Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3089
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3089, 475 aa
1>>>pF1KB3089 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8151+/-0.000969; mu= 14.6376+/- 0.058
mean_var=64.8542+/-13.353, 0's: 0 Z-trim(103.8): 22 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.159259
statistics sampled from 7548 (7562) to 7548 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 ( 475) 3191 742.3 2.6e-214
CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 500) 1504 354.7 1.3e-97
CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 ( 499) 1249 296.1 5.6e-80
CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 ( 465) 706 171.3 1.9e-42
CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 ( 467) 697 169.3 8e-42
CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10 ( 467) 617 150.9 2.7e-36
CCDS77187.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 426) 491 121.9 1.3e-27
CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21 ( 481) 453 113.2 6.2e-25
CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3 ( 451) 435 109.1 1e-23
CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 456) 414 104.2 2.9e-22
CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 413 104.0 3.3e-22
CCDS56268.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 294 76.7 5.7e-14
>>CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 (475 aa)
initn: 3191 init1: 3191 opt: 3191 Z-score: 3961.1 bits: 742.3 E(32554): 2.6e-214
Smith-Waterman score: 3191; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGV
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CCDS60 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 YPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB3 WSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
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CCDS60 WSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
430 440 450 460 470
>>CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 (500 aa)
initn: 1481 init1: 674 opt: 1504 Z-score: 1865.9 bits: 354.7 E(32554): 1.3e-97
Smith-Waterman score: 1508; 49.1% identity (77.8% similar) in 442 aa overlap (40-467:50-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 TLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVATCHF
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CCDS11 GSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTK
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CCDS11 NMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNF
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CCDS11 VVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMF
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAI
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CCDS11 EGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTR-SFGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVL
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKNR
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CCDS11 GSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNR
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGT
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CCDS11 CNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGT
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWS------
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CCDS11 NADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQ-SWYNLWKEFRSYL
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470
pF1KB3 ----SPG--FAIQKIRVKAGETQKKVIFCSRE-KVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
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CCDS11 SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRE-LWFRKCRDGWRMKNET
440 450 460 470 480 490
CCDS11 SPTVELP
500
>>CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 (499 aa)
initn: 1308 init1: 794 opt: 1249 Z-score: 1549.3 bits: 296.1 E(32554): 5.6e-80
Smith-Waterman score: 1353; 44.3% identity (73.7% similar) in 463 aa overlap (27-473:38-495)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHL
:.. . . .....: : . . :..
CCDS10 FSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQG---CQI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 IPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDS--NVIVVDWL
. ... : :: : :.::::.: :. :.:. ..:::: : .: . :: .:::.
CCDS10 RINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAAL-KSQPAQPVNVGLVDWI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTN-
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CCDS10 TLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 -KKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDI
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CCDS10 THKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 YPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCS
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CCDS10 YPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SKEAFEKGLCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGT
. ..: .::::::.:.:::.:::.. . ..:....: ::.: :.::.::: ::.: .
CCDS10 DMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQFIN-
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 ESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKS
..:: . .: .:: :: . ..::.:: . ...:::::::: .::::::.:.:.::..
CCDS10 QTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWEN
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB3 DSYFS--WSD------WWSSP---GFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPA
.. .. :. : ..: :.... :::::::::... :::.. . : .
CCDS10 SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEK
430 440 450 460 470 480
470
pF1KB3 VFVKCHDKSLNKKSG
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CCDS10 IFVKCEIKSKTSKRKIR
490
>>CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 462 init1: 325 opt: 706 Z-score: 875.5 bits: 171.3 E(32554): 1.9e-42
Smith-Waterman score: 706; 31.2% identity (63.4% similar) in 423 aa overlap (36-450:50-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 LLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVA
:....: : : :. .. . . . . :..
