FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1902, 1093 aa
1>>>pF1KA1902 1093 - 1093 aa - 1093 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3387+/-0.00144; mu= -13.4771+/- 0.088
mean_var=759.3591+/-155.902, 0's: 0 Z-trim(114.5): 65 B-trim: 53 in 1/54
Lambda= 0.046543
statistics sampled from 14978 (15033) to 14978 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.462), width: 16
Scan time: 5.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46429.1 FMNL2 gene_id:114793|Hs108|chr2 (1092) 7144 496.0 1.9e-139
CCDS44874.1 FMNL3 gene_id:91010|Hs108|chr12 (1027) 2478 182.7 3.8e-45
CCDS41780.1 FMNL3 gene_id:91010|Hs108|chr12 ( 976) 2401 177.5 1.3e-43
CCDS11497.1 FMNL1 gene_id:752|Hs108|chr17 (1100) 2397 177.3 1.7e-43
CCDS14467.1 DIAPH2 gene_id:1730|Hs108|chrX (1101) 925 78.4 9.7e-14
CCDS14468.1 DIAPH2 gene_id:1730|Hs108|chrX (1096) 917 77.9 1.4e-13
CCDS54999.1 DAAM2 gene_id:23500|Hs108|chr6 (1067) 890 76.1 4.8e-13
CCDS56426.1 DAAM2 gene_id:23500|Hs108|chr6 (1068) 883 75.6 6.7e-13
>>CCDS46429.1 FMNL2 gene_id:114793|Hs108|chr2 (1092 aa)
initn: 4324 init1: 3824 opt: 7144 Z-score: 2617.0 bits: 496.0 E(32554): 1.9e-139
Smith-Waterman score: 7144; 99.8% identity (99.9% similar) in 1093 aa overlap (1-1093:1-1092)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGNAGSMDSQQTDFRAHNVPLKLPMPEPGELEERFAIVLNAMNLPPDKARLLRQYDNEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGNAGSMDSQQTDFRAHNVPLKLPMPEPGELEERFAIVLNAMNLPPDKARLLRQYDNEKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WELICDQERFQVKNPPHTYIQKLKGYLDPAVTRKKFRRRVQESTQVLRELEISLRTNHIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WELICDQERFQVKNPPHTYIQKLKGYLDPAVTRKKFRRRVQESTQVLRELEISLRTNHIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 WVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSKPWSRSIEDLHRGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSKPWSRSIEDLHRGSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLRAIMNYQYGFNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLRAIMNYQYGFNM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDNFKEVCGEKQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDNFKEVCGEKQRF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EKLMEHFRNEDNNIDFMVASMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLDEYLDKLKHTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKLMEHFRNEDNNIDFMVASMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLDEYLDKLKHTE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLSEKLQDTENEAMSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLSEKLQDTENEAMSKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VELEKQLMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMVKEKEEAIQRQSTLEKKIHELEKQGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VELEKQLMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMVKEKEEAIQRQSTLEKKIHELEKQGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IKIQKKGDGDIAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMGAASSGPLPPPPPPLPPSSDTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IKIQKKGDGDIAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMGAASSGPLPPPPPPLPPSSDTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ETVQNGPVTPPMPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLPGPASETVPAPPLAPPLPSAPPLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::::::
CCDS46 ETVQNGPVTPPMPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP-LPGPAAETVPAPPLAPPLPSAPPLPG
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQINGTVFNEIDDERILEDLNVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQINGTVFNEIDDERILEDLNVD
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EFEEIFKTKAQGPAIDLSSSKQKIPQKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEICKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EFEEIFKTKAQGPAIDLSSSKQKIPQKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEICKA
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 IHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTENEVKVLRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIERLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTENEVKVLRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIERLM
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHAIIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSKRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHAIIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSKRGA
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 VYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTLLHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSLENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTLLHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSLENV
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LLDVKELQRGMDLTKREYTMHDHNTLLKEFILNNEGKLKKLQDDAKIAQDAFDDVVKYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLDVKELQRGMDLTKREYTMHDHNTLLKEFILNNEGKLKKLQDDAKIAQDAFDDVVKYFG
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ENPKTTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEENELRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKSPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENPKTTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEENELRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKSPSH
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 KSKRQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEGKDGAIEDIITDLRNQPYRRADAVRRSVRRRFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSKRQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEGKDGAIEDIITDLRNQPYRRADAVRRSVRRRFDD
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090
pF1KA1 QNLRSVNGAEITM
:::::::::::::
CCDS46 QNLRSVNGAEITM
1080 1090
>>CCDS44874.1 FMNL3 gene_id:91010|Hs108|chr12 (1027 aa)
initn: 4603 init1: 2417 opt: 2478 Z-score: 924.1 bits: 182.7 E(32554): 3.8e-45
Smith-Waterman score: 4718; 69.8% identity (85.7% similar) in 1056 aa overlap (20-1075:23-1012)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MGNAGSMDSQQTDFRAHNVPLKLPMPEPGELEERFAIVLNAMNLPPDKARLLRQYDN
: :.::::: :::::::.::..::::::::::::::::
CCDS44 MGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNLPPDKARLLRQYDN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 EKKWELICDQERFQVKNPPHTYIQKLKGYLDPAVTRKKFRRRVQESTQVLRELEISLRTN
::::.:::::::::::::::::::::...:::.::::::::::::::.::::::::::::
CCDS44 EKKWDLICDQERFQVKNPPHTYIQKLQSFLDPSVTRKKFRRRVQESTKVLRELEISLRTN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 HIGWVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSKPWSRSIEDLHR
::::::::::.:::::::::.:::::: .: ::::..:: ... :: . ::::::::.
