Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0049
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0049, 1823 aa
1>>>pF1KB0049 1823 - 1823 aa - 1823 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7993+/-0.00178; mu= 8.1786+/- 0.105
mean_var=263.7806+/-50.369, 0's: 0 Z-trim(103.9): 119 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.078968
statistics sampled from 7518 (7619) to 7518 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 5.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1823) 12143 1399.6 0
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1816) 12066 1390.8 0
CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1668) 948 124.1 4.4e-27
CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1724) 948 124.1 4.5e-27
CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277) 948 124.4 7e-27
CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333) 948 124.4 7e-27
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695) 850 113.3 1.7e-23
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122) 622 87.2 1e-15
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 610 85.6 1.8e-15
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761) 605 85.0 2.6e-15
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 600 84.5 3.9e-15
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 583 82.5 1.4e-14
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9 (1575) 545 78.2 2.8e-13
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075) 546 78.6 4.1e-13
CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs108|chr9 ( 602) 484 70.8 1.8e-11
CCDS43492.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 ( 120) 451 66.3 7.7e-11
>>CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1823 aa)
initn: 12143 init1: 12143 opt: 12143 Z-score: 7492.2 bits: 1399.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12143; 100.0% identity (100.0% similar) in 1823 aa overlap (1-1823:1-1823)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
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CCDS43 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
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CCDS43 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 IKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 TPADNGLILLMVNGSMFFRLEMRNGYLHVFYDFGFSGGPVHLEDTLKKAQINDAKYHEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPADNGLILLMVNGSMFFRLEMRNGYLHVFYDFGFSGGPVHLEDTLKKAQINDAKYHEIS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 IIYHNDKKMILVVDRRHVKSMDNEKMKIPFTDIYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDINFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIYHNDKKMILVVDRRHVKSMDNEKMKIPFTDIYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDINFRG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 CMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGVGYGCPEDSLISRRAYFNGQSFIASIQKISFFDGFEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGVGYGCPEDSLISRRAYFNGQSFIASIQKISFFDGFEGG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 FNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVKGIKVQSVDKQYNDGLSHFVISSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVKGIKVQSVDKQYNDGLSHFVISSVS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 PTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQYANFTGCISNAYFTRVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQYANFTGCISNAYFTRVD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 RDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKASQNKKGGKSKDAPSWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKASQNKKGGKSKDAPSWD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 PVALKLPERNTPRNSHCHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFEHLKGDFGAKSQFSIRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVALKLPERNTPRNSHCHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFEHLKGDFGAKSQFSIRLR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 TRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLWHDVIFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLWHDVIFIR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 ERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEATWKIKGPIYLGGVAPGKAVKNVQINSIYSFSGCLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEATWKIKGPIYLGGVAPGKAVKNVQINSIYSFSGCLSN
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 LQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKFEIAFEVRPRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKFEIAFEVRPRS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB0 SSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB0 NVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDG
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820
pF1KB0 HPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
:::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
1810 1820
>>CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1816 aa)
initn: 10089 init1: 10089 opt: 12066 Z-score: 7444.8 bits: 1390.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12066; 99.6% identity (99.6% similar) in 1823 aa overlap (1-1823:1-1816)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTG-------CDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 IKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYN
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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CCDS42 KGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGN-ST
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CCDS42 TASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPAST
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CCDS42 QEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRNIHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
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CCDS33 LEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDR
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CCDS33 CLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFV--SSRDDPSAPCVSCPCPLSVPS-NNFAEGCV
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CCDS33 LRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTG
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CCDS33 ACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHCLCKAGVTGR
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CCDS33 RCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGL
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pF1KB0 ------------------------PP--TGMDCPTIS--------------------CDK
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CCDS33 PEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDH
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CCDS33 CVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGI-NASSMAWARLH--RLNASIADLQSQLRSPLGPR
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CCDS33 HETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQAS---QLLAG-TEATLGHAKTLLAAI
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CCDS33 RAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARD-LGAPQAAAEAE
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CCDS33 LAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQEL
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: . : .. ...... .. ... .: .. :.:.. : ::. .. . : .
CCDS33 NSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAASL
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:::.. : .....: . : :. : :::.: : : .:: . . ... :.:.:..:
CCDS33 DGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIEA
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::.: :.. :. :...: ::. .:. . .: ..:...:..: :..
CCDS33 SNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVV------------RQGLVDRAQQLLANS
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.. .::. . ..:.: . : .. .:.: : :.. . : . .....
CCDS33 -TALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKK
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..... .. ::. :. .::. : .:. :. . . . .. . :: .: .: .: .
CCDS33 IAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEK
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pF1KB0 VVPQLLDQLRTVEQK--RPAS-NVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDGQSAVEVH
..:::: .: .:.. . :: .:::: :.::::::.:..:::..: : :.:.:.:...
CCDS33 TLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLR
2690 2700 2710 2720 2730 2740
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pF1KB0 SRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIKNDNLVYV
. .. :: :.:.:..:.. : .: : :.:..:.::..: .:::..... .. .:
CCDS33 TPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPG-QGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWV
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:.:: . .. .. :. :...:. . :. .: :.:...:. ::.
CCDS33 YQLGEAGPAVLSIDEDIGEQ---FAAVSLDRTLQFGH-------MSVTVERQMIQETKGD
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CCDS33 TVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFER
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CCDS33 TFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFA---RISFDSQISTTKRFEQELRLVS
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