Result of FASTA (ccds) for
pF1KB1569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1569, 983 aa
1>>>pF1KB1569 983 - 983 aa - 983 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1648+/-0.00147; mu= 7.0426+/- 0.085
mean_var=320.3625+/-69.983, 0's: 0 Z-trim(105.7): 680 B-trim: 90 in 1/52
Lambda= 0.071656
statistics sampled from 7760 (8553) to 7760 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 6648 703.4 5.8e-202
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 4715 503.5 8.5e-142
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 4709 502.9 1.3e-141
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 4325 463.2 1.1e-129
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 3777 406.6 1.3e-112
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 3719 400.6 8.3e-111
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 3667 394.8 2.4e-109
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 3370 364.5 6e-100
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 3370 364.5 6.2e-100
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 3368 364.3 6.9e-100
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 3356 363.0 1.6e-99
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 3167 343.5 1.2e-93
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3 (1130) 3076 334.2 9.2e-91
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 2680 293.1 1.8e-78
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 2651 290.1 1.4e-77
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 2173 240.8 1.1e-62
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 2173 240.8 1.1e-62
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 2057 228.8 4.4e-59
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 ( 495) 1860 208.0 3.9e-53
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 (1008) 1747 196.7 2e-49
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 1700 191.9 5.7e-48
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 (1022) 1545 175.8 3.8e-43
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 ( 729) 1471 168.0 6.3e-41
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 279) 1199 139.3 1e-32
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 ( 295) 1093 128.4 2.1e-29
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 765 94.8 4.7e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 765 94.8 4.7e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 765 94.8 4.8e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 765 94.8 4.9e-19
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 769 95.8 6.4e-19
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 759 94.8 1.3e-18
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 759 94.8 1.3e-18
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 756 94.4 1.6e-18
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 747 93.0 1.8e-18
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 746 92.9 1.9e-18
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 743 92.5 2.3e-18
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 748 93.5 2.5e-18
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 748 93.5 2.5e-18
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 740 92.2 2.8e-18
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 740 92.2 2.9e-18
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 738 92.0 3.4e-18
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 737 91.9 3.6e-18
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 732 91.4 5e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 720 89.8 9e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 723 90.4 9e-18
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 723 90.7 1.3e-17
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 720 90.3 1.3e-17
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 717 90.0 1.7e-17
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 716 89.9 1.9e-17
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 716 90.0 2e-17
>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 (983 aa)
initn: 6648 init1: 6648 opt: 6648 Z-score: 3739.3 bits: 703.4 E(32554): 5.8e-202
Smith-Waterman score: 6648; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
490 500 510 520 530 540
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pF1KB1 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
550 560 570 580 590 600
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pF1KB1 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB1 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB1 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KB1 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
:::::::::::::::::::::::
CCDS29 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
970 980
>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016 aa)
initn: 3366 init1: 2127 opt: 4715 Z-score: 2659.2 bits: 503.5 E(32554): 8.5e-142
Smith-Waterman score: 4715; 68.4% identity (90.3% similar) in 977 aa overlap (10-983:44-1016)
10 20 30
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
:: :..: . :. .::::::::::.:..
CCDS75 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB1 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
:.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:. ..:..:..::
CCDS75 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB1 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
:::::::::.: :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
CCDS75 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB1 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
:..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.
CCDS75 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB1 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
::..:.:: :::::.: ..::.:.::.::::::::::: :.:::::.. ::.:::::.
CCDS75 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB1 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
:: ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
CCDS75 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB1 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
:::.:.: : ::::::::.. : ::::. . :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
CCDS75 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB1 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
:::::::::::.::::::.:: ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
CCDS75 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB1 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..: .::: ..::::::::::::::
CCDS75 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB1 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI-GRFCGY-KSKHGA
. ::.:::::.: : . :...::. .::.:..:..:::.::: ::. :: ::: :.:.
CCDS75 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGRRCGYSKAKQDP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB1 DEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVC
.:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
CCDS75 EEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVC
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB1 SGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVM
:::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS75 SGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVM
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB1 IVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB1 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::
CCDS75 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWE
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KB1 VMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVS
:.::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::::::.::.::::..::.
CCDS75 VVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVN
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KB1 ILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVE
.::::::::.::: ...:. : :::: ..: . ..:..:.::... .. :::
CCDS75 MLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENG
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KB1 YSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
::: :..:... .:....:::.:: ::::..:.. ...: :: ::.
CCDS75 YSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
970 980 990 1000 1010
>>CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015 aa)
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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.:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
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:::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
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CCDS35 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
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CCDS35 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWE
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CCDS35 VVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVN
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CCDS35 MLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENG
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CCDS35 YSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
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>>CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 (986 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS24 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
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CCDS24 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK
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CCDS24 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEE
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CCDS24 KDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYS
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CCDS24 ISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGV
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CCDS24 SKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYY
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CCDS24 EKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRI
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CCDS24 IGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEK------HLN-QG
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CCDS24 DDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQD
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CCDS24 VIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTG
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pF1KB1 SAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMK
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CCDS24 TESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLA
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pF1KB1 KVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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CCDS24 RIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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>>CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 (984 aa)
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CCDS46 NGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAE
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CCDS46 SRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGG
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CCDS46 RDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAIN
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CCDS46 GVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIR
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::::...: . .. :.. ... :..:.: .:: :.::::.:::: : :. :.: :.
