Result of FASTA (ccds) for
pF1KB1499
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1499, 1321 aa
1>>>pF1KB1499 1321 - 1321 aa - 1321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5200+/-0.00117; mu= 1.4860+/- 0.070
mean_var=424.9245+/-84.930, 0's: 0 Z-trim(113.1): 136 B-trim: 53 in 1/53
Lambda= 0.062218
statistics sampled from 13661 (13795) to 13661 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 6.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12397.1 NCAN gene_id:1463|Hs108|chr19 (1321) 9266 847.6 0
CCDS54876.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (2409) 1376 139.7 9.2e-32
CCDS4060.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (3396) 1376 139.9 1.1e-31
CCDS47242.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 ( 655) 1319 133.9 1.4e-30
CCDS54875.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (1642) 1327 135.1 1.5e-30
CCDS53971.1 ACAN gene_id:176|Hs108|chr15 (2431) 1191 123.1 9.2e-27
CCDS53970.1 ACAN gene_id:176|Hs108|chr15 (2530) 1191 123.1 9.4e-27
CCDS1150.1 BCAN gene_id:63827|Hs108|chr1 ( 671) 1144 118.2 7.4e-26
CCDS1149.1 BCAN gene_id:63827|Hs108|chr1 ( 911) 1144 118.4 9e-26
CCDS10346.1 HAPLN3 gene_id:145864|Hs108|chr15 ( 360) 827 89.5 1.8e-17
CCDS76790.1 HAPLN3 gene_id:145864|Hs108|chr15 ( 422) 827 89.6 2e-17
CCDS1148.1 HAPLN2 gene_id:60484|Hs108|chr1 ( 340) 766 84.0 7.7e-16
CCDS4061.1 HAPLN1 gene_id:1404|Hs108|chr5 ( 354) 759 83.4 1.2e-15
>>CCDS12397.1 NCAN gene_id:1463|Hs108|chr19 (1321 aa)
initn: 9266 init1: 9266 opt: 9266 Z-score: 4514.4 bits: 847.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9266; 100.0% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MGAPFVWALGLLMLQMLLFVAGEQGTQDITDASERGLHMQKLGSGSVQAALAELVALPCL
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CCDS12 MGAPFVWALGLLMLQMLLFVAGEQGTQDITDASERGLHMQKLGSGSVQAALAELVALPCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 FTLQPRPSAARDAPRIKWTKVRTASGQRQDLPILVAKDNVVRVAKSWQGRVSLPSYPRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FTLQPRPSAARDAPRIKWTKVRTASGQRQDLPILVAKDNVVRVAKSWQGRVSLPSYPRRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 ANATLLLGPLRASDSGLYRCQVVRGIEDEQDLVPLEVTGVVFHYRSARDRYALTFAEAQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ANATLLLGPLRASDSGLYRCQVVRGIEDEQDLVPLEVTGVVFHYRSARDRYALTFAEAQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 ACRLSSAIIAAPRHLQAAFEDGFDNCDAGWLSDRTVRYPITQSRPGCYGDRSSLPGVRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ACRLSSAIIAAPRHLQAAFEDGFDNCDAGWLSDRTVRYPITQSRPGCYGDRSSLPGVRSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 GRRNPQELYDVYCFARELGGEVFYVGPARRLTLAGARAQCRRQGAALASVGQLHLAWHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRRNPQELYDVYCFARELGGEVFYVGPARRLTLAGARAQCRRQGAALASVGQLHLAWHEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 