Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0019, 2843 aa
1>>>pF1KB0019 2843 - 2843 aa - 2843 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4876+/-0.00124; mu= -6.0622+/- 0.075
mean_var=341.0481+/-69.820, 0's: 0 Z-trim(111.2): 27 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.069449
statistics sampled from 12183 (12194) to 12183 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 10.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4107.1 APC gene_id:324|Hs108|chr5 (2843) 18537 1873.1 0
CCDS12068.1 APC2 gene_id:10297|Hs108|chr19 (2303) 2327 249.0 2.4e-64
>>CCDS4107.1 APC gene_id:324|Hs108|chr5 (2843 aa)
initn: 18537 init1: 18537 opt: 18537 Z-score: 10044.8 bits: 1873.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 18537; 100.0% identity (100.0% similar) in 2843 aa overlap (1-2843:1-2843)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 RGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 QTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 HGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 WEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 VDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 QQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRENN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 CLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 GSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 PKASHRSKQRHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PKASHRSKQRHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 LDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMPYAKLEYKRSS
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CCDS41 QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMPYAKLEYKRSS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 NDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 LDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 STDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 STDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 TNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 TYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSANTLQIAEIKEKIGTRSAEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSANTLQIAEIKEKIGTRSAEDPV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 SEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQET
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 PLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 KDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 QNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPINFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPINFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQ
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB0 SGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB0 FRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB0 AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRND
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB0 SLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB0 GQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENN
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CCDS41 GQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENN
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB0 NKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQ
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB0 ECISSAMPKKKKPSRLKGDNEKHSPRNMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECISSAMPKKKKPSRLKGDNEKHSPRNMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFD
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB0 WKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSRQASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSRQASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFT
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB0 SNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESKGIKGGKKVYKSLITGKVRSNSEISGQMKQPLQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESKGIKGGKKVYKSLITGKVRSNSEISGQMKQPLQAN
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB0 MPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKGPPLKTPASKSPSEGQTATTSPRGAKPSVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKGPPLKTPASKSPSEGQTATTSPRGAKPSVKS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB0 ELSPVARQTSQIGGSSKAPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ELSPVARQTSQIGGSSKAPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPN
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB0 KLSQLPRTSSPSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLSQLPRTSSPSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKG
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB0 LNQMNNGNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNQMNNGNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESA
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KB0 SFESLSPSSRPASPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SFESLSPSSRPASPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDG
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KB0 RPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSES
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KB0 SEKAKSEDEKHVNSISGTKQSKENQVSAKGTWRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SEKAKSEDEKHVNSISGTKQSKENQVSAKGTWRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAES
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KB0 KTLIYQMAPAVSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KTLIYQMAPAVSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDN
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KB0 QAKQNVGNGSVPMRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QAKQNVGNGSVPMRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERT
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KB0 PFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKT
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840
pF1KB0 DSTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV
:::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV
2830 2840
>>CCDS12068.1 APC2 gene_id:10297|Hs108|chr19 (2303 aa)
initn: 3421 init1: 1544 opt: 2327 Z-score: 1268.6 bits: 249.0 E(32554): 2.4e-64
Smith-Waterman score: 3990; 35.4% identity (56.9% similar) in 2845 aa overlap (2-2800:4-2289)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDE
..: :.::..:::::: :::.:::::.:::.::.:::::.:.::::::.:::..:.:
CCDS12 MASSVAPYEQLVRQVEALKAENSHLRQELRDNSSHLSKLETETSGMKEVLKHLQGKLEQE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 A--MASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMG
: ..:::: ..::.:: :..: ... ..:.. . : . ..:. : ::: :
CCDS12 ARVLVSSGQTEVLEQLKALQMDITSLYNLKFQPP----TLGPEP---AARTPEGSPV-HG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 SFPRR-GFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLT
: : . .: . :: . ::::..:: .:: ...:::::: :::.:::.:.::.: :: .
CCDS12 SGPSKDSFGELSRATIRLLEELDRERCFLLNEIEKEEKEKLWYYSQLQGLSKRLDELPHV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 EN-FSLQTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQL
:. ::.: :. :.:::.::..:: :::..:: ..: .::: : .:..::.:..:
CCDS12 ETQFSMQMDLIRQQLEFEAQHIRSLMEERFGTSDEMVQRAQIRASRLEQIDKELL-----
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 LQSQATEAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSS
::. : .:.: :.. .. .. .:.. . . .
