Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1867
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1867, 778 aa
1>>>pF1KA1867 778 - 778 aa - 778 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7660+/-0.00111; mu= 13.7238+/- 0.066
mean_var=140.9150+/-28.954, 0's: 0 Z-trim(106.4): 136 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.108043
statistics sampled from 8810 (8957) to 8810 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53723.1 KIRREL3 gene_id:84623|Hs108|chr11 ( 778) 5140 813.9 0
CCDS55796.1 KIRREL3 gene_id:84623|Hs108|chr11 ( 600) 3749 597.0 2.9e-170
CCDS73413.1 KIRREL3 gene_id:84623|Hs108|chr11 ( 766) 3446 549.9 5.7e-156
CCDS1172.2 KIRREL gene_id:55243|Hs108|chr1 ( 757) 1971 320.0 9.2e-87
CCDS72952.1 KIRREL gene_id:55243|Hs108|chr1 ( 657) 1610 263.6 7.2e-70
CCDS12479.1 KIRREL2 gene_id:84063|Hs108|chr19 ( 633) 1427 235.1 2.7e-61
CCDS12481.1 KIRREL2 gene_id:84063|Hs108|chr19 ( 708) 1424 234.7 4.1e-61
CCDS12480.1 KIRREL2 gene_id:84063|Hs108|chr19 ( 583) 1278 211.8 2.5e-54
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 361 69.2 5e-11
CCDS1182.1 CADM3 gene_id:57863|Hs108|chr1 ( 432) 347 66.6 9.8e-11
>>CCDS53723.1 KIRREL3 gene_id:84623|Hs108|chr11 (778 aa)
initn: 5140 init1: 5140 opt: 5140 Z-score: 4340.5 bits: 813.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5140; 100.0% identity (100.0% similar) in 778 aa overlap (1-778:1-778)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MKPFQLDLLFVCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKPFQLDLLFVCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 IIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 STLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 STLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGREGEEHSTIKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGREGEEHSTIKQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LMMDRGEFQQDSVLKQLEVLKEEEKEFQNLKDPTNGYYSVNTFKEHHSTPTISLSSCQPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LMMDRGEFQQDSVLKQLEVLKEEEKEFQNLKDPTNGYYSVNTFKEHHSTPTISLSSCQPD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LRPAGKQRVPTGMSFTNIYSTLSGQGRLYDYGQRFVLGMGSSSIELCEREFQRGSLSDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRPAGKQRVPTGMSFTNIYSTLSGQGRLYDYGQRFVLGMGSSSIELCEREFQRGSLSDSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA1 SFLDTQCDSSVSSSGKQDGYVQFDKASKASASSSHHSQSSSQNSDPSRPLQRRMQTHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SFLDTQCDSSVSSSGKQDGYVQFDKASKASASSSHHSQSSSQNSDPSRPLQRRMQTHV
730 740 750 760 770
>>CCDS55796.1 KIRREL3 gene_id:84623|Hs108|chr11 (600 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3170.2 bits: 597.0 E(32554): 2.9e-170
Smith-Waterman score: 3749; 99.5% identity (99.6% similar) in 569 aa overlap (1-569:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MKPFQLDLLFVCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKPFQLDLLFVCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 IIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 STLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 STLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGREGEEHSTIKQ
:::::::::::::::::::::::::. :
CCDS55 AVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRSTGGRSGISGRGTEKKARLRLPRRASKQECNEQGS
550 560 570 580 590 600
>>CCDS73413.1 KIRREL3 gene_id:84623|Hs108|chr11 (766 aa)
initn: 3444 init1: 3444 opt: 3446 Z-score: 2913.6 bits: 549.9 E(32554): 5.7e-156
Smith-Waterman score: 5032; 98.5% identity (98.5% similar) in 778 aa overlap (1-778:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MKPFQLDLLFVCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKPFQLDLLFVCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 IIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 STLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS73 STLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQ------------ESVPMAVIIGV
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGREGEEHSTIKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGREGEEHSTIKQ
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LMMDRGEFQQDSVLKQLEVLKEEEKEFQNLKDPTNGYYSVNTFKEHHSTPTISLSSCQPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LMMDRGEFQQDSVLKQLEVLKEEEKEFQNLKDPTNGYYSVNTFKEHHSTPTISLSSCQPD
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LRPAGKQRVPTGMSFTNIYSTLSGQGRLYDYGQRFVLGMGSSSIELCEREFQRGSLSDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LRPAGKQRVPTGMSFTNIYSTLSGQGRLYDYGQRFVLGMGSSSIELCEREFQRGSLSDSS
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770
pF1KA1 SFLDTQCDSSVSSSGKQDGYVQFDKASKASASSSHHSQSSSQNSDPSRPLQRRMQTHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SFLDTQCDSSVSSSGKQDGYVQFDKASKASASSSHHSQSSSQNSDPSRPLQRRMQTHV
710 720 730 740 750 760
>>CCDS1172.2 KIRREL gene_id:55243|Hs108|chr1 (757 aa)
initn: 2033 init1: 1871 opt: 1971 Z-score: 1671.1 bits: 320.0 E(32554): 9.2e-87
Smith-Waterman score: 2092; 45.9% identity (70.8% similar) in 760 aa overlap (43-778:16-757)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 FFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVVSGQPVTLLCAIP
..: :::.: ::.::.:: ..: :..
