Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0434
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0434, 866 aa
1>>>pF1KB0434 866 - 866 aa - 866 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9249+/-0.00122; mu= 9.5254+/- 0.073
mean_var=175.2459+/-34.388, 0's: 0 Z-trim(105.8): 24 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.096884
statistics sampled from 8646 (8649) to 8646 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 3.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43270.1 NAA15 gene_id:80155|Hs108|chr4 ( 866) 5754 817.7 0
CCDS9379.1 NAA16 gene_id:79612|Hs108|chr13 ( 864) 4200 600.5 4.2e-171
CCDS45044.1 NAA16 gene_id:79612|Hs108|chr13 ( 429) 2192 319.6 7.5e-87
>>CCDS43270.1 NAA15 gene_id:80155|Hs108|chr4 (866 aa)
initn: 5754 init1: 5754 opt: 5754 Z-score: 4359.2 bits: 817.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5754; 100.0% identity (100.0% similar) in 866 aa overlap (1-866:1-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPAVSLPPKENALFKRILRCYEHKQYRNGLKFCKQILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLG
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CCDS43 MPAVSLPPKENALFKRILRCYEHKQYRNGLKFCKQILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 KKEEAYELVRRGLRNDLKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKWDKDNLQILRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KKEEAYELVRRGLRNDLKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKWDKDNLQILRDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPAQRASWIGYAIAYHLLEDYEMAAKILEEFRKTQQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPAQRASWIGYAIAYHLLEDYEMAAKILEEFRKTQQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 SPDKVDYEYSELLLYQNQVLREAGLYREALEHLCTYEKQICDKLAVEETKGELLLQLCRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPDKVDYEYSELLLYQNQVLREAGLYREALEHLCTYEKQICDKLAVEETKGELLLQLCRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDAADVYRGLQERNPENWAYYKGLEKALKPANMLERLKIYEEAWTKYPRGLVPRRLPLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDAADVYRGLQERNPENWAYYKGLEKALKPANMLERLKIYEEAWTKYPRGLVPRRLPLNF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LSGEKFKECLDKFLRMNFSKGCPPVFNTLRSLYKDKEKVAIIEELVVGYETSLKSCRLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSGEKFKECLDKFLRMNFSKGCPPVFNTLRSLYKDKEKVAIIEELVVGYETSLKSCRLFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 PNDDGKEEPPTTLLWVQYYLAQHYDKIGQPSIALEYINTAIESTPTLIELFLVKAKIYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PNDDGKEEPPTTLLWVQYYLAQHYDKIGQPSIALEYINTAIESTPTLIELFLVKAKIYKH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AGNIKEAARWMDEAQALDTADRFINSKCAKYMLKANLIKEAEEMCSKFTREGTSAVENLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AGNIKEAARWMDEAQALDTADRFINSKCAKYMLKANLIKEAEEMCSKFTREGTSAVENLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 EMQCMWFQTECAQAYKAMNKFGEALKKCHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRSYVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EMQCMWFQTECAQAYKAMNKFGEALKKCHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRSYVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 LLKLEDVLRQHPFYFKAARIAIEIYLKLHDNPLTDENKEHEADTANMSDKELKKLRNKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLKLEDVLRQHPFYFKAARIAIEIYLKLHDNPLTDENKEHEADTANMSDKELKKLRNKQR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 RAQKKAQIEEEKKNAEKEKQQRNQKKKKDDDDEEIGGPKEELIPEKLAKVETPLEEAIKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RAQKKAQIEEEKKNAEKEKQQRNQKKKKDDDDEEIGGPKEELIPEKLAKVETPLEEAIKF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LTPLKNLVKNKIETHLFAFEIYFRKEKFLLMLQSVKRAFAIDSSHPWLHECMIRLFNTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTPLKNLVKNKIETHLFAFEIYFRKEKFLLMLQSVKRAFAIDSSHPWLHECMIRLFNTAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CESKDLSDTVRTVLKQEMNRLFGATNPKNFNETFLKRNSDSLPHRLSAAKMVYYLDPSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CESKDLSDTVRTVLKQEMNRLFGATNPKNFNETFLKRNSDSLPHRLSAAKMVYYLDPSSQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 KRAIELATTLDESLTNRNLQTCMEVLEALYDGSLGDCKEAAEIYRANCHKLFPYALAFMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRAIELATTLDESLTNRNLQTCMEVLEALYDGSLGDCKEAAEIYRANCHKLFPYALAFMP
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB0 PGYEEDMKITVNGDSSAEAEELANEI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGYEEDMKITVNGDSSAEAEELANEI
850 860
>>CCDS9379.1 NAA16 gene_id:79612|Hs108|chr13 (864 aa)
initn: 4201 init1: 3792 opt: 4200 Z-score: 3185.3 bits: 600.5 E(32554): 4.2e-171
Smith-Waterman score: 4200; 70.6% identity (89.8% similar) in 866 aa overlap (1-866:1-864)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPAVSLPPKENALFKRILRCYEHKQYRNGLKFCKQILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLG
:: : :::::. ::::::.:::.:::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MPNVLLPPKESNLFKRILKCYEQKQYKNGLKFCKMILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 KKEEAYELVRRGLRNDLKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKWDKDNLQILRDL
:::::::.::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS93 KKEEAYEFVRKGLRNDVKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKLDKDNLQILRDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPAQRASWIGYAIAYHLLEDYEMAAKILEEFRKTQQT
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::.:: :.:::::.:::.