CCDS46 YYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDD
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: :. .:: :::....... :.: .. .: .:... ..: :...:. . :
CCDS46 YKSELREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGS-P
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CCDS46 GMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVA
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CCDS46 IKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFL
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pF1KB1 RKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVL
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CCDS46 RQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYL
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pF1KB1 EDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMS
.:: . .::. :::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::.::::::.::
CCDS46 QDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMS
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CCDS46 NQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLK
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CCDS46 TVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSE
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CCDS46 DLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
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>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 (998 aa)
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CCDS32 PPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPESGWEEVSGY
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:: ..:::::::::: . ::::::::... : ..:..:::::::.::::::: . :.:::
CCDS32 DEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIPNIPGSCKE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
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::::.:.:.:.: . . :. ..:.:::: ::::...: : ..::..: ::.
CCDS32 TFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNTKVRSFGPL
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.: :::::::: :::..:.:::...::: :. ..:.::.:. . ::: . :.:. :
CCDS32 SKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVIAPGTCIPN
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CCDS32 AVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQGEGPCLPC
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::.: : .. : :.::..:::.: . ::: :: ::.::::.::::.::.:: : :
CCDS32 PPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLILEWSEPRD
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::: :. .:.::::: . . . : :. ::.:.:::.:::. : .. ::::: ::::
CCDS32 LGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLLAHTRYTFE
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..:::::: : : ..:::.::::::::: : :.. .: .:..::: ::.:::.::
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:::.::.::.: .: . .. ..: ...:.::. :: :.::::.:::: :: ::::
CCDS32 DYEMKYFEKSEGIAS--TVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQYSRPAEFET
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. . : . . . :. .:. ::.........:. . : : :..::.: . . . .
CCDS32 TSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAI--VCLRKQRHGSDSEYTEKLQQY
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. ::...:.:: :::::..::.:::::.:.. ..:..:.::::::::: :::: :...:
CCDS32 IA-PGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKQPGRRE
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. ::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::.::::.::.::: .:
CCDS32 VFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFMENCAL
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::::: .:.:::::::::::::::.::::::.:.::::::::::::.:::::::::::::
CCDS32 DSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGL
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:: ::::: . .::. :::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS32 SRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPY
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pF1KB1 WEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNP
:.:::::::.::.. ::::::::::.::.::::::: .::: :::: :::. :::::::
CCDS32 WDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNA
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pF1KB1 GSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAK
.:::.:.:: . :. :::.. : ::: :.::::... .. :: :... ..: : .:.
CCDS32 ASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFDLVAQ
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pF1KB1 ISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
....:. ..:::..: ::::.:::. .. : : .::
CCDS32 MTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQM-NQTLPVQV
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pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
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CCDS46 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
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CCDS46 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
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CCDS46 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
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CCDS46 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
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CCDS46 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
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CCDS46 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
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CCDS46 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
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CCDS46 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDCMYYFNAV
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:::.. : :::.:.::::::::: : ... . .::.:::..:..:::.:::::.
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.::::. .: . : ... ..::...:: .:::::.::::.:::: : :. :.: ..
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. ::.. :.:: :::::..::.:::::.: . ..:..:.:::::::::::.::::.:.:
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: ::::::: :::::::::::.::::::::::::.:.:::::::: ::::.::.::::::
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:::::..:.:::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::.:::::::::::::
CCDS22 DSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGL
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pF1KB1 SRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPY
:: :::: . .::. :::::::::.:::: ::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS22 SRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPY
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pF1KB1 WEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNP
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CCDS22 WDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNP
830 840 850 860 870 880
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pF1KB1 GSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAK
.::: .. .. . :::.. : :.: :. .::... .. :: :... ..: :....
CCDS22 NSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQ
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pF1KB1 ISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
. .:. .::::..: ::::..::.....:
CCDS22 MMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
950 960 970 980
>>CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055 aa)
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pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
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CCDS81 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDE
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pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
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CCDS81 NMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETF
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pF1KB1 NLYYMESDDDHGVK----FREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNK
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CCDS81 NLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSR
120 130 140 150 160 170
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pF1KB1 KGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSK
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CCDS81 SGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB1 EEDPP-RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYE--ERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPP
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CCDS81 EVDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB1 HSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTG
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CCDS81 NSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSG
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pF1KB1 GRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAV
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CCDS81 GREDLVYNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAV
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pF1KB1 NGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEV
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CCDS81 NGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYEL
420 430 440 450 460 470
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pF1KB1 KYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDS
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CCDS81 QYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEA
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CCDS81 EYQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIV---CNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGH
540 550 560 570 580
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pF1KB1 LKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKE
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CCDS81 MT-PGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKRE
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