Result of FASTA (omim) for
pF1KB0044
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0044, 1258 aa
1>>>pF1KB0044 1258 - 1258 aa - 1258 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5470+/-0.000424; mu= 23.4280+/- 0.027
mean_var=97.5970+/-19.631, 0's: 0 Z-trim(113.3): 42 B-trim: 2156 in 2/53
Lambda= 0.129824
statistics sampled from 22581 (22623) to 22581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 13.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005853 (OMIM: 604358) cohesin subunit SA-1 [Hom (1258) 8287 1563.7 0
XP_011510631 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin sub (1121) 7375 1392.8 0
XP_011510633 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin sub (1121) 7375 1392.8 0
XP_016861012 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin sub (1121) 7375 1392.8 0
XP_016861013 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin sub (1032) 6775 1280.4 0
NP_001269347 (OMIM: 300826) cohesin subunit SA-2 i (1231) 5509 1043.3 0
XP_016884723 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1231) 5509 1043.3 0
XP_016884721 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1231) 5509 1043.3 0
XP_005262418 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1231) 5509 1043.3 0
XP_016884722 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1231) 5509 1043.3 0
NP_001036216 (OMIM: 300826) cohesin subunit SA-2 i (1231) 5509 1043.3 0
NP_006594 (OMIM: 300826) cohesin subunit SA-2 isof (1231) 5509 1043.3 0
NP_001036214 (OMIM: 300826) cohesin subunit SA-2 i (1268) 5506 1042.8 0
XP_005262414 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1268) 5506 1042.8 0
XP_011529555 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1268) 5506 1042.8 0
XP_005262417 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1268) 5506 1042.8 0
XP_005262416 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1268) 5506 1042.8 0
XP_006724790 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1268) 5506 1042.8 0
NP_001036215 (OMIM: 300826) cohesin subunit SA-2 i (1268) 5506 1042.8 0
XP_005262415 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1268) 5506 1042.8 0
XP_006724791 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1199) 5433 1029.1 0
XP_016884724 (OMIM: 300826) PREDICTED: cohesin sub (1199) 5433 1029.1 0
XP_016861014 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin sub ( 821) 5403 1023.3 0
NP_001269645 (OMIM: 608489,615723) cohesin subunit (1225) 3660 697.0 2e-199
NP_036579 (OMIM: 608489,615723) cohesin subunit SA (1225) 3660 697.0 2e-199
XP_011514044 (OMIM: 608489,615723) PREDICTED: cohe (1226) 3660 697.0 2e-199
NP_001269646 (OMIM: 608489,615723) cohesin subunit (1226) 3660 697.0 2e-199
XP_016867175 (OMIM: 608489,615723) PREDICTED: cohe (1238) 3660 697.0 2e-199
XP_016867172 (OMIM: 608489,615723) PREDICTED: cohe (1239) 3660 697.0 2e-199
XP_016867174 (OMIM: 608489,615723) PREDICTED: cohe (1239) 3660 697.0 2e-199
XP_016867173 (OMIM: 608489,615723) PREDICTED: cohe (1239) 3660 697.0 2e-199
NP_001269647 (OMIM: 608489,615723) cohesin subunit (1167) 3331 635.4 6.7e-181
XP_016867176 (OMIM: 608489,615723) PREDICTED: cohe (1180) 3331 635.4 6.7e-181
XP_016867686 (OMIM: 612550) PREDICTED: tripartite ( 185) 478 100.3 1.3e-20
>>NP_005853 (OMIM: 604358) cohesin subunit SA-1 [Homo sa (1258 aa)
initn: 8287 init1: 8287 opt: 8287 Z-score: 8385.0 bits: 1563.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8287; 100.0% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1258)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 EAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 INFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 INFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 FIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 SIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 RELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 YSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 AAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 PPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 KTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 SNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFID
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 QDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 LTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 TVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 RPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 GSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB0 VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
1210 1220 1230 1240 1250
>>XP_011510631 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin subunit (1121 aa)
initn: 7375 init1: 7375 opt: 7375 Z-score: 7462.4 bits: 1392.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7375; 100.0% identity (100.0% similar) in 1121 aa overlap (138-1258:1-1121)
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 SYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMP
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 GPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAM
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 KLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENM
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 MNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVR
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KB0 LKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEA
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KB0 LSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRM
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KB0 LVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIE
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KB0 LMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAE
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KB0 KVANLLQIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVANLLQIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEE
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KB0 YTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDL
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KB0 TKWDLFGNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKWDLFGNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRK
580 590 600 610 620 630
770 780 790 800 810 820
pF1KB0 TVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQS
640 650 660 670 680 690
830 840 850 860 870 880
pF1KB0 ELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAA
700 710 720 730 740 750
890 900 910 920 930 940
pF1KB0 DIFKHYMKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIFKHYMKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSA
760 770 780 790 800 810
950 960 970 980 990 1000
pF1KB0 HVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVL
820 830 840 850 860 870
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB0 SEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGS
880 890 900 910 920 930
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB0 SSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSR
940 950 960 970 980 990
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB0 PMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB0 GLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAII
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1250
pF1KB0 EDDSGFGMPMF
:::::::::::
XP_011 EDDSGFGMPMF
1120
>>XP_011510633 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin subunit (1121 aa)
initn: 7375 init1: 7375 opt: 7375 Z-score: 7462.4 bits: 1392.8 E(85289): 0
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 HVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVL
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XP_011 SEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAII
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pF1KB0 EDDSGFGMPMF
:::::::::::
XP_011 EDDSGFGMPMF
1120
>>XP_016861012 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin subunit (1121 aa)
initn: 7375 init1: 7375 opt: 7375 Z-score: 7462.4 bits: 1392.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7375; 100.0% identity (100.0% similar) in 1121 aa overlap (138-1258:1-1121)
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 SYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMP
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pF1KB0 GPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAM
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pF1KB0 KLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENM
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XP_016 MNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAII
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:::::::::::
XP_016 EDDSGFGMPMF
1120
>>XP_016861013 (OMIM: 604358) PREDICTED: cohesin subunit (1032 aa)
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XP_016 MKLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERN
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pF1KB0 KMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIG
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pF1KB0 VWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKD
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pF1KB0 RIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLH
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pF1KB0 KKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELL
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pF1KB0 KDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKE
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pF1KB0 RKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDAL
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pF1KB0 LKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQ
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pF1KB0 ALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLC
520 530 540 550 560 570
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pF1KB0 DLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEA
580 590 600 610 620 630
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pF1KB0 NKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDK
640 650 660 670 680 690
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pF1KB0 IQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVAT
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pF1KB0 LHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMME
760 770 780 790 800 810
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB0 RREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDN
820 830 840 850 860 870
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pF1KB0 TWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISW
880 890 900 910 920 930
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pF1KB0 LGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEF
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pF1KB0 EDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
1000 1010 1020 1030
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pF1KB0 MITS-ELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSR
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:::.: ::: :::::::....::.:: .. ::: ::::::.:::::.::.:::::
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:.:. :.: .:. ::
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