CCDS93 SLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPTQRASWIGYAIAYHLLKDYDMALKLLEEFRQTQQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 SPDKVDYEYSELLLYQNQVLREAGLYREALEHLCTYEKQICDKLAVEETKGELLLQLCRL
:.:.:::::::.::::::.::: : .:.:::. ::::::::: ::: :::.::.: ::
CCDS93 PPNKIDYEYSELILYQNQVMREADLLQESLEHIEMYEKQICDKLLVEEIKGEILLKLGRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDAADVYRGLQERNPENWAYYKGLEKALKPANMLERLKIYEEAWTKYPRGLVPRRLPLNF
..:..:...: .:: ::: ::.::::::. ... :::.:::: ..:....::::::..
CCDS93 KEASEVFKNLIDRNAENWCYYEGLEKALQISTLEERLQIYEEISKQHPKAITPRRLPLTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LSGEKFKECLDKFLRMNFSKGCPPVFNTLRSLYKDKEKVAIIEELVVGYETSLKSCRLFN
. ::.:.: .:::::.::::::::.:.::.::: . :::.::.:::..::.:::.: .:.
CCDS93 VPGERFRELMDKFLRVNFSKGCPPLFTTLKSLYYNTEKVSIIQELVTNYEASLKTCDFFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 PNDDGKEEPPTTLLWVQYYLAQHYDKIGQPSIALEYINTAIESTPTLIELFLVKAKIYKH
: ..:..:::::::::::.::::.::.:: :.::.:::.:: ::::::::: .:::::::
CCDS93 PYENGEKEPPTTLLWVQYFLAQHFDKLGQYSLALDYINAAIASTPTLIELFYMKAKIYKH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AGNIKEAARWMDEAQALDTADRFINSKCAKYMLKANLIKEAEEMCSKFTREGTSAVENLN
::.::::.::::::.:::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::.::::
CCDS93 IGNLKEAAKWMDEAQSLDTADRFINSKCAKYMLRANMIKEAEEMCSKFTREGTSAMENLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 EMQCMWFQTECAQAYKAMNKFGEALKKCHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRSYVD
::::::::::: .::. ....:.:::::::.::::.::::::::::::::::.:::.:::
CCDS93 EMQCMWFQTECISAYQRLGRYGDALKKCHEVERHFFEITDDQFDFHTYCMRKMTLRAYVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 LLKLEDVLRQHPFYFKAARIAIEIYLKLHDNPLTDENKEHEADTANMSDKELKKLRNKQR
::.:::.::.: ::::::: ::::::::.:::::.:.:..: .. :.: :::::. .:::
CCDS93 LLRLEDILRRHAFYFKAARSAIEIYLKLYDNPLTNESKQQEINSENLSAKELKKMLSKQR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 RAQKKAQIEEEKKNAEKEKQQRNQKKKKDDDDEEIGGPKEELIPEKLAKVETPLEEAIKF
::::::..:::.:.::.:.::.:::::.:...:: .: ::::::::: .::.:::::.::
CCDS93 RAQKKAKLEEERKHAERERQQKNQKKKRDEEEEEASGLKEELIPEKLERVENPLEEAVKF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LTPLKNLVKNKIETHLFAFEIYFRKEKFLLMLQSVKRAFAIDSSHPWLHECMIRLFNTAV
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CCDS93 LIPLKNLVADNIDTHLLAFEIYFRKGKFLLMLQSVKRAFAINSNNPWLHECLIR-FSKSV
670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CESKDLSDTVRTVLKQEMNRLFGATNPKNFNETFLKRNSDSLPHRLSAAKMVYYLDPSSQ
. ..: : : ::.:::...: . ..::: :::::. :: : ::.:::.:.:: : :
CCDS93 SNHSNLPDIVSKVLSQEMQKIFVKKDLESFNEDFLKRNATSLQHLLSGAKMMYFLDKSRQ