CCDS12 ------EAQ------------DRVQQTEPQALLAVK----------SVPVDEDPETEVPT
230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 SSTHSAPRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLP
..:. .: :::.:. :::::.:.:..: .::::::::: .::..::.:::::
CCDS12 HPEDGTPQPGNS----KVEVVFWLLSMLATRDQEDTARTLLAMSSSPESCVAMRRSGCLP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 LLIQLLHGNDKDS---VLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLE
::.:.:::.. . . .. :.:.:: ::.::::::. ::::. .:.:.::::.::
CCDS12 LLLQILHGTEAAAGGRAGAPGAPGAKDARMRANAALHNIVFSQPDQGLARKEMRVLHVLE
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 QIRAYCETCWEWQEAHEPGMDQD-KNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELG
::::::::::.: .:.. : . . : :.: ::: :.:..::::::::.:.::::::
CCDS12 QIRAYCETCWDWLQARDGGPEGGGAGSAPIPIEPQICQATCAVMKLSFDEEYRRAMNELG
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB0 GLQAIAELLQVDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALV
::::.::::::: ::. .: : ...:::::::.::::::::::::::::. .:::.:.:
CCDS12 GLQAVAELLQVDYEMHKMTRDPLNLALRRYAGMTLTNLTFGDVANKATLCARRGCMEAIV
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KB0 AQLKSESEDLQQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLS
::: :.::.:.::..:.:::::::::.::::.:::.::: ::..:.:.. ::::::::::
CCDS12 AQLASDSEELHQVVSSILRNLSWRADINSKKVLREAGSVTALVQCVLRATKESTLKSVLS
500 510 520 530 540 550
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pF1KB0 ALWNLSAHCTENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNE
:::::::: ::::: :: :::::.:::.::::. :.:.:::::::::::::::::.:: :
CCDS12 ALWNLSAHSTENKAAICQVDGALGFLVSTLTYKCQSNSLAIIESGGGILRNVSSLVATRE
560 570 580 590 600 610
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pF1KB0 DHRQILRENNCLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNL
:.::.::..:::::::::: ::::::::::::::::::::. .::: :::.:::.::.::
CCDS12 DYRQVLRDHNCLQTLLQHLTSHSLTIVSNACGTLWNLSARSARDQELLWDLGAVGMLRNL
620 630 640 650 660 670
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pF1KB0 IHSKHKMIAMGSAAALRNLMANRPAKYKDA-NIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHL
.::::::::::::::::::.:.::::.. : . .:::: .:::.::::.::::::::.::
CCDS12 VHSKHKMIAMGSAAALRNLLAHRPAKHQAAATAVSPGSCVPSLYVRKQRALEAELDARHL
680 690 700 710 720 730
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pF1KB0 SETFDNIDNLSPKASHRSKQ------RHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLS
......... .: :.. . . :: ..: ::. :.. ::. . . .... .
CCDS12 AQALEHLEKQGPPAAEAATKKPLPPLRHLDGLAQDYASDSGCFDDDDAPS----SLAAAA
740 750 760 770 780 790
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pF1KB0 PYLNTTVLPSSSSSRGSLDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPG---TSSKRGLQI
.: :.: .. . . .: . ..: : :. . .. : ...: ..
CCDS12 ----ATGEPASPAALSLFLGSPFLQGQALARTPPTRRGGKEAEKDTSGEAAVAAKAKAKL
800 810 820 830 840
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pF1KB0 STTAAQIAKVMEEVSAIHTSQEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFT--
. ..:.: ...:..::.:::..: : :. : . : . :.. : .
CCDS12 ALAVARIDQLVEDISALHTSSDDSFSLSSG------DPGQEAPREGRAQSCSPCRGPEGG
850 860 870 880 890 900
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pF1KB0 KSENSNRTCSMPYAKLEYKRSSNDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYG
. : ..:. . : . ::::::: :.:::: : .: : :
CCDS12 RREAGSRAHPLLRLKAAHASLSNDSLNSGSASDGYCPREHMLP-------------C---
910 920 930 940
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB0 QYPADLAHKIHSANHMDDNDGELDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIED
:. : : :..:
CCDS12 -------------------------PLA--------ALASRREDP---------------
950
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pF1KB0 EIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTESTDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSN
.: .: ::
CCDS12 --------------------------------------RCGQPRPSR-------------
960
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB0 HGINQNVSQSLCQEDDYEDDKPTNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPID
... :: . :. : . . . : .:: . .:: :.
