FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA2022, 1516 aa
1>>>pF1KA2022 1516 - 1516 aa - 1516 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4124+/-0.00104; mu= 13.8694+/- 0.063
mean_var=110.7356+/-21.894, 0's: 0 Z-trim(106.7): 22 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.121879
statistics sampled from 9141 (9148) to 9141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 5.160
The best scores are: opt bits E(32554)
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>>CCDS35337.1 KIAA2022 gene_id:340533|Hs108|chrX (1516 aa)
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Smith-Waterman score: 10085; 100.0% identity (100.0% similar) in 1516 aa overlap (1-1516:1-1516)
10 20 30 40 50 60
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CCDS35 MDNQQDKAIVASANGENTLINGVKENDSEDQDVAMKSFAALEAAAPIQPTPVAQKETLMY
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CCDS35 PRGLLPLPSKKPCMQSPPSPLGLIEAPEHAANSASVNAISLTSGIAKGLNTWSLPNECEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 APFAIMEPAGMSALNGDCLMQPSRTCLGCFMESKDAVDPEPGISLKVGDLNRDYETCAVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA2 DIGIQCINAGENMKYGEQLLSDQLLGFPLHKSRAGDRRETEKPDIDLEDPAQKSYYEALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DIGIQCINAGENMKYGEQLLSDQLLGFPLHKSRAGDRRETEKPDIDLEDPAQKSYYEALL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA2 LDKCNTEEALLANSNQDWGYFETFISESKIELLDLCSKNELSVNLFSEEDVDNYMFDDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LDKCNTEEALLANSNQDWGYFETFISESKIELLDLCSKNELSVNLFSEEDVDNYMFDDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 STLGSDVCSLKIRYESFQDNVRDKTTLLMQEDAQFNFFPSVFTTCPKRESKSGALKQSSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FSQFKVPDVSIIWGEEDKNLDKKKGKEEGQEDKGVEKKDGKDNGEKPALNKPCSGTEVEQ
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LKNPKQGHLANSLETSGSFSDDSSFIEISYDAMGEIKDCSRYMARDTNSGSSSSQQNYGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RAKRKVRYSEDYLYDVDSLEGEKVNERKEWLPVGSKEEDDDEWCPKKRRKVTRKEPPVII
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pF1KA2 KYIIINRFKGEKNMLVKLGKVDASETTVNLSENQLNKYAKLAPLKGFWQKKKKQRNTNTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KYIIINRFKGEKNMLVKLGKVDASETTVNLSENQLNKYAKLAPLKGFWQKKKKQRNTNTD
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pF1KA2 SIKTPFSQKQSFEPGSFEVSFLPPARKRKSKLGNRHRIQRIPSIEISASSKQISLCNDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SIKTPFSQKQSFEPGSFEVSFLPPARKRKSKLGNRHRIQRIPSIEISASSKQISLCNDQR
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pF1KA2 HASNHKEDGGLKGTLKSAPLGAPSCANGSHLNDITGPDSVKVKAQDTEFKGPERKVLNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HASNHKEDGGLKGTLKSAPLGAPSCANGSHLNDITGPDSVKVKAQDTEFKGPERKVLNKI
670 680 690 700 710 720
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pF1KA2 KFKSEARLKSKKVKAAGQESKPIVQMSPLLENQSSKANLKNEVIPGTSNSSRLSEFHEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KFKSEARLKSKKVKAAGQESKPIVQMSPLLENQSSKANLKNEVIPGTSNSSRLSEFHEAK
730 740 750 760 770 780
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pF1KA2 AAKSSTFLPTTCSSEMPLSSANVTTNIPVIPGGYLQTLLDASDLSNNTSISYFSHHSPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAKSSTFLPTTCSSEMPLSSANVTTNIPVIPGGYLQTLLDASDLSNNTSISYFSHHSPEQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA2 NEGSLTQTEKSFVPLQPTQDCVLTSSSDSELQQSSHNFKMESSNYRNVWPNKATSGTQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NEGSLTQTEKSFVPLQPTQDCVLTSSSDSELQQSSHNFKMESSNYRNVWPNKATSGTQEF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA2 MAEVSREIAPTQSSEFGASQVVSMENNLTPTTYNPICLNSGGSNCNKVLYDSMQDTQLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAEVSREIAPTQSSEFGASQVVSMENNLTPTTYNPICLNSGGSNCNKVLYDSMQDTQLPS
910 920 930 940 950 960
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pF1KA2 DDSYQLCHFNNGEICFPFQQGPVNMDDGRLFSFDSMAPLSVSSSNYCSLSLKSCEKDGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DDSYQLCHFNNGEICFPFQQGPVNMDDGRLFSFDSMAPLSVSSSNYCSLSLKSCEKDGDD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA2 DITDDFLAHCSPKLVIQQSIDEIAPLKESTDLLDISNFTPDKFRHSSLSEMSPPDTPSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DITDDFLAHCSPKLVIQQSIDEIAPLKESTDLLDISNFTPDKFRHSSLSEMSPPDTPSLS
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pF1KA2 PQITRCESMKTLGTLKGFQEGVPGPLDSVEKIKWDCSTLSRQVQMEDGFTLNNHQFQFHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PQITRCESMKTLGTLKGFQEGVPGPLDSVEKIKWDCSTLSRQVQMEDGFTLNNHQFQFHM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KA2 FNDEDSVSLLQKNPCLSTFNDPSGQISTNNKVSKSRKKSSPSKSGAMNQSSSQKNTRKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FNDEDSVSLLQKNPCLSTFNDPSGQISTNNKVSKSRKKSSPSKSGAMNQSSSQKNTRKKS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA2 LKGNNKGIEKPPGKNSRQVPKSTKKGKYMAAINGEKMQIGIGRGGSQTNTISSTGKTLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LKGNNKGIEKPPGKNSRQVPKSTKKGKYMAAINGEKMQIGIGRGGSQTNTISSTGKTLAE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KA2 CIQHGGPMASMKMPSQKGLSGDWALGKESSPGWSDMSMGTNTNSLLDDDQREFQEPSYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CIQHGGPMASMKMPSQKGLSGDWALGKESSPGWSDMSMGTNTNSLLDDDQREFQEPSYIL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KA2 SNIASGMADVQRFMMASIEPLWEPMEHHGDPNIFYSPESNSLKLKTLKILAGTPQESKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SNIASGMADVQRFMMASIEPLWEPMEHHGDPNIFYSPESNSLKLKTLKILAGTPQESKKK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA2 INSGSQGATKNHRSIKGVSKSNGKTAIGDPGRANMPGYNEDSRSTFFDKKYSNMSTLGNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 INSGSQGATKNHRSIKGVSKSNGKTAIGDPGRANMPGYNEDSRSTFFDKKYSNMSTLGNN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KA2 GPTHKKLYRHKSSSKALRDEKCKGKHMEREQVHKDESGTASFEKLRDSDYNLLKAETTFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GPTHKKLYRHKSSSKALRDEKCKGKHMEREQVHKDESGTASFEKLRDSDYNLLKAETTFW
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510
pF1KA2 VLPVFEEETRIFQKDI
::::::::::::::::
CCDS35 VLPVFEEETRIFQKDI
1510
>>CCDS69177.1 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3052 aa)
initn: 406 init1: 295 opt: 381 Z-score: 352.3 bits: 78.9 E(32554): 2.7e-13
Smith-Waterman score: 518; 24.0% identity (53.1% similar) in 1244 aa overlap (242-1427:639-1740)
220 230 240 250 260 270
pF1KA2 SRAGDRRETEKPDIDLEDPAQKSYYEALLLDKCNTEEALLANSNQDWGYFETFISESKIE
.: ..: .::. . : . ..:. :
CCDS69 DSPFIHMHRHPNENTLGKNSFNFSDLNHSKNKVSSEGNEKGNSTALSSLFPSSFTEN-CE
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pF1KA2 LLDLCSKNELSVNLFSEEDVDNYMFDDDESTLGSDVCSLKIRYESFQDNVRDKTTLLMQE
::. ..:. :. .. ::: :.. :::::: ::.. .: .: :.
CCDS69 LLSCSGENRTMVHSLNS--------TADESGLNK----LKIRYEEFQEHKTEKPSL-SQQ
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pF1KA2 DAQFNFFPSV-FTTCPKRESKSGALKQSSDFSQFKVPDVSIIWGEEDKNLDKKKGKEEGQ
:.. ::::: ...: : .: . . .:. :.. . : .: : :.
CCDS69 AAHYMFFPSVVLSNCLTRPQKLSPVT-------YKLQP-----GNKPSRLKLNKRKLAGH
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pF1KA2 EDKGVEKKDGKDNGEKPALNKPCSGTEVEQLKNP-KQGHLANSLE--TSGSFSDDSSFIE
.. ...... .. .. :.::.. :: :.. ::..: : :.: . .
CCDS69 QETSTKSSETGSTKDNFIQNNPCNS-------NPEKDNALASDLTKTTRGAFENKTP---
770 780 790 800 810
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pF1KA2 ISYDAMGEIKDCSRYMARDTNSGSSSSQQNYGL-------RAKRKVRYSEDYLYDVDSLE
. : : :: ..:. ..:..:: :::::: : . ::
CCDS69 ----TDGFI-DCH------FGDGTLETEQSFGLYGNKYTLRAKRKVNYETE-----DSES
820 830 840 850
510 520 530 540 550
pF1KA2 GEKVNERKEWLP----VGSKEEDDDEWCPKKRRKVTRKEPPVIIKYIIINRFKGEKNMLV
. ... : :: .: : : .::::...: :::::::::::::.:.:::::
CCDS69 SFVTHNSKISLPHPMEIG--ESLDGTLKSRKRRKMSKKLPPVIIKYIIINRFRGRKNMLV
860 870 880 890 900 910
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pF1KA2 KLGKVDASETTVNLSENQLNKYAKLAPLKGFWQKKKKQRNTNTDSIKTPFSQKQSFEPGS
::::.:..: : :.:.... : :::::: :: : . :. :.. :.: . :
CCDS69 KLGKIDSKEKQVILTEEKMELYKKLAPLKDFWPKVPDSPATKYPIY--PLTPKKSHRRKS
920 930 940 950 960 970
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pF1KA2 FEVSFLPPARKR--KSKLGNRHRIQRIPSIEISASSKQISLCNDQRHASNHKEDGGLKGT
. : :.:. :.. : . :.: :.. . : .: . . .: . :: :. .
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pF1KA2 LKSAPLGAPSCANGSHLNDI-------TGPDSVKVKAQDTE----FKGPE--RKVLN-KI
. :: : . : .:. : : . .. : . ::::. .:..: .:
CCDS69 DVMSKLGFLSERSTSPINSSPPRCWSPTDPRAEEIMAAAEKEAMLFKGPNVYKKTVNSRI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KA2 KFKSEARLKSKKVKAAGQESKPIVQMSPLLENQSSKANLKNEVIPGTSNSSRLSEFHEAK
:.:: . :: :: . ..: . . .. .: : :... ... :
CCDS69 GKTSRARAQIKKSKA--KLANPSI-----VTKKRNKRNQTNKLVDDGKKKPR--------
1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA2 AAKSSTFLPTTCSSEMPLSSANVTTNIPVIPGGYLQTLLDASDLSNNTSISYFSHHSPEQ
::..: : .. :.. .. .. :. .. .: ...:. .: : :. .:
CCDS69 -AKQKTNEKGTSRKHTTLKDEKIKSQ----SGAEVKFVLKHQNVSEFASSSGGSQLLFKQ
1140 1150 1160 1170 1180
850 860 870 880 890
pF1KA2 NE----GS-LTQTEKSFVPLQPTQDCVLTSSSDSELQ-QSSHNFKMESSNYRNVWPNKAT
.. :: . . .. .: . . :.. .: :. ..: ... :. .. :. .
CCDS69 KDMPLMGSAVDHPLSASLPTGINAQQKLSGCFSSFLESKKSVDLQTFPSSRDDLHPSVVC
1190 1200 1210 1220 1230 1240
900 910 920 930 940
pF1KA2 SGTQEFMAEVSREIAPTQSSEFGASQ-------VVSMENNLTPTTYNPICLNSGGSNCNK
.. ..... . .::. : .. . .. :.:. .. : ..:: :. .
CCDS69 NSIGPGVSKINVQRPHNQSAMFTLKESTLIQKNIFDLSNHLSQVAQNTQ-ISSGMSSKIE
1250 1260 1270 1280 1290 1300
950 960 970 980 990 1000
pF1KA2 VLYDSMQDTQLPSDDSYQLCHFNNGEICFPFQQGPVNMDDGRLFSFDSMAPLSVSSSNYC
...: . : : .: .. :. . ..:. . . : ::. . : ..
CCDS69 DNANNIQRNYLSSIG--KLSEYRNS-LESKLDQA---YTPNFLHCKDSQQQI-VCIAEQS
1310 1320 1330 1340 1350
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA2 SLSLKSCEKDGDDDITDDFLAHCSPKLVIQQSIDEIA-PLKESTDLLDISNFTPDKFRHS
. : ..: . :. .. . . ... : .:: :. .::.::: :.. .
CCDS69 KHS-ETC-SPGNTASEESQMPNNCFVTSLRSPIKQIAWEQKQRGFILDMSNFKPERVKPR
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA2 SLSEMSPPDTPSLSPQITRCESMKTLGTLKGFQEGVPGPLDSVEKIKWDCSTLSRQVQME
:::: . : . ...:.. ....: ..: :: : : .... .:: . .
