Result of FASTA (omim) for
pF1KB2323
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB2323, 1021 aa
1>>>pF1KB2323 1021 - 1021 aa - 1021 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8291+/-0.000521; mu= 19.7530+/- 0.032
mean_var=104.0568+/-20.186, 0's: 0 Z-trim(109.3): 75 B-trim: 22 in 1/60
Lambda= 0.125730
statistics sampled from 17461 (17515) to 17461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 11.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001243038 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfa (1021) 6792 1244.2 0
NP_001243035 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfa (1021) 6792 1244.2 0
NP_004249 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamil (1021) 6792 1244.2 0
NP_001243040 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfa ( 959) 5474 1005.1 0
XP_016858335 (OMIM: 604516) PREDICTED: immunoglobu ( 974) 5474 1005.1 0
XP_016858336 (OMIM: 604516) PREDICTED: immunoglobu ( 974) 5474 1005.1 0
NP_001007238 (OMIM: 149700,603491) immunoglobulin (1194) 2097 392.6 6.6e-108
XP_005270851 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1199) 2090 391.4 1.6e-107
NP_001533 (OMIM: 149700,603491) immunoglobulin sup (1214) 1288 245.9 1e-63
XP_005270850 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1214) 1288 245.9 1e-63
XP_011539617 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1214) 1288 245.9 1e-63
XP_006710656 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1219) 1281 244.6 2.4e-63
XP_011539618 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu ( 657) 746 147.3 2.5e-34
NP_065173 (OMIM: 601204) prostaglandin F2 receptor ( 879) 717 142.2 1.2e-32
XP_016857363 (OMIM: 601204) PREDICTED: prostagland ( 885) 711 141.1 2.6e-32
NP_001307176 (OMIM: 606644) immunoglobulin superfa ( 613) 514 105.2 1.1e-21
XP_016858325 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 613) 514 105.2 1.1e-21
XP_016858326 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 613) 514 105.2 1.1e-21
NP_001193594 (OMIM: 606644) immunoglobulin superfa ( 613) 514 105.2 1.1e-21
XP_016858324 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 613) 514 105.2 1.1e-21
NP_443100 (OMIM: 606644) immunoglobulin superfamil ( 613) 514 105.2 1.1e-21
XP_011508461 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 501 102.9 5.6e-21
XP_016858329 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 501 102.9 5.6e-21
XP_016858328 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 501 102.9 5.6e-21
XP_016858327 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 501 102.9 5.6e-21
XP_006711694 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 596) 501 102.9 5.6e-21
>>NP_001243038 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamily (1021 aa)
initn: 6792 init1: 6792 opt: 6792 Z-score: 6661.7 bits: 1244.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6792; 100.0% identity (100.0% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:1-1021)
10 20 30 40 50 60
pF1KB2 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB2 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB2 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB2 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB2 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB2 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB2 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB2 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB2 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB2 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB2 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB2 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB2 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB2 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB2 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB2 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB2 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB2 N
:
NP_001 N
>>NP_001243035 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamily (1021 aa)
initn: 6792 init1: 6792 opt: 6792 Z-score: 6661.7 bits: 1244.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6792; 100.0% identity (100.0% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:1-1021)
10 20 30 40 50 60
pF1KB2 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB2 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB2 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB2 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB2 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB2 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB2 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB2 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB2 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB2 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB2 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB2 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB2 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB2 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB2 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB2 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB2 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB2 N
:
NP_001 N
>>NP_004249 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamily me (1021 aa)
initn: 6792 init1: 6792 opt: 6792 Z-score: 6661.7 bits: 1244.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6792; 100.0% identity (100.0% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:1-1021)
10 20 30 40 50 60
pF1KB2 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB2 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB2 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB2 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB2 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB2 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB2 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB2 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB2 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB2 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB2 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB2 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB2 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
730 740 750 760 770 780
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pF1KB2 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB2 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB2 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
910 920 930 940 950 960
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pF1KB2 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB2 N
:
NP_004 N
>>NP_001243040 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamily (959 aa)
initn: 6388 init1: 5472 opt: 5474 Z-score: 5370.0 bits: 1005.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6268; 93.9% identity (93.9% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:1-959)
10 20 30 40 50 60
pF1KB2 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQHFQWSV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB2 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKDAGEYE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB2 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATAQHTHL
:::::::::::::::::::::
NP_001 CHTPNTDEKYYGSYSAKTNLI---------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB2 SVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----------------------DFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLSIERLQ
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pF1KB2 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNITADSLFAEGKPL
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB2 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAF
240 250 260 270 280 290
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pF1KB2 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSVVMSTKNK
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pF1KB2 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSY
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pF1KB2 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESS
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pF1KB2 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGT
480 490 500 510 520 530
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pF1KB2 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVYDRNSLYNNRPPRASA
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pF1KB2 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNGNLQLAIIWYFSPVST
600 610 620 630 640 650
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pF1KB2 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHILNVEDSDRGKYHCAV
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KB2 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVTEHREVAIRCSLESVG
720 730 740 750 760 770
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pF1KB2 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVE
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910 920 930 940 950 960
pF1KB2 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLF
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB2 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAGGVTTNRREDEEEDEG
900 910 920 930 940 950
pF1KB2 N
:
NP_001 N
>>XP_016858335 (OMIM: 604516) PREDICTED: immunoglobulin (974 aa)
initn: 6388 init1: 5472 opt: 5474 Z-score: 5369.9 bits: 1005.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6268; 93.9% identity (93.9% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:16-974)
10 20 30 40
pF1KB2 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLVTLLGRKRTVLAQMAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB2 TGHQGPSEQHFQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGHQGPSEQHFQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB2 LHISKLQMKDAGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHISKLQMKDAGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLI------------------------
130 140 150
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pF1KB2 LTCEASKATAQHTHLSVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLN
::::::::::::::::::::::
XP_016 --------------------------------------DFILVPGPLYTERFAASDVQLN
160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KB2 KLGPTTFRLSIERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLGPTTFRLSIERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQ
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KB2 VNITADSLFAEGKPLELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VNITADSLFAEGKPLELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB2 SQGELQVSKLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQGELQVSKLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHL
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB2 RKPAARSVVMSTKNKQQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKPAARSVVMSTKNKQQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQ
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KB2 DGIVQLGASYGVPSYHGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGIVQLGASYGVPSYHGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLS
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB2 WTQKISVTVKSLESSLQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTQKISVTVKSLESSLQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPAS
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB2 SHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVY
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB2 DRNSLYNNRPPRASAISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DRNSLYNNRPPRASAISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNG
600 610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB2 NLQLAIIWYFSPVSTNASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLQLAIIWYFSPVSTNASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHI
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB2 LNVEDSDRGKYHCAVEEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNVEDSDRGKYHCAVEEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVT
720 730 740 750 760 770
830 840 850 860 870 880
pF1KB2 EHREVAIRCSLESVGSSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EHREVAIRCSLESVGSSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCY
780 790 800 810 820 830
890 900 910 920 930 940
pF1KB2 RSSSTDFVLKLHQVEMEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSSSTDFVLKLHQVEMEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTL
840 850 860 870 880 890
950 960 970 980 990 1000
pF1KB2 PSRICSSAPLLYFLFICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSRICSSAPLLYFLFICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEKALWVDLKEAG
900 910 920 930 940 950
1010 1020
pF1KB2 GVTTNRREDEEEDEGN
::::::::::::::::
XP_016 GVTTNRREDEEEDEGN
960 970
>>XP_016858336 (OMIM: 604516) PREDICTED: immunoglobulin (974 aa)
initn: 6388 init1: 5472 opt: 5474 Z-score: 5369.9 bits: 1005.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6268; 93.9% identity (93.9% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:16-974)
10 20 30 40
pF1KB2 MAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLVTLLGRKRTVLAQMAGISYVASFFLLLTKLSIGQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB2 TGHQGPSEQHFQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGHQGPSEQHFQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB2 LHISKLQMKDAGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHISKLQMKDAGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLI------------------------
130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB2 LTCEASKATAQHTHLSVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLN
::::::::::::::::::::::
XP_016 --------------------------------------DFILVPGPLYTERFAASDVQLN
160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KB2 KLGPTTFRLSIERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLGPTTFRLSIERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQ
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KB2 VNITADSLFAEGKPLELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VNITADSLFAEGKPLELVCLVVSSGRDPQLQGIWFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB2 SQGELQVSKLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQGELQVSKLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHL
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB2 RKPAARSVVMSTKNKQQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKPAARSVVMSTKNKQQVVWEGETLAFLCKAGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQ
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KB2 DGIVQLGASYGVPSYHGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGIVQLGASYGVPSYHGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLS
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB2 WTQKISVTVKSLESSLQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTQKISVTVKSLESSLQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPAS
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB2 SHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKKTKVSQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEVEVY
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB2 DRNSLYNNRPPRASAISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DRNSLYNNRPPRASAISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILSRSNG
600 610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB2 NLQLAIIWYFSPVSTNASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLQLAIIWYFSPVSTNASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEKVSQDLFQLHI
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB2 LNVEDSDRGKYHCAVEEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNVEDSDRGKYHCAVEEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYWTENVT
720 730 740 750 760 770
830 840 850 860 870 880
pF1KB2 EHREVAIRCSLESVGSSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EHREVAIRCSLESVGSSATLYSVMWYWNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEEGLRRHLHCY
780 790 800 810 820 830
890 900 910 920 930 940
pF1KB2 RSSSTDFVLKLHQVEMEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSSSTDFVLKLHQVEMEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMVLTVLPSEPTL
840 850 860 870 880 890
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]