Result of FASTA (omim) for
pF1KB3015
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3015, 736 aa
1>>>pF1KB3015 736 - 736 aa - 736 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6705+/-0.000449; mu= 15.5049+/- 0.028
mean_var=149.7058+/-29.986, 0's: 0 Z-trim(116.1): 348 B-trim: 846 in 1/52
Lambda= 0.104823
statistics sampled from 26598 (26978) to 26598 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 9.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001177 (OMIM: 602751) transcription regulator p ( 736) 4929 757.9 3.2e-218
NP_996749 (OMIM: 602751) transcription regulator p ( 736) 4929 757.9 3.2e-218
XP_016866656 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 708) 612 105.1 1e-21
NP_001164265 (OMIM: 605394) transcription regulato ( 841) 612 105.1 1.2e-21
XP_016866654 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 612 105.1 1.2e-21
XP_016866655 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 612 105.1 1.2e-21
XP_011534341 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 612 105.1 1.2e-21
XP_005248816 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 612 105.1 1.2e-21
XP_011534342 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 612 105.1 1.2e-21
NP_068585 (OMIM: 605394) transcription regulator p ( 841) 612 105.1 1.2e-21
XP_005248815 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 877) 612 105.2 1.2e-21
XP_016866648 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866650 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866649 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866645 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866647 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866651 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866646 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866652 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_016866653 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 612 105.2 1.3e-21
XP_005257472 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 731) 326 61.8 1.1e-08
NP_001317191 (OMIM: 163260) nuclear factor erythro ( 742) 326 61.8 1.1e-08
XP_005257469 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 742) 326 61.8 1.1e-08
NP_001317190 (OMIM: 163260) nuclear factor erythro ( 761) 326 61.9 1.1e-08
XP_005257468 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 761) 326 61.9 1.1e-08
XP_005257467 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 772) 326 61.9 1.2e-08
NP_003195 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid ( 772) 326 61.9 1.2e-08
NP_001129495 (OMIM: 601490) transcription factor N ( 373) 287 55.6 4.2e-07
NP_001248390 (OMIM: 601490) transcription factor N ( 373) 287 55.6 4.2e-07
XP_005268963 (OMIM: 601490) PREDICTED: transcripti ( 373) 287 55.6 4.2e-07
NP_006154 (OMIM: 601490) transcription factor NF-E ( 373) 287 55.6 4.2e-07
XP_011511364 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymp ( 650) 281 55.0 1.2e-06
NP_001128210 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 prot ( 650) 281 55.0 1.2e-06
NP_001697 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein ( 706) 281 55.0 1.2e-06
XP_005247751 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymp ( 706) 281 55.0 1.2e-06
NP_001124317 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 prot ( 706) 281 55.0 1.2e-06
NP_862827 (OMIM: 608992) B-cell CLL/lymphoma 6 mem ( 480) 278 54.4 1.3e-06
NP_056982 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domai ( 584) 279 54.6 1.3e-06
NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB do ( 584) 279 54.6 1.3e-06
XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 584) 279 54.6 1.3e-06
XP_005259627 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 634) 279 54.7 1.4e-06
NP_004280 (OMIM: 604135) nuclear factor erythroid ( 694) 278 54.6 1.6e-06
XP_011526851 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 415) 271 53.3 2.4e-06
XP_016883156 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 432) 271 53.3 2.5e-06
XP_005260254 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 589) 271 53.4 3.1e-06
XP_005260255 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 589) 271 53.4 3.1e-06
XP_011526850 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 589) 271 53.4 3.1e-06
NP_079500 (OMIM: 614639) zinc finger and BTB domai ( 589) 271 53.4 3.1e-06
XP_006723763 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 589) 271 53.4 3.1e-06
XP_005260253 (OMIM: 614639) PREDICTED: zinc finger ( 589) 271 53.4 3.1e-06