CCDS75 CYERLGCFSDDSPWSGITERPLHILPWSPKDVNTRFLLYTNEN--PNNFQEVAADSSSIS
20 30 40 50 60 70
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pF1KB3 TCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSA
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CCDS75 GSNFKTNRKTRFIIHGFIDKGE-ENWLANVCKNLFKVE-SVNCICVDWKGGSRTGYTQAS
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130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPA
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CCDS75 QNIRIVGAEVAYFVEFLQSAFGYSPSNVHVIGHSLGAHAAGEAGRRTNGTIGRITGLDPA
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190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSP---GRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPG
: :. . ::.:.:: ::::.: : :.: . ..:... :::.:..::::. .::
CCDS75 EPCFQGTPELVRLDPSDAKFVDVIH--TDGAPIVPNLGFGMSQVVGHLDFFPNGGVEMPG
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 CNIGEAIRVIAERGL--GDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKG
:. . ... :. : : .. :.: :: . . ::..: .. . .. :.: ..: .
CCDS75 CKKNILSQIVDIDGIWEGTRD-FAACNHLRSYKYYTDSIVNPDGFA-GFPCASYNVFTAN
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KB3 LCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSS---KMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETH
:. : .. : ..:. .. .: .. :.:: : . . ..:.:.. .:: . :
CCDS75 KCFPCPSGGCPQMGHYADRYPGKTNDVGQKFYLDTGDASNFARWRYKVSVTLSGKKVTGH
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 TNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSW
. .::.:. ..:.. . .. ..:.: . ..::.:.: :.:. : ..
CCDS75 ----ILVSLFGNKGNSKQYEIFKGTLKPDSTHSNEFDSDVDVGDLQMVKFIWYNNVINP-
380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 SDWWSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
. : . .:: :... . :. ::: : :
CCDS75 ----TLPRVGASKIIVETN-VGKQFNFCSPETVREEVLLTLTPC
430 440 450 460
>>CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 (467 aa)
initn: 435 init1: 240 opt: 697 Z-score: 864.3 bits: 169.3 E(32554): 8e-42
Smith-Waterman score: 697; 31.9% identity (63.1% similar) in 420 aa overlap (37-450:52-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 LVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVAT
: ..: : : :. . :. . .. .
CCDS75 YEDLGCFSDTEPWGGTAIRPLKILPWSPEKIGTRFLLYTNENPNNFQILLLSDPS-TIEA
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 CHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAG
.:. . :: ..:::. : :::: . :.. : . : : ::: . .: : .:.
CCDS75 SNFQMDRKTRFIIHGFIDKG-DESWVTDMCKKLFEVE-EVNCICVDWKKGSQATYTQAAN
90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 YTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAG
...:: .::.... . :..:: ..:::.:.:::::.:: ::: : ..:::::::.
CCDS75 NVRVVGAQVAQMLDILLTEYSYPPSKVHLIGHSLGAHVAGEAGSKT-PGLSRITGLDPVE
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGS-PGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNI
.:: . ::.:.:::::::.:: . : ..: .. .::.:..:::: .:::.
CCDS75 ASFESTPEEVRLDPSDADFVDVIHTDAAPLIPFLGFGTNQQMGHLDFFPNGGESMPGCKK
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GEAIRVIAERGL--GDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCL
. ... :. : : .: :.: :: . ...:.:: .. . :: :.: ..::. :.
CCDS75 NALSQIVDLDGIWAGTRD-FVACNHLRSYKYYLESILNPDGFA-AYPCTSYKSFESDKCF
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SCRKNRCNNLGYEINKVRAKRS---SKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQ
: . : ..:. .: .. : .:..:.: . ..: :.: .:: .: :.:
CCDS75 PCPDQGCPQMGHYADKFAGRTSEEQQKFFLNTGEASNFARWRYGVSITLSG---RTATGQ
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDW
....:.:. ..... . .. ..:.:. . ...:.: . .:. :...
