Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3104
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3104, 803 aa
1>>>pF1KB3104 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4408+/-0.000952; mu= 19.1283+/- 0.058
mean_var=63.8480+/-12.880, 0's: 0 Z-trim(103.6): 26 B-trim: 2 in 1/52
Lambda= 0.160509
statistics sampled from 7460 (7483) to 7460 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75684.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 803) 5350 1248.3 0
CCDS75683.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 865) 5243 1223.5 0
CCDS75682.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 801) 5236 1221.9 0
CCDS78291.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 758) 4092 957.0 0
CCDS54388.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 800) 2901 681.2 1.9e-195
CCDS33278.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 789) 2872 674.5 1.9e-193
CCDS46400.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 796) 2870 674.0 2.7e-193
CCDS54389.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 746) 2708 636.5 5e-182
CCDS33311.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2 ( 760) 1536 365.1 2.5e-100
CCDS2216.1 DPP4 gene_id:1803|Hs108|chr2 ( 766) 1535 364.8 3e-100
CCDS77480.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2 ( 735) 1384 329.9 9.6e-90
CCDS78290.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 353) 832 201.9 1.5e-51
CCDS45928.1 DPP9 gene_id:91039|Hs108|chr19 ( 892) 475 119.4 2.6e-26
CCDS10210.1 DPP8 gene_id:54878|Hs108|chr15 ( 882) 470 118.2 5.8e-26
CCDS10207.1 DPP8 gene_id:54878|Hs108|chr15 ( 898) 470 118.3 5.9e-26
>>CCDS75684.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 (803 aa)
initn: 5350 init1: 5350 opt: 5350 Z-score: 6687.4 bits: 1248.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5350; 99.9% identity (99.9% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB3 FVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
::::::::::: :::::::::::
CCDS75 FVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
790 800
>>CCDS75683.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 (865 aa)
initn: 5241 init1: 5241 opt: 5243 Z-score: 6553.0 bits: 1223.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5243; 99.1% identity (99.6% similar) in 792 aa overlap (12-803:74-865)
10 20 30 40
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVI
.: ..:.::::::::::::::::::::::
CCDS75 LGPRAQAAAPRERGGGGGGAGGRPRFQYQARSDGDEEDELVGSNPPQRNWKGIAIALLVI
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LVICSLIVTSVILLTPAEDNSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LVICSLIVTSVILLTPAEDNSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKG
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 TVRLWNVETNTSTVLIEGKKIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVRLWNVETNTSTVLIEGKKIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSK
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 IPHGDPQSLDPPEVSNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPHGDPQSLDPPEVSNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGV
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 IYNGLSDWLYEEEILKTHIAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IYNGLSDWLYEEEILKTHIAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYH
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 YPKAGSENPSISLHVIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YPKAGSENPSISLHVIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQ
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 NVSILTLCDATTGVCTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NVSILTLCDATTGVCTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHI
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 TVSSSQPNSSNDNIQSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVSSSQPNSSNDNIQSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNF
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 NRQCLSCDLVENCTYFSASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NRQCLSCDLVENCTYFSASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVK
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 KAINDRQMPKVEYRDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KAINDRQMPKVEYRDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEV
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 SWETVMVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SWETVMVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDR
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 TRVAVFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TRVAVFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLD
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 NRAYEMTKVAHRVSALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NRAYEMTKVAHRVSALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDES
770 780 790 800 810 820
770 780 790 800
pF1KB3 HYFTSSSLKQHLYRSIINFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS75 HYFTSSSLKQHLYRSIINFFVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
830 840 850 860
>>CCDS75682.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 (801 aa)
initn: 5233 init1: 5233 opt: 5236 Z-score: 6544.8 bits: 1221.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5236; 99.2% identity (99.6% similar) in 790 aa overlap (14-803:12-801)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
.: . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MKEKAMIKTAKMQGNVMELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
720 730 740 750 760 770
790 800
pF1KB3 FVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
::::::::::: :::::::::::
CCDS75 FVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
780 790 800
>>CCDS78291.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 (758 aa)
initn: 4092 init1: 4092 opt: 4092 Z-score: 5113.5 bits: 957.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4928; 94.3% identity (94.3% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPI--------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 -------------FIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
380 390 400 410 420 430
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CCDS78 FVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
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pF1KB3 NFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
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CCDS33 KFFSDCLK---EEISVLPQEPEEDE
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CCDS46 LQYAAWGVQGQQLIYIFENNIYYQPDIKSSSLRLTSSGKEEIIFNGIADWLYEEELLHSH
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pF1KB3 IAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGL
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CCDS46 DGRGSGFQGLKILQEIHRRLGSVEVKDQITAVKFLLKLPYIDSKRLSIFGKGYGGYIASM
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pF1KB3 ILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALE
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CCDS46 IL----KSDEKLFKCGSVVAPITDLKLYASAFSERYLGMPSKEESTYQAASVLHNVHGLK
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pF1KB3 EQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSII
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CCDS46 EENILIIHGTADTKVHFQHSAELIKHLIKAGVNYTMQVYPDEGHNVSEKS-KYHLYSTIL
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pF1KB3 NFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
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CCDS46 KFFSDCLK---EEISVLPQEPEEDE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]