FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3065, 472 aa
1>>>pF1KB3065 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3448+/-0.00121; mu= 17.5130+/- 0.072
mean_var=109.0740+/-35.227, 0's: 0 Z-trim(102.6): 209 B-trim: 1320 in 3/44
Lambda= 0.122804
statistics sampled from 6690 (7022) to 6690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5015.1 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 ( 472) 3093 559.9 2.1e-159
CCDS5016.2 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 ( 439) 2746 498.3 6.5e-141
CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 666 129.7 4.9e-30
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 350 73.8 3.5e-13
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 339 71.8 1.3e-12
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 323 69.0 9.5e-12
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 316 67.8 2.4e-11
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 ( 332) 314 67.3 2.7e-11
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 310 66.7 4.9e-11
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 307 66.1 6.5e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 306 66.1 9.3e-11
>>CCDS5015.1 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 (472 aa)
initn: 3093 init1: 3093 opt: 3093 Z-score: 2975.2 bits: 559.9 E(32554): 2.1e-159
Smith-Waterman score: 3093; 100.0% identity (100.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKSILDGLADTTFRTITTDLLYVGSNDIQYEDIKGDMASKLGYFPQKFPLTSFRGSPFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MKSILDGLADTTFRTITTDLLYVGSNDIQYEDIKGDMASKLGYFPQKFPLTSFRGSPFQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KMTAGDNPQLVPADQVNITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KMTAGDNPQLVPADQVNITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VLSLTLGTFTVLENLLVLCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VLSLTLGTFTVLENLLVLCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 HRKDSRNVFLFKLGGVTASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 WTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 WTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 AHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGKVQVTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGKVQVTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AIMVYDVFGKMNKLIKTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AIMVYDVFGKMNKLIKTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB3 PLDNSMGDSDCLHKHANNAASVHRAAESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 PLDNSMGDSDCLHKHANNAASVHRAAESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
430 440 450 460 470
>>CCDS5016.2 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 (439 aa)
initn: 2746 init1: 2746 opt: 2746 Z-score: 2643.4 bits: 498.3 E(32554): 6.5e-141
Smith-Waterman score: 2792; 93.0% identity (93.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-439)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKSILDGLADTTFRTITTDLLYVGSNDIQYEDIKGDMASKLGYFPQKFPLTSFRGSPFQE
::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS50 MKSILDGLADTTFRTITTDLL---------------------------------GSPFQE
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KMTAGDNPQLVPADQVNITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KMTAGDNPQLVPADQVNITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIA
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VLSLTLGTFTVLENLLVLCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VLSLTLGTFTVLENLLVLCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVF
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 HRKDSRNVFLFKLGGVTASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 HRKDSRNVFLFKLGGVTASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLM
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 WTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 WTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWK
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 AHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGKVQVTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGKVQVTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AIMVYDVFGKMNKLIKTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AIMVYDVFGKMNKLIKTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQ
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KB3 PLDNSMGDSDCLHKHANNAASVHRAAESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 PLDNSMGDSDCLHKHANNAASVHRAAESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
390 400 410 420 430
>>CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 (360 aa)
initn: 951 init1: 508 opt: 666 Z-score: 652.8 bits: 129.7 E(32554): 4.9e-30
Smith-Waterman score: 929; 48.7% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (108-405:25-307)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 ITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTLGTFTVLENLLV
.:.:. :. :.::: :: ...:::. :
CCDS24 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAV
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 LCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVT
: .:: :..:: .::: :::::: ::.:.::.:. ::..::::: ::. :::.:.:.::
CCDS24 LYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVT
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 ASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNC
.::::::::.:::::::. .. : .:: ..:: .:.:.. .::... ... :::.::.:
CCDS24 MTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTC
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 EKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSI
::..:: : . ::. :. . :. :.:.: ..:::::.:.. . : :
CCDS24 --CPRPCSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASL--SGHQ---
180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 IIHTSEDGKVQVTRPDQARM--DIRLAKTLVLILVVLIICWGPLLAIMVYDVFGKMNKLI
: .: : .::: :.:::::: :.:.::.::: :.::.:.... .. .
CCDS24 ------DRQV----PGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQV
230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 KTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQPLDNSMGDSDCLHKH
: .:::::::::.:: :::.:::::: ..:
CCDS24 KKAFAFCSMLCLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSV
280 290 300 310 320 330
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 332 init1: 180 opt: 350 Z-score: 350.1 bits: 73.8 E(32554): 3.5e-13
Smith-Waterman score: 491; 28.7% identity (61.9% similar) in 394 aa overlap (59-450:13-364)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 QYEDIKGDMASKLGYFPQKFPLTSFRGSPFQEKMTAGDNPQLVPADQVNITEFYNKSLSS
: ..:: ..:: :::.:..
CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQC----------FYNESIAF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 FKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTLGTFTVLENLLVLCVILHSRSLR
: . . :.. . : : ..:... :..:. : .: ::::. .: .: ..
CCDS67 FYN-----RSGKH-LATE----WNTVSKLVMG-LGITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFH
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 CRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVTASFTASVGSLF
: :.....::.::..... . : ... :. . ...:.. : . .:.::::..:.
CCDS67 F-PIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLL
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSDIF
::.:.:.. : . :. .: ..::.. ..::.:::....: .:::: ::..
