Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1962
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1962, 744 aa
1>>>pF1KA1962 744 - 744 aa - 744 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0860+/-0.00182; mu= 13.8069+/- 0.109
mean_var=294.8026+/-53.572, 0's: 0 Z-trim(107.1): 958 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.074698
statistics sampled from 8309 (9373) to 8309 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 5125 567.5 2.7e-161
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1673 195.3 2.4e-49
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1673 195.4 2.4e-49
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1673 195.4 2.5e-49
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1673 195.4 2.5e-49
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1656 193.6 8.8e-49
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1646 192.5 1.9e-48
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1637 191.5 3.6e-48
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1629 190.8 7.1e-48
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1629 190.8 7.3e-48
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1617 189.5 1.8e-47
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1617 189.5 1.8e-47
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1602 187.7 5e-47
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1591 186.4 1e-46
CCDS35105.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 256) 1584 185.1 1.1e-46
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1584 185.9 2.1e-46
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1586 186.3 2.1e-46
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1578 185.1 2.8e-46
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1571 184.5 5.3e-46
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1564 183.6 8.3e-46
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1561 183.4 1.1e-45
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1557 183.1 1.7e-45
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1551 182.4 2.5e-45
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1551 182.4 2.5e-45
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1551 182.4 2.5e-45
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1547 181.7 2.8e-45
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1548 181.9 2.8e-45
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1547 182.2 4e-45
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1547 182.2 4.1e-45
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1541 181.1 4.5e-45
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1535 180.6 7.6e-45
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1535 180.6 7.9e-45
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1531 180.1 9.7e-45
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 1531 180.3 1.1e-44
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 1531 180.3 1.2e-44
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1529 179.9 1.2e-44
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1526 179.7 1.7e-44
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 1521 179.0 2.1e-44
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1522 179.2 2.1e-44
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1519 178.8 2.4e-44
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1520 179.3 3.2e-44
CCDS34357.1 ZNF311 gene_id:282890|Hs108|chr6 ( 666) 1514 178.3 3.5e-44
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1511 177.9 4.3e-44
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1512 178.1 4.4e-44
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1508 177.6 5.4e-44
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1507 177.5 6.1e-44
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1503 176.8 6.7e-44
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1504 177.1 6.8e-44
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1503 176.9 6.9e-44
CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19 ( 412) 1499 176.3 8.4e-44
>>CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 (744 aa)
initn: 5125 init1: 5125 opt: 5125 Z-score: 3009.3 bits: 567.5 E(32554): 2.7e-161
Smith-Waterman score: 5125; 99.9% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MQAVVPLNKMTAISPEPQTLASTEQNEVPRVVTSGEQEAILRGNAADAESFRQRFRWFCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MQAVVPLNKMTAISPEPQTLASTEQNEVPRVVTSGEQEAILRGNAADAESFRQRFRWFCY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SEVAGPRKALSQLWELCNQWLRPDIHTKEQILELLVFEQFLTILPGEIRIWVKSQHPESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SEVAGPRKALSQLWELCNQWLRPDIHTKEQILELLVFEQFLTILPGEIRIWVKSQHPESS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EEVVTLIEDLTQMLEEKDPVSQDSTVSQEENSKEDKMVTVCPNTESCESITLKDVAVNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EEVVTLIEDLTQMLEEKDPVSQDSTVSQEENSKEDKMVTVCPNTESCESITLKDVAVNFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RGEWKKLEPFQKELYKEVLLENLRNLEFLDFPVSKLELISQLKWVELPWLLEEVSKSSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RGEWKKLEPFQKELYKEVLLENLRNLEFLDFPVSKLELISQLKWVELPWLLEEVSKSSRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DESALDKIIERCLRDDDHGLMEESQQYCGSSEEDHGNQGNSKGRVAQNKTLGSGSRGKKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DESALDKIIERCLRDDDHGLMEESQQYCGSSEEDHGNQGNSKGRVAQNKTLGSGSRGKKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DPDKSPFGHNFKETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESKKPFSFHSDLVLNRKEKTAGEKSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DPDKSPFGHNFKETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESKKPFSFHSDLVLNRKEKTAGEKSRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKTPMCEKCRKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKTPMCEKCRKDS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CQEAALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSDSS
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CQEAALNKDEGNESGEKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSDSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 HQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 HTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKPYKCNQCEKAFPTHSLLSRHQRIHTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKPYKCNQCEKAFPTHSLLSRHQRIHTGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KPYKCKECGKSFSQSSSLNEHHRIHTGEKPYECNYCGATFSRSSILVEHLKIHTGRREYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KPYKCKECGKSFSQSSSLNEHHRIHTGEKPYECNYCGATFSRSSILVEHLKIHTGRREYE
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KA1 CNECEKTFKSNSGLIRHRGFHSAE
::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CNECEKTFKSNSGLIRHRGFHSAE
730 740
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 8450 init1: 1491 opt: 1673 Z-score: 999.5 bits: 195.3 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 1673; 53.2% identity (77.3% similar) in 440 aa overlap (312-744:154-589)
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 KGRVAQNKTLGSGSRGKKFDPDKSPFGHNFKETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESKKPFSF
.: :: .. ...: . .: : ::
CCDS74 GENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSH
130 140 150 160 170 180
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 HSDLVLNRKEKTAGEKSRKSNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIR
: :. ... .: ::. . .. : . .:::::.:: .:: :.. ::..:: : .
CCDS74 SSALIEHHRTHT-GERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ---RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQ
190 200 210 220 230
410 420 430 440 450
pF1KA1 RSTL---SRRKT---PM-CEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFGYSASL
. : .: .: :. : .: :. ...... : ...:.: ..::.::::: : :
CCDS74 IAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHL
240 250 260 270 280 290
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSDSSSLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQ
:.: :::::::::.:.::::::: ::::: :.: :.::::..: .:::.:: . ::.::
CCDS74 TQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQ
300 310 320 330 340 350
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 RIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHT
: :::::::.: .::. ::.:. : .:.::::::::: :..:::.::::::::.:.: ::
CCDS74 RTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHT
360 370 380 390 400 410
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 GEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKP
:::::.:..:::::::.. ::.::::::::::: ::::: .::: .:. :::.:.::::
CCDS74 GEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
420 430 440 450 460 470
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 YKCNQCEKAFPTHSLLSRHQRIHTGVKPYKCKECGKSFSQSSSLNEHHRIHTGEKPYECN
:.:::: .:: . : .::::::: :::.:..::..::::: : ::.:::: :::: ::
CCDS74 YECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCN
480 490 500 510 520 530
700 710 720 730 740
pF1KA1 YCGATFSRSSILVEHLKIHTGRREYECNECEKTFKSNSGLIRHRGFHSAE
:: .::.:: : .: . :::.. :::..: :.:.... : .:: .:..:
CCDS74 ECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGK
540 550 560 570 580 590
CCDS74 AFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 8450 init1: 1491 opt: 1673 Z-score: 999.3 bits: 195.4 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 1756; 45.4% identity (68.8% similar) in 625 aa overlap (168-744:12-631)
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 DPVSQDSTVSQEENSKEDKMVTVCPNTESCESITLKDVAVNFSRGEWKKLEPFQKELYKE
:..:..::.:.::. :: .:.: :. ::..
CCDS74 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRD
10 20 30 40
200 210 220
pF1KA1 VLLENLRNL----EFLDFP--VSKLELISQLKWVE--LPW--------------------
:.:...: : ..: : .: :: ..: :: ::
CCDS74 VMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQG
50 60 70 80 90 100
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LLEEVSKSSRLDESALDKIIERCLRDDDHGLMEESQQYCGS---------SEEDHGNQGN
. ::.:.: : : : . : .: .: : : . : . .: .
CCDS74 ISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQ
110 120 130 140 150 160
290 300 310 320 330
pF1KA1 SKGRVAQNKTLGSGSRGKKFDPDK-SP--FGHNFK-ETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESK
.: ..: .:. . . :.. :: .: : : :: .. ...: . .:
CCDS74 RNG-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECG
170 180 190 200 210 220
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 KPFSFHSDLVLNRKEKTAGEKSRKSNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCG
: :: : :. ... .: ::. . .. : . .:::::.::. :: :.. ::..::
CCDS74 KAFSHSSALIEHHRTHT-GERPYECHECLKGFRNSSALTKHQR---IHTGEKPYKCTQCG
230 240 250 260 270
400 410 420 430 440
pF1KA1 IIFIRRSTL---SRRKT---PM-CEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFG
: . . : .: .: :. : .: :. ...... : ...:.: ..::.:::::
CCDS74 RTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFR
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 YSASLTKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSDSSSLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAH
: ::.: :::::::::.:.::::::: ::::: :.: :.::::..: .:::.:: .
CCDS74 QSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITP
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LIKHQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKH
::.::: :::::::.: .::. ::.:. : .:.::::::::: :..:::.::::::::.:
CCDS74 LIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQH
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 QRIHTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLH
.: :::::::.:..:::::::.. ::.::::::::::: ::::: .::: .:. :::.:
CCDS74 ERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIH
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SGEKPYKCNQCEKAFPTHSLLSRHQRIHTGVKPYKCKECGKSFSQSSSLNEHHRIHTGEK
.:::::.:::: .:: . : .::::::: :::.:..::..::::: : ::.:::: ::
CCDS74 TGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEK
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 PYECNYCGATFSRSSILVEHLKIHTGRREYECNECEKTFKSNSGLIRHRGFHSAE
:: :: :: .::.:: : .: . :::.. :::..: :.:.... : .:: .:..:
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. .: . .: ..: .:. . . :.. :: .: : : :: ..
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:.. ::..:: : . . : .: .: :. : .: :. ...... : ...:.:
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..::.::::: : ::.: :::::::::.:.::::::: ::::: :.: :.::::..:
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.:::.:: . ::.::: :::::::.: .::. ::.:. : .:.::::::::: :..::
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740
pF1KA1 RGFHSAE
: .:..:
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:.:...: : ..: : .: :: ..: :: :: :: ..
CCDS54 VMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLET
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CCDS54 RPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAF
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CCDS54 TPVKTPVLEQWQRNG-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTC
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CCDS54 VKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHT-GERPYECHECLKGFRNSSALTKHQR---IH
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:.::::::::.:.: :::::::.:..:::::::.. ::.::::::::::: ::::: .::
CCDS54 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
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: .:. :::.:.:::::.:::: .:: . : .::::::: :::.:..::..:::::
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CCDS64 TFQGNPDLI-QRQIVHTGEASFMCDDCGKTFSQNSVL---KNRHRSHMSEKAYQCSECGK
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CCDS64 AFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRR
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CCDS64 RIHTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHT
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CCDS64 GDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKP
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CCDS64 HECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCS
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pF1KA1 LENLRNLEFLDF----------PVSKLELISQLKWVELPWL---------LEEVSKSS--
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CCDS46 LENYRNLVSLDISCKCVNTDLPPKGKNNMGEAFYTVKLERLESCDTVGLSFQEVQKNTYD
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pF1KA1 -----RLDESALDKII---------ERCLRDDDHGLMEESQQYCGSSEEDHG---NQGNS
. ::. .. .: :: . .. .. : : ..: .: .
CCDS46 FECQWKDDEGNYKTVLMLQKENLPGRRAQRDRRAAGNRHIENQLGVSFQSHLPELQQFQH
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pF1KA1 KGRVAQ-NKTLGS-GSRGKKFDPDKSPFGHNFKETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESKKPF
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CCDS46 EGKIYEYNQVEKSPNNRGKHYKCDEC--GKVFSQNSRLTSHKRIHTGEKPYQCNKCGKAF
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CCDS46 TVRSNLTIHQVIHT-GEKPYKCNECGKVFSQPSNLAGHQR---IHTGEKPYKCNECGKAF
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CCDS46 RAHSKLTTHQVIHTGEKPYKCKECGKCFTQNSHLASHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRS
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CCDS46 SLTTHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLAKHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTK
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CCDS46 HQIIHTGEKPFKCNECVKVFTQYSHLANHRRIHTGEKPYRCDECGKAFSVRSSLTTHQAI
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pF1KA1 HTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGE
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CCDS46 HTGEKPYKCNDCGKVFTQNSHLASHRGIHSGEKPYKCDECGKAFSQTSQLARHWRVHTGE
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::::::.: ::: .:: :. :: :::: :::::..::: : ..: : :.:::::::::.
CCDS46 KPYKCNECGKAFSVHSSLTIHQTIHTGQKPYKCNDCGKVFRHNSYLAIHQRIHTGEKPYK
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pF1KA1 CNYCGATFSRSSILVEHLKIHTGRREYECNECEKTFKSNSGLIRHRGFHSAE
:: :: .:: : :. : ::::.. :.:::: :.: .:: : :: .:..:
CCDS46 CNECGKAFSVHSNLATHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLANHRRIHTGEKPYRCNEC
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CCDS46 GKAFSVRSTLTTHMAVHTGDKPYKCNQCGKVFTQNSNLAKHRRIHSG
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CCDS46 MALTQGQLSFSDVAIEFSQEEWKCLDPGQKALYRDVM
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CCDS46 LENYRNLVSLGICLPDLSVTSMLEQKRDPWTLQSEVKIINNPDG-------RECIK----
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CCDS46 GVNTEKSSKLGSSA---GNKSLKNQHGLTLQLHL----TEWQPFQAVRNIYGCKHVEKSI
90 100 110 120 130
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:: .. ... .. :.. .:. .. : : : :. .... :: :. :::. :
CCDS46 SDNSSVSPVQISFFSVKTHIFNNYRNDFLF-STLLPQEQKVHIREKPYGCNEHGKVFRVS
140 150 160 170 180 190
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CCDS46 SSLTN---RQVIHIADKTYKCSDCGEIFSSNSNFAQHQRIHTGEKPYKYNECGKVFNQNS
200 210 220 230 240 250
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pF1KA1 ALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSDSSSLTP
: . . ..:.: .. ..:::.:.. : :..::.:::::::: :.::::::: ::::
CCDS46 HLAQHQKIHTGQKPYNNKECGKVFSHHAYLAQHRKIHTGEKPYKCSECGKAFSVCSSLTA
260 270 280 290 300 310
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pF1KA1 HHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQHQRI
: :.::::. : .::: : .. : :: .::::.::::..::. :: . : .:...
CCDS46 HLVIHTGEKPYDCKECGKVFRHKSSLTTHQTVHTGERPYKCNECGKGFSRIAFLARHRKV
320 330 340 350 360 370
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pF1KA1 HTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRIHTGE
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CCDS12 FKCNE----CGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT-GEK
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360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SRKSNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKT------P
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CCDS12 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRR---VHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
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pF1KA1 M-CEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMCN
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CCDS12 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
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480 490 500 510 520 530
pF1KA1 ECGKAFSDSSSLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCGR
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CCDS12 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]