Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0016, 1690 aa
1>>>pF1KB0016 1690 - 1690 aa - 1690 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1538+/-0.00104; mu= 17.1943+/- 0.063
mean_var=186.9667+/-35.844, 0's: 0 Z-trim(109.9): 93 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.093798
statistics sampled from 11115 (11196) to 11115 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 6.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690) 11371 1553.0 0
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544) 4883 675.0 5.3e-193
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1379) 4036 560.4 1.6e-158
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1559) 4033 560.0 2.3e-158
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1560) 4033 560.0 2.3e-158
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1580) 3969 551.4 9.2e-156
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1482) 3801 528.6 6.2e-149
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1539) 3801 528.6 6.3e-149
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570) 2942 412.4 6.3e-114
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 ( 523) 494 80.6 1.6e-14
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 ( 506) 493 80.4 1.7e-14
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 487 80.0 4.9e-14
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 813) 458 75.9 6.2e-13
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 835) 458 75.9 6.3e-13
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 458 76.1 7.4e-13
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 447 74.6 2.1e-12
>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690 aa)
initn: 11371 init1: 11371 opt: 11371 Z-score: 8322.9 bits: 1553.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11371; 100.0% identity (100.0% similar) in 1690 aa overlap (1-1690:1-1690)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 FACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPVVERKILDLYAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPVVERKILDLYAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VQMPNLDLKEKVEPEVLSTDTQTSPEPGTRMNILPKRTRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VQMPNLDLKEKVEPEVLSTDTQTSPEPGTRMNILPKRTRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 IFGAGPKVVGLAMGTKDKEDEVTRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IFGAGPKVVGLAMGTKDKEDEVTRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 RGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVRE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 YTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 GFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 CWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 NPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 HYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 SEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 PLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 FRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 SQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 ARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 VCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 EQLESLSAKGRPIPVRLEALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EQLESLSAKGRPIPVRLEALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 GVYGSGKNRRKKVKELIEKEKEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GVYGSGKNRRKKVKELIEKEKEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 MHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 SSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 RQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 FNRVVSSVSSSPRQTMDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FNRVVSSVSSSPRQTMDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 IKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 AKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKVKGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKVKGKD
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 SSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 RKKKKEKAAAAKVELVKESTEKKREKKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RKKKKEKAAAAKVELVKESTEKKREKKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 DKVDWVQCDGGCDEWFHQVCVGVSPEMAENEDYICINCAKKQGPVSPGPAPPPSFIMSYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DKVDWVQCDGGCDEWFHQVCVGVSPEMAENEDYICINCAKKQGPVSPGPAPPPSFIMSYK
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690
pF1KB0 LPMEDLKETS
::::::::::
CCDS41 LPMEDLKETS
1690
>>CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544 aa)
initn: 5217 init1: 3675 opt: 4883 Z-score: 3578.5 bits: 675.0 E(32554): 5.3e-193
Smith-Waterman score: 5405; 50.5% identity (74.1% similar) in 1678 aa overlap (1-1664:17-1541)
10 20 30 40
pF1KB0 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAE
..: :: : ::.:::::::::::::::.::..:: .:::.::
CCDS30 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLG---EFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB0 KTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGST
.:::::.::: ::::::::.: ...::::.::::::::.:::.:.::::.::.:::::::
CCDS30 QTGICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGST
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 LKIPVVERKILDLYALSKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYER
:::: ::::::::. :.:.:: .::: .: :..::.:.....:. :::..:: ...::::
CCDS30 LKIPHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYER
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB0 ILYPYELFQSGVSLMGVQMPNL--DLKEK-VEPEVLSTDTQTSPE----PGTRMNILPKR
:: ::.:: :: :: .: ::: : :.: .:. . ...: :. : . . .
CCDS30 ILNPYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 TRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQIFGAGPKVVGLA-MGTKDKEDEVTRRRKVTNRSDAFN
. .: . : .:. .:.. .. :: . : .. :.. . :. ... .. .
CCDS30 AMNIKIEPEETTEARTHNLRR-RMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVE-NEKEK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 MQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWR
. :..:.: : ::::::..:: ::.::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS30 PKSRSKKAT---NAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 CPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
::::.:.:::::.::::::::.:.:::..:::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 LVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVL
:::.::::: :::::::.::.:::::::.::. :. :::::: ::::::::::.:::::
CCDS30 LVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB0 AHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEE
:::..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.
CCDS30 AHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLEN
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB0 VMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQ
::..:::::: ::::::::::::::::.:: : ::::::::::::::.::::::::::::
CCDS30 VMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQ
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB0 GYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVC
:.::::::::::.::::.:::::.::: :.:.:::::.:.: :::. . ::: .:. :
CCDS30 GFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQ
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB0 KELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPER
:....: :.: :::.: ..::. ::. :::.::::::: :.::::.::..:::.:
CCDS30 KDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGL
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KB0 LVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANFNH
::::.: .:: :: : ::::: :.:: .. ..:.::.::. :. :.::: :..:.
CCDS30 LVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINK
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KB0 KKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGR
::.:. .....:..: .:.:.:::.:.:: ....:: :::::: ::. :.. : .:.
CCDS30 KKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGK
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KB0 TRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQM
....:::.::. :: ::..::::.::. .:.::. ::.:....:. . .:::....::
CCDS30 SQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQD
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KB0 LIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHH
:.:.. . ::::.: ... .:.:::::.::. . ::...::: :..::: ::::::.
CCDS30 LLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYS
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KB0 AVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKE
:::::::.:::::::::.:..::: :.::::::. :: . :.: ..:::.::: .::.
CCDS30 AVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKD
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB0 ALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLEALPQVESQVAAARAWRER
..:.::.: ::..:.:. :. : : ..:: :::.:..::..:. :: ..::.:
CCDS30 SVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKEC
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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.. : .:. : : :.: :.: : ... .: : : .:
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CCDS30 EDYICVRCTVKDAPSRK
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CCDS65 KLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLES
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.. .:.: .. .: :::.::.::::. :: .:. :: . . .: : ..
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CCDS14 PEKVAPE---------------EGSGK-RDLELLSSLLPQ-LTGPVLELPEATRAPLEEL
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CCDS14 SPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
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CCDS81 QTGICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGST
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CCDS81 LKIPHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYER
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CCDS81 ILNPYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAE
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CCDS81 RQSLAVLPRLECSGAILAHCNLRLLDSSNSSASASQAMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMG
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CCDS81 CPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNAVDLYVCLLCGSGNDE
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:::::: :::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::.
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CCDS81 HRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMD
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CCDS81 FELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDL
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CCDS81 LVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPL
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:::::. :: . :.: ..:::.::: .::...:.::.: ::..:.:. :. :
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. ..:. ...:. .. .. : .:. : : :.:
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.::.: ..::.::: : :.... : : :.. :: . .. :: .::
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CCDS55 DENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENL
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CCDS14 FAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSL
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CCDS14 SKIVIEEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIYPYEMFQSGANHVQ
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CCDS14 CNTHPFDNEVKDK-EYKPHSIPLRQSVQP-SKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPEL
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CCDS14 KKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTV--HKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLS
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CCDS14 LEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEI
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CCDS14 PRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELV
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CCDS14 YDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVAL
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.. ..:... :::.. .:..:..:...:...:.. ..:.:.: . . :.: . . .
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: ..: .. : ... :: : .. :. : :.
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CCDS14 TLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVE
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CCDS55 ENMAPGKGSDLEL------------------------------------------LSSLL
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CCDS55 EKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQ
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CCDS55 EKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
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CCDS83 QNFEDL-ERKYWK--NRIYNSPI--YGADIS----GSLF---DENTK-----------QW
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CCDS83 YDLWKRGQDRAVVD-HMEPRVPASQELSTQKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARHSPWPMAA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]