CCDS67 AIAIERHITVFRMQLHTRMSNR-RVVVVIVVIWTMAIVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMA
150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 PHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGKVQ
: ...::.:: . : .. .: : .:. ......:: . :.: :
CCDS67 PLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMSR---------HSS--GP--
200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 VTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLLAIMVYDVFGKMNKLIKTVFAFCSMLCLL
: .. : . : ::.:..: ..:::: : :.... :: . .. . : .: .
CCDS67 --RRNRDTM-MSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVL-AYEKFFLLLAEF
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 NSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQPLDNSMGDSDCLHKHANNA--ASVHRAA
::..:::::. :.:.. .::... :. . .: . : :: . :.. :.::
CCDS67 NSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQIL-CCQRSENPTGPTEG-SDRSASSLNHTILAGVHSND
310 320 330 340 350 360
450 460 470
pF1KB3 ESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
.: .
CCDS67 HSVV
>>CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 (334 aa)
initn: 414 init1: 210 opt: 339 Z-score: 340.0 bits: 71.8 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 418; 26.9% identity (62.5% similar) in 309 aa overlap (111-415:36-319)
90 100 110 120 130
pF1KB3 FYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTL---GTFTVLENLLV
..: .:.. ...: ::. :: .:
CCDS93 KVNLSGLPRDYLDAAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISCENAIV
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 LCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVT
. .:.:. ::: : . .:::::.::::... .. .:. .... . .. : .: ..
CCDS93 VLIIFHNPSLRA-PMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATK---LVTIGLIV
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 ASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNC
:::.::: ::. ..:::.:.. :.:. : . : . ..: .: ...::..::::
CCDS93 ASFSASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNC
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 EKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSI
. .:.:: . : .. .. . : :..: .. .:: . ....: ...
CCDS93 LRDESTCSVVRPLTKNNAAILSV---SFLFMFALMLQLYI------QICKIVMRHAHQIA
190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 IIHTSEDGKVQVTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLLAIMVYDVFGKMNKLIKT
. : . :: .: . .::..:: .. :: :. .:.... . .
CCDS93 LQHHFLATSHYVT----TRKGV---STLAIILGTFAACWMPFT---LYSLIA--DYTYPS
240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VFAFCSML-CLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQPLDNSMGDSDCLHKHA
.... ..: :: .::.:::.:......:. . .:
CCDS93 IYTYATLLPATYNSIINPVIYAFRNQEIQKALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
290 300 310 320 330
440 450 460 470
pF1KB3 NNAASVHRAAESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa)
initn: 311 init1: 172 opt: 323 Z-score: 324.4 bits: 69.0 E(32554): 9.5e-12
Smith-Waterman score: 457; 26.9% identity (65.6% similar) in 305 aa overlap (121-421:31-316)
100 110 120 130 140
pF1KB3 ENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTLGTFTVL----ENLLVLCVILHSRS
:. : .::: : : ::. .....:.
CCDS70 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
10 20 30 40 50 60
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 LRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVTASFTASVGS
.. : :.....::.::..... .:. ... . . : .... : . .:.:::. .
CCDS70 FHF-PFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTN
70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSD
:.. :..:..:: : . . .:. .... . :.:.::: ....: ::::: :.::.
CCDS70 LLVIAVERHMSIMR-MRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSS
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 IFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGK
. : ...::.:: ..: :. :.... .:. :. .:. .. .:.
CCDS70 LAPIYSRSYLVFW--TVSNLMAFLIMVVVYL---------RIYVYVKRKTNVLSPHTSGS
180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 VQVTRPDQARMDIRLAKTLVLILVVLIICWGPLLAIMVYDVFGKMNKLIKTVFAFCSMLC
.. . : ..: ::.. .: ....:: : :.... : .. . .. : . .:
CCDS70 IS-----RRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLA
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 LLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQPLDNSMGDSDCLHKHANNAASVHRAA
::::.::::::. ...:. ....:. : . .:
CCDS70 LLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMI-CCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDS
290 300 310 320 330 340
450 460 470
pF1KB3 ESCIKSTVKIAKVTMSVSTDTSAEAL
CCDS70 ISQGAVCNKSTS
350
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 420 init1: 139 opt: 316 Z-score: 317.3 bits: 67.8 E(32554): 2.4e-11
Smith-Waterman score: 462; 30.5% identity (62.1% similar) in 311 aa overlap (120-427:49-338)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTLGTFTVLENLLVLCVILHSRSLRC
.:. . . : .:::..:: .: ......
CCDS77 YVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFH-
20 30 40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 RPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVTASFTASVGSLFL
:: :.:::.::..:::..: .. ... . : . .... :.. ....::: ::.
CCDS77 RPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLREGSMFVALSASVFSLLA
80 90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TAIDRYISIHR-PLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNCEKLQSVCSDIF
::.:::.. . : : ... : :.:..... ::..:::: . : :: ..
CCDS77 IAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISAC--WVISLILGGLPIMGWNCISALSSCSTVL
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 PHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSIIIHTSEDGKVQ
: . :..: : ..::: :: : : ..... :. : :.: .
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..: .. . : ::....: :.: ::.::. ... :: : : .: . .:
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.::: .:::::.: .:..:.:: .. :. : .: :
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CCDS77 SSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
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: . .: : .. : .:. :. : .:.....: ...
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CCDS11 YLLCQADVKSGNGQAGVQPALGVGL
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::.:.... :: : :: : ....: : ::.....::.::::: . :: :
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CCDS66 --KVANHNNSERSMALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDVACRVQACPILFKA--QWF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]