Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3009
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3009, 648 aa
1>>>pF1KB3009 648 - 648 aa - 648 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3696+/-0.00127; mu= 12.5446+/- 0.077
mean_var=300.4807+/-56.216, 0's: 0 Z-trim(111.9): 897 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.073989
statistics sampled from 11760 (12790) to 11760 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.393), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8443.1 ZNF202 gene_id:7753|Hs108|chr11 ( 648) 4524 497.3 2.6e-140
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1256 148.6 2.9e-35
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1166 139.0 2.3e-32
CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 425) 1111 132.7 9.8e-31
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1098 131.5 2.8e-30
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1076 129.3 1.6e-29
CCDS42713.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 383) 1008 121.7 1.9e-27
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1010 122.2 2.1e-27
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1004 121.6 3.4e-27
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1004 121.6 3.4e-27
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1004 121.6 3.5e-27
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1001 121.1 3.6e-27
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 990 119.9 8.2e-27
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 985 119.5 1.3e-26
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 962 117.1 7.7e-26
CCDS31939.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 533) 956 116.3 1.1e-25
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 959 117.0 1.1e-25
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 953 116.1 1.4e-25
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 945 115.5 3.3e-25
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 937 114.2 4.1e-25
CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 452) 933 113.8 5.3e-25
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 932 114.0 7.2e-25
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 932 114.0 7.4e-25
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 930 113.7 7.9e-25
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 930 113.7 8.2e-25
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 930 113.7 8.3e-25
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 930 113.7 8.3e-25
CCDS77434.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 438) 925 112.9 9.5e-25
CCDS46209.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 533) 926 113.1 9.8e-25
CCDS54324.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 545) 926 113.2 9.9e-25
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 921 112.4 1.2e-24
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 925 113.3 1.3e-24
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 921 112.5 1.3e-24
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 923 112.9 1.4e-24
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 921 112.6 1.4e-24
CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 387) 919 112.2 1.4e-24
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 918 112.1 1.5e-24
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 918 112.3 1.8e-24
CCDS77435.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 345) 913 111.5 2e-24
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 918 112.5 2e-24
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 916 112.1 2.1e-24
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 916 112.2 2.2e-24
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 916 112.2 2.2e-24
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 916 112.3 2.4e-24
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 914 112.0 2.6e-24
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 914 112.0 2.6e-24
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 914 112.0 2.6e-24
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 914 112.0 2.6e-24
CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 509) 911 111.5 2.9e-24
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 913 112.0 3.1e-24
>>CCDS8443.1 ZNF202 gene_id:7753|Hs108|chr11 (648 aa)
initn: 4524 init1: 4524 opt: 4524 Z-score: 2632.4 bits: 497.3 E(32554): 2.6e-140
