Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3090
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3090, 618 aa
1>>>pF1KB3090 618 - 618 aa - 618 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2502+/-0.000936; mu= 15.4446+/- 0.056
mean_var=105.0829+/-21.956, 0's: 0 Z-trim(108.0): 78 B-trim: 571 in 1/52
Lambda= 0.125115
statistics sampled from 9866 (9945) to 9866 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.305), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 ( 618) 4196 768.4 0
CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 ( 569) 3862 708.1 7.8e-204
CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs108|chr11 ( 604) 3045 560.7 2e-159
CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs108|chrX ( 497) 688 135.2 2e-31
CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 ( 280) 390 81.2 2e-15
CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 ( 298) 384 80.1 4.5e-15
CCDS12863.1 BIRC8 gene_id:112401|Hs108|chr19 ( 236) 306 66.0 6.5e-11
>>CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 (618 aa)
initn: 4196 init1: 4196 opt: 4196 Z-score: 4098.3 bits: 768.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4196; 100.0% identity (100.0% similar) in 618 aa overlap (1-618:1-618)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LGSTSKNTSPMRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LGSTSKNTSPMRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 MSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RRHFPNCPFLENSLETLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RRHFPNCPFLENSLETLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 STSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 STSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 VDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLR
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB3 KCPICRGIIKGTVRTFLS
::::::::::::::::::
CCDS83 KCPICRGIIKGTVRTFLS
610
>>CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 (569 aa)
initn: 3862 init1: 3862 opt: 3862 Z-score: 3772.9 bits: 708.1 E(32554): 7.8e-204
Smith-Waterman score: 3862; 100.0% identity (100.0% similar) in 569 aa overlap (50-618:1-569)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 SIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPMRNSFAHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPMRNSFAHSL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 SPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRF
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 SISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESG
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 DDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFG
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 PGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAED
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 EKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDIIKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDIIKQK
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 TQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLE
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 EQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
520 530 540 550 560
>>CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs108|chr11 (604 aa)
initn: 2444 init1: 1945 opt: 3045 Z-score: 2975.6 bits: 560.7 E(32554): 2e-159
Smith-Waterman score: 3045; 72.8% identity (89.2% similar) in 604 aa overlap (20-618:2-604)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNS-NKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAG
.:.:.: .::. .: : ..:::.::::::::::::::::
CCDS83 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.
CCDS83 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 S-LGSTSKNTSP--MRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNP
. : .::. : : . :: .::: : :.:. : ::::. ::.:::: .:.:. .
CCDS83 NNLEATSQPTFPSSVTNS-THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 YSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDA
: ::..:.::.::.. ::::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS83 YHCAMNNENARLLTFQTWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MSEHRRHFPNCPFLENSLE-TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGF
:::: ::::.:::.::.:. : :...:::::::::::..::. ::::: :.:::::::::
CCDS83 MSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 YYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHL
:::: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. ::::
CCDS83 YYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQS
:::::::::. :.:::. :::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.:::::::
CCDS83 LEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 KILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCV
:::.:::::. :::.: ::::::: ::::.:. .:: :.:: :::::::::::.::::
CCDS83 KILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 LPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTL
.::::.:: :..::.::::.:::::: ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...:
CCDS83 IPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 YKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQEC
:..:::....::::::::: : .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:
CCDS83 YEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDC
530 540 550 560 570 580
600 610
pF1KB3 APSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
:::::::::::. ::::::::::
CCDS83 APSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
590 600
>>CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs108|chrX (497 aa)
initn: 1048 init1: 507 opt: 688 Z-score: 677.5 bits: 135.2 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 1085; 34.1% identity (55.7% similar) in 596 aa overlap (42-618:22-497)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 GPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAG
.: :. :..:...::.: ::: .:::::
CCDS14 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 FYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPM
: ::: .: :.:: : .: :. ::: . .:... :.: ::... . .. : :.. .
CCDS14 FLYTGEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYLENSATQSTNSGIQ
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RNSF-AHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLT
... ... . .: .: : . . : . : :::.. : . :: .::::. .
CCDS14 NGQYKVENYLGSRDHFALDRPSETH-ADYLLRTGQVVDISDT-IYPRNPAMYSEEARLKS
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KB3 YHMWP-LTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPF
.. :: . :.: ::: ::.:: : ::.: :: :::::.:::: : : :::::::::: :
CCDS14 FQNWPDYAHLTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB3 LENSLETLR-----------FSIS-----NLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASA
. . ..: : : : :: . ::. :: : : :. :::: :
CCDS14 VLGRNLNIRSESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYS--VNKEQLARA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 GFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYP
::: .:..: :::: : ::: :. ..::: .::::.: :..:...::::....:.
CCDS14 GFYALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIH--LT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 HLLEQ-LLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQT
: ::. :. :.. : :. . : .....:.:. :..:::. .:.
CCDS14 HSLEECLVRTTEKT-------------PSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKI
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQL
.. :: .: :::... .:. :.::. .. ..:.
CCDS14 MEEKIQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDES--------------------------
400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TCVLPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEID
.: :: :::
CCDS14 ---------------------------SQTSLQ-----------------------KEI-
430
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 STLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVC
: ::::::::::. ::.:::.....::.::::::.:
CCDS14 ------------------------STEEQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIVFVPCGHLVTC
440 450 460 470
600 610
pF1KB3 QECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
..:: .. :::.: .: . :.:
CCDS14 KQCAEAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
480 490
>>CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 (280 aa)
initn: 588 init1: 376 opt: 390 Z-score: 390.3 bits: 81.2 E(32554): 2e-15
Smith-Waterman score: 429; 29.3% identity (43.4% similar) in 389 aa overlap (230-618:48-280)
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRF
:. : . . : . . :.. ::
CCDS13 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLRPLTEEEEEEGAGATLSR
20 30 40 50 60 70
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 SISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESG
. . .: .. :. .:. :: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::. :. :
CCDS13 GPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQSWKRG
80 90 100 110 120 130
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 DDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFG
::::.::::::: :.::.: ::..:: .: . :::.. :
CCDS13 DDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD---------------
140 150 160 170
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 PGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAED
: : ::: .::. :. :. . : :
CCDS13 PWEEP-EDA----APVAPSVPASGYPE-----------LPT-------------------
180 190 200
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 EKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDIIKQK
.:: ..:. : : :
CCDS13 PRREVQSESAQEPGARD-------------------------------------------
210 220
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 TQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLE
.:
CCDS13 ----------------------------------------------------------VE
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 EQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
::::::::::::::.:. ::.::.:::::: : ::::.:. :::::. ... ::::::
CCDS13 AQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVRTFLS
230 240 250 260 270 280
>>CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 (298 aa)
initn: 588 init1: 376 opt: 384 Z-score: 384.0 bits: 80.1 E(32554): 4.5e-15
Smith-Waterman score: 454; 30.6% identity (45.8% similar) in 389 aa overlap (230-618:48-298)
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRF
:. : . . : . . :.. ::
CCDS13 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLRPLTEEEEEEGAGATLSR
20 30 40 50 60 70
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