CCDS69 SLSE-----AISQTKALSQCKN-RNVSTPSAFGEGQSG-LAVLKEL-----LQKRQQKAQ
1420 1430 1440 1450 1460
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA2 DGFTLNNHQFQFHMFNDEDSVSLLQKNPCLSTFNDPSGQISTNNKVSKSRKKSSPSKSGA
.. : .. . :. : :: ::.. :. ...:. .:: :
CCDS69 NANTTQDPLSNKHQPN---------KNI--------SGSLEHNKANKRTRSVTSPRKP-R
1470 1480 1490 1500
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA2 MNQSSSQKNTRKKSLKGNNKGIEKPPGKNSRQVPKSTKKGK--YMAAINGEK---MQIGI
.:..::. : :: .. .. .:: :. .:.. . ... . :. .. ..
CCDS69 TPRSTKQKEKIPKLLKVDSLNL-----QNSSQLDNSVSDDSPIFFSDPGFESCYSLEDSL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA2 GRGGSQTNTISSTGKTLAECIQHGGPM---ASMKMPSQKGLSGDWALGKESSPGWS--DM
. . . :.. :.: . : ..: . :....: :: :: : . .. :: .
CCDS69 SPEHNYNFDINTIGQT-GFCSFYSGSQFVPADQNLP-QKFLS-DAV--QDLFPGQAIEKN
1570 1580 1590 1600 1610
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA2 SMGTNTNSLLDDDQREFQEPSYILSNIASGMADVQRFMMASIEPLWEPMEHHGDPNIFY-
. .. :. :.:... . . : : :: . . : ..:. : .:. : :.
CCDS69 EFLSHDNQKCDEDKHHTTDSA---SWIRSGTLSPEIFEKSTIDSN-ENRRHNQWKNSFHP
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA2 -SPESNSLKLKTLKILAGTPQESKK-KINSGSQGATKNHRSIKGVSKSNGKTAIGDPGRA
. .:::. . .. . . :.: ..: .: ... . .. . :.. : :
CCDS69 LTTRSNSI-MDSFCVQQAEDCLSEKSRLNRSS----VSKEVFLSLPQPNNSDWIQGHTRK
1680 1690 1700 1710 1720
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA2 NMPGYNEDSRSTFFDKKYSNMSTLGNNGPTHKKLYRHKSSSKALRDEKCKGKHMEREQVH
.: : . :: .: :
CCDS69 EM-GQSLDSANTSFTAILSSPDGELVDVACEDLELYVSRNNDMLTPTPDSSPRSTSSPSQ
1730 1740 1750 1760 1770 1780
>>CCDS5091.2 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3130 aa)
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Smith-Waterman score: 518; 24.0% identity (53.1% similar) in 1244 aa overlap (242-1427:717-1818)
220 230 240 250 260 270
pF1KA2 SRAGDRRETEKPDIDLEDPAQKSYYEALLLDKCNTEEALLANSNQDWGYFETFISESKIE
.: ..: .::. . : . ..:. :
CCDS50 DSPFIHMHRHPNENTLGKNSFNFSDLNHSKNKVSSEGNEKGNSTALSSLFPSSFTEN-CE
690 700 710 720 730 740
280 290 300 310 320 330
pF1KA2 LLDLCSKNELSVNLFSEEDVDNYMFDDDESTLGSDVCSLKIRYESFQDNVRDKTTLLMQE
::. ..:. :. .. ::: :.. :::::: ::.. .: .: :.
CCDS50 LLSCSGENRTMVHSLNS--------TADESGLNK----LKIRYEEFQEHKTEKPSL-SQQ
750 760 770 780 790
340 350 360 370 380 390
pF1KA2 DAQFNFFPSV-FTTCPKRESKSGALKQSSDFSQFKVPDVSIIWGEEDKNLDKKKGKEEGQ
:.. ::::: ...: : .: . . .:. :.. . : .: : :.
CCDS50 AAHYMFFPSVVLSNCLTRPQKLSPVT-------YKLQP-----GNKPSRLKLNKRKLAGH
800 810 820 830 840
400 410 420 430 440
pF1KA2 EDKGVEKKDGKDNGEKPALNKPCSGTEVEQLKNP-KQGHLANSLE--TSGSFSDDSSFIE
.. ...... .. .. :.::.. :: :.. ::..: : :.: . .
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CCDS50 DNANNIQRNYLSSIG--KLSEYRNS-LESKLDQA---YTPNFLHCKDSQQQI-VCIAEQS
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CCDS50 NANTTQDPLSNKHQPN---------KNI--------SGSLEHNKANKRTRSVTSPRKP-R
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