LDQCDPGWLADGSVRYPIQTPRRRCGGPAPGVRTVYRFANRTGFPSPAERFDAYCFRAHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDQCDPGWLADGSVRYPIQTPRRRCGGPAPGVRTVYRFANRTGFPSPAERFDAYCFRAHH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 PTSQHGDLETPSSGDEGEILSAEGPPVRELEPTLEEEEVVTPDFQEPLVSSGEEETLILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTSQHGDLETPSSGDEGEILSAEGPPVRELEPTLEEEEVVTPDFQEPLVSSGEEETLILE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 EKQESQQTLSPTPGDPMLASWPTGEVWLSTVAPSPSDMGAGTAASSHTEVAPTDPMPRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKQESQQTLSPTPGDPMLASWPTGEVWLSTVAPSPSDMGAGTAASSHTEVAPTDPMPRRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 GRFKGLNGRYFQQQEPEPGLQGGMEASAQPPTSEAAVNQMEPPLAMAVTEMLGSGQSRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRFKGLNGRYFQQQEPEPGLQGGMEASAQPPTSEAAVNQMEPPLAMAVTEMLGSGQSRSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 WADLTNEVDMPGAGSAGGKSSPEPWLWPPTMVPPSISGHSRAPVLELEKAEGPSARPATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WADLTNEVDMPGAGSAGGKSSPEPWLWPPTMVPPSISGHSRAPVLELEKAEGPSARPATP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 DLFWSPLEATVSAPSPAPWEAFPVATSPDLPMMAMLRGPKEWMLPHPTPISTEANRVEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLFWSPLEATVSAPSPAPWEAFPVATSPDLPMMAMLRGPKEWMLPHPTPISTEANRVEAH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 GEATATAPPSPAAETKVYSLPLSLTPTGQGGEAMPTTPESPRADFRETGETSPAQVNKAE
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CCDS12 GEATATAPPSPAAETKVYSLPLSLTPTGQGGEAMPTTPESPRADFRETGETSPAQVNKAE
670 680 690 700 710 720
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pF1KB1 HSSSSPWPSVNRNVAVGFVPTETATEPTGLRGIPGSESGVFDTAESPTSGLQATVDEVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HSSSSPWPSVNRNVAVGFVPTETATEPTGLRGIPGSESGVFDTAESPTSGLQATVDEVQD
730 740 750 760 770 780
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pF1KB1 PWPSVYSKGLDASSPSAPLGSPGVFLVPKVTPNLEPWVATDEGPTVNPMDSTVTPAPSDA
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CCDS12 PWPSVYSKGLDASSPSAPLGSPGVFLVPKVTPNLEPWVATDEGPTVNPMDSTVTPAPSDA
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850 860 870 880 890 900
pF1KB1 SGIWEPGSQVFEEAESTTLSPQVALDTSIVTPLTTLEQGDKVGVPAMSTLGSSSSQPHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGIWEPGSQVFEEAESTTLSPQVALDTSIVTPLTTLEQGDKVGVPAMSTLGSSSSQPHPE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 PEDQVETQGTSGASVPPHQSSPLGKPAVPPGTPTAASVGESASVSSGEPTVPWDPSSTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEDQVETQGTSGASVPPHQSSPLGKPAVPPGTPTAASVGESASVSSGEPTVPWDPSSTLL
910 920 930 940 950 960