CCDS12 ----LDLDLPGCQAE-----PPAR------EATSADARVR----TIKLSPTYQHV--PL-
970 980 990 1000
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pF1KB0 YSLKYATDIPSSQKQSFSFSKSSSGQSSKTEHMSSSSENTSTP--SSNAKRQNQLHPSSA
:. : : .: .: . : : .:..: : :..
CCDS12 --LEGA---------------SRAG-----------AEPLAGPGISPGARKQAWL-PADH
1010 1020 1030
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pF1KB0 QSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQTYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEA
:. :.: :. .: . ....: ... :. .:::::::::::: . : .. .
CCDS12 LSKV--PEKLAAAPLS-VASKALQKLAAQEGPLSLSRCSSLSSLSSA-GRPGPSEGGDLD
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KB0 DSANTLQIAEIKEKIGTRSAE-DPVSEVPAVSQHPRTKSS--RLQGSSLSSESARHKAVE
:: ..: : :. : :: : . ..:.... : . . : .: .:. :.:
CCDS12 DSDSSL---EGLEEAGPSEAELDSTWRAPGATSLPVAIPAPRRNRGRGLGVEDA------
1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB0 FSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQETPLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGM
::.: :.:::::::..:::.::::: :::: :::::. ::::::.
CCDS12 --------------TPSSSSENYVQETPLVLSRCSSVSSLGSFESPSIASSIPSEPCSGQ
1150 1160 1170 1180
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pF1KB0 VSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP--PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAA
:: ::::.:::::::::::::::::: : :: : . . . . :: :.
CCDS12 GSGTISPSELPDSPGQTMPPSRSKTPPLAPAPQG-------PPEATQFSLQWESYVKRFL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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pF1KB0 VNAAVQRVQVLP---DADTLLHFATESTPDGFSCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPV
: .. :: :: .. .:..:. ..:::.::::::.: : ..:.:::::..: .
CCDS12 DIADCRERCRLPSELDAGSV-RFTVEKPDENFSCASSLSALALHEHYVQQDVELRLLPSA
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KB0 QENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSEKDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSS
. .:. . ... .:. : . . . :...:.:.::. .:.:..
CCDS12 CPERGGGAGGAGLHFAGHRRREEGPAPTGSRPRG----AADQELELLRECLGAAVPARL-
1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KB0 RKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPSQNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTP
:: .:: : : .:. .::: :.:. : .: . .::::
CCDS12 RK------VASALVP--GRRALPVPVYMLVPAPAPAQ----------EDDSCTDSAEGTP
1360 1370 1380 1390
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pF1KB0 INFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQSGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSV
.:::.:.:::: :...:: . .: . : : :: :: :. :
CCDS12 VNFSSAASLSDETLQGPPRDQPGGPA---GRQR---------PT-GRPTSARQ-------
1400 1410 1420 1430
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KB0 TIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKPFRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGK
:: :. :: . . .: . :. :. :.
CCDS12 ----------------------AM--GHRHKAGGAGRSAEQSRGAGK-----NRAGLELP
1440 1450 1460
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pF1KB0 KKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLNAERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLP
.: : : :: ::..: :
CCDS12 LGRP--PSAP--------------AD--------------KDGSK--------------P
1470 1480
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pF1KB0 NNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRNDSLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENK
. :.::. :..: :: : . ::: ::: :.
CCDS12 G---RTRGDGALQSLCLTTPTEEAVYCFYGNDS-----------------------DEEP
1490 1500 1510
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KB0 ESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINRGQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATD
. : . .: .:.:: . ..: .: : .. : :: : .:
CCDS12 PAAAPTPTHR----------RTSAIPRA-FTRERP----QGRKEAPAPSKAAP--AAPPP
1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KB0 EKLQ-NFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENNNKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGY
. : .. ..:: :.: .:: :::: : :: .::: . . .: ..
