Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0449
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0449, 474 aa
1>>>pF1KB0449 474 - 474 aa - 474 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7741+/-0.00112; mu= 5.9873+/- 0.065
mean_var=244.4313+/-56.844, 0's: 0 Z-trim(108.7): 665 B-trim: 198 in 1/51
Lambda= 0.082034
statistics sampled from 9594 (10379) to 9594 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 3161 388.0 1.2e-107
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 2548 315.5 8.4e-86
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 2133 266.4 5.2e-71
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 2083 260.5 3.2e-69
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 1982 248.5 1.2e-65
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 1982 248.5 1.2e-65
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 1982 248.5 1.3e-65
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 1227 159.0 8.7e-39
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 1227 159.1 9.1e-39
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 1227 159.1 9.3e-39
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 1148 149.6 5.3e-36
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 1127 147.2 3.2e-35
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 1122 146.6 4.6e-35
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 1099 143.7 2.5e-34
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 1090 142.7 5.8e-34
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 1053 138.3 1.1e-32
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 1039 136.6 3.5e-32
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 1034 136.0 5.2e-32
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 774 105.3 1.1e-22
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 755 103.1 5e-22
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 757 103.7 6.9e-22
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 757 103.7 7.1e-22
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 757 103.7 7.2e-22
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 747 102.5 1.6e-21
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 747 102.5 1.6e-21
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 747 102.6 1.6e-21
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 747 102.6 1.6e-21
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 730 100.1 3.9e-21
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 715 98.7 2e-20
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 700 96.8 6.4e-20
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 700 96.9 6.6e-20
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 700 96.9 6.8e-20
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 663 92.1 8.1e-19
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 651 90.8 2.6e-18
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 639 89.3 6.2e-18
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 643 90.3 8.5e-18
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 624 87.5 2.2e-17
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 264) 614 86.2 4.4e-17
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 615 86.5 4.6e-17
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 616 86.8 5.6e-17
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 616 86.9 6.2e-17
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 600 84.6 1.4e-16
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 599 84.8 2.2e-16
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 599 84.9 2.5e-16
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 591 83.7 3.7e-16
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 582 82.6 7.4e-16
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 581 82.5 8.1e-16
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 575 82.0 1.7e-15
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 579 82.8 1.8e-15
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 579 82.8 1.9e-15
>>CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 (474 aa)
initn: 3161 init1: 3161 opt: 3161 Z-score: 2046.3 bits: 388.0 E(32554): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 3161; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB0 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
430 440 450 460 470
>>CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 (504 aa)
initn: 3147 init1: 2543 opt: 2548 Z-score: 1653.9 bits: 315.5 E(32554): 8.4e-86
Smith-Waterman score: 3091; 94.0% identity (94.0% similar) in 504 aa overlap (1-474:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KB0 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSME-----------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEVRASGALPRQVAGCTHKGVHRRAAALQPD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 -DVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 GEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIH
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 TDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQN
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 LLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 HYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINH
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 APRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQ
430 440 450 460 470 480
460 470
pF1KB0 KDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
490 500
>>CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 2254 init1: 2117 opt: 2133 Z-score: 1388.3 bits: 266.4 E(32554): 5.2e-71
Smith-Waterman score: 2133; 72.7% identity (90.1% similar) in 433 aa overlap (42-474:98-522)
20 30 40 50 60 70
pF1KB0 RFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPG
.:::..: : : . : :.: :
CCDS90 PPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDG-----ESDQASGTSSDEV--
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB0 QLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRA
: :: . : . .::.::::..:::::: :::.:. .:.:::..:: . .:.:: ::::
CCDS90 QSPTGVCL-RNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRA
130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB0 SLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
:::.:::::.:::.::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB0 SLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLR
::::.:::::::::::..:::.::::::::::.:::::.: :::.:::::::.:..:.::
CCDS90 SLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILR
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 GLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
::::::.::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 LLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAF
::::.:::: ::::::::: .:::.::::::::::..::::::::::::..:::::...
CCDS90 LLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSN
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 SEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGER
::..:.:: : ::::::::::::..::.:....: ::::.:.::: :..: :::::: :
CCDS90 EEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPR
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KB0 VHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
.: : ...:::::::::::::::.:. .. . :.:::::::..
