Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0063, 2201 aa
1>>>pF1KB0063 2201 - 2201 aa - 2201 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4148+/-0.00181; mu= -6.7951+/- 0.108
mean_var=295.8494+/-53.804, 0's: 0 Z-trim(101.9): 280 B-trim: 9 in 1/53
Lambda= 0.074566
statistics sampled from 6448 (6730) to 6448 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 4.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 15080 1638.8 0
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 2044 236.4 6.8e-61
CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 1706 200.0 5.8e-50
CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 1590 187.4 1.9e-46
CCDS77526.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2446) 1409 168.2 4.1e-40
CCDS42814.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2477) 1409 168.2 4.1e-40
CCDS2399.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2355) 1272 153.4 1.1e-35
CCDS46510.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2330) 1269 153.1 1.3e-35
CCDS47165.1 TENM3 gene_id:55714|Hs108|chr4 (2699) 886 112.0 3.9e-23
CCDS83040.1 TENM2 gene_id:57451|Hs108|chr5 (2535) 806 103.3 1.4e-20
CCDS44688.1 TENM4 gene_id:26011|Hs108|chr11 (2769) 797 102.4 3e-20
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 667 87.9 7.6e-17
CCDS14609.1 TENM1 gene_id:10178|Hs108|chrX (2725) 670 88.7 3.8e-16
CCDS55488.1 TENM1 gene_id:10178|Hs108|chrX (2732) 670 88.7 3.8e-16
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 663 87.8 4e-16
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 644 85.5 4.4e-16
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 638 84.8 6.2e-16
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 632 84.2 1e-15
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 629 84.3 7.5e-15
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 593 80.1 2.6e-14
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 594 80.3 4.9e-14
CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 579 78.5 5.9e-14
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 570 77.4 8.9e-14
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 570 77.5 9.6e-14
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 570 77.5 1e-13
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 570 77.6 1.6e-13
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 570 77.6 1.6e-13
CCDS77523.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2265) 581 79.1 2.5e-13
CCDS42813.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2296) 579 78.9 2.9e-13
CCDS77522.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2240) 578 78.8 3.1e-13
CCDS2400.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2176) 576 78.6 3.5e-13
CCDS77525.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2267) 576 78.6 3.6e-13
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 552 75.7 5.9e-13
CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 545 74.9 9.6e-13
CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 545 74.9 1e-12
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 543 74.7 1.1e-12
CCDS2773.1 COL7A1 gene_id:1294|Hs108|chr3 (2944) 564 77.3 1.1e-12
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 543 74.7 1.2e-12
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 543 74.7 1.2e-12
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 542 74.6 1.3e-12
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 505 70.6 1.7e-11
CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 353) 503 70.3 1.7e-11
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 516 72.0 1.9e-11
CCDS47544.1 VWDE gene_id:221806|Hs108|chr7 (1590) 517 72.1 2.2e-11