CCDS75 -IKVALFGNKGNTHQYSIFRGILKPGSTHSYEFDAKLDVGTIEKVKFLWNNNVINP----
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB3 WSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
. : . :: :. :: . :::.. :
CCDS75 -TLPKVGATKITVQKGEEKTVYNFCSEDTVREDTLLTLTPC
430 440 450 460
>>CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10 (467 aa)
initn: 208 init1: 162 opt: 617 Z-score: 765.0 bits: 150.9 E(32554): 2.7e-36
Smith-Waterman score: 619; 28.7% identity (60.5% similar) in 443 aa overlap (14-448:34-454)
10 20 30 40
pF1KB3 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFAL
: ..... :. . .. :...: :
CCDS31 IWIVAFLFFGTSRGKEVCYERLGCFKDGLPWTRTFSTELVGLPWSPEK-----INTRFLL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 RTPEDTAEDTCHLIPGVAES-VATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKR
: .. .. . : .: : . . .:. .. : . : :: . : .: . .: .
CCDS31 YTIHNP--NAYQEISAVNSSTIQASYFGTDKITRINIAGWKTDG---KWQRDMCNVLLQL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 EPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGA
: : : : .::.. ..: : ... ..:: .:: ::. . ..:.: ..:::.:.::::
CCDS31 E-DINCINLDWINGSRE-YIHAVNNLRVVGAEVAYFIDVLMKKFEYSPSKVHLIGHSLGA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 HAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHT-FTRGSPGRSI
: :: ::: ..:::::::::: :. . ::.:.::.::::.:: .: ..
CCDS31 HLAGEAGS-RIPGLGRITGLDPAGPFFHNTPKEVRLDPSDANFVDVIHTNAARILFELGV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB3 GIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCN--IGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSL
: ::.:.::::: .:::. : .. . .. .. :.: :: ... .:.
CCDS31 GTIDACGHLDFYPNGGKHMPGCEDLITPLLKFNFNAYKKEMASFFDCNHARSYQFYAESI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 LNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKR----SSKMYLKTRSQ
:: . :: : : .:. : :. : :. : ..:. .. . : .:...:.: :
CCDS31 LNPDA-FIAYPCRSYTSFKAGNCFFCSKEGCPTMGHFADRFHFKNMKTNGSHYFLNTGSL
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 MPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYT
:. .........::.: :. . . . :.: .. .. .. .. . ::. :: .
CCDS31 SPFARWRHKLSVKLSGSEV---TQGTVFLRVGGAVRKTGEFAIVSGKLEPGMTYTKLIDA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 EVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQK
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CCDS31 DVNVGNITSVQFIWKKHLFED-----SQNKLGAEMVINTSGKYGYKSTFCSQDIMGPNIL
410 420 430 440 450 460
460 470
pF1KB3 GKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
CCDS31 QNLKPC
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10 20 30 40 50 60
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.: ::: .: .. :.: : .. . : :
CCDS77 GSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSF
20 30 40 50 60 70
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CCDS77 NMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNF
.::...::...:..:. .. : ::::.:::::::.:: ::.
CCDS77 VVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGN-------------------
140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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:..:. :: :
CCDS77 ----------------------FVKGTVGR-----------------------------I
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.:.: .::: :::..:::.:::.:...:: :..:.... :.::.::::::::
CCDS77 TAITE--------VVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNR
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pF1KB3 CNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGT
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CCDS77 CNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGT
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pF1KB3 VAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWS------
:.:...:. . : . : : .::.::: :.:.:: ..: :.. : :: . :.