CCDS12 ARTQPSLIADETPPCYSLSSSASSLS---------EPEP---SEPPAVHPRGREPAVT--
1570 1580 1590 1600
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pF1KB0 APKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQECISSAMPKKKKP-SRLKGDNEKHSPR
.: .:.:: : . ..:::.:::::.:... : : :. ...::
CCDS12 -------KDPGPGGGRDSSPSP---RAAEELLQRCISSALPRRRPPVSGLR----RRKPR
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pF1KB0 NMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFDWKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSR
: : . .. . . . : .. .:.::::::::::. ::::::: .:
CCDS12 ATR--LDERPAEGSRERGEEAAGSDRASDLDSVEWRAIQEGANSIVTWLHQAAAA---TR
1660 1670 1680 1690 1700
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pF1KB0 QASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFTSNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESK
.:::.::::::. ::.:.:: : : ...: :... : . . :
CCDS12 EASSESDSILSFVSGLSVGST--LQPPKHRK-------------GRQAEGEMGSARRPEK
1710 1720 1730 1740 1750
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pF1KB0 GIKGGKKVYKSLITGKVRSNS-EISGQMKQPLQANMPSISRGRTMIHIPGV--RNSSSST
.:. .: : :. :: . . . : ..:.. ::::.:..:. : . ..:
CCDS12 --RGAASVKTS---GSPRSPAGPEKPRGTQKTTPGVPAVLRGRTVIYVPSPAPRAQPKGT
1760 1770 1780 1790 1800
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pF1KB0 -SPVS---KKGPP-LKTPAS--KSPSEGQTATTS-PRGAKPSVKSELSPVARQTSQIGGS
.: . : .:: : ::. : :: :: . : : :: : . :: :... .
CCDS12 PGPRATPRKVAPPCLAQPAAPAKVPSPGQQRSRSLHRPAKTSELATLSQPPRSATPPARL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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pF1KB0 SKAPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPNKLSQLPRTSSPSTAS
.:.:: :.:. : ::.::: : : .. . ... :. : .:.: . . .
CCDS12 AKTPSSSSSQTS----PASQPLPRK-----RPPVTQAAGALPGPGA-SPVPKTPARTLLA
1870 1880 1890 1900 1910
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pF1KB0 TKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKGLNQMNNGNGA-NKKV
. . . :: : .: ... : : ..: : . .: . : :: . ..
CCDS12 KQHK-----TQRSPVRIPFMQRPARR-GPPPLARAVP--EPGPRGRAGTEAGPGARGGRL
1920 1930 1940 1950 1960 1970
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pF1KB0 ELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESASFESLSPSSRPASP
: :..:. :::::: :.: . :: ::::: :: :::. : .: :: . . . :::
CCDS12 GLVRVASALSSGSES--SDRSGFRRQLTFIKE--SPGLRRRRSELSSAESAASAPQGASP
1980 1990 2000 2010 2020
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pF1KB0 TRSQAQTP-VLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDGRPAKRHDIARSHS
:.. : :. : : . . :. :: :. :::.: . :
CCDS12 RRGRPALPAVFLCSSRCEELRAAPRQGPAPARQRPPAARPS---PGERPARR-----TTS
2030 2040 2050 2060 2070
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pF1KB0 ESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSESSEKAKSEDEKHVN
:::::::. :. . . : :. .:::..:. :: .. ::......... . . .
CCDS12 ESPSRLPV-RAPAARPETVKRYASLPHISVARRPDGAVPAAPASADAARRSSDGEPRPL-
2080 2090 2100 2110 2120 2130
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pF1KB0 SISGTKQSKENQVSAKGT-WRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAESKTLIYQMAPAVS
.:.: :: ::.:.... .. ... :. . .:
CCDS12 ----------PRVAAPGTTWRRIRDEDVPHILRSTLPATALPLRGSTPEDA--PAGPPPR
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pF1KB0 KTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDNQAKQNVGNGSVP
:: :. :. :. . :... : : : ... . : ..:..
CCDS12 KTSDAVVQTEE--VAAPKTNSS----TSPSLETREPPGAP--------------AGGQLS
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pF1KB0 MRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERTPFSSSSSSKHSS
. :.: .::.:. . :. . ..:. : : . :.:.:
CCDS12 L--------LGS--DVDGPSLA--------KAPISAPFVHEGLGVAVGGFPA---SRHGS
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:: . ::: :::: ::: .: . ::
CCDS12 PSRS--ARVPPFNYVPSPMVVAATTDSAAEKAPATASATLLE
2270 2280 2290 2300
2843 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 11:31:30 2016 done: Thu Nov 3 11:31:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]