>>NP_001177 (OMIM: 602751) transcription regulator prote (736 aa)
initn: 4929 init1: 4929 opt: 4929 Z-score: 4038.8 bits: 757.9 E(85289): 3.2e-218
Smith-Waterman score: 4929; 100.0% identity (100.0% similar) in 736 aa overlap (1-736:1-736)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSLSENSVFAYESSVHSTNVLLSLNDQRKKDVLCDVTIFVEGQRFRAHRSVLAACSSYFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSLSENSVFAYESSVHSTNVLLSLNDQRKKDVLCDVTIFVEGQRFRAHRSVLAACSSYFH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRIVGQADGELNITLPEEVTVKGFEPLIQFAYTAKLILSKENVDEVCKCVEFLSVHNIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRIVGQADGELNITLPEEVTVKGFEPLIQFAYTAKLILSKENVDEVCKCVEFLSVHNIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SCFQFLKFKFLDSTADQQECPRKKCFSSHCQKTDLKLSLLDQRDLETDEVEEFLENKNVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCFQFLKFKFLDSTADQQECPRKKCFSSHCQKTDLKLSLLDQRDLETDEVEEFLENKNVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TPQCKLRRYQGNAKASPPLQDSASQTYESMCLEKDAALALPSLCPKYRKFQKAFGTDRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPQCKLRRYQGNAKASPPLQDSASQTYESMCLEKDAALALPSLCPKYRKFQKAFGTDRVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TGESSVKDIHASVQPNERSENECLGGVPECRDLQVMLKCDESKLAMEPEETKKDPASQCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGESSVKDIHASVQPNERSENECLGGVPECRDLQVMLKCDESKLAMEPEETKKDPASQCP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TEKSEVTPFPHNSSIDPHGLYSLSLLHTYDQYGDLNFAGMQNTTVLTEKPLSGTDVQEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEKSEVTPFPHNSSIDPHGLYSLSLLHTYDQYGDLNFAGMQNTTVLTEKPLSGTDVQEKT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 FGESQDLPLKSDLGTREDSSVASSDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDTPCQMQLSPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGESQDLPLKSDLGTREDSSVASSDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDTPCQMQLSPAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AKDGSEQISQKRSECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLSSVNCPFISTLSTEGCSSNLEIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKDGSEQISQKRSECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLSSVNCPFISTLSTEGCSSNLEIGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DDYVSEPQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESCSAREQECEVKLPFNAQRIISLSRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDYVSEPQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESCSAREQECEVKLPFNAQRIISLSRND
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 FQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQSEKESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQSEKESLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KERDHILSTLGETKQNLTGLCQKVCKEAALSQEQIQILAKYSAADCPLSFLISEKDKSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KERDHILSTLGETKQNLTGLCQKVCKEAALSQEQIQILAKYSAADCPLSFLISEKDKSTP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 DGELALPSIFSLSDRPPAVLPPCARGNSEPGYARGQESQQMSTATSEQAGPAEQCRQSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGELALPSIFSLSDRPPAVLPPCARGNSEPGYARGQESQQMSTATSEQAGPAEQCRQSGG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB3 ISDFCQQMTDKCTTDE
::::::::::::::::
NP_001 ISDFCQQMTDKCTTDE
730
>>NP_996749 (OMIM: 602751) transcription regulator prote (736 aa)
initn: 4929 init1: 4929 opt: 4929 Z-score: 4038.8 bits: 757.9 E(85289): 3.2e-218
Smith-Waterman score: 4929; 100.0% identity (100.0% similar) in 736 aa overlap (1-736:1-736)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSLSENSVFAYESSVHSTNVLLSLNDQRKKDVLCDVTIFVEGQRFRAHRSVLAACSSYFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 MSLSENSVFAYESSVHSTNVLLSLNDQRKKDVLCDVTIFVEGQRFRAHRSVLAACSSYFH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRIVGQADGELNITLPEEVTVKGFEPLIQFAYTAKLILSKENVDEVCKCVEFLSVHNIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 SRIVGQADGELNITLPEEVTVKGFEPLIQFAYTAKLILSKENVDEVCKCVEFLSVHNIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SCFQFLKFKFLDSTADQQECPRKKCFSSHCQKTDLKLSLLDQRDLETDEVEEFLENKNVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 SCFQFLKFKFLDSTADQQECPRKKCFSSHCQKTDLKLSLLDQRDLETDEVEEFLENKNVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TPQCKLRRYQGNAKASPPLQDSASQTYESMCLEKDAALALPSLCPKYRKFQKAFGTDRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 TPQCKLRRYQGNAKASPPLQDSASQTYESMCLEKDAALALPSLCPKYRKFQKAFGTDRVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TGESSVKDIHASVQPNERSENECLGGVPECRDLQVMLKCDESKLAMEPEETKKDPASQCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 