CCDS77 NADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQ-SWYNLWKEFRSYL
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430 440 450 460 470
pF1KB3 ----SPG--FAIQKIRVKAGETQKKVIFCSRE-KVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
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CCDS77 SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRE-LWFRKCRDGWRMKNET
370 380 390 400 410
CCDS77 SPTVELP
420
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pF1KB3 ESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVA
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CCDS13 PRIETILMMYTRNNLNCAEPLFEQNNSLNVNFNTQKKTVWLIHGYRPVGSIPLWLQNFVR
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pF1KB3 ALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEH-YPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLL
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CCDS13 ILLNEE-DMNVIVVDWSRGATTFIYNRAVKNTRKVAVSLSVHIKNLLKH-GASLDNFHFI
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160 170 180 190 200 210
pF1KB3 GYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGS
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CCDS13 GVSLGAHISGFVGKIFHGQLGRITGLDPAGPRFSRKPPYSRLDYTDAKFVDVIHSDSNG-
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pF1KB3 PGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFI
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CCDS13 ----LGIQEPLGHIDFYPNGGNKQPGC----------PKSIFSGIQFIKCNHQRAVHLFM
240 250 260 270 280
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pF1KB3 DSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSC---RKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKM-----
:: .. : .. : : . .. .::..: ... : :::. . .. . .:
CCDS13 ASLETNCN-FISFPCRSYKDYKTSLCVDCDCFKEKSCPRLGYQAKLFKGVLKERMEGRPL
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pF1KB3 ----YLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLY---GTVAES----ENIP
.: : . .:. .... ..: . ..: . .: ..: : . : .: :
CCDS13 RTTVFLDTSGTYPFCTYYFVLSII---VPDKTMMDGSFSFKLLNQLGMIEEPRLYEKNKP
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pF1KB3 F-TLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWSSPGFAIQKIRVKAG
: : ::
CCDS13 FYKLQEVKILAQFYNDFVNISSIGLTYFQSSNLQCSTCTYKIQSLMLKSLTYPERPPLCR
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CCDS32 SFHSAVVGTGLNVRLMLYTRKNLTCAQTINSSAFGNLNVTKKTTFIVHGFRPTGSPPVWM
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pF1KB3 PKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEH-YPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLD
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CCDS32 DDLVKGLLSVE-DMNVVVVDWNRGATTLIYTHASSKTRKVAMVLKEFIDQMLAE-GASLD
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pF1KB3 NVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHT
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CCDS32 DIYMIGVSLGAHISGFVGEMYDGWLGRITGLDPAGPLFNGKPHQDRLDPSDAQFVDVIHS
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
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CCDS32 DTD-----ALGYKEPLGNIDFYPNGGLDQPGCP-----KTI----LGGF-QYFKCDHQRS
210 220 230 240 250
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pF1KB3 IHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSC---RKNRCNNLGYEINK----VRAKR
..:...:: : :: :.: . ...: :.:: .:. : ::: .. .:.:
CCDS32 VYLYLSSL-RESCTITAYPCDSYQDYRNGKCVSCGTSQKESCPLLGYYADNWKDHLRGKD
260 270 280 290 300 310
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pF1KB3 S--SKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPE
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CCDS32 PPMTKAFFDTAEESPFCMYHYFVDIITWNKNVRRGDITIKLRDKAGNTTESKINHEPTTF
320 330 340 350 360 370
>>CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 (456 aa)
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pF1KB3 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRR--DF--------IDIESKFALRTP
: .::. ..: : . . : . :: :.. .: : .:
CCDS29 MPPGPWESCFWVGGLILWLS--VGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVP
10 20 30 40 50
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pF1KB3 EDTAEDTC-HLIPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPD
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CCDS29 ---SNPSCGQLVEGSSD-LQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLL-RATN
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CCDS29 ANVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLV-LGVSESSIHIIGVSLGAHVG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 GIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQK
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CCDS29 GMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTD-----NLGIRI
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pF1KB3 PVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENP
:::::: . ::: :::: . . :. :.: :..::.:..: : :
CCDS29 PVGHVDYFVNGGQDQPGC---------PTFFYAGYSYLI-CDHMRAVHLYISALENS-CP
230 240 250 260 270
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pF1KB3 SKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKN---RCNNLGY-EINKVRAK---RSSKMYLKTRSQMPY
:. :.: .:: : ::.: . : .: : . :. . . :.:: : :. ::
CCDS29 LMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPY
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pF1KB3 KVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVD
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CCDS29 CMHHSLVEFHLKELRNKD-TN--IEVTFLSSNITSSS-KITIPKQQRYGKGIIAHATPQC
340 350 360 370 380 390
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pF1KB3 IGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKA
CCDS29 QINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLK
400 410 420 430 440 450
475 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]