Smith-Waterman score: 4524; 99.8% identity (100.0% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MATAVEPEDQDLWEEEGILMVKLEDDFTCRPESVLQRDDPVLETSHQNFRRFRYQEAASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MATAVEPEDQDLWEEEGILMVKLEDDFTCRPESVLQRDDPVLETSHQNFRRFRYQEAASP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 REALIRLRELCHQWLRPERRTKEQILELLVLEQFLTVLPGELQSWVRGQRPESGEEAVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 REALIRLRELCHQWLRPERRTKEQILELLVLEQFLTVLPGELQSWVRGQRPESGEEAVTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VEGLQKQPRRPRRWVTVHVHGQEVLSEETVHLGAEPESPNELQDPVQSSTPEQSPEETTQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VEGLQKQPRRPRRWVTVHVHGQEVLSEETVHLGVEPESPNELQDPVQSSTPEQSPEETTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SPDLGAPAEQRPHQEEELQTLQESEVPVPEDPDLPAERSSGDSEMVALLTALSQGLVTFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SPDLGAPAEQRPHQEEELQTLQESEVPVPEDPDLPAERSSGDSEMVALLTALSQGLVTFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DVAVCFSQDQWSDLDPTQKEFYGEYVLEEDCGIVVSLSFPIPRPDEISQVREEEPWVPDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DVAVCFSQDQWSDLDPTQKEFYGEYVLEEDCGIVVSLSFPIPRPDEISQVREEEPWVPDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QEPQETQEPEILSFTYTGDRSKDEEECLEQEDLSLEDIHRPVLGEPEIHQTPDWEIVFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QEPQETQEPEILSFTYTGDRSKDEEECLEQEDLSLEDIHRPVLGEPEIHQTPDWEIVFED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NPGRLNERRFGTNISQVNSFVNLRETTPVHPLLGRHHDCSVCGKSFTCNSHLVRHLRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NPGRLNERRFGTNISQVNSFVNLRETTPVHPLLGRHHDCSVCGKSFTCNSHLVRHLRTHT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GEKPYKCMECGKSYTRSSHLARHQKVHKMNAPYKYPLNRKNLEETSPVTQAERTPSVEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GEKPYKCMECGKSYTRSSHLARHQKVHKMNAPYKYPLNRKNLEETSPVTQAERTPSVEKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 YRCDDCGKHFRWTSDLVRHQRTHTGEKPFFCTICGKSFSQKSVLTTHQRIHLGGKPYLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YRCDDCGKHFRWTSDLVRHQRTHTGEKPFFCTICGKSFSQKSVLTTHQRIHLGGKPYLCG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ECGEDFSEHRRYLAHRKTHAAEELYLCSECGRCFTHSAAFAKHLRGHASVRPCRCNECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ECGEDFSEHRRYLAHRKTHAAEELYLCSECGRCFTHSAAFAKHLRGHASVRPCRCNECGK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB3 SFSRRDHLVRHQRTHTGEKPFTCPTCGKSFSRGYHLIRHQRTHSEKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SFSRRDHLVRHQRTHTGEKPFTCPTCGKSFSRGYHLIRHQRTHSEKTS
610 620 630 640
>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa)
initn: 4275 init1: 905 opt: 1256 Z-score: 746.5 bits: 148.6 E(32554): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 1350; 36.7% identity (63.9% similar) in 668 aa overlap (7-644:13-658)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MATAVEPEDQDLWEEEGILMVKLED-DFTCRPESVLQRD-DPVLETSHQNFRRF
:.. . ..:: : :: : . : : ::.. :: : . .::..
CCDS27 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 RYQEAASPREALIRLRELCHQWLRPERRTKEQILELLVLEQFLTVLPGELQSWVRGQRPE
:.: ..:.::: ::::::. :: :: .:::::::::::::::..:::::..::. ..::
CCDS27 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SGEEAVTLVEGLQKQPRRPRRWVTVHVHGQEVLSEETVHLGAEPESPNELQDPVQSSTPE
::::::..:: .:.. .. :.. .. ::. :::. ::. ::: :.. .
CCDS27 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEE-VSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESP-----PTSPLSGG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 QSPEETTQSPDLGAPAEQRPHQEEELQTLQESEVPVPEDPDLPAERSSGDSEMVALLTAL
..: . : : . :. . : . ::: :: .:::. ...: .
CCDS27 SAP-----GAHLEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTS-PVPT---LPQVGNSGDQAGATVLRMV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 S-QGLVTFKDVAVCFSQDQWSDLDPTQKEFYGEYVLEEDCGIVVSLSFPIPRPDEISQVR
: :...:..: ..: .:..: .:. . ... :. ... . . . .:.. .
CCDS27 RPQDTVAYEDLSVDYTQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KB3 E----EEP----------WVPDIQEPQETQEP---EILSFTYTGDRSKDEEECLEQEDLS
: : :: : .. : :. . : . :. :.. :: : .
CCDS27 EFFKGSESSNRTSGGLFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDED
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KB3 LE-------DIHRPVLGEPEIHQTP-DWEIVFEDNPG-RLNERRFGTNISQVNSFVNLRE
. : .. : .: . ..: . : :.. . . : .: : ... . ... ..
CCDS27 KKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDE--CGKAFNRSSHLIGHQR
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 TTPVHPLLG-RHHDCSVCGKSFTCNSHLVRHLRTHTGEKPYKCMECGKSYTRSSHLARHQ
.: : . ..:. :::.: .:.:. :::::::::::.: ::::.: .:::: .::
CCDS27 ---IHT--GEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQ
410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 KVHKMNAPYKYPLNRKNLEETSPVTQAERTPSVEKPYRCDDCGKHFRWTSDLVRHQRTHT
..:. . ::: : . ..: .:. .:: . ::::.:..::. : ...:.::: ::
CCDS27 RLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHT
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GEKPFFCTICGKSFSQKSVLTTHQRIHLGGKPYLCGECGEDFSEHRRYLAHRKTHAAEEL
:.::. :. ::..: .. : ::::: : ::: :.:::. ::. . . :.. :..:.
