Result of FASTA (ccds) for
pF1KB1630
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1630, 1052 aa
1>>>pF1KB1630 1052 - 1052 aa - 1052 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0073+/-0.000933; mu= 11.9754+/- 0.057
mean_var=179.9031+/-35.932, 0's: 0 Z-trim(112.3): 62 B-trim: 8 in 1/53
Lambda= 0.095621
statistics sampled from 13031 (13092) to 13031 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 5.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 7036 983.5 0
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 5792 811.9 0
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 2887 411.2 6.1e-114
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 2887 411.2 6.2e-114
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 1434 210.7 1.2e-53
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 1435 211.0 1.9e-53
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 1397 205.8 6.7e-52
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 1215 180.4 1.3e-44
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 1188 177.0 3.6e-43
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 1188 177.0 3.6e-43
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 1188 177.0 3.7e-43
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 1160 173.1 5.1e-42
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 1157 172.7 6.7e-42
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 1157 172.7 6.7e-42
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 919 140.0 7.7e-32
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 895 136.2 2.4e-31
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 770 118.9 3.3e-26
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 770 119.0 3.7e-26
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 770 119.0 3.7e-26
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 770 119.0 3.8e-26
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 770 119.0 4.2e-26
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 770 119.1 4.4e-26
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 688 107.9 1.7e-22
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 688 107.9 1.7e-22
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 688 107.9 1.8e-22
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 683 107.3 2.9e-22
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 683 107.3 2.9e-22
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 683 107.3 2.9e-22
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 683 107.3 2.9e-22
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 675 106.2 6.2e-22
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 677 106.6 7.9e-22
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 677 106.6 7.9e-22
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 669 105.5 1.8e-21
CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 666 105.1 2.4e-21
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 663 104.6 2.5e-21
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 663 104.7 2.8e-21
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 654 103.4 6.8e-21
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 606 96.6 4.4e-19
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 589 94.3 2.2e-18
CCDS58914.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 ( 596) 461 76.3 2.2e-13
CCDS3639.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1026) 461 76.5 3.3e-13
CCDS47101.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1028) 461 76.5 3.4e-13
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 ( 747) 448 74.6 9.1e-13
CCDS35072.1 ERCC6L2 gene_id:375748|Hs108|chr9 ( 712) 427 71.7 6.5e-12
CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 726) 426 71.5 7.3e-12
CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 910) 426 71.6 8.7e-12
CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX (1250) 423 71.3 1.5e-11
>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa)
initn: 7036 init1: 7036 opt: 7036 Z-score: 5252.4 bits: 983.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7036; 100.0% identity (100.0% similar) in 1052 aa overlap (1-1052:1-1052)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 IFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 KPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 RDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 LHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 NWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 SADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 REWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 REWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 NSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 SINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 TVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 VFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 EKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB1 LFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB1 GFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 MAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB1 KLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KB1 AEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKLKL
1030 1040 1050
>>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058 aa)
initn: 5731 init1: 5731 opt: 5792 Z-score: 4324.9 bits: 811.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5793; 81.7% identity (92.9% similar) in 1044 aa overlap (11-1051:29-1057)
10 20 30 40
pF1KB1 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAA
: : .. . ::. :. .. ...:: :
CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKG--EKKKE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB1 QAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELF
. :.: : : : ..::. :: :::::..:::.:::.::::::::
CCDS76 KNVSSFQLKLAAKA----------PKSEKEM---DPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELF
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB1 AHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKAT
::::::.:::.:::::.:: :::::::::::.:.:.:::::::::::::::::.:: :..
CCDS76 AHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTS
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB1 NVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYM
::: ::: :::::: : :::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.
CCDS76 NVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB1 KHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDV
:::::::::::::::::::::::.:::::::.:: .:..:::. ::::.:: ..::::::
CCDS76 KHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDV
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB1 CVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQN
:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS76 CVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQN
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB1 NLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEK
::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::.::::::::.::::
CCDS76 NLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEK
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB1 SLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYL
:::::::.:::.:::::::::::.:::::::.:::.::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB1 FDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWR
::::::::::::: :.:.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS76 FDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWR
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB1 NYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWN
.::::::::::::.::...:.:.: :::.::.:::::::::::::::.::::::::::::
CCDS76 GYEYCRLDGQTPHEEREEAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWN
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB1 PQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNL
:::::::::::::::: : :::::.:::::::::::::::.::::::::::::::.::.
CCDS76 PQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQS
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB1 NKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRN
::..:.::::::::::::::::::::.::::: ::::: ::::::::.:.:::::::::
CCDS76 NKLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRN
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KB1 FTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKA
: :: :.:.:.:::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS76 FRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKA
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB1 PRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDE
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:: : ::.::: :::
CCDS76 PRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDG
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB1 AESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIE
:: :. :: ::::::::::::::.:::::::::::::.:::::.:::::::::.::::.:
CCDS76 AEPLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVME
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB1 YSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::.:::.
CCDS76 YSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTS
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KB1 KGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCN
:::::::::::::::::::.:::.::::.:::::.::.::::::::.:::::::.:::::
CCDS76 KGKNYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCN
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB1 TLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPK-PSTQKRKMDGAPDGRGRK--KKLKL
:::.:::.::::.::.:.::::::. : : .:::: ..: .. :.: ::.:
CCDS76 TLISLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
1010 1020 1030 1040 1050
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CCDS76 KKVKS
1070
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CCDS92 KTLSEFSVVFSLLLTGTPIQNSLQELYSLLSFVEPDLFSKEEVGDFIQRYQDIEKESESA
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CCDS92 SELHKLLQPFLLRRVKAEVATELPKKTEVVIYHGMSALQKKYYKAILMKDLDAFENETAK
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CCDS92 RVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHLAIKNFGQ--QPIFVFLLSTR
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CCDS92 AGGVGMNLTAADTVIFVDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNKSVKVIRLIGRDTVEEIVYRK
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pF1KB1 AEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQM---IRHGATHVFASKESEITDEDIDGI
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CCDS92 AASKLQLTNMIIEGGHFT-LGAQKPAADADLQLSEILKFGLDKLLASEGSTMDEIDLESI
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pF1KB1 LERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRE
: : : .. .:.. :. . .. .: :::.:: . :: :..
CCDS92 L--GETKDGQWVSDALPAAEGGSRD-QEEGKNHMYLFEGKDYSK----------EPSKED
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pF1KB1 RKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIG
::. :.. . ... :: . .. . . . : : : : :: .
CCDS92 RKS-------FEQLVNLQKTLLEKASQEGRSLRNKG-SVLIPGLVEGSTK-----RKRV-
590 600 610 620 630
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pF1KB1 YKVPRNPELPNAAQAQKEE----QLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQF
.:: . : ...: . .. : .. . :: :.:.:. . :.. ....:
CCDS92 ----LSPEELEDRQKKRQEAAAKRRRLIEEKKRQKEEAEHKKKM-----AWWESNNYQSF
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pF1KB1 IKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQR
.:. .:.::
CCDS92 CLPSEESEPEDLENGEESSAELDYQDPDATSLKYVSGDVTHPQAGAEDALIVHCVDDSGH
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>>CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828 aa)
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pF1KB1 SPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRP
: ::.. :: .:: .. : : : :
CCDS10 FNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWM-GLP
370 380 390 400 410 420
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pF1KB1 RIK---KDEK---QNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRF---EDSPSYV-
. .:: ... . : : :.... . :. :: . :: . .:.:.
CCDS10 YSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKT---IPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLG
430 440 450 460 470
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pF1KB1 -KWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMV
. .:::::..::::: . .. . :::::::::::.::::.:.:. : ... :: ..
CCDS10 GENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLI
480 490 500 510 520 530
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CCDS32 PAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSW
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CCDS32 AQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKF
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CCDS32 YVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAA
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CCDS32 LGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTP
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