Result of FASTA (omim) for
pF1KA1866
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1866, 1773 aa
1>>>pF1KA1866 1773 - 1773 aa - 1773 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.7483+/-0.000479; mu= -30.5043+/- 0.030
mean_var=630.2816+/-130.015, 0's: 0 Z-trim(122.9): 131 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.051087
statistics sampled from 41703 (41838) to 41703 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.491), width: 16
Scan time: 19.600
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011534493 (OMIM: 609991) PREDICTED: fibronectin (1777) 9750 735.1 1.4e-210
XP_011534492 (OMIM: 609991) PREDICTED: fibronectin (1871) 9750 735.1 1.5e-210
NP_115921 (OMIM: 609991) fibronectin type III doma (1894) 9750 735.1 1.5e-210
XP_016861597 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1694) 1353 116.2 2.7e-24
XP_011510959 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1693) 1344 115.5 4.3e-24
XP_011510958 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1694) 1309 112.9 2.6e-23
XP_011510960 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1689) 1301 112.3 3.9e-23
XP_005247339 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1779) 1197 104.7 8.3e-21
XP_011510956 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1716) 1182 103.6 1.7e-20
XP_011510953 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1726) 1181 103.5 1.8e-20
XP_005247356 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1744) 1178 103.3 2.1e-20
XP_011510950 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1747) 1178 103.3 2.1e-20
XP_005247359 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1725) 1173 102.9 2.7e-20
XP_011510943 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1768) 1172 102.8 3e-20
XP_005247366 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1495) 1168 102.5 3.1e-20
XP_005247338 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1793) 1168 102.5 3.7e-20
XP_011510954 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1722) 1163 102.2 4.6e-20
XP_011510942 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1771) 1163 102.2 4.7e-20
XP_006713635 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1719) 1162 102.1 4.8e-20
XP_005247345 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1769) 1162 102.1 4.9e-20
XP_011510961 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1682) 1159 101.9 5.5e-20
XP_016861596 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1724) 1158 101.8 5.9e-20
XP_005247352 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1747) 1155 101.6 7e-20
XP_005247346 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1768) 1155 101.6 7e-20
XP_011510945 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1766) 1152 101.4 8.2e-20
XP_005247360 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1706) 1151 101.3 8.4e-20
XP_011510949 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1748) 1150 101.2 9e-20
XP_005247341 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1774) 1149 101.1 9.6e-20
XP_011510955 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1719) 1148 101.1 9.8e-20
XP_011510948 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1762) 1148 101.1 1e-19
XP_011510962 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1672) 1147 101.0 1e-19
XP_005247357 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1735) 1147 101.0 1e-19
XP_005247363 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1657) 1140 100.5 1.4e-19
XP_006713634 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1721) 1135 100.1 1.9e-19
XP_005247353 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1746) 1131 99.8 2.4e-19
XP_005247362 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1678) 1130 99.7 2.4e-19
XP_006713633 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1731) 1127 99.5 2.9e-19
XP_011510946 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1765) 1122 99.2 3.8e-19
XP_011510951 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1745) 1120 99.0 4.2e-19
XP_005247355 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1745) 1116 98.7 5.1e-19