CCDS27 GKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKP
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 YLCSECGRCFTHSAAFAKHLRGHASVRPCRCNECGKSFSRRDHLVRHQRTHTGEKPFTCP
: :::::. :.... . .: : :.. .: .:.::::.:. :.:::: ::::::. :
CCDS27 YKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCN
580 590 600 610 620 630
630 640
pF1KB3 TCGKSFSRGYHLIRHQRTHSEKTS
:::::... ::: ::: :.
CCDS27 ECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGK
640 650 660 670 680 690
>>CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 6542 init1: 888 opt: 1166 Z-score: 694.5 bits: 139.0 E(32554): 2.3e-32
Smith-Waterman score: 1222; 35.8% identity (56.3% similar) in 673 aa overlap (43-644:46-643)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 WEEEGILMVKLEDDFTCRPESVLQRDDPVLETSHQNFRRFRYQEAASPREALIRLRELCH
:: .:::: : : . :.::.:: .:::::
CCDS11 ILLRWKSDKAQSGPYNVEKEILTSRFLRDTETCRQNFRNFPYPDLAGPRKALSQLRELCL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 QWLRPERRTKEQILELLVLEQFLTVLPGELQSWVRGQRPESGEEAVTLVEGLQKQPRRPR
.::::: ..:::::::::::::::.::::...::..: :::.:::::::: : .
CCDS11 KWLRPEIHSKEQILELLVLEQFLTILPGEVRTWVKSQYPESSEEAVTLVEDLTQ------
80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RWVTVHVHGQEVLSEETVHLGAEPESPNELQDPVQSSTPEQSPEETTQSPDLGAPAEQRP
.: ::. : .:. ...::: :
CCDS11 -----------ILEEEA---------------PQNSTLSQDTPEED-------------P
130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 HQEEELQTLQESEVPVPEDPDLPAERSSGDSEMVALLTALSQGLVTFKDVAVCFSQDQWS
. .. .:: . :: ...: .::::::: ..:..:
CCDS11 RGKHAFQTGWLN--------DLVTKES-----------------MTFKDVAVDITQEDWE
160 170 180
260 270 280 290 300
pF1KB3 DLDPTQKEFYGEYVLEEDCGIVVSLSFPIPRPDEISQVREEEPW--VPDIQE-PQETQEP
. :.:::.: .:. . .:::.. . :: : . :::: . .: : :. :
CCDS11 LMRPVQKELYKTVTLQ-NYWNMVSLGLTVYRPTVIPIL--EEPWMVIKEILEGPSPEWET
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KB3 EILSFTYTGDRSKDEEECLEQEDLSLEDIH--------RPVLGEPEIHQT----------
. . : . : :: .: : . ..::: . : : .::
CCDS11 KAQACTPVEDMSKLTKE--ETHTIKLEDSYDYDDRLERRGKGGFWKIHTDERGFSLKSVL
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390
pF1KB3 -----PDWEIVFEDNPGRLNERR-------FGTNISQVNSFVNLRETTPVH---------
: : . . . : : .. : :.... .: : ..: :
CCDS11 SQEYDPTEECLSKYDIYRNNFEKHSNLIVQFDTQLDNKTSVYNEGRATFNHVSYGIVHRK
310 320 330 340 350 360
400 410 420
pF1KB3 --------------------PLLGRH---------HDCSVCGKSFTCNSHLVRHLRTHTG
: : .: ..: ::: : : :. : : :::
CCDS11 ILPGEKPYKCNVCGKKFRKYPSLLKHQSTHAKEKSYECEECGKEFRHISSLIAHQRMHTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EKPYKCMECGKSYTRSSHLARHQKVHKMNAPYKYPLNRKNLEETSPVTQAERTPSVEKPY
::::.: .:::.... .::. ::..: . ::: :.. . . .: .:: . ::::
CCDS11 EKPYECHQCGKAFSQRAHLTIHQRIHTGEKPYKCDDCGKDFSQRAHLTIHQRTHTGEKPY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 RCDDCGKHFRWTSDLVRHQRTHTGEKPFFCTICGKSFSQKSVLTTHQRIHLGGKPYLCGE
.: .::: : .:.:. :::.::::::..:. :::.:::.. : ::.:: : ::: :.:
CCDS11 KCLECGKTFSHSSSLINHQRVHTGEKPYICNECGKTFSQSTHLLQHQKIHTGKKPYKCNE
490 500 510 520 530 540
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