CCDS11 MLSLLVWILTLSDTFSQGTQTRFSQEPADQTVVAGQRAVLPCVLL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 EYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQDDAVYECQAIQA
.:.:.: : :::::::.:. :...:.: :::. .:...:.: :::.::: ::::: .:
CCDS11 NYSGIVQWTKDGLALGMGQGLKAWPRYRVVGSADAGQYNLEITDAELSDDASYECQATEA
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 AIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAASIIWLRKGEVING
:.::: :.::::.::.: : ::::: :.:: : ::::.: ::::::.:::.: : .:
CCDS11 ALRSRRAKLTVLIPPEDTRIDGGPVILLQAGTPHNLTCRAFNAKPAATIIWFRDGTQQEG
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 ATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKETSVTIDIQHPPLV
:. : ::.:::::. :: :.:.: :.. :. ..::. :.:::.:::::. .:..::: :
CCDS11 AVASTELLKDGKRETTVSQLLINPTDLDIGRVFTCRSMNEAIPSGKETSIELDVHHPPTV
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 NLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYRTTVDYTYFSEPV
.::.::: : : . :.: :.: ::: . ::::: : .:..: :.:.:::..:.:::
CCDS11 TLSIEPQTVQEGERVVFTCQATANPEILGYRWAKGGFLIEDAHESRYETNVDYSFFTEPV
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 SCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTGNPSLTIVWMKRG
:::: : .::::.: :.:.:.::....:. .:.:::. ..:.:.::: ::..: :.
CCDS11 SCEVHNKVGSTNVSTLVNVHFAPRIVVDPKPTTTDIGSDVTLTCVWVGNPPLTLTWTKKD
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 SGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPPIISSTQTQHALH
:..:::: . : :::: : ::: :.:::.:::.:..:::: : ::::::::: .:.:..
CCDS11 SNMVLSNSNQLLLKSVTQADAGTYTCRAIVPRIGVAEREVPLYVNGPPIISSEAVQYAVR
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 GEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVISTLTISNIVRAD
:. :...::: ::::::::::.:::: :: :: ::::: .. ::.:::::.:...::
CCDS11 GDGGKVECFIGSTPPPDRIAWAWKENFLEVGTLERYTVERTNSGSGVLSTLTINNVMEAD
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 FQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLM
::: :::::::::: : ::.:.:. : .:...: :...::.. .. ..
CCDS11 FQTHYNCTAWNSFGPGTAIIQLEER------------EVLPVGIIAGATIGASILLIFFF
470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KA1 ATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPA---SGREGEEHS--TIKQLMMD-RG
..: : : . . : :. : ::.:: :..:: : :: . : : ..: .
CCDS11 IALVFFLYRRRKGSRKDVTLRKLDIKVETVNREPLTMHSDREDDTASVSTATRVMKAIYS
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EFQQDSVLKQ-LEVLKEEEKEFQNLKDPTNGYYSVNTFKEHHSTPTISLSSCQPDLRPAG
:..: ::: :. . .: ..::::::::.: . :.. :. : . : : :
CCDS11 SFKDDVDLKQDLRCDTIDTREEYEMKDPTNGYYNV---RAHEDRPS-SRAVLYADYRAPG
580 590 600 610 620
670 680 690 700 710
pF1KA1 KQRV---PTG-MSFTNIYSTLS--GQGRLYDYGQRFV-------LGMGSSSIELCE--RE
: :.. .: .. :. :. ..: ::: . . : ..: : ..
CCDS11 PARFDGRPSSRLSHSSGYAQLNTYSRGPASDYGPEPTPPGPAAPAGTDTTSQLSYENYEK
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KA1 FQRGSLSDSSSFLDTQCD-SSVSSSG-KQDGYVQFDKASKASASSSHHSQSSSQNSDPSR
:. . .... . .. :: .. : .: .: :.... : .: :.:: ..