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pF1KB1 PVTLGIEDFELEVLAGSPGVESFWEEVASGEEPALPGTPMNAGAEEVHSDPCENNPCLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVTLGIEDFELEVLAGSPGVESFWEEVASGEEPALPGTPMNAGAEEVHSDPCENNPCLHG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB1 GTCNANGTMYGCSCDQGFAGENCEIDIDDCLCSPCENGGTCIDEVNGFVCLCLPSYGGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTCNANGTMYGCSCDQGFAGENCEIDIDDCLCSPCENGGTCIDEVNGFVCLCLPSYGGSF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB1 CEKDTEGCDRGWHKFQGHCYRYFAHRRAWEDAEKDCRRRSGHLTSVHSPEEHSFINSFGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CEKDTEGCDRGWHKFQGHCYRYFAHRRAWEDAEKDCRRRSGHLTSVHSPEEHSFINSFGH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB1 ENTWIGLNDRIVERDFQWTDNTGLQFENWRENQPDNFFAGGEDCVVMVAHESGRWNDVPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENTWIGLNDRIVERDFQWTDNTGLQFENWRENQPDNFFAGGEDCVVMVAHESGRWNDVPC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB1 NYNLPYVCKKGTVLCGPPPAVENASLIGARKAKYNVHATVRYQCNEGFAQHHVATIRCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NYNLPYVCKKGTVLCGPPPAVENASLIGARKAKYNVHATVRYQCNEGFAQHHVATIRCRS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB1 NGKWDRPQIVCTKPRRSHRMRRHHHHHQHHHQHHHHKSRKERRKHKKHPTEDWEKDEGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NGKWDRPQIVCTKPRRSHRMRRHHHHHQHHHQHHHHKSRKERRKHKKHPTEDWEKDEGNF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB1 C
:
CCDS12 C
>>CCDS54876.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (2409 aa)
initn: 2414 init1: 1237 opt: 1376 Z-score: 683.8 bits: 139.7 E(32554): 9.2e-32
Smith-Waterman score: 1386; 35.2% identity (62.7% similar) in 668 aa overlap (674-1304:1765-2409)
650 660 670 680 690 700
pF1KB1 LPHPTPISTEANRVEAHGEATATAPPSPAAETKVYSLPLSLTPTGQGGEAMPTTPESPRA
: : .. : :. : ..: . ..:
CCDS54 SSTLSDGQAIADQSEIIPTLGQFERTQEEYEDKKHAGP-SFQPEFSSGAEEALVDHTPYL
1740 1750 1760 1770 1780 1790
710 720 730 740 750 760
pF1KB1 DFRETG--ETSPAQVNKAEHSSSSPWPSVNRNVAVG-FVPTETATEPTGLRGIPGSESGV
.. : . : ..: . ..:. :. . . ..::. :. . : . : :::..
CCDS54 SIATTHLMDQSVTEVPDVMEGSNPPYYT-DTTLAVSTFAKLSSQTPSSPLTIYSGSEASG
1800 1810 1820 1830 1840 1850
770 780 790 800 810
pF1KB1 FDTAESPTS--GLQATVDEVQDPWPSVYSKGLDASSPSAPLGSPGVFLV--PKVTPN--L
.:.. :... . :..: : .. . : . . .. :...:. :
CCDS54 HTEIPQPSALPGIDVG-SSVMSPQDSFKEIHVNIEATFKPSSEEYLHITEPPSLSPDTKL
1860 1870 1880 1890 1900 1910
820 830 840 850 860 870
pF1KB1 EPWVATDEGPTVNPMDSTVTPAPSDASGIWEPGSQVFEEAESTTLSPQVALDTSIVTP-L
:: . :.: . . .:.. .. :...... .. : . ::. .. . : .
CCDS54 EP--SEDDGKP--ELLEEMEASPTELIAV--EGTEILQDFQNKT-DGQVSGEAIKMFPTI
1920 1930 1940 1950 1960
880 890 900 910 920
pF1KB1 TTLEQGDKVGVPAMSTLGSSSSQPHPEPEDQVETQGTSGASVP---PHQSS-PL--GKPA
: : : . . : .... :: . : :. .. :: :. : : ..:
CCDS54 KTPEAGTVITTADEIELEGATQWPHSTSASA--TYGVEAGVVPWLSPQTSERPTLSSSPE
1970 1980 1990 2000 2010 2020
930 940 950 960 970
pF1KB1 VPPGTPTAASVGESASVSSGEPTVPW-----DPSSTLLPVTLGIE----DFEL-EVLAGS
. : : .: :........: : . ..:. :: .. : : : :. .
CCDS54 INPETQAALIRGQDSTIAASEQQVAARILDSNDQATVNPVEFNTEVATPPFSLLETSNET
2030 2040 2050 2060 2070 2080
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB1 PGVESFWEEVASGEEPALPGTPMNAGAEEVHSDPCENNPCLHGGTCNANGTMYGCSCDQG
. .. :: . : ::: : : :. ::::.:::: . : : :.: :
CCDS54 DFLIGINEESVEGTAIYLPG-P----------DRCKMNPCLNGGTCYPTETSYVCTCVPG
2090 2100 2110 2120 2130
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB1 FAGENCEIDIDDCLCSPCENGGTCIDEVNGFVCLCLPSYGGSFCEKDTEGCDRGWHKFQG
..:..::.:.:.: .::.::.::.: : : ::::::: :..::.::: :: :::::::
CCDS54 YSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCVDGFNTFRCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQG
2140 2150 2160 2170 2180 2190
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KB1 HCYRYFAHRRAWEDAEKDCRRRSGHLTSVHSPEEHSFINSFGHENTWIGLNDRIVERDFQ
.::.::::::.:. ::..:: ...::::. : ::. :.: ::. ::::::.. :.::.
CCDS54 QCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQMFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFR
2200 2210 2220 2230 2240 2250
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pF1KB1 WTDNTGLQFENWRENQPDNFFAGGEDCVVMVAHESGRWNDVPCNYNLPYVCKKGTVLCGP
:::.. ::.:::: ::::.::..::::::.. ::.:.::::::::.: :.:::::: ::
CCDS54 WTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQ
2260 2270 2280 2290 2300 2310
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB1 PPAVENASLIGARKAKYNVHATVRYQCNEGFAQHHVATIRCRSNGKWDRPQIVCTKP---
::.::::. .: : .:.... .::.:..:: :.:. :::: .::.: :.:.: .:
CCDS54 PPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWAIPKITCMNPSAY
2320 2330 2340 2350 2360 2370
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB1 RRSHRMRRHHHHHQ------HHHQHHHHKSRK--ERRKHKKHPTEDWEKDEGNFC
.:.. :. .. . . .: :. ::. : :.
CCDS54 QRTYSMKYFKNSSSAKDNSINTSKHDHRWSRRWQESRR
2380 2390 2400
>--
initn: 1110 init1: 1059 opt: 1173 Z-score: 585.3 bits: 121.5 E(32554): 2.8e-26
Smith-Waterman score: 1189; 29.6% identity (55.1% similar) in 1020 aa overlap (37-954:21-1015)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 WALGLLMLQMLLFVAGEQGTQDITDASERGLHMQKLG-SGSVQAALAELVALPCLFTLQP
:: :.: : :...:. :.::: :. .:
CCDS54 MFINIKSILWMCSTLIVTHALHKVKVGKSPPVRGSLSGKVSLPCHFSTMP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 R--PS-AARDAPRIKWTKVRTASGQR--QDLPILVAKDNVVRVAKSWQGRVSLPSYPRRR
:: . . ::::.:... .. . .. .:::... ........::::.:..:.
CCDS54 TLPPSYNTSEFLRIKWSKIEVDKNGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQDYKGRVSVPTHPEAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 ANATLLLGPLRASDSGLYRCQVVRGIEDEQDLVPLEVTGVVFHYRSARDRYALTFAEAQE
..:.: . : :::.:::::.:. :::: :: : : : :::::::.: .::.:.: ::.
CCDS54 GDASLTVVKLLASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLTVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAQK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 ACRLSSAIIAAPRHLQAAFEDGFDNCDAGWLSDRTVRYPITQSRPGCYGDRSSLPGVRSY
:: .:.::.:..: ::.::::..::::::.:.:::::: : :::::. . :::.:
CCDS54 ACLDVGAVIATPEQLFAAYEDGFEQCDAGWLADQTVRYPIRAPRVGCYGDKMGKAGVRTY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 GRRNPQELYDVYCFARELGGEVFYVGPARRLTLAGARAQCRRQGAALASVGQLHLAWHEG
: :.::: :::::.. .: :.::.. ..:. : .:. : : ::.::.:. ::..:
CCDS54 GFRSPQETYDVYCYVDHLDGDVFHLTVPSKFTFEEAAKECENQDARLATVGELQAAWRNG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 LDQCDPGWLADGSVRYPIQTPRRRCGGPAPGVRTVYRFANRTGFPSPAERFDAYCFRAHH
.:::: :::.:.:::.:. . : .::: ::::.::: :.:::: : :::::::. .
CCDS54 FDQCDYGWLSDASVRHPVTVARAQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPPPDSRFDAYCFKRRM
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB1 PTSQHGDLETPSSGDEGEILSAEGPPVRELEPTLEEEEVVTPDFQE-PLVSSGEEETLIL
. : . : : : : ::..: . : ::. : : : :.:
CCDS54 SDLSVIGHPIDSESKEDEPCSEETDPVHDLMAEILPE---FPDIIEIDLYHSEENEEEEE
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB1 EEKQESQQTLSPT-------------PGDPMLASWPTGEVWLSTVAPSPSDMGAGTAASS
: . .. : .:. : :: : :. . .:::: .... .. ...
CCDS54 ECANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDPEAAEARRGQ--FESVAPS-QNFSDSSESDT
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB1 H----------TEVAPTD-------------P--MPRRRGRFKGLNGRYFQ----QQEPE
: : : :.. : .:. .:.: . : ..: :
CCDS54 HPFVIAKTELSTAVQPNESTETTESLEVTWKPETYPETSEHFSGGEPDVFPTVPFHEEFE
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB1 PGL-QGGMEASAQPPTSEA-AVNQMEPPLAMAVTEMLG----SGQSRSPWADLTNEVDMP
: . : :. .. : . ... :... : : . .:.. ..:: .
CCDS54 SGTAKKGAESVTERDTEVGHQAHEHTEPVSLFPEESSGEIAIDQESQKIAFARATEVTF-
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600
pF1KB1 GAGSAGGKSSPEPWLWPPTMVPPSISGH-SRAPVLELEKAEGPSARPATPDLFW---SPL
: ::. . ::.:: : :.. :. .. : :. .: . : .:
CCDS54 --GEEVEKSTSVTY--TPTIVPSSASAYVSEEEAVTLIGNPWPDDLLSTKES-WVEATPR
590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 EAT-VSAPSPAPW-EAFPVATSPDLPMMAMLRGPKEWMLPHPTPISTEANRV--EAHGEA
... .:. : : :. : . :..:. .. : :. ...:. :. :.
CCDS54 QVVELSGSSSIPITEGSGEAEEDEDTMFTMVTDLSQRNTTD-TLITLDTSRIITESFFEV
640 650 660 670 680 690
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 TATA--PPSPAAETKVYSLPLSLTPTGQGGEAMPTTPESPRADFRETGETSPAQVNKAEH
::. : : .:: .: ... . .: . .: . .: : :. :
CCDS54 PATTIYPVSEQPSAKV--VPTKFVSETDTSEWISSTTVEEKKRKEEEGTTGTA-------
700 710 720 730 740
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pF1KB1 SSSSPWPSVNRNVAVGFVPTETATEPTGLRGIPGSESGVFDTAESPTSGLQATVDEVQDP
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CCDS47 FRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVAC
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CCDS47 AYQRTYSMKYFKNSSSAKDNSINTSKHDHRWSRRWQESRR
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CCDS54 GDGSAYTVSEDELLTGSERVPVLETTP--VGKIDHSVSYPPGAVTEHKVKTDEVVTLTPR
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CCDS54 IGPKVSLSPGPEQK-YETEGSSTTGFTSSLSPFSTHITQLMEETTTEKTSLEDIDLGS-G
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CCDS54 LFEKPKATELIE----------FSTIKVTV---PSDITTAF---SSVDRLHTTSAFKPSS
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CCDS54 AITKK--PPLIDREPGEET-TSDMVIIGESTSHVPPTTLEDIVAKETETDIDREYFTTSS
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CCDS54 PPATQPTRPPTVEDKEAFGPQA-LSTPQP-----PASTKF----------------HPDI
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CCDS54 NVYIIEVR--ENKTGP-------------DRCKMNPCLNGGTCYPTETSYVCTCVPGYSG
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CCDS11 DQGQWSDVPCNYHLSYTCKMGLVSCGPPPELPLAQVFGRPRLRYEVDTVLRYRCREGLAQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]