Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0966
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0966, 427 aa
1>>>pF1KB0966 427 - 427 aa - 427 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8000+/-0.00156; mu= 11.1445+/- 0.092
mean_var=217.4200+/-44.658, 0's: 0 Z-trim(105.7): 952 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.086981
statistics sampled from 7542 (8561) to 7542 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 1.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42638.1 ZNF134 gene_id:7693|Hs108|chr19 ( 427) 3058 397.4 1.4e-110
CCDS12961.1 ZNF671 gene_id:79891|Hs108|chr19 ( 534) 1552 208.6 1.2e-53
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1538 206.8 4.2e-53
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1538 206.9 4.5e-53
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1538 206.9 4.6e-53
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1536 206.5 4.8e-53
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1536 206.6 5.1e-53
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 1536 206.6 5.2e-53
CCDS12440.2 ZNF792 gene_id:126375|Hs108|chr19 ( 632) 1482 199.9 6e-51
CCDS77368.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 441) 1408 190.4 3e-48
CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 442) 1408 190.4 3e-48
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1360 184.4 2e-46
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1360 184.4 2.1e-46
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 1360 184.4 2.1e-46
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 1360 184.4 2.1e-46
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 1360 184.4 2.1e-46
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 1360 184.4 2.1e-46
CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 1354 183.7 3.6e-46
CCDS82406.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 377) 1294 176.0 5.6e-44
CCDS46210.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 448) 1294 176.1 6.2e-44
CCDS33133.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 489) 1294 176.1 6.5e-44
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1290 175.8 1.1e-43
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1290 175.8 1.1e-43
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 1287 175.2 1.1e-43
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1290 175.8 1.1e-43
CCDS82408.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 432) 1267 172.7 6.3e-43
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 1267 172.7 6.7e-43
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 1267 172.7 6.8e-43
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1268 173.1 7.5e-43
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1261 172.2 1.4e-42
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1261 172.2 1.4e-42
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1251 170.9 3.4e-42
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1238 169.3 1.1e-41
CCDS46209.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 533) 1226 167.6 2.5e-41
CCDS54324.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 545) 1226 167.7 2.6e-41
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1224 167.5 3.2e-41
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1220 167.0 4.6e-41
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1220 167.0 4.8e-41
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1220 167.0 4.9e-41
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1220 167.0 4.9e-41
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1211 165.5 7.4e-41
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1212 165.9 8.9e-41
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1212 166.0 9.2e-41
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1214 166.4 9.2e-41
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1212 166.0 9.3e-41
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1214 166.4 9.5e-41
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1214 166.4 9.5e-41
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1212 166.4 1.4e-40
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1199 164.2 2.5e-40
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1199 164.2 2.5e-40
>>CCDS42638.1 ZNF134 gene_id:7693|Hs108|chr19 (427 aa)
initn: 3058 init1: 3058 opt: 3058 Z-score: 2098.8 bits: 397.4 E(32554): 1.4e-110