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 KRAIELATTLDESLTNRNLQTCMEVLEALYDGSLGDCKEAAEIYRANCHKLFPYALAFMP
..:: .:: :::.. .....: ..: ::: :::.:.:. : :: ::.:.:.. ::.:
CCDS93 EKAIAIATRLDETIKDKDVKTLIKVSEALLDGSFGNCSSQYEEYRMACHNLLPFTSAFLP
780 790 800 810 820 830
850 860
pF1KB0 PGYEEDMKITVNGDSSAEAEELANEI
: : .: . .:. . :::::
CCDS93 AVNEVDNP-NVALNHTANYDVLANEI
840 850 860
>>CCDS45044.1 NAA16 gene_id:79612|Hs108|chr13 (429 aa)
initn: 2192 init1: 2192 opt: 2192 Z-score: 1672.7 bits: 319.6 E(32554): 7.5e-87
Smith-Waterman score: 2192; 75.4% identity (92.8% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPAVSLPPKENALFKRILRCYEHKQYRNGLKFCKQILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLG
:: : :::::. ::::::.:::.:::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MPNVLLPPKESNLFKRILKCYEQKQYKNGLKFCKMILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 KKEEAYELVRRGLRNDLKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKWDKDNLQILRDL
:::::::.::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS45 KKEEAYEFVRKGLRNDVKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKLDKDNLQILRDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPAQRASWIGYAIAYHLLEDYEMAAKILEEFRKTQQT
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::.:: :.:::::.:::.
CCDS45 SLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPTQRASWIGYAIAYHLLKDYDMALKLLEEFRQTQQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 SPDKVDYEYSELLLYQNQVLREAGLYREALEHLCTYEKQICDKLAVEETKGELLLQLCRL
:.:.:::::::.::::::.::: : .:.:::. ::::::::: ::: :::.::.: ::
CCDS45 PPNKIDYEYSELILYQNQVMREADLLQESLEHIEMYEKQICDKLLVEEIKGEILLKLGRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDAADVYRGLQERNPENWAYYKGLEKALKPANMLERLKIYEEAWTKYPRGLVPRRLPLNF
..:..:...: .:: ::: ::.::::::. ... :::.:::: ..:....::::::..
CCDS45 KEASEVFKNLIDRNAENWCYYEGLEKALQISTLEERLQIYEEISKQHPKAITPRRLPLTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LSGEKFKECLDKFLRMNFSKGCPPVFNTLRSLYKDKEKVAIIEELVVGYETSLKSCRLFN
. ::.:.: .:::::.::::::::.:.::.::: . :::.::.:::..::.:::.: .:.
CCDS45 VPGERFRELMDKFLRVNFSKGCPPLFTTLKSLYYNTEKVSIIQELVTNYEASLKTCDFFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 PNDDGKEEPPTTLLWVQYYLAQHYDKIGQPSIALEYINTAIESTPTLIELFLVKAKIYKH
: ..:..:::::::::::.::::.::.:: :.::.:::.:: ::::::::: .::::::
CCDS45 PYENGEKEPPTTLLWVQYFLAQHFDKLGQYSLALDYINAAIASTPTLIELFYMKAKIYKV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AGNIKEAARWMDEAQALDTADRFINSKCAKYMLKANLIKEAEEMCSKFTREGTSAVENLN
CCDS45 KSESCFLSS
866 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 18:51:52 2016 done: Sat Nov 5 18:51:53 2016
Total Scan time: 3.880 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]