TGESSVKDIHASVQPNERSENECLGGVPECRDLQVMLKCDESKLAMEPEETKKDPASQCP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TEKSEVTPFPHNSSIDPHGLYSLSLLHTYDQYGDLNFAGMQNTTVLTEKPLSGTDVQEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 TEKSEVTPFPHNSSIDPHGLYSLSLLHTYDQYGDLNFAGMQNTTVLTEKPLSGTDVQEKT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 FGESQDLPLKSDLGTREDSSVASSDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDTPCQMQLSPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 FGESQDLPLKSDLGTREDSSVASSDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDTPCQMQLSPAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AKDGSEQISQKRSECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLSSVNCPFISTLSTEGCSSNLEIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 AKDGSEQISQKRSECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLSSVNCPFISTLSTEGCSSNLEIGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DDYVSEPQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESCSAREQECEVKLPFNAQRIISLSRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 DDYVSEPQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESCSAREQECEVKLPFNAQRIISLSRND
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 FQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQSEKESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 FQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQSEKESLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KERDHILSTLGETKQNLTGLCQKVCKEAALSQEQIQILAKYSAADCPLSFLISEKDKSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 KERDHILSTLGETKQNLTGLCQKVCKEAALSQEQIQILAKYSAADCPLSFLISEKDKSTP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 DGELALPSIFSLSDRPPAVLPPCARGNSEPGYARGQESQQMSTATSEQAGPAEQCRQSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 DGELALPSIFSLSDRPPAVLPPCARGNSEPGYARGQESQQMSTATSEQAGPAEQCRQSGG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB3 ISDFCQQMTDKCTTDE
::::::::::::::::
NP_996 ISDFCQQMTDKCTTDE
730
>>XP_016866656 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcription r (708 aa)
initn: 637 init1: 565 opt: 612 Z-score: 510.7 bits: 105.1 E(85289): 1e-21
Smith-Waterman score: 676; 30.4% identity (53.9% similar) in 601 aa overlap (1-523:87-668)
10 20
pF1KB3 MSLSE---NSVFAYESSVHSTNVLLSLNDQ
::..: . ...:::.:: ::.::.::::
XP_016 KRRKTQVEETSQISRNWNVFKSWQSQGVNGMSVDEKPDSPMYVYESTVHCTNILLGLNDQ
60 70 80 90 100 110
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 RKKDVLCDVTIFVEGQRFRAHRSVLAACSSYFHSRIVGQADGELNITLPEEVTVKGFEPL
::::.:::::..:: ..:::::.:::::: :: . .:::. ..: ..::::::..:: ::
XP_016 RKKDILCDVTLIVERKEFRAHRAVLAACSEYFWQALVGQTKNDLVVSLPEEVTARGFGPL
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 IQFAYTAKLILSKENVDEVCKCVEFLSVHNIEESCFQFLKFKFLDSTADQQECPRKKCFS
.::::::::.::.::. :: .:.::: .::.:.:::.::. ..:.: : :: .
XP_016 LQFAYTAKLLLSRENIREVIRCAEFLRMHNLEDSCFSFLQTQLLNSEDGLFVC-RK---D
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190
pF1KB3 SHCQKT--DLKLSLLDQRDLETDEVEEFLENKNVQTPQCKL--RRYQGNAKASP------
. ::. : . : ...: : . .. :. .. :. .. . . .: : :
XP_016 AACQRPHEDCENSAGEEEDEEEETMDS--ETAKMACPRDQMLPEPISFEAAAIPVAEKEE
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230
pF1KB3 ---PLQDSASQTYESMCLEKDAALALPSLCPKYRKFQKA---------------FGTD-R
: : ..: :: :::: :.:.:.: : :.. :
XP_016 ALLPEPDVPTDTKESS--EKDALTQY----PRYKKYQLACTKNVYNASSHSTSGFASTFR
300 310 320 330 340
240 250 260 270 280
pF1KB3 VRTGESSVKDIHASVQ-----PNERSENE----CLGG-VPECRDLQVMLKCDESKLAMEP
.. .:.: : : :.:..:.: ::.: :. .: .. :... . :
XP_016 EDNSSNSLKPGLARGQIKSEPPSEENEEESITLCLSGDEPDAKDRAGDVEMDRKQPSPAP
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320 330
pF1KB3 EETKKDPASQCPTEKSEVTP------FPHNSSIDPHGLYSLSLLH-------TYDQ---Y
: :. .: ..: : ..:.. :: : : : .:.
XP_016 TPTAPAGAACLERSRSVASPSCLRSLFSITKSVELSGLPSTSQQHFARSPACPFDKGITQ
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370
pF1KB3 GDLN-----FAGMQNTTVLTEK---------PLSGTDVQE--KTFGE--SQDLPLKSDLG
:::. :.: . . .: :: : .. : :: ... ..:.
XP_016 GDLKTDYTPFTGNYGQPHVGQKEVSNFTMGSPLRGPGLEALCKQEGELDRRSVIFSSSAC
470 480 490 500 510 520
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 TREDSSVAS-SDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDTPCQMQLSPAVAKDGSEQISQKRS
. ..:: : : ::......: . ::.: .. : .. : . .
XP_016 DQVSTSVHSYSGVSSLDKDLSEPVPKGLWVGAGQSLPSSQAYSHGGLMADHLPGRMRPNT
530 540 550 560 570 580
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 ECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLSSVNCPFISTLSTEGCSSNLEIGNDDYVSEPQQEPCP
:: . :.. : . : :: . . .. : .: . : .. ::
XP_016 SCP-VPIKVCPRSPPLETRTRTSSSCSSYSYAEDGSGGSPCSLPL------CEFSSSPCS
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