Smith-Waterman score: 3058; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MTLVTAGGAWTGPGCWHEVKDEESSSEQSISIAVSHVNTSKAGLPAQTALPCDICGPILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MTLVTAGGAWTGPGCWHEVKDEESSSEQSISIAVSHVNTSKAGLPAQTALPCDICGPILK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 DILHLDEHQGTHHGLKLHTCGACGRQFWFSANLHQYQKCYSIEQPLRRDKSEASIVKNCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DILHLDEHQGTHHGLKLHTCGACGRQFWFSANLHQYQKCYSIEQPLRRDKSEASIVKNCT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 VSKEPHPSEKPFTCKEEQKNFQATLGGCQQKAIHSKRKTHRSTESGDAFHGEQMHYKCSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VSKEPHPSEKPFTCKEEQKNFQATLGGCQQKAIHSKRKTHRSTESGDAFHGEQMHYKCSE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 CGKAFSRKDTLVQHQRIHSGEKPYECSECGKAFSRKATLVQHQRIHTGERPYECSECGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CGKAFSRKDTLVQHQRIHSGEKPYECSECGKAFSRKATLVQHQRIHTGERPYECSECGKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 FSRKDNLTQHKRIHTGEMPYKCNECGKYFSHHSNLIVHQRVHNGARPYKCSDCGKVFRHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FSRKDNLTQHKRIHTGEMPYKCNECGKYFSHHSNLIVHQRVHNGARPYKCSDCGKVFRHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 STLVQHESIHTGENPYDCSDCGKSFGHKYTLIKHQRIHTESKPFECIECGKFFSRSSDYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STLVQHESIHTGENPYDCSDCGKSFGHKYTLIKHQRIHTESKPFECIECGKFFSRSSDYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 AHQRVHTGERPFVCSKCGKDFIRTSHLVRHQRVHTGERPYECSECGKAYSLSSHLNRHQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AHQRVHTGERPFVCSKCGKDFIRTSHLVRHQRVHTGERPYECSECGKAYSLSSHLNRHQK
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 VHTAGRL
:::::::
CCDS42 VHTAGRL
>>CCDS12961.1 ZNF671 gene_id:79891|Hs108|chr19 (534 aa)
initn: 1602 init1: 888 opt: 1552 Z-score: 1076.4 bits: 208.6 E(32554): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1552; 52.8% identity (74.2% similar) in 430 aa overlap (1-427:115-534)
10 20
pF1KB0 MTLVTAGGAWTG--PGCWHEVKDEESSSEQ
:: .: : : ::::: :.::: ::::
CCDS12 LASLGIAFSRSRAVMKLERGEEPWVYDQVDMTSATEREAQRGLRPGCWHGVEDEEVSSEQ
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30 40 50 60 70 80
pF1KB0 SISIA-VSHVNTSKAGLPAQTALPCDICGPILKDILHLDEHQGTHHGLKLHTCGACGRQF
:: .: ::.: : : : .. ::::::::::: ::: ...: . : . :::::.::
CCDS12 SIFVAGVSEVRTLMAELESH---PCDICGPILKDTLHLAKYHGGKARQKPYLCGACGKQF
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KB0 WFSANLHQYQKCYSIEQPLRRDKSEASIVKNCTVSKEPHPSEKPFTCKEEQKNFQATLGG
:::... :.:. . . . : ... : ::.: : : :: .:: . ...:.:: :
CCDS12 WFSTDFDQHQNQPNGGKLFPRKEGRDS-VKSCRV----HVPEKTLTCGKGRRDFSATSGL
210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 CQQKAIHSKRKTHRSTESGDAFHGEQMHYKCSECGKAFSRKDTLVQHQRIHSGEKPYECS
:..: :. : :.::. ..: : ...:.::::::.:::::..:::::.::.::::.
CCDS12 LQHQASLSSMKPHKSTKLVSGFLMGQRYHRCGECGKAFTRKDTLARHQRIHTGERPYECN
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 ECGKAFSRKATLVQHQRIHTGERPYECSECGKTFSRKDNLTQHKRIHTGEMPYKCNECGK
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CCDS12 ECGKFFSQSYDLFKHQTVHTGERPYECSECGKFFRQISGLIEHRRVHTGERLYQCGKCGK
320 330 340 350 360 370
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 YFSHHSNLIVHQRVHNGARPYKCSDCGKVFRHKSTLVQHESIHTGENPYDCSDCGKSFGH
.:: .:::: ::.::.::::: ::.::: : .: ::: :. :::: ::.::.:::.:..
CCDS12 FFSSKSNLIRHQEVHTGARPYVCSECGKEFSRKHTLVLHQRTHTGERPYECSECGKAFSQ
380 390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 KYTLIKHQRIHTESKPFECIECGKFFSRSSDYIAHQRVHTGERPFVCSKCGKDFIRTSHL
. : : ::: :. .:: .::: :: : : ::.::.::.:. :::::: : . .:
CCDS12 SSHLNVHWRIH--SSDYECSRCGKAFSCISKLIQHQKVHSGEKPYECSKCGKAFTQRPNL
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420
pF1KB0 VRHQRVHTGERPYECSECGKAYSLSSHLNRHQKVHTAGRL
.:: .:::::::: :::::. . .. : ::.::.. .:
CCDS12 IRHWKVHTGERPYVCSECGREFIRKQTLVLHQRVHAGEKL
500 510 520 530
>>CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 (555 aa)
initn: 3469 init1: 1217 opt: 1538 Z-score: 1066.8 bits: 206.8 E(32554): 4.2e-53
Smith-Waterman score: 1538; 51.7% identity (76.0% similar) in 420 aa overlap (8-426:58-470)
10 20 30
pF1KB0 MTLVTAGGAWTGPGCWHEVKDEESSSEQSISIA-VSH
: . ::: :. ::. ::: :: : .
CCDS58 EVPSVLHRMFMTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQ
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 VNTSKAGLPAQTALPCDICGPILKDILHLDEHQGTHHGLKLHTCGACGRQFWFSANLHQY
::: : .:.: :.:: .:.::::: :::::. : :::::: .::..::::.:.
