FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0015, 1591 aa
1>>>pF1KB0015 1591 - 1591 aa - 1591 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0914+/-0.00119; mu= 15.3665+/- 0.071
mean_var=133.1115+/-26.482, 0's: 0 Z-trim(105.4): 121 B-trim: 72 in 1/49
Lambda= 0.111165
statistics sampled from 8288 (8413) to 8288 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 5.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6579.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1591) 10679 1725.9 0
CCDS83361.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1610) 9488 1534.9 0
CCDS45264.1 UNC13C gene_id:440279|Hs108|chr15 (2214) 6137 997.5 0
CCDS46013.2 UNC13A gene_id:23025|Hs108|chr19 (1703) 5483 892.6 0
>>CCDS6579.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1591 aa)
initn: 10679 init1: 10679 opt: 10679 Z-score: 9257.9 bits: 1725.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10679; 99.9% identity (99.9% similar) in 1591 aa overlap (1-1591:1-1591)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSLLCVRVKRAKFQGSPDKFNTYVTLKVQNVKSTTVAVRGDQPSWEQDFMFEISRLDLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MSLLCVRVKRAKFQGSPDKFNTYVTLKVQNVKSTTVAVRGDQPSWEQDFMFEISRLDLGL
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SVEVWNKGLIWDTMVGTVWIALKTIRQSDEEGPGEWSTLEAETLMKDDEICGTRNPTPHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ILLDTRFELPFDIPEEEARYWTYKWEQINALGADNEYSSQEESQRKPLPTAAAQCSFEDP
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DSAVDDRDSDYRSETSNSFPPPYHTASQPNASVHQFPVPVRSPQQLLLQGSSRDSCNDSM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QSYDLDYPERRAISPTSSSRYGSSCNVSQGSSQLSELDQYHEQDDDHRETDSIHSCHSSH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLSRDGQAGFGEQEKPLEVTGQAEKEAACEPKEMKEDATTHPPPDLVLQKDHFLGPQESF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PEENASSPFTQARAHWIRAVTKVRLQLQEIPDDGDPSLPQWLPEGPAGGLYGIDSMPDLR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RKKPLPLVSDLSLVQSRKAGITSAMATRTSLKDEELKSHVYKKTLQALIYPISCTTPHNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCSECGVKCHEKCQDLLNADCLQRAAEKSCKHGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EDRTQNIIMAMKDRMKIRERNKPEIFEVIRDVFTVNKAAHVQQMKTVKQSVLDGTSKWSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KITITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVSKTKKRTKTIFGNLNPVWEEKFHFECHNSSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS65 AIRLQISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHYLTDIQGSGGVRIPEARGDDAWKVYFDE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TAQEIVDEFAMRYGIESIYQAMTHFACLSSKYMCPGVPAVMSTLLANINAYYAHTTASTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEYIFNNCHDLYSRQYQLKQELPPEEQGP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SIRNLDFWPKLITLIVSIIEEDKNSYTPVLNQFPQELNVGKVSAEVMWHLFAQDMKYALE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB0 FAKTIGKVLMQYADILSKDFPAYCTKEKLPCILMNNVQQLRVQLEKMFEAMGGKELDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LIFTAAKELSHLSKLKDHMVREETRNLTPKQCAVLDLALDTIKQYFHAGGNGLKKTFLEK
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pF1KB0 SPDLQSLRYALSLYTQTTDTLIKTFVRSQTTQGSGVDDPVGEVSIQVDLFTHPGTGEHKV
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CCDS65 SPDLQSLRYALSLYTQTTDTLIKTFVRSQTTQGSGVDDPVGEVSIQVDLFTHPGTGEHKV
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pF1KB0 TVKVVAANDLKWQTAGMFRPFVEVTMVGPHQSDKKRKFTTKSKSNNWAPKYNETFHFLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 NEEGPESYELQICVKDYYFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGSCACWCPLGRKIHMDETGLT
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NEEGPESYELQICVKDYCFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGSCACWCPLGRKIHMDETGLT
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KB0 ILRILSQRSNDEVAREFVKLKSESRSTEEGS
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ILRILSQRSNDEVAREFVKLKSESRSTEEGS
1570 1580 1590
>>CCDS83361.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1610 aa)
initn: 9481 init1: 9481 opt: 9488 Z-score: 8225.5 bits: 1534.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10631; 98.8% identity (98.8% similar) in 1610 aa overlap (1-1591:1-1610)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB0 SVEVWNKGLIWDTMVGTVWIALKTIRQSDEEGPGEWSTLEAETLMKDDEICGTRNPTPHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SVEVWNKGLIWDTMVGTVWIALKTIRQSDEEGPGEWSTLEAETLMKDDEICGTRNPTPHK
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ILLDTRFELPFDIPEEEARYWTYKWEQINALGADNEYSSQEESQRKPLPTAAAQCSFEDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DSAVDDRDSDYRSETSNSFPPPYHTASQPNASVHQFPVPVRSPQQLLLQGSSRDSCNDSM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QSYDLDYPERRAISPTSSSRYGSSCNVSQGSSQLSELDQYHEQDDDHRETDSIHSCHSSH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLSRDGQAGFGEQEKPLEVTGQAEKEAACEPKEMKEDATTHPPPDLVLQKDHFLGPQESF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKKPLPLVSDLSLVQSRKAGITSAMATRTSLKDEELKSHVYKKTLQALIYPISCTTPHNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCSECGVKCHEKCQDLLNADCLQRAAEKSCKHGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EDRTQNIIMAMKDRMKIRERNKPEIFEVIRDVFTVNKAAHVQQMKTVKQSVLDGTSKWSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KITITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVSKTKKRTKTIFGNLNPVWEEKFHFECHNSSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AIRLQISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHYLTDIQGSGGVRIPEARGDDAWKVYFDE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TAQEIVDEFAMRYGIESIYQAMTHFACLSSKYMCPGVPAVMSTLLANINAYYAHTTASTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLSTYRNNFPAGSPERLQDLKSTVDLLTSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEYIFNNCHDLYSRQYQLKQELPPEEQGP