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 485 68.4 8e-11
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 501 70.5 1e-10
>>CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201 aa)
initn: 15080 init1: 15080 opt: 15080 Z-score: 8782.5 bits: 1638.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 15080; 99.9% identity (100.0% similar) in 2201 aa overlap (1-2201:1-2201)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MGAMTQLLAGVFLAFLALATEGGVLKKVIRHKRQSGVNATLPEENQPVVFNHVYNIKLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MGAMTQLLAGVFLAFLALATEGGVLKKVIRHKRQSGVNATLPEENQPVVFNHVYNIKLPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 GSQCSVDLESASGEKDLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVFTHRINIPRRACGCAAAPDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GSQCSVDLESASGEKDLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVFTHRINIPRRACGCAAAPDVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 ELLSRLEELENLVSSLREQCTAGAGCCLQPATGRLDTRPFCSGRGNFSTEGCGCVCEPGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ELLSRLEELENLVSSLREQCTAGAGCCLQPATGRLDTRPFCSGRGNFSTEGCGCVCEPGW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 KGPNCSEPECPGNCHLRGRCIDGQCICDDGFTGEDCSQLACPSDCNDQGKCVNGVCICFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KGPNCSEPECPGNCHLRGRCIDGQCICDDGFTGEDCSQLACPSDCNDQGKCVNGVCICFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 GYAGADCSREICPVPCSEEHGTCVDGLCVCHDGFAGDDCNKPLCLNNCYNRGRCVENECV
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CCDS68 GYAGADCSREICPVPCSEEHGTCVDGLCVCHDGFAGDDCNKPLCLNNCYNRGRCVENECV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 CDEGFTGEDCSELICPNDCFDRGRCINGTCYCEEGFTGEDCGKPTCPHACHTQGRCEEGQ
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CCDS68 CDEGFTGEDCSELICPNDCFDRGRCINGTCYCEEGFTGEDCGKPTCPHACHTQGRCEEGQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 CVCDEGFAGVDCSEKRCPADCHNRGRCVDGRCECDDGFTGADCGELKCPNGCSGHGRCVN
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CCDS68 CVCDEGFAGVDCSEKRCPADCHNRGRCVDGRCECDDGFTGADCGELKCPNGCSGHGRCVN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 GQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCVEGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCHQHGRC
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CCDS68 GQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCVEGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCHQHGRC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 VNGMCVCDDGYTGEDCRDRQCPRDCSNRGLCVDGQCVCEDGFTGPDCAELSCPNDCHGRG
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CCDS68 VNGMCVCDDGYTGEDCRDRQCPRDCSNRGLCVDGQCVCEDGFTGPDCAELSCPNDCHGQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 RCVNGQCVCHEGFMGKDCKEQRCPSDCHGQGRCVDGQCICHEGFTGLDCGQHSCPSDCNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RCVNGQCVCHEGFMGKDCKEQRCPSDCHGQGRCVDGQCICHEGFTGLDCGQHSCPSDCNN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 LGQCVSGRCICNEGYSGEDCSEVSPPKDLVVTEVTEETVNLAWDNEMRVTEYLVVYTPTH
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CCDS68 LGQCVSGRCICNEGYSGEDCSEVSPPKDLVVTEVTEETVNLAWDNEMRVTEYLVVYTPTH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 EGGLEMQFRVPGDQTSTIIRELEPGVEYFIRVFAILENKKSIPVSARVATYLPAPEGLKF
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CCDS68 EGGLEMQFRVPGDQTSTIIQELEPGVEYFIRVFAILENKKSIPVSARVATYLPAPEGLKF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 KSIKETSVEVEWDPLDIAFETWEIIFRNMNKEDEGEITKSLRRPETSYRQTGLAPGQEYE
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CCDS68 KSIKETSVEVEWDPLDIAFETWEIIFRNMNKEDEGEITKSLRRPETSYRQTGLAPGQEYE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 ISLHIVKNNTRGPGLKRVTTTRLDAPSQIEVKDVTDTTALITWFKPLAEIDGIELTYGIK