CCDS90 IHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
480 490 500 510 520
>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 2204 init1: 2067 opt: 2083 Z-score: 1356.3 bits: 260.5 E(32554): 3.2e-69
Smith-Waterman score: 2083; 72.8% identity (89.8% similar) in 423 aa overlap (42-464:98-512)
20 30 40 50 60 70
pF1KB0 RFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPG
.:::..: : : . : :.: :
CCDS53 PPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDG-----ESDQASGTSSDEV--
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB0 QLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRA
: :: . : . .::.::::..:::::: :::.:. .:.:::..:: . .:.:: ::::
CCDS53 QSPTGVCL-RNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRA
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140 150 160 170 180 190
pF1KB0 SLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
:::.:::::.:::.::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
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pF1KB0 SLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLR
::::.:::::::::::..:::.::::::::::.:::::.: :::.:::::::.:..:.::
CCDS53 SLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILR
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 GLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
::::::.::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 LLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAF
::::.:::: ::::::::: .:::.::::::::::..::::::::::::..:::::...
CCDS53 LLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSN
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 SEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGER
::..:.:: : ::::::::::::..::.:....: ::::.:.::: :..: :::::: :
CCDS53 EEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPR
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KB0 VHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
.: : ...:::::::::::::::.:. .. . :
CCDS53 IHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVINHFTCRS
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>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (496 aa)
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>>CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (502 aa)
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20 30 40 50 60 70
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260 270 280 290 300 310
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::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
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:::::.::: ::::::::: :::::::::::::::.:.::.:::.:::::::::::. .
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CCDS48 IHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
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>>CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (570 aa)
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20 30 40 50 60 70
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CCDS55 GSDPGEAPTRAAPGELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDG-----ESDQASATSSDEVQ-
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140 150 160 170 180 190
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CCDS55 SLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
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::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS55 GLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDI
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320 330 340 350 360 370
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:::::.::: ::::::::: :::::::::::::::.:.::.:::.:::::::::::. .
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::.::..: : . :..::::::.:: ::..:: .:...:.::: :..: .: :::::
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470 480 490 500 510 520
440 450 460 470
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CCDS55 IHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
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>>CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 (423 aa)
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: :: : ::: . ....:. :: .::::.:.::::: .. .:. : : . :
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CCDS75 VRLQPEAGESMRAFGKNNSYGKSLSNSKH
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: ..:::::::. .:: ::.: : :.: :::.:.:::::::.: :.: :::::::::
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: :: : ::: . ....:. :: .::::.:.::::: .. .:. : : . :
CCDS56 IFVEMIQGVAAFPGMKDIQDQLERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLR
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. .:. . . : :.:: :.:.::.::::: :: .: :. .: : .:::.. .
CCDS56 QAWNKLSYVNHAEDLASKLLQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPN
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..:: . : :: .. . ::. .:
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10 20 30 40 50
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..:::...: .: : : ..... . : : . :: .
CCDS75 MCDLIEPQPAEKIGKMKKLRRTLSESFSRI-ALKKDDTTFDEICVTKMSTRNCQ------
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: : :...: :. : . :. :: :. ... : . .. ..
CCDS75 GMD-----SVIKPLDTIPEDKK----VRVQRTQS----TFDPFEKPANQVKRVHSENNAC
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... : .: . : : .: .. ::: ..: ::.:::::.::::.::.::.. .:
CCDS75 INFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNGKL
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:::: :::..:::.: :::::.::::.::::::: :::.::: ..:::::::. .:: ::
CCDS75 VALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLCQY
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pF1KB0 LD-HCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
.: : :.: :::.:.:::::::.: :.: :::::::::::::.. ::::::::::::
CCDS75 MDKHPGGLHP-DNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLAR
230 240 250 260 270
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pF1KB0 AKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPG-STVK
:::::..::::::::::::::::::::::::: .:::::::: :: : ::: . ..
CCDS75 AKSVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDIQ
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pF1KB0 EELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLD--TDGIHLLSSL
..:. :: .::::.:.::::: .. .:. : : . : . .:. . . : :.:
CCDS75 DQLERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASKL
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pF1KB0 LLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAF-QQPG
: :.:.::.::::: :: .: :. .: : .:::.. ...:: . : :: .. .
CCDS75 LQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNNS
400 410 420 430 440 450
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::. .:
CCDS75 YGKSLSNSKH
460
474 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:55:02 2016 done: Sat Nov 5 16:55:03 2016
Total Scan time: 3.150 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]