XP_011510941 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1773) 1115 98.6 5.4e-19
XP_005247342 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1773) 1114 98.6 5.7e-19
XP_006713632 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1742) 1109 98.2 7.3e-19
XP_016861595 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1768) 1106 98.0 8.6e-19
XP_011510947 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1765) 1102 97.7 1.1e-18
XP_005247351 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1754) 1099 97.5 1.2e-18
XP_005247350 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1757) 1099 97.5 1.2e-18
XP_005247347 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1768) 1098 97.4 1.3e-18
XP_005247344 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1771) 1084 96.4 2.6e-18
XP_005247358 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1726) 1083 96.3 2.7e-18
>>XP_011534493 (OMIM: 609991) PREDICTED: fibronectin typ (1777 aa)
initn: 8527 init1: 6972 opt: 9750 Z-score: 3901.4 bits: 735.1 E(85289): 1.4e-210
Smith-Waterman score: 11185; 95.2% identity (95.7% similar) in 1750 aa overlap (93-1773:28-1777)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 NHSGVSRPVYRAESPPGGEWIEIDGFPIKGPGPFNETVTEKEVPNKPLRVRVRSSDDRLS
: . ...:::::::::::::::::::::
XP_011 MAPEAGATLRAPRRLSWAALLLLAALLPVASSAAASEKEVPNKPLRVRVRSSDDRLS
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VAWKAPRLSGAKSPRRSRGFLLGYGESGRKMNYVPLTRDERTHEIKKLASESVYVVSLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAWKAPRLSGAKSPRRSRGFLLGYGESGRKMNYVPLTRDERTHEIKKLASESVYVVSLQS
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 MNSQGRSQPVYRAALTKRKISEEDELDVPDDISVRVMSSQSVLVSWVDPVLEKQKKVVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MNSQGRSQPVYRAALTKRKISEEDELDVPDDISVRVMSSQSVLVSWVDPVLEKQKKVVAS
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RQYTVRYREKGELARWDYKQIANRRVLIENLIPDTVYEFAVRISQGERDGKWSTSVFQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQYTVRYREKGELARWDYKQIANRRVLIENLIPDTVYEFAVRISQGERDGKWSTSVFQRT
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340
pF1KA1 PESAPTTAPENLNVWPVNGKPTVVAASWDALPETEGKVK---------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PESAPTTAPENLNVWPVNGKPTVVAASWDALPETEGKVKEYILSYAPALKPFGAKSLTYP
240 250 260 270 280 290
350
pF1KA1 ------------------------------------------ASKADVQQNTEDNGKPEK
.:::::.:::::::::::
XP_011 GDTTSALVDGLQPGERYLFKIRATNRRGLGPHSKAFIVAMPTTSKADVEQNTEDNGKPEK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 PEPSSPSPRAPASSQHPSVPASPQGRNAKDLLLDLKNKILANGGAPRKPQLRAKKAEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEPSSPSPRAPASSQHPSVPASPQGRNAKDLLLDLKNKILANGGAPRKPQLRAKKAEELD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 LQSTEITGEEELGSREDSPMSPSDTQDQKRTLRPPSRHGHSVVAPGRTAVRARMPALPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQSTEITGEEELGSREDSPMSPSDTQDQKRTLRPPSRHGHSVVAPGRTAVRARMPALPRR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 EGVDKPGFSLATQPRPGAPPSASASPAHHASTQGTSHRPSLPASLNDNDLVDSDEDERAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGVDKPGFSLATQPRPGAPPSASASPAHHASTQGTSHRPSLPASLNDNDLVDSDEDERAV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 GSLHPKGAFAQPRPALSPSRQSPSSVLRDRSSVHPGAKPASPARRTPHSGAAEEDSSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSLHPKGAFAQPRPALSPSRQSPSSVLRDRSSVHPGAKPASPARRTPHSGAAEEDSSASA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 PPSRLSPPHGGSSRLLPTQPHLSSPLSKGGKDGEDAPATNSNAPSRSTMSSSVSSHLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPSRLSPPHGGSSRLLPTQPHLSSPLSKGGKDGEDAPATNSNAPSRSTMSSSVSSHLSSR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 TQVSEGAEASDGESHGDGDREDGGRQAEATAQTLRARPASGHFHLLRHKPFAANGRSPSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQVSEGAEASDGESHGDGDREDGGRQAEATAQTLRARPASGHFHLLRHKPFAANGRSPSR
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 FSIGRGPRLQPSSSPQSTVPSRAHPRVPSHSDSHPKLSSGIHGDEEDEKPLPATVVNDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSIGRGPRLQPSSSPQSTVPSRAHPRVPSHSDSHPKLSSGIHGDEEDEKPLPATVVNDHV
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PSSSRQPISRGWEDLRRSPQRGASLHRKEPIPENPKSTGADTHPQGKYSSLASKAQDVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSSSRQPISRGWEDLRRSPQRGASLHRKEPIPENPKSTGADTHPQGKYSSLASKAQDVQQ
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 STDADTEGHSPKAQPGSTDRHASPARPPAARSQQHPSVPRRMTPGRAPEQQPPPPVATSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_011 STDADTEGHSPKAQPGSTDRHASPARPPAARSQQHPSVPRRMTPGRAPQQQPPPPVATSQ
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 HHPGPQSRDAGRSPSQPRLSLTQAGRPRPTSQGRSHSSSDPYTASSRGMLPTALQNQDED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HHPGPQSRDAGRSPSQPRLSLTQAGRPRPTSQGRSHSSSDPYTASSRGMLPTALQNQDED
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 AQGSYDDDSTEVEAQDVRAPAHAARAKEAAASLPKHQQVESPTGAGAGGDHRSQRGHAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AQGSYDDDSTEVEAQDVRAPAHAARAKEAAASLPKHQQVESPTGAGAGGDHRSQRGHAAS
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 PARPSRPGGPQSRARVPSRAAPGKSEPPSKRPLSSKSQQSVSAEDEEEEDAGFFKGGKED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_011 PARPSRPGGPQSRARVPSRAAPGKSEPPSKRPLSSKSQQSVSAEDDEEEDAGFFKGGKED
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 LLSSSVPKWPSSSTPRGGKDADGSLAKEEREPAIALAPRGGSLAPVKRPLPPPPGSSPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLSSSVPKWPSSSTPRGGKDADGSLAKEEREPAIALAPRGGSLAPVKRPLPPPPGSSPRA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 SHVPSRPPPRSAATVSPVAGTHPWPRYTTRAPPGHFSTTPMLSLRQRMMHARFRNPLSRQ
:::::: ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHVPSRLPPRSAATVSPVAGTHPWPQYTTRAPPGHFSTTPMLSLRQRMMHARFRNPLSRQ
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 PARPSYRQGYNGRPNVEGKVLPGSNGKPNGQRIINGPQGTKWVVDLDRGLVLNAEGRYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PARPSYRQGYNGRPNVEGKVLPGSNGKPNGQRIINGPQGTKWVVDLDRGLVLNAEGRYLQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 DSHGNPLRIKLGGDGRTIVDLEGTPVVSPDGLPLFGQGRHGTPLANAQDKPILSLGGKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSHGNPLRIKLGGDGRTIVDLEGTPVVSPDGLPLFGQGRHGTPLANAQDKPILSLGGKPL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 VGLEVIKKTTHPPTTTMQPTTTTTPLPTTTTPRPTTATTRRTTT------RRPTTTVRTT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
XP_011 VGLEVIKKTTHPPTTTMQPTTTTTPLPTTTTPRPTTATTRRTTTTRRTTTRRPTTTVRTT
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 TRTTTTTTPKPTTPIPTCPPGTLERHDDDGNLIMSSNGIPECYAEEDEFSGLETDTAVPT
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRTTTTTTPTPTTPIPTCPPGTLERHDDDGNLIMSSNGIPECYAEEDEFSGLETDTAVPT
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA1 EEAYVIYDEDYEFETSRPPTTTEPSTTATTPRVIPEEGAISSFPEEEFDLAGRKRFVAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEAYVIYDEDYEFETSRPPTTTEPSTTATTPRVIPEEGAISSFPEEEFDLAGRKRFVAPY
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA1 VTYLNKDPSAPCSLTDALDHFQVDSLDEIIPNDLKKSDLPPQHAPRNITVVAVEGCHSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTYLNKDPSAPCSLTDALDHFQVDSLDEIIPNDLKKSDLPPQHAPRNITVVAVEGCHSFV
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA1 IVDWDKATPGDVVTGYLVYSASYEDFIRNKWSTQASSVTHLPIENLKPNTRYYFKVQAQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVDWDKATPGDVVTGYLVYSASYEDFIRNKWSTQASSVTHLPIENLKPNTRYYFKVQAQN
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 PHGYGPISPSVSFVTESDNPLLVVRPPGGEPIWIPFAFKHDPSYTDCHGRQYVKRTWYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHGYGPISPSVSFVTESDNPLLVVRPPGGEPIWIPFAFKHDPSYTDCHGRQYVKRTWYRK
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA1 FVGVVLCNSLRYKIYLSDNLKDTFYSIGDSWGRGEDHCQFVDSHLDGRTGPQSYVEALPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVGVVLCNSLRYKIYLSDNLKDTFYSIGDSWGRGEDHCQFVDSHLDGRTGPQSYVEALPT
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1740 1750 1760 1770
pF1KA1 IQGYYRQYRQEPVRFGNIGFGTPYYYVGWYECGVSIPGKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IQGYYRQYRQEPVRFGNIGFGTPYYYVGWYECGVSIPGKW
1740 1750 1760 1770
>>XP_011534492 (OMIM: 609991) PREDICTED: fibronectin typ (1871 aa)
initn: 8529 init1: 6972 opt: 9750 Z-score: 3901.1 bits: 735.1 E(85289): 1.5e-210
Smith-Waterman score: 11582; 94.6% identity (94.9% similar) in 1834 aa overlap (9-1773:61-1871)
10 20 30
pF1KA1 MGLKVTWDPPKDATSRPVEHYNIAYGKSLKSLKYIKