FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3011, 721 aa
1>>>pF1KB3011 721 - 721 aa - 721 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5910+/-0.00144; mu= -7.2842+/- 0.081
mean_var=407.6258+/-95.148, 0's: 0 Z-trim(105.3): 455 B-trim: 122 in 1/51
Lambda= 0.063525
statistics sampled from 7824 (8374) to 7824 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16
Scan time: 3.920
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS77189.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 376) 737 83.3 7.4e-16
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CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 621 72.9 1.8e-12
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CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 562 67.3 5.4e-11
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CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 554 66.5 8.2e-11
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 555 66.7 8.5e-11
>>CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 (721 aa)
initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 2426.4 bits: 459.5 E(32554): 7.8e-129
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 721 aa overlap (1-721:1-721)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 QGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 HYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 MQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALDFLEQILTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALDFLEQILTFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHIYNWERYHDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHIYNWERYHDC
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370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFDTNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFDTNYS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TEPCWQYSDHHENKYCDLECSHTCNYKTRSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDLSNWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TEPCWQYSDHHENKYCDLECSHTCNYKTRSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDLSNWK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EQSKEKSDKKGKSKCERNGLVKAQIALEEASQQLAGKEREKNQGFDFDSFIAGTIQLSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EQSKEKSDKKGKSKCERNGLVKAQIALEEASQQLAGKEREKNQGFDFDSFIAGTIQLSSQ
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pF1KB3 HEPTDVVDKLNDLNSSVSQLELKSLISKSVSQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HEPTDVVDKLNDLNSSVSQLELKSLISKSVSQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GEDCFFINQFCEVRKDEQVEKENTYTSYLDKFFSRKEDTEMLETEPVEDGKLGERGHEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GEDCFFINQFCEVRKDEQVEKENTYTSYLDKFFSRKEDTEMLETEPVEDGKLGERGHEEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 FLNNSGEFLFNKQLESIGIPQFHSPVGSPLKSIQATLTPSAMKSSPQIPHQTYSSILKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLNNSGEFLFNKQLESIGIPQFHSPVGSPLKSIQATLTPSAMKSSPQIPHQTYSSILKHL
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 N
:
CCDS10 N
>>CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 (587 aa)
initn: 1542 init1: 968 opt: 1791 Z-score: 917.8 bits: 180.1 E(32554): 8.4e-45
Smith-Waterman score: 1947; 53.9% identity (74.7% similar) in 608 aa overlap (1-574:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVK
:::: . . ...:.:::.:..:..::: : ::::.::::. ..::.:::.:.: .:.:
CCDS42 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 HALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLE
::::::::::::::::::::.:.:::.:..: : : ... .:::::::::::: .::
CCDS42 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQ---GELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 QGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDP
:: : ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::.:
CCDS42 QGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 HYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQ
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::. ::::::::::
CCDS42 HYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQ
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250 260 270 280 290 300
pF1KB3 MQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALDFLEQILTFS
::::::.:::..:::..::: :.: .. . : ..:: .::: .. ::.::::.::::.
CCDS42 MQLILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTW-EVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB3 PMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHIYNWE----R
:::::::: .:.::::: :: : ::: :.:::.::::.:::.:: ..:.. ::. :
CCDS42 PMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSR
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 YHDCQFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFD
: :. .: : .::: :::: : . :.::::::: .. :..::.
CCDS42 YPVSLSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGS-APLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQ----
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 TNYSTEPCWQYSDHHENKYCDLECSHTCNYKTRSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDL
.. : : .. .:. ...:.::. : ::::.:.::... .:: :::::.::
CCDS42 SHSSMERAFE-ADY----------GRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDL
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB3 SNWKE------------QSKEKSDKKGKSKCERNGLVKA-QIALEEASQQLAGKEREKNQ
:.::. .. . :. .. : ::. : . :.:: ::. .
CCDS42 SHWKQAAGAPPTATGLADTGAREDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560
pF1KB3 G---------------FDFDSFIAGTIQLSSQHEPTDVVD-KLNDLNSSVSQLELKSLI-
. ::.: ::. ...: .. : :. : ::.:::.. . .:.
CCDS42 SPPGRPAPVDGGASPQFDLDVFISRALKLCTK--PEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQ
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 SKSVSQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSGGEDCFFINQFCEVRKDEQVEKENTYT
... :.:.
CCDS42 TEAFSKERW
580
>>CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 (233 aa)
initn: 807 init1: 807 opt: 1175 Z-score: 617.6 bits: 123.2 E(32554): 4.4e-28
Smith-Waterman score: 1175; 75.6% identity (90.6% similar) in 234 aa overlap (1-234:1-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVK
:::: . . ...:.:::.:..:..::: : ::::.::::. ..::.:::.:.: .:.:
CCDS77 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 HALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLE
::::::::::::::::::::.:.:::.: :: : : ... .:::::::::::: .::
CCDS77 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKG---TDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLE
70 80 90 100 110
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pF1KB3 QGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDP
:: : ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::.:
CCDS77 QGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 HYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQ
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::. ::::
CCDS77 HYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGTL
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pF1KB3 MQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALDFLEQILTFS
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
initn: 797 init1: 322 opt: 842 Z-score: 450.1 bits: 92.9 E(32554): 9.5e-19
Smith-Waterman score: 910; 45.2% identity (72.2% similar) in 334 aa overlap (14-341:36-355)
10 20 30 40
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCD
::.: :: .:. .: :. :.: :: :.
CCDS10 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
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pF1KB3 KRVAIKKIVLTDPQSV-KHALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELN
::::::: . :. ...::::.:. :. :.:.. . .:: : .: .
CCDS10 TRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAS---------TLEAMR
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 SVYIVQEYMETDLANVLEQGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINT
.:::::. ::::: ..:.. : ..: :.::.:::::::::::::::::::.::.:::
CCDS10 DVYIVQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 E-DLVLKIGDFGLARIMDPHYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCI
: ::: ::::::: ::...: : :.: ..:.:::.:...:. ..:::.::.:..:::
CCDS10 TCD--LKICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB3 FAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDM-TEPHKP---
.::::... .: : : :.:.. :: .. ....: .: . :: . . : :
CCDS10 LAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHIL---GILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 LTQLLPGISREALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDE
..:.: . .:::.:...:::.: :.:.::::.:::. : : :::.. .:: . :
CCDS10 WAKLFPKSDSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAME
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 VDDILLMDETHSHIYNWERYHDCQFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVD
.::.
CCDS10 LDDLPKERLKELIFQETARFQPGVLEAP
360 370
>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa)
initn: 693 init1: 392 opt: 785 Z-score: 417.8 bits: 88.1 E(32554): 5.9e-17
Smith-Waterman score: 785; 41.4% identity (69.4% similar) in 324 aa overlap (14-332:49-363)
10 20 30 40
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCD
::.:..: .. .: :. :.: ::
CCDS11 GPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTG
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 KRVAIKKI--VLTDPQSVKHALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTEL
..:::::: .. ..:..:::.::.... ::::. . .:: : : : :.
CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRP-----TVPYG---EF
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 NSVYIVQEYMETDLANVLEQG-PLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFI
.:::.: . ::.:: ...... :: ::.: :.:::::::::.:::.:.::::::.::..
CCDS11 KSVYVVLDLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLV
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KB3 NTEDLVLKIGDFGLAR-IMDPHYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAG
: :. :::::::.:: . :. ..: ..:.:::.:.:.:: ..::.:::.:..:
CCDS11 N-ENCELKIGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVG
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 CIFAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSV-IPVYIRNDMTEPHKPL
:::.:::. . :: : . ..:.:::. . . : . . . .::.. . :
CCDS11 CIFGEMLARRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPW
250 260 270 280 290 300
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pF1KB3 TQLLPGISREALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEV
. :: .:.::..: ..: : : :..: :: ::... : : ::: . ::
CCDS11 ETVYPGADRQALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDR
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 DDILLMDETHSHIYNWERYHDCQFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDP
CCDS11 EALTRERIKEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDC
370 380 390 400 410 420
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
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10 20 30 40 50
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::.: :: .:. .: :. :.: :: :: ::::::: .
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:. ...::::::. :. :.::. . .:. .:. :. : :::::. :::
CCDS13 HQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKD----------VYIVQDLMET
70 80 90 100 110
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:: ..:. : ..: :.::.:::::::::::::::::::.::..:: : ::: ::
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120 130 140 150 160
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::::. :: ..: : :.: ..:.:::.:...:. ..:::.::.:..:::.::::... .:
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: : :.:.. :: .. ....: .: . :: . . ::: : ..:.:. . .
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CCDS13 ALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKE
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CCDS13 LIFEETARFQPGYRS
350 360
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10 20 30 40 50
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::. :: ::....... :.:.. ..... :. : : :.:.::.: . :
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pF1KB3 AGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLS-VIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALD
:. ...:..:::. . . : ... : ::.. :. ..... : . :.:
CCDS48 PGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVD
230 240 250 260 270 280
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pF1KB3 FLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHI
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CCDS48 LLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRD-LLIDEWKSLT
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pF1KB3 YNWERYHDCQFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLE
:.
CCDS48 YDEVISFVPPPLDQEEMES
350 360
>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDP
... .: ... ::..:.:.: :. : : .: :. :::.:: :. :
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKK--LSRP
10 20 30 40 50
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pF1KB3 -QSVKHA---LREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYME
::. :: ::....... :.:.. ..... :. : : :.:.::.: . :
CCDS48 FQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARS--------LEEFNDVYLVTHLMG
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pF1KB3 TDLANVLEQGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDF
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CCDS48 ADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVN-EDCELKILDF
120 130 140 150 160
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pF1KB3 GLARIMDPHYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLF
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:. ...:.: : : . : .. .:. . ::.. :. ..... : . :.
CCDS48 PGTDHINQLQQIMRLTGTPPAYLINRMPSHEA-RNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAV
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pF1KB3 DFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSH
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CCDS48 DLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRD-LLIDEWKSL
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:.
CCDS48 TYDEVISFVPPPLDQEEMES
350 360
>>CCDS77189.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 (376 aa)
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pF1KB3 KGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLI
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CCDS77 MWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQMQLI
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250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALDFLEQILTFSPMDR
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CCDS77 LETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTW-EVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDR
40 50 60 70 80
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CCDS77 LTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVS
90 100 110 120 130 140
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pF1KB3 QFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFDTNYS
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CCDS77 LSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGS-APLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQ----SHSS
150 160 170 180 190 200
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TEPCWQYSDHHENKYCDLECSHTCNYKTRSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDLSNWK
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CCDS77 MERAFE-ADY----------GRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDLSHWK
210 220 230 240 250
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CCDS77 QAAGAPPTATGLADTGAREDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSASPPG
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pF1KB3 ------------FDFDSFIAGTIQLSSQHEPTDVVD-KLNDLNSSVSQLELKSLI-SKSV
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CCDS77 RPAPVDGGASPQFDLDVFISRALKLCTK--PEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQTEAF
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pF1KB3 SQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSGGEDCFFINQFCEVRKDEQVEKENTYTSYLD
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CCDS77 SKERW
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
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10 20 30 40
pF1KB3 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCD
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CCDS42 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
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CCDS42 TRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAS---------TLEAMR
70 80 90 100 110
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pF1KB3 SVYIVQEYMETDLANVLEQGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINT
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CCDS42 DVYIVQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINT
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CCDS42 TCDL--KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCI
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pF1KB3 FAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDM-TEPHKP---
.::::... .: : : :.:.. :: .. ....: .: . :: . . : :
CCDS42 LAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHIL---GILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVA
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 LTQLLPGISREALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDE
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CCDS42 WAKLFPKSDSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDE-VGQSPAAVGLG
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 VDDILLMDETHSHIYNWERYHDCQFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVD
CCDS42 AGEQGGT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]