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CCDS68 ISLHIVKNNTRGPGLKRVTTTRLDAPSQIEVKDVTDTTALITWFKPLAEIDGIELTYGIK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 DVPGDRTTIDLTEDENQYSIGNLKPDTEYEVSLISRRGDMSSNPAKETFTTGLDAPRNLR
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CCDS68 DVPGDRTTIDLTEDENQYSIGNLKPDTEYEVSLISRRGDMSSNPAKETFTTGLDAPRNLR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 RVSQTDNSITLEWRNGKAAIDSYRIKYAPISGGDHAEVDVPKSQQATTKTTLTGLRPGTE
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CCDS68 RVSQTDNSITLEWRNGKAAIDSYRIKYAPISGGDHAEVDVPKSQQATTKTTLTGLRPGTE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 YGIGVSAVKEDKESNPATINAATELDTPKDLQVSETAETSLTLLWKTPLAKFDRYRLNYS
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CCDS68 YGIGVSAVKEDKESNPATINAATELDTPKDLQVSETAETSLTLLWKTPLAKFDRYRLNYS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 LPTGQWVGVQLPRNTTSYVLRGLEPGQEYNVLLTAEKGRHKSKPAHVKASTEQAPELENL
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CCDS68 LPTGQWVGVQLPRNTTSYVLRGLEPGQEYNVLLTAEKGRHKSKPARVKASTEQAPELENL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 TVTEVGWDGLRLNWTAADQAYEHFIIQVQEANKVEAARNLTVPGSLRAVDIPGLKAATPY
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CCDS68 TVTEVGWDGLRLNWTAADQAYEHFIIQVQEANKVEAARNLTVPGSLRAVDIPGLKAATPY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 TVSIYGVIQGYRTPVLSAEASTGETPNLGEVVVAEVGWDALKLNWTAPEGAYEYFFIQVQ
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CCDS68 TVSIYGVIQGYRTPVLSAEASTGETPNLGEVVVAEVGWDALKLNWTAPEGAYEYFFIQVQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 EADTVEAAQNLTVPGGLRSTDLPGLKAATHYTITIRGVTQDFSTTPLSVEVLTEEVPDMG
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CCDS68 EADTVEAAQNLTVPGGLRSTDLPGLKAATHYTITIRGVTQDFSTTPLSVEVLTEEVPDMG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 NLTVTEVSWDALRLNWTTPDGTYDQFTIQVQEADQVEEAHNLTVPGSLRSMEIPGLRAGT
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CCDS68 NLTVTEVSWDALRLNWTTPDGTYDQFTIQVQEADQVEEAHNLTVPGSLRSMEIPGLRAGT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 PYTVTLHGEVRGHSTRPLAVEVVTEDLPQLGDLAVSEVGWDGLRLNWTAADNAYEHFVIQ
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CCDS68 PYTVTLHGEVRGHSTRPLAVEVVTEDLPQLGDLAVSEVGWDGLRLNWTAADNAYEHFVIQ
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 VQEVNKVEAAQNLTLPGSLRAVDIPGLEAATPYRVSIYGVIRGYRTPVLSAEASTAKEPE
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CCDS68 VQEVNKVEAAQNLTLPGSLRAVDIPGLEAATPYRVSIYGVIRGYRTPVLSAEASTAKEPE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 IGNLNVSDITPESFNLSWMATDGIFETFTIEIIDSNRLLETVEYNISGAERTAHISGLPP
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CCDS68 IGNLNVSDITPESFNLSWMATDGIFETFTIEIIDSNRLLETVEYNISGAERTAHISGLPP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 STDFIVYLSGLAPSIRTKTISATATTEALPLLENLTISDINPYGFTVSWMASENAFDSFL
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CCDS68 STDFIVYLSGLAPSIRTKTISATATTEALPLLENLTISDINPYGFTVSWMASENAFDSFL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 VTVVDSGKLLDPQEFTLSGTQRKLELRGLITGIGYEVMVSGFTQGHQTKPLRAEIVTEAE
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CCDS68 VTVVDSGKLLDPQEFTLSGTQRKLELRGLITGIGYEVMVSGFTQGHQTKPLRAEIVTEAE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 PEVDNLLVSDATPDGFRLSWTADEGVFDNFVLKIRDTKKQSEPLEITLLAPERTRDITGL
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CCDS68 PEVDNLLVSDATPDGFRLSWTADEGVFDNFVLKIRDTKKQSEPLEITLLAPERTRDITGL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB0 REATEYEIELYGISKGRRSQTVSAIATTAMGSPKEVIFSDITENSATVSWRAPTAQVESF
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CCDS68 REATEYEIELYGISKGRRSQTVSAIATTAMGSPKEVIFSDITENSATVSWRAPTAQVESF
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB0 RITYVPITGGTPSMVTVDGTKTQTRLVKLIPGVEYLVSIIAMKGFEESEPVSGSFTTALD
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CCDS68 RITYVPITGGTPSMVTVDGTKTQTRLVKLIPGVEYLVSIIAMKGFEESEPVSGSFTTALD
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB0 GPSGLVTANITDSEALARWQPAIATVDSYVISYTGEKVPEITRTVSGNTVEYALTDLEPA
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CCDS68 GPSGLVTANITDSEALARWQPAIATVDSYVISYTGEKVPEITRTVSGNTVEYALTDLEPA
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB0 TEYTLRIFAEKGPQKSSTITAKFTTDLDSPRDLTATEVQSETALLTWRPPRASVTGYLLV
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CCDS68 TEYTLRIFAEKGPQKSSTITAKFTTDLDSPRDLTATEVQSETALLTWRPPRASVTGYLLV
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB0 YESVDGTVKEVIVGPDTTSYSLADLSPSTHYTAKIQALNGPLRSNMIQTIFTTIGLLYPF
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CCDS68 YESVDGTVKEVIVGPDTTSYSLADLSPSTHYTAKIQALNGPLRSNMIQTIFTTIGLLYPF
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB0 PKDCSQAMLNGDTTSGLYTIYLNGDKAEALEVFCDMTSDGGGWIVFLRRKNGRENFYQNW
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CCDS68 PKDCSQAMLNGDTTSGLYTIYLNGDKAEALEVFCDMTSDGGGWIVFLRRKNGRENFYQNW
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB0 KAYAAGFGDRREEFWLGLDNLNKITAQGQYELRVDLRDHGETAFAVYDKFSVGDAKTRYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KAYAAGFGDRREEFWLGLDNLNKITAQGQYELRVDLRDHGETAFAVYDKFSVGDAKTRYK
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB0 LKVEGYSGTAGDSMAYHNGRSFSTFDKDTDSAITNCALSYKGAFWYRNCHRVNLMGRYGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LKVEGYSGTAGDSMAYHNGRSFSTFDKDTDSAITNCALSYKGAFWYRNCHRVNLMGRYGD
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200
pF1KB0 NNHSQGVNWFHWKGHEHSIQFAEMKLRPSNFRNLEGRRKRA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NNHSQGVNWFHWKGHEHSIQFAEMKLRPSNFRNLEGRRKRA
2170 2180 2190 2200
>>CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358 aa)
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:.: :
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CCDS13 LNGKYGESRHSQGINWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
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CCDS30 GYILTYQFPDGTVKEMQLGREDQRFALQGLEQGATYPVSLVAFKGGRRSRNVSTTLSTVG
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CCDS30 ARFPHPSDCSQVQQNSNAASGLYTIYLHGDASRPLQVYCDMETDGGGWIVFQRRNTGQLD
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CCDS30 FFKRWRSYVEGFGDPMKEFWLGLDKLHNLTTGTPARYEVRVDLQTANESAYAIYDFFQVA
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CCDS30 SSKERYKLTVGKYRGTAGDALTYHNGWKFTTFDRDNDIALSNCALTHHGGWWYKNCHLAN
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CCDS30 PNGRYGETKHSEGVNWEPWKGHEFSIPYVELKIRPHGYSREPVLGRKKRTLRGRLRTF
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CCDS47 MRLSWSVAQGPFDSFVVQYEDTNG--QPQALL
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CCDS47 VDGDQSKILISGLEPSTPYRFLLYGLHEGKRLGPLSAEGTTGLAPAGQTSEESRPRLSQL
40 50 60 70 80 90
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CCDS47 SVTDVTTSSLRLNWEAPPGAFDSFLLRFGVPSPSTLEPHPRPLLQRELMVPGTRHSAVLR
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CCDS47 DLRSGTLYSLTLYGLRGPHKADSIQGTARTLSPVLESPRDLQFSEIRETSAKVNWMPPPS
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CCDS47 RADSFKVSYQLADGGEPQSVQVDGQARTQKLQGLIPGARYEVTVVSVRGFEESEPLTGFL
220 230 240 250 260 270
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CCDS47 TTVPDGPTQLRALNLTEGFAVLHWKPPQNPVDTYDVQVTAPGAPPLQAETPGSAVDYPLH
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]