CCDS11 FNSHPFPGAAGYPTYRLGYPQAPPSGLERTPYEAYDPIGKY-ATATRFSYTS-QHSDYGQ
690 700 710 720 730 740
770
pF1KA1 PLQRRMQTHV
.:.::::::
CCDS11 RFQQRMQTHV
750
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. : : ..: . :..: ::: :. . .: ..::::::::.: . :.
CCDS72 DDTASVSTATRVMKAIYSSFKDDVDLKQDLRCDTIDTREEYEMKDPTNGYYNV---RAHE
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. :. : . : : : : :.. .: .. :. :. ..: ::: . .
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CCDS72 APAGTDTTSQLSYENYEKFNSHPFPGAAGYPTYRLGYPQAPPSGLERTPYEAYDPIGKY-
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CCDS72 ATATRFSYTS-QHSDYGQRFQQRMQTHV
640 650
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CCDS12 R--EDRGPIVHTD---HSDLVLEEEGTLET-KDPTNGYYKVRGVSPPAS-PDSRVTSFQW
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CCDS12 KSPGISNLP
630
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CCDS12 MLRMRVPALLVLLFCFRGRAGPSPHFLQQPEDLVVLLGEEARLPCA
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pF1KA1 IPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQDDAVYECQAI
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CCDS12 LGAYWGLVQWTKSGLALGGQRDLPGWSRYWISGNAANGQHDLHIRPVELEDEASYECQAT
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CCDS12 QAGLRSRPAQLHVLVPPEAPQVLGGPSVSLVAGVPANLTCRSRGDARPTPELLWFRDGVL
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CCDS12 RRGGAQVLGSGATLRLPSVGPEDAGDYVCRAEAGLSGLRGGAAEARLTVNAPPVVTALHS
350 360 370 380 390 400
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CCDS12 APAFLRGPARLQCLVFASPAPDAVVWSWDEGFLEAGSQGRFLVETFPAPESRGGLGPGLI
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CCDS12 LPPPSPLGPPGTPTFYDF-NPHLGMVPPCRLYRARAGYLTTPHPRAFTSYIKPTSFGPPD
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CCDS12 MLRMRVPALLVLLFCFRGRAGWSRYWISGNAANGQHDLHIRPVELE
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CCDS12 TAITLSLQYPPEVTLSASPHTVQEGEKVIFLCQATAQPPVTGYRWAKGGSPVLGARGPRL
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CCDS12 APPVVTALHSAPAFLRGPARLQCLVFASPAPDAVVWSWDEGFLEAGSQGRFLVETFPAPE
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CCDS12 SRGGLGPGLISVLHISGTQESDFSRSFNCSARN---------RLGEGGAQASLG---RRD
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pF1KA1 SVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGR
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CCDS12 LLPTVRIVA-GVAAATTTLLMVITGVALCCWRHSKASASFSEQKNLMRIPG-SSDGSSSR
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pF1KA1 EGEEHSTIKQLMMDRGEFQQDSVLKQLEVLKEEEKEFQNLKDPTNGYYSVNTFKEHHSTP
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CCDS12 GPEEEETGSR--EDRGPIVHTD---HSDLVLEEEGTLET-KDPTNGYYKVRGVSPP-ASP
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pF1KA1 TISLSSCQPDLRPAGKQRVPTGMSFTNIYSTLSGQGRLYDYGQRFVLGMGSSSIELCERE
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CCDS12 DSRVTSFQWKSPGISNLP
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CCDS44 AALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPEDAMPRIVEQPPDLLVSRGEPATLPCRAEGRPRPNIEW
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CCDS44 YKNGARVATVREDPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRAR-PDEGVYTCVARNYLGAAASRN
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 ARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAASIIWLRKGEVINGATYSKT
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CCDS44 ASLEVAVLRDDFRQSPGNVV-VAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWRKDGARLK-EEEGRI
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 LLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKETSVT--IDIQHPPLVNLSV
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CCDS44 TIRGGK-------LMMSHTLKSDAGMYVCVASNMA--GERESAAAEVMVLERPSFLRRPV
220 230 240 250 260
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pF1KA1 EPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKR-GQIIKEASGEVYRTTVDYTYFSEPVS--
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CCDS44 N-QVVLADAPVTFLCEVKGDPP-PRLRWRKEDGEL---PTGR-YEIRSDHSLWIGHVSAE
270 280 290 300 310
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