CCDS44 HIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVMFDFEGLESGDDGAFDKLRSWSRSIEDLQP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 GSNLPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLRAIMNYQYG
: : .: ::..::.:.:.:::.:::.::.::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS44 PSALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILCLRAIMNYQYG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FNMVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDNFKEVCGEK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: :
CCDS44 FNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAFDNFKEVCKEL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 QRFEKLMEHFRNEDNNIDFMVASMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLDEYLDKLK
.:::::::.:::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:.:.: .
CCDS44 HRFEKLMEYFRNEDSNIDFMVACMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLEEFLQKSR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 HTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLSEKLQDTENEAM
::::.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::..:::.::: : ::: :
CCDS44 HTESEKLQVQIQAYLDNVFDVGGLLEDAETKNVALEKVEELEEHVSHLTEKLLDLENENM
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SKIVELEKQLMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMVKEKEEAIQRQSTLEKKIHELEK
...::::::.::.:::. ..: :.... ::::::...::::::.::. :: ... ::
CCDS44 MRVAELEKQLLQREKELESIKETYENTSHQVHTLRRLIKEKEEAFQRRCHLEPNVRGLE-
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 QGTIKIQKKGDGDIAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMGAASSGPLPPPPPPLPPSS
:. ::..: ::: : : .:: :
CCDS44 -------------------------SVDSEALA--RVGP---AELSEGMPP--------S
480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 DTPETVQNGPVTPPMPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLPGPASETVPAPPLAPPLPSAPP
: . : ::: : :::: :: ::::: : : :: :::
CCDS44 DLD-------LLAPAPPPEEVLPLPPPPAPPLPPPPP---------PLPDKCPP---APP
510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 LPGTSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQINGTVFNEIDDERILEDL
::: ..:.::.. ::.:..::::::::::.:::::.:::::::.::::.:.:::.:::::
CCDS44 LPG-AAPSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDL
550 560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 NVDEFEEIFKTKAQGPAIDLSSSKQKIPQKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEI
..:.:::.:::::::::.:: ::.: ::...:::::::::::::::::::::..:.::
CCDS44 DLDKFEELFKTKAQGPALDLICSKNKTAQKAASKVTLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEI
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 CKAIHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTENEVKVLRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIE
:.:::.:::.::::::::::::::::: :::.:: :::::.:::.:. :::::. :::.:
CCDS44 CRAIHTFDLQTLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVE
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 RLMQKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHAIIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSK
:: :.:. :::.::: ...:::::::.::::::.:.:::::::..:::::::::::::::
CCDS44 RLTQRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSK
730 740 750 760 770 780
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 RGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTLLHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSL
::::::::::::::::::::::::.::::.:. .::::: ... :..:::.:::::::::
CCDS44 RGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSL
790 800 810 820 830 840
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 ENVLLDVKELQRGMDLTKREYTMHDHNTLLKEFILNNEGKLKKLQDDAKIAQDAFDDVVK
:::::::::: :::.: .:: ..:: :..:..:. .::::: ::: ::: :..:.. ::.
CCDS44 ENVLLDVKELGRGMELIRRECSIHD-NSVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEEAYNAVVR
850 860 870 880 890 900
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 YFGENPKTTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEENELRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKS
::::.::::::::::::::::...::.::.::: :::::... :: : ::: .. : :.
CCDS44 YFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEARKKQEEVMREKQLAQEA--KKLDAKT
910 920 930 940 950
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 PSHKSKRQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEGKDGAIEDIITDLRNQPYRRADAVRRSVRRR
::...: :::::::::::::.:..: :::::::.:::::: :. ::. .::...:
CCDS44 PSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPM----VVRHQARSA
960 970 980 990 1000 1010
1080 1090
pF1KA1 FDDQNLRSVNGAEITM
CCDS44 APPSGPPRAPGPH
1020
>>CCDS41780.1 FMNL3 gene_id:91010|Hs108|chr12 (976 aa)
initn: 3663 init1: 1692 opt: 2401 Z-score: 896.4 bits: 177.5 E(32554): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 4436; 67.2% identity (81.9% similar) in 1056 aa overlap (20-1075:23-961)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MGNAGSMDSQQTDFRAHNVPLKLPMPEPGELEERFAIVLNAMNLPPDKARLLRQYDN
: :.::::: :::::::.::..::::::::::::::::
CCDS41 MGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNLPPDKARLLRQYDN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 EKKWELICDQERFQVKNPPHTYIQKLKGYLDPAVTRKKFRRRVQESTQVLRELEISLRTN
::::.:::::::::::::::::::::...:::.::::::::::::::.::::::::::::
CCDS41 EKKWDLICDQERFQVKNPPHTYIQKLQSFLDPSVTRKKFRRRVQESTKVLRELEISLRTN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 HIGWVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSKPWSRSIEDLHR
::::::::::.:::::::::.:::::: .:
CCDS41 HIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVM-----------------------------
130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 GSNLPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLRAIMNYQYG
:.:::.::.::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS41 ----------------------YSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILCLRAIMNYQYG
160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FNMVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDNFKEVCGEK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: :
CCDS41 FNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAFDNFKEVCKEL
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 QRFEKLMEHFRNEDNNIDFMVASMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLDEYLDKLK
.:::::::.:::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:.:.: .
CCDS41 HRFEKLMEYFRNEDSNIDFMVACMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLEEFLQKSR
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 HTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLSEKLQDTENEAM
::::.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::..:::.::: : ::: :
CCDS41 HTESEKLQVQIQAYLDNVFDVGGLLEDAETKNVALEKVEELEEHVSHLTEKLLDLENENM
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SKIVELEKQLMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMVKEKEEAIQRQSTLEKKIHELEK
...::::::.::.:::. ..: :.... ::::::...::::::.::. :: ... ::
CCDS41 MRVAELEKQLLQREKELESIKETYENTSHQVHTLRRLIKEKEEAFQRRCHLEPNVRGLE-
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 QGTIKIQKKGDGDIAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMGAASSGPLPPPPPPLPPSS
:. ::..: ::: : : .:: :
CCDS41 -------------------------SVDSEALA--RVGP---AELSEGMPP--------S
430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 DTPETVQNGPVTPPMPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLPGPASETVPAPPLAPPLPSAPP
: . : ::: : :::: :: ::::: : : :: :::
CCDS41 DLD-------LLAPAPPPEEVLPLPPPPAPPLPPPPP---------PLPDKCPP---APP
460 470 480 490
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 LPGTSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQINGTVFNEIDDERILEDL
::: ..:.::.. ::.:..::::::::::.:::::.:::::::.::::.:.:::.:::::
CCDS41 LPG-AAPSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDL
500 510 520 530 540 550
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 NVDEFEEIFKTKAQGPAIDLSSSKQKIPQKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEI
..:.:::.:::::::::.:: ::.: ::...:::::::::::::::::::::..:.::
CCDS41 DLDKFEELFKTKAQGPALDLICSKNKTAQKAASKVTLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEI
560 570 580 590 600 610
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 CKAIHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTENEVKVLRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIE
:.:::.:::.::::::::::::::::: :::.:: :::::.:::.:. :::::. :::.:
CCDS41 CRAIHTFDLQTLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVE
620 630 640 650 660 670
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 RLMQKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHAIIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSK
:: :.:. :::.::: ...:::::::.::::::.:.:::::::..:::::::::::::::
CCDS41 RLTQRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSK
680 690 700 710 720 730
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 RGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTLLHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSL
::::::::::::::::::::::::.::::.:. .::::: ... :..:::.:::::::::
CCDS41 RGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSL
740 750 760 770 780 790
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 ENVLLDVKELQRGMDLTKREYTMHDHNTLLKEFILNNEGKLKKLQDDAKIAQDAFDDVVK
:::::::::: :::.: .:: ..:: :..:..:. .::::: ::: ::: :..:.. ::.
CCDS41 ENVLLDVKELGRGMELIRRECSIHD-NSVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEEAYNAVVR
800 810 820 830 840
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 YFGENPKTTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEENELRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKS
::::.::::::::::::::::...::.::.::: :::::... :: : ::: .. : :.
CCDS41 YFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEARKKQEEVMREKQLAQEA--KKLDAKT
850 860 870 880 890 900
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 PSHKSKRQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEGKDGAIEDIITDLRNQPYRRADAVRRSVRRR
::...: :::::::::::::.:..: :::::::.:::::: :. ::. .::...:
CCDS41 PSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPM----VVRHQARSA
910 920 930 940 950 960
1080 1090
pF1KA1 FDDQNLRSVNGAEITM
CCDS41 APPSGPPRAPGPH
970
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60 70 80 90 100
pF1KA1 NEKKWELICDQERFQVKNPPHTYIQKLKGYLDPA-VTRK---------KFRRRVQESTQV
:::::::::::::::::::: .::::::.:.: . :.:: :.:::::::::
CCDS11 NEKKWELICDQERFQVKNPPAAYIQKLKSYVDTGGVSRKVAADWMSNLGFKRRVQESTQV
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110 120 130 140 150 160
pF1KA1 LRELEISLRTNHIGWVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSK
::::: ::::::::::.:::::::.:::::.:::.::: .::.:.::... . .: .:.:
CCDS11 LRELETSLRTNHIGWVQEFLNEENRGLDVLLEYLAFAQCSVTYDMESTDNGASNS-EKNK
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 PWSRSIEDLHRGSNLPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIM
: .:.::: .: :: : .: :: ... . ::..:.:::.::.:::::::::
CCDS11 PLEQSVEDLSKGP--PSSVPKS-----RHLTIKLTPAHSRKALRNSRIVSQKDDVHVCIM
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 CLRAIMNYQYGFNMVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSA
::::::::: ::..::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS11 CLRAIMNYQSGFSLVMNHPACVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHDIILAA
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290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FDNFKEVCGEKQRFEKLMEHFRNEDNNIDFMVASMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTK
::::::::::..:::::::.:::::.::::::: ::::::::::::.::::: ::::::.
CCDS11 FDNFKEVCGEQHRFEKLMEYFRNEDSNIDFMVACMQFINIVVHSVENMNFRVFLQYEFTH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 LGLDEYLDKLKHTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLS
:::: ::..:. ::::::::::::::::.:::::::::.:::::.::..:::.:... :.
CCDS11 LGLDLYLERLRLTESDKLQVQIQAYLDNIFDVGALLEDTETKNAVLEHMEELQEQVALLT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 EKLQDTENEAMSKIVELEKQLMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMVKEKEE--AIQR
:.:.:.:::.:.::.:::::: : :::...:: ....... . : :: : :
CCDS11 ERLRDAENESMAKIAELEKQLSQARKELETLRERFSESTAMGPSRRPPEPEKAPPAAPTR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KA1 QSTLEKKIHELEKQGTIKIQKKGDGD---IAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVG---PTM
:.:: :..:::..: :.: . : :: : :::: : .: : :. . : .: : .
CCDS11 PSALELKVEELEEKGLIRILR-GPGDAVSIEILPV-AVATPSGGDAPTPGVPTGSPSPDL
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 GAASS---GPLPPPPPPLP--PS-SDTPETVQNGPVTPPMPPPPPPPPPPPPP---PPPP
. :. : :::::::: :: ...: .. : .::.: : ::: :: : ::::
CCDS11 APAAEPAPGAAPPPPPPLPGLPSPQEAPPSAP--PQAPPLPGSPEPPPAPPLPGDLPPPP
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570 580 590 600 610 620
pF1KA1 PPPPPLPGPASETVPAPPLAPPLPSAPPLPGTSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPV
::::: :: . . : :: :: :..:: . . .. : :: ::::.::::::.
CCDS11 PPPPPPPGTDGPVPPPPPPPPPPPGGPP-DALGRRDSELGPG---VKAKKPIQTKFRMPL
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pF1KA1 FNWVALKPNQINGTVFNEIDDERILEDLNVDEFEEIFKTKAQGPAIDLSSSKQKIPQKGS
.:::::::.::.::::.:..::..:..:....::: ::::.:::..:::. :.: ::.
CCDS11 LNWVALKPSQITGTVFTELNDEKVLQELDMSDFEEQFKTKSQGPSLDLSALKSKAAQKAP
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 NKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEICKAIHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTENEVKV
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CCDS11 SKATLIEANRAKNLAITLRKGNLGAERICQAIEAYDLQALGLDFLELLMRFLPTEYERSL
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 LRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIERLMQKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHAIIAA
. .:::..:.:.::.:::::. ::.: :: ..:: ..:.::: .. :.: :::.:::::
CCDS11 ITRFEREQRPMEELSEEDRFMLCFSRIPRLPERMTTLTFLGNFPDTAQLLMPQLNAIIAA
770 780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 SVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSKRGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTLLHYIS
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CCDS11 SMSIKSSDKLRQILEIVLAFGNYMNSSKRGAAYGFRLQSLDALLEMKSTDRKQTLLHYLV
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870 880 890 900 910 920
pF1KA1 NVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSLENVLLDVKELQRGMDLTKREYTMHDHNTLLKE
.:. ::: :.. :...::...::..:::..:: ::. ::::..::.::.. .: .:::
CCDS11 KVIAEKYPQLTGFHSDLHFLDKAGSVSLDSVLADVRSLQRGLELTQREFVRQDDCMVLKE
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930 940 950 960 970 980
pF1KA1 FILNNEGKLKKLQDDAKIAQDAFDDVVKYFGENPKTTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEEN
:. : . :: :.: ::.::..::.::::::::: :..:: .: ::.::::.::.:
CCDS11 FLRANSPTMDKLLADSKTAQEAFESVVEYFGENPKTTSPGLFFSLFSRFIKAYKKAEQEV
950 960 970 980 990 1000
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 ELRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKSPSHKSKRQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEG-K
: :: : : .: . . : :::: :..: :..::.::.::: :. .::. .
CCDS11 EQWKK-EAAAQEAGADTPGKGEPPAPKSPP-KARRPQMDLISELKRRQQKEPL-IYESDR
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 DGAIEDIITDLRNQPYRRADAVRRSVRRRFDDQNLRSVNGAEITM
::::::::: ... :. : . .:. :
CCDS11 DGAIEDIITVIKTVPFT-ARTGKRTSRLLCEASLGEEMPL
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CCDS14 RILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIV--GEENILDKLLGAITTAAERNN
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:. :.:.:..:.... .: : : : .. : ......: : . :.:: :
CCDS14 KEKENDELDIQLKVFDENKED--DLTELSHRLNDIRAEMDDMNEVYHLLYNMLKDTAAEN
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. . :.. :. :: . . . :: . .:. . . . ::
CCDS14 YFLSI-LQHFLLIRN-DYYIRPQYYKIIEECVSQIVLHCSGMDPDFKYRQRLDIDLTHLI
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.: ..: : .: . ...:: : .. : : . .:. . . .
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....:. : :: :::: . : : .::.: : :::::: : ::::::
CCDS14 LSSSSGIPGPPAAPPLPGVGPPPP-----PPAPPLPGGAPLPPPPPPLPGMMGIPPPPPP
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: : : : :: ::: ..:: :: : . . :. :. :: . : .::
CCDS14 PLLFGG-----PPPP--PPLGGVPPPPGIS---LNLPYGMKQKKMYKP---EVSMKRINW
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640 650 660 670 680
pF1KA1 VALKPNQINGTVFNEIDDERILEDL--NVDEFEEI---FKT--KAQGPAIDLSSSKQKIP
..:.... . : :. :: : : : .. : : :.: : : .:
CCDS14 SKIEPTELSENCFWL----RVKEDKFENPDLFAKLALNFATQIKVQKNAEALEEKKTGPT
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pF1KA1 QKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEICKAIHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTEN
.: ... .:. . :.::.: : . ..: ..: . : ... :.. ::
CCDS14 KKKVKELRILDPKTAQNLSIFLGSYRMPYEDIRNVILEVNEDMLSEALIQNLVKHLP---
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750 760 770 780 790 800
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: :.: . .. ..: . ..: . .:... :. ... . : .: : :. . :.. :
CCDS14 EQKILNELAELKNEYDDLCEPEQFGVVMSSVKMLQPRLSSILFKLTFEEHINNIKPSIIA
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pF1KA1 IIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSKRGA-VYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTL
. : .:.:......::..: .::::::..:.: :::.. : . ::::.:.: ::
CCDS14 VTLACEELKKSESFNRLLELVLLVGNYMNSGSRNAQSLGFKINFLCKIRDTKSADQKTTL
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pF1KA1 LHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSLENVLLDVKELQRGM-----DLTKREYT
::.:... .:::... : .::..::.:. :: . . .. ... . :. : .
CCDS14 LHFIADICEEKYRDILKFPEELEHVESASKVSAQILKSNLASMEQQIVHLERDIKKFPQA
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..:. .... : . . . .::. . . .... .:: . ::. :: .
CCDS14 ENQHDKFVEKMTSFTKTAREQYEKLSTMHNNMMKLYENLGEYFIFDSKTVSIEEFFGDLN
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pF1KA1 RFVKAYKQAEEENELRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKSPSHKSKRQQQELIAELRRR
: . .: .::. :...:. . : .: ::. : .:.:.: .. : .
CCDS14 NFRTLFLEAVRENNKRREMEEKTRRAKLAKEK-AEQE--KLERQKKKKQLIDINKEGDET
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pF1KA1 QVKDNRHVYEG-KDGAIEDIITDLRNQPYRRADAVRRSVRRRFDDQNLRSVNGAEITM
: :: . :. ..:: . : :.. : : : ..: . .:
CCDS14 GVMDN--LLEALQSGA---AFRDRRKRIPRNPDNRRVPLERSRSRHNGAISSK
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pF1KA1 NLPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLRAIMNYQYGFN
:... ..::.. .. :.::.:.:: ..:..
CCDS14 LTSNPVSWVNNFGHEGLGLLLDELEKLLDKKQQENIDKKNQYKL-IQCLKAFMNNKFGLQ
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pF1KA1 MVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDNFKEVCGEK--
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CCDS14 RILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIV--GEENILDKLLGAITTAAERNN
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CCDS14 RERFSPIVEGLENQEA-LQLQVACMQFINALVTSPYELDFRIHLRNEFLRSGLKTMLPDL
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pF1KA1 KHTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLSEKLQDTENEA
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CCDS14 KEKENDELDIQLKVFDENKED--DLTELSHRLNDIRAEMDDMNEVYHLLYNMLKDTAAEN
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. . :.. :. :: . . . :: . .:. . . . ::
CCDS14 YFLSI-LQHFLLIRN-DYYIRPQYYKIIEECVSQIVLHCSGMDPDFKYRQRLDIDLTHLI
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pF1KA1 QSTLEKKIHELEKQGTIKIQKKGDGDI-------AILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPT
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CCDS14 DSCVNKAKVEESEQKAAEFSKKFDEEFTARQEAQAELQKRDEKIKELEAEIQQLRTQAQV
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CCDS14 LSSSSGIPGPPAAPPLPGVGPPPP-----PPAPPLPGGAPLPPPPPPLPGMMGIPPPPPP
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CCDS14 PLLFGG-----PPPP--PPLGGVPPPPGIS---LNLPYGMKQKKMYKP---EVSMKRINW
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..:.... . : :. :: : : : .. : : :.: : : .:
CCDS14 SKIEPTELSENCFWL----RVKEDKFENPDLFAKLALNFATQIKVQKNAEALEEKKTGPT
650 660 670 680 690
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pF1KA1 QKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEICKAIHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTEN
.: ... .:. . :.::.: : . ..: ..: . : ... :.. ::
CCDS14 KKKVKELRILDPKTAQNLSIFLGSYRMPYEDIRNVILEVNEDMLSEALIQNLVKHLP---
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 EVKVLRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIERLMQKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHA
: :.: . .. ..: . ..: . .:... :. ... . : .: : :. . :.. :
CCDS14 EQKILNELAELKNEYDDLCEPEQFGVVMSSVKMLQPRLSSILFKLTFEEHINNIKPSIIA
760 770 780 790 800 810
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pF1KA1 IIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSKRGA-VYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTL
. : .:.:......::..: .::::::..:.: :::.. : . ::::.:.: ::
CCDS14 VTLACEELKKSESFNRLLELVLLVGNYMNSGSRNAQSLGFKINFLCKIRDTKSADQKTTL
820 830 840 850 860 870
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pF1KA1 LHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSLENVLLDVKELQRGM-----DLTKREYT
::.:... .:::... : .::..::.:. :: . . .. ... . :. : .
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..:. .... : . . . .::. . . .... .:: . ::. :: .
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: ::
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CCDS56 ------------CIKALMNNSQGRAHVLAQPEAISTIAQSLRTENSKTKVAVLEILGAVC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]