 2.6e-17
>>CCDS2239.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 (594 aa)
initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997 Z-score: 5072.6 bits: 948.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
550 560 570 580 590
>>CCDS7149.1 GAD2 gene_id:2572|Hs108|chr10 (585 aa)
initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618 Z-score: 3320.7 bits: 624.4 E(32554): 1.2e-178
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (4-594:2-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
..:.:. : .. : . . : : .:: ::. : .: :.:..: .. :.
CCDS71 MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
.. .. : .... .: ... ....... : : ::::: .::. :. :: .:
CCDS71 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
..:::.:: :.:::::::.:::.:..::. .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
CCDS71 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
.:::::.:::::::::..:::..:::::::::::::::::::::.: .::::::::.::
CCDS71 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
. .:::::::::::::::..: ::.:.::::: :::::.:.:. ::::.::.:.::..::
CCDS71 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::.:::.::::::.::::.::.:.: .::::::::.::: :.:::::::::::::. .:
CCDS71 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
:::.::..:.::::::::::::::::. ::.:.:::::::::::::::: :::::.::.:
CCDS71 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
.:..:.:::: :.:::: ::.::.::::::::.:::::::.::.::::.::::.::: ..
CCDS71 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
.:::::::::: ::::: .::::.:.:.:::::::::: ::: . :. .: .: ::::
CCDS71 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS71 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
540 550 560 570 580
>>CCDS58235.1 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 (493 aa)
initn: 1461 init1: 760 opt: 1781 Z-score: 2258.5 bits: 427.6 E(32554): 1.8e-119
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:7-493)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
::. :. .:. ::..: .... ..:
CCDS58 MADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
. : :: ....:..: . .. ::: .. :: .::: :: ...:.:.::::::::::
CCDS58 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
.::: .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .::::: ::::: ::
CCDS58 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
:.:::::.. :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
CCDS58 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
: .::::..: :.: .: :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
CCDS58 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
:::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.
CCDS58 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
:.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.: :.: .:.. . ::.::
CCDS58 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
..:.:: ::.:. ::: .:::::..: :::: .::. .:.: :::: .: :.. :
CCDS58 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
400 410 420 430 440
560 570 580 590
pF1KB3 TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
. :.::::.: ..::::.:..: : : .:.:::..:.:::::::
CCDS58 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
450 460 470 480 490
>>CCDS8848.2 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 (520 aa)
initn: 1461 init1: 760 opt: 1781 Z-score: 2258.1 bits: 427.6 E(32554): 1.9e-119
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:34-520)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
::. :. .:. ::..: .... ..:
CCDS88 PLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
. : :: ....:..: . .. ::: .. :: .::: :: ...:.:.::::::::::
CCDS88 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
.::: .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .::::: ::::: ::
CCDS88 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
:.:::::.. :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
CCDS88 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
: .::::..: :.: .: :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
CCDS88 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
:::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.
CCDS88 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
:.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.: :.: .:.. . ::.::
CCDS88 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
..:.:: ::.:. ::: .:::::..: :::: .::. .:.: :::: .: :.. :
CCDS88 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590
pF1KB3 TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
. :.::::.: ..::::.:..: : : .:.:::..:.:::::::
CCDS88 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
480 490 500 510 520
>>CCDS2649.2 GADL1 gene_id:339896|Hs108|chr3 (521 aa)
initn: 1404 init1: 789 opt: 1732 Z-score: 2195.8 bits: 416.1 E(32554): 5.5e-116
Smith-Waterman score: 1732; 50.9% identity (80.4% similar) in 491 aa overlap (106-594:42-521)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 LLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVVDILLN-YVRKTFDR
:: :: .:. :. .... : :. :
CCDS26 DGDIDQQEMIPSKKNAVLVDGVVLNGPTTDAKAGE----KFVEEACRLIMEEVVLKATDV
20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 STKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQLSTG
. :: ... :.:: . . .::. : : ...: :::...:.:.:.:::::::: .:
CCDS26 NEKVCEWRPPEQLKQLL---DLEMRDSGEPPHKLLELCRDVIHYSVKTNHPRFFNQLYAG
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPGGAI
:: .:.....: . : ...:::..:::.:.:. .:::: :..:: :.:::::.:::..
CCDS26 LDYYSLVARFMTEALNPSVYTYEVSPVFLLVEEAVLKKMIEFIGW--KEGDGIFNPGGSV
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 SNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILIKCN
::::.. ::::: :..: ::... :.:.:::: . :::.:::.. ::.::.:: ... .
CCDS26 SNMYAMNLARYKYCPDIKEKGLSGSPRLILFTSAECHYSMKKAASFLGIGTENVCFVETD
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 ERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDA
:::.:: ..: .. .:...: .:: : ::.:::: :::::..:::::::...:::::::
CCDS26 GRGKMIPEELEKQVWQARKEGAAPFLVCATSGTTVLGAFDPLDEIADICERHSLWLHVDA
250 260 270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 AWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKEKG-ILQGCNQMCAG
.:::. :::::::. :.::.::.::.::::::. . .:: :.:::.:. .:. : . :.
CCDS26 SWGGSALMSRKHRKLLHGIHRADSVAWNPHKMLMAGIQCCALLVKDKSDLLKKCYSAKAS
310 320 330 340 350 360
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 YLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAK
:::: :: ::::::::::.:::.:. : ::::. ::: ::.:.:...:. : :..:: .
CCDS26 YLFQQDKFYDVSYDTGDKSIQCSRRPDAFKFWMTWKALGTLGLEERVNRALALSRYLVDE
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 IKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESGTTM
::.:: :.... :::..:.:::::: ::: . ..:. ::. ::: :: ::..:. :
CCDS26 IKKREGFKLLM--EPEYANICFWYIPPSLREMEEGPEFWAKLNLVAPAIKERMMKKGSLM
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590
pF1KB3 VGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
.::::. :.::::.:. .: ... :.:::..::. ::.:.
CCDS26 LGYQPHRGKVNFFRQVVISPQVSREDMDFLLDEIDLLGKDM
490 500 510 520
>>CCDS2240.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 (224 aa)
initn: 1409 init1: 1409 opt: 1409 Z-score: 1791.8 bits: 340.1 E(32554): 1.7e-93
Smith-Waterman score: 1409; 100.0% identity (100.0% similar) in 213 aa overlap (1-213:1-213)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMPSDMRECWLLR
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
>>CCDS5511.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 (480 aa)
initn: 354 init1: 354 opt: 453 Z-score: 571.4 bits: 115.4 E(32554): 1.6e-25
Smith-Waterman score: 501; 26.4% identity (59.4% similar) in 397 aa overlap (119-502:12-400)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 RRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVVDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLL
:.:: . ::.. : .: .: :
CCDS55 MNASEFRRRGKEMVDYMANYMEGIEGR--QVYPDVEPGYLR
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 EGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGH-PRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTS
. . ..:...:.:. : . . :: : : :: . :. . .. .. : .
CCDS55 PLIPA---AAPQEPDTFEDIINDVEKIIMPGVTHWHSPYFFAYFPTASSYPAMLADMLCG
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TANTNMFTYEIAPVFVLMEQIT---LKKMREI----VGWSSKDGDGIFSPGGAISNMYSI
. . :.. .:. . .: . : :: :. .. .. .: :... ... ... ..
CCDS55 AIGCIGFSWAASPACTELETVMMDWLGKMLELPKAFLNEKAGEGGGVIQGSASEATLVAL
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310
pF1KB3 MAARYKYFPEVKTKG----MAAV-PKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILIKCNE
.::: : . .... . .::. ::: ..:.:.: :...:: .: .. : .
CCDS55 LAARTKVIHRLQAASPELTQAAIMEKLVAYSSDQAHSSVERAGL---IGGVKLKAIPSDG
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDAA
. . .. . . : : .::.. :: :::. .:: . :.. ::.: ..:::::::
CCDS55 NFAMRASALQEALERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCSFDNLLEVGPICNKEDIWLHVDAA
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 WGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKEKGILQGCNQMCAGYL
..:. .. . :: :::.: :.: ..:::: . : ..:::. ::.. : : .. ::
CCDS55 YAGSAFICPEFRHLLNGVEFADSFNFNPHKWLLVNFDCSAMWVKKRTDLTGAFRLDPTYL
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 FQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAKIK
. .. . : : ::. .:.:.... :. :.. : : ..:.. . . ..
CCDS55 KHSHQDSGLITDYRHWQIPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVKGLQAYIRKHVQLSHEFESLVR
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 NREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESGTTMVG
. .::.
CCDS55 QDPRFEICVEVILGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKKIHLVPCHLRDKFVLRFAICSR
400 410 420 430 440 450
>>CCDS56485.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 (402 aa)
initn: 354 init1: 354 opt: 443 Z-score: 560.1 bits: 113.1 E(32554): 7.1e-25
Smith-Waterman score: 443; 30.3% identity (62.9% similar) in 267 aa overlap (243-502:59-322)
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 MFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPGGAISN--MYSIMAARYKYFPE
: . :. :::. :. . ...::: : . .
CCDS56 VYPDVEPGYLRPLIPAAAPQEPDTFEDIINDVEKIIMPGGSASEATLVALLAARTKVIHR
30 40 50 60 70 80
280 290 300 310 320
pF1KB3 VKTKG----MAAV-PKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFE
... . .::. ::: ..:.:.: :...:: .: .. : . . . ..
CCDS56 LQAASPELTQAAIMEKLVAYSSDQAHSSVERAGL---IGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQ
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 AKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRK
. . : : .::.. :: :::. .:: . :.. ::.: ..:::::::..:. .. .
CCDS56 EALERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCSFDNLLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPE
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 HRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKEKGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVS
:: :::.: :.: ..:::: . : ..:::. ::.. : : .. :: . .. .
CCDS56 FRHLLNGVEFADSFNFNPHKWLLVNFDCSAMWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLI
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 YDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFN
: : ::. .:.:.... :. :.. : : ..:.. . . ... .::.
CCDS56 TDYRHWQIPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVKGLQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEICVE
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANF
CCDS56 VILGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKKIHLVPCHLRDKFVLRFAICSRTVESAHVQRA
330 340 350 360 370 380
>>CCDS75598.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 (442 aa)
initn: 354 init1: 354 opt: 439 Z-score: 554.3 bits: 112.1 E(32554): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 443; 26.2% identity (59.8% similar) in 378 aa overlap (134-502:9-362)
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LPAKNGEEQTVQFLLEVVDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPE
:. ...:. . .::.:: .. . .:
CCDS75 MNASEFRRRGKEMVDYMANY--MEGIEGRQVYPDVEPG
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFV
:. .. .. .: :... . .. : . : .: : :.. : :
CCDS75 YLRPLIP--------AAAPQEPDTFEDIINDVEKIIMPGA--ASPACTELET-------V
40 50 60 70
230 240 250 260 270
pF1KB3 LMEQITLKKMREI----VGWSSKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKG----
.:. : :: :. .. .. .: :... ... ... ...::: : . .... .
CCDS75 MMDW--LGKMLELPKAFLNEKAGEGGGVIQGSASEATLVALLAARTKVIHRLQAASPELT
80 90 100 110 120 130
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 MAAV-PKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQK
.::. ::: ..:.:.: :...:: .: .. : . . . .. . . :
CCDS75 QAAIMEKLVAYSSDQAHSSVERAGL---IGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQEALERDKAA
140 150 160 170 180 190
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 GYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIE
: .::.. :: :::. .:: . :.. ::.: ..:::::::..:. .. . :: :::.:
CCDS75 GLIPFFMVATLGTTTCCSFDNLLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPEFRHLLNGVE
200 210 220 230 240 250
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 RANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKEKGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQ
:.: ..:::: . : ..:::. ::.. : : .. :: . .. . : :
CCDS75 FADSFNFNPHKWLLVNFDCSAMWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLITDYRHWQIP
260 270 280 290 300 310
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 CGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVC
::. .:.:.... :. :.. : : ..:.. . . ... .::.
CCDS75 LGRRFRSLKMWFVFRMYGVKGLQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEICVEVILGLVCFR
320 330 340 350 360 370
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 FWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPA
CCDS75 LKGSNKVNEALLQRINSAKKIHLVPCHLRDKFVLRFAICSRTVESAHVQRAWEHIKELAA
380 390 400 410 420 430
>>CCDS10134.1 HDC gene_id:3067|Hs108|chr15 (662 aa)
initn: 283 init1: 283 opt: 416 Z-score: 522.0 bits: 106.8 E(32554): 9.4e-23
Smith-Waterman score: 439; 26.6% identity (57.0% similar) in 398 aa overlap (119-502:13-400)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 RRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVVDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLL
:.:: . .:. . .: .: .: :
CCDS10 MMEPEEYRERGREMVDYICQYLSTVRER--RVTPDVQPGYLR
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 EGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV-RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTS
. : :.: ..:. : . . :: . :.. . . .: :. :..
CCDS10 AQLPESAPE---DPDSWDSIFGDIERIIMPGVVHWQSPHMHAYYPALTSWPSLLGDMLAD
50 60 70 80 90
210 220 230 240 250
pF1KB3 TANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS--------SKDGDGIFSPGGAISNMYS
. : ::. .:. . .:. .. . ...: :..: :... . :.. .
CCDS10 AINCLGFTWASSPACTELEMNVMDWLAKMLGLPEHFLHHHPSSQGGGVLQSTVSESTLIA
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 IMAARYKYFPEVKTKGMAA-----VPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILIKCN
..::: . . :.::. : .:: ..:.:.: :..::: .. .. .. .
CCDS10 LLAARKNKILEMKTSEPDADESCLNARLVAYASDQAHSSVEKAGL---ISLVKMKFLPVD
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 ERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDA
. .. .. : : ::.: :: .: :: ::: ::: ..:.. :: . .::::.::
CCDS10 DNFSLRGEALQKAIEEDKQRGLVPVFVCATLGTTGVCAFDCLSELGPICAREGLWLHIDA
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 AWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKEKGILQGCNQMCAGY
:..: .. . : :.::: :.: :.:: : : : ..:... ::.: :: .. :
CCDS10 AYAGTAFLCPEFRGFLKGIEYADSFTFNPSKWMMVHFDCTGFWVKDKYKLQQTFSVNPIY
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 LFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAKI
: . .. :. : : .:. :.:.. .. :. ... .. . :.:.:. . .
CCDS10 LRHANS--GVATDFMHWQIPLSRRFRSVKLWFVIRSFGVKNLQAHVRHGTEMAKYFESLV
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 KNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESGTTMV
.: ::.
CCDS10 RNDPSFEIPAKRHLGLVVFRLKGPNCLTENVLKEIAKAGRLFLIPATIQDKLIIRFTVTS
400 410 420 430 440 450
594 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:23:06 2016 done: Fri Nov 4 23:23:07 2016
Total Scan time: 3.240 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]