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pF1KB0 SIRNLDFWPKLITLIVSIIEEDKNSYTPVLNQFPQELNVGKVSAEVMWHLFAQDMKYALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SIRNLDFWPKLITLIVSIIEEDKNSYTPVLNQFPQELNVGKVSAEVMWHLFAQDMKYALE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EHEKDHLCKSADYMNLHFKVKWLHNEYVRDLPVLQGQVPEYPAWFEQFVLQWLDENEDVS
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pF1KB0 LEFLRGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFTQLNQSFEIIRKLECPDPSILAHYMRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LEFLRGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFTQLNQSFEIIRKLECPDPSILAHYMRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FAKTIGKVLMQYADILSKDFPAYCTKEKLPCILMNNVQQLRVQLEKMFEAMGGKELDLEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ADSLKELQVKLNTVLDELSMVFGNSFQVRIDECVRQMADILGQVRGTGNASPDARASAAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DADSVLRPLMDFLDGNLTLFATVCEKTVLKRVLKELWRVVMNTMERMIVLPPLTDQTGTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LIFTAAKELSHLSKLKDHMVREETRNLTPKQCAVLDLALDTIKQYFHAGGNGLKKTFLEK
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:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS83 SPDLQSLRYALSLYTQTTDTLIKTFVRSQTTQVHDGKGIRFTANEDIRPEKGSGVDDPVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EVSIQVDLFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQTAGMFRPFVEVTMVGPHQSDKKRKFTTK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KB0 SKSNNWAPKYNETFHFLLGNEEGPESYELQICVKDYYFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS83 SKSNNWAPKYNETFHFLLGNEEGPESYELQICVKDYCFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGS
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CCDS83 CACWCPLGRKIHMDETGLTILRILSQRSNDEVAREFVKLKSESRSTEEGS
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CCDS45 YFHAGGNGLKKNFLEKSPDLQSLRYALSLYTQTTDALIKKFIDTQTSQSRSSKDAVGQIS
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CCDS45 NTWSPKYNETFQFILGKENRPGAYELHLSVKDYCFAREDRIIGMTVIQLQNIAEKGSYGA
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CCDS46 E-EFSEPQALSPTGSSRYASSGELSQGSSQLSEDFDPDEHSLQGSDMEDERDRDSYHSCH
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CCDS46 VAEPKDFKRISLPPAAPGKEDKAPVAPTEAPDMAKVAPKPATPDKVPAAEQIPEAEPPKD
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::::::: :::::::::::::..::::::::::::::::.:...:.:.:.::.::::.::
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CCDS46 KGDDAWKVYYDETAQEIVDEFAMRYGVESIYQAMTHFACLSSKYMCPGVPAVMSTLLANI
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CCDS46 NAYYAHTTASTNVSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLSMYRNNFPASSPERLQ
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CCDS46 DLKSTVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEYIFNNCHELYSREYQ
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CCDS46 TDPAKKGEVLPEEQGPSIKNLDFWSKLITLIVSIIEEDKNSYTPCLNQFPQELNVGKISA
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CCDS46 EVMWNLFAQDMKYAMEEHDKHRLCKSADYMNLHFKVKWLYNEYVTELPAFKDRVPEYPAW
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CCDS46 FEPFVIQWLDENEEVSRDFLHGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFSQLNQSFEIIK
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pF1KB0 KLECPDPSILAHYMRRFAKTIGKVLMQYADILSKDFPAYCTKEK--LPCILMNNVQQLRV
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CCDS46 KLECPDPQIVGHYMRRFAKTISNVLLQYADIISKDFASYCSKEKEKVPCILMNNTQQLRV
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pF1KB0 QLEKMFEAMGGKELDLEAADSLKELQVKLNTVLDELSMVFGNSFQVRIDECVRQMADILG
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CCDS46 QLEKMFEAMGGKELDAEASDILKELQVKLNNVLDELSRVFATSFQPHIEECVKQMGDILS
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CCDS46 QVKGTGNVPASACSSVAQDADNVLQPIMDLLDSNLTLFAKICEKTVLKRVLKELWKLVMN
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pF1KB0 TMERMIVLPPLTDQT-------------------------GTQLIFTAAKELSHLSKLKD
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CCDS46 TMEKTIVLPPLTDQTMIGNLLRKHGKGLEKGRVKLPSHSDGTQMIFNAAKELGQLSKLKD
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CCDS46 HMVREEAKSLTPKQCAVVELALDTIKQYFHAGGVGLKKTFLEKSPDLQSLRYALSLYTQA
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CCDS46 TDLLIKTFVQTQSAQGLGVEDPVGEVSVHVELFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQTSGI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KB0 FRPFVEVTMVGPHQSDKKRKFTTKSKSNNWAPKYNETFHFLLGNEEGPESYELQICVKDY
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CCDS46 FRPFIEVNIIGPQLSDKKRKFATKSKNNSWAPKYNESFQFTLSADAGPECYELQVCVKDY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KB0 YFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGSCACWCPLGRKIHMDETGLTILRILSQRSNDEVAREF
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