CCDS58 FRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQKLHTCG---KQFYISANLQQH
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 QKCYSIEQPLRRDKSEASIVKNCTVSKEPHPSEKPFTCKEEQKNFQATLGGCQQKAIHSK
:. . : :.: . ::....: : : :::::::.: .:.: :.. .: : ..
CCDS58 QRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIV----HVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 RKTHRSTESGDAFHGEQMHYKCSECGKAFSRKDTLVQHQRIHSGEKPYECSECGKAFSRK
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CCDS58 EKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRR
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 ATLVQHQRIHTGERPYECSECGKTFSRKDNLTQHKRIHTGEMPYKCNECGKYFSHHSNLI
.:.:::..:. ::::::.:::: :. ... :.:.:::: :: : :::: ::. .:
CCDS58 CNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLN
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 VHQRVHNGARPYKCSDCGKVFRHKSTLVQHESIHTGENPYDCSDCGKSFGHKYTLIKHQR
:..::.: :::.:..::: : ..:.:.::. .:::: ::.::.:::::.....:: :::
CCDS58 SHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQR
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 IHTESKPFECIECGKFFSRSSDYIAHQRVHTGERPFVCSKCGKDFIRTSHLVRHQRVHTG
.:: .: :: :::: :::::. : :.:.::::::. ::::::.: ..: . :..::::
CCDS58 VHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTG
390 400 410 420 430 440
400 410 420
pF1KB0 ERPYECSECGKAYSLSSHLNRHQKVHTAGRL
:::: :.::::..: ::.:. ::.:::. :
CCDS58 ERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPY
450 460 470 480 490 500
>>CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 3469 init1: 1217 opt: 1538 Z-score: 1066.3 bits: 206.9 E(32554): 4.5e-53
Smith-Waterman score: 1538; 51.7% identity (76.0% similar) in 420 aa overlap (8-426:119-531)
10 20 30
pF1KB0 MTLVTAGGAWTGPGCWHEVKDEESSSEQSISIA-VSH
: . ::: :. ::. ::: :: : .
CCDS74 EVPSVLHRMFMTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQ
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 VNTSKAGLPAQTALPCDICGPILKDILHLDEHQGTHHGLKLHTCGACGRQFWFSANLHQY
::: : .:.: :.:: .:.::::: :::::. : :::::: .::..::::.:.
CCDS74 FRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQKLHTCG---KQFYISANLQQH
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 QKCYSIEQPLRRDKSEASIVKNCTVSKEPHPSEKPFTCKEEQKNFQATLGGCQQKAIHSK
:. . : :.: . ::....: : : :::::::.: .:.: :.. .: : ..
CCDS74 QRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIV----HVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTG
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 RKTHRSTESGDAFHGEQMHYKCSECGKAFSRKDTLVQHQRIHSGEKPYECSECGKAFSRK
.: . :.. . ::.. . :.. ..:.::::. ::::: ::: . : .:::.:::: .:.
CCDS74 EKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRR
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 ATLVQHQRIHTGERPYECSECGKTFSRKDNLTQHKRIHTGEMPYKCNECGKYFSHHSNLI
.:.:::..:. ::::::.:::: :. ... :.:.:::: :: : :::: ::. .:
CCDS74 CNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLN
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 VHQRVHNGARPYKCSDCGKVFRHKSTLVQHESIHTGENPYDCSDCGKSFGHKYTLIKHQR
:..::.: :::.:..::: : ..:.:.::. .:::: ::.::.:::::.....:: :::
CCDS74 SHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQR
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 IHTESKPFECIECGKFFSRSSDYIAHQRVHTGERPFVCSKCGKDFIRTSHLVRHQRVHTG
.:: .: :: :::: :::::. : :.:.::::::. ::::::.: ..: . :..::::
CCDS74 VHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTG
450 460 470 480 490 500
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pF1KB0 ERPYECSECGKAYSLSSHLNRHQKVHTAGRL
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10 20 30
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90 100
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10 20 30 40
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CCDS77 RV----HLSEKSLQSREVGKDLLTSSGVLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCS
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CCDS77 ECGKAFGQKYLLVQHQRLHTGEKPYECSECGKLFSHKSNLFIHQIVHTGERPYGCSDCGK
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CCDS77 SFSRNADLIQHQRVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHRIHTGVRPYECSECGKLFSF
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CCDS77 NSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKFYSHKSSLINHWRVHTGERPYECSECGKFFSQSSSL
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CCDS77 MQHRKVHTGEKPFKCNECGRFFSENSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHSSSLVKHR
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..::
CCDS77 RIHTGEIQ
440
427 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:18:34 2016 done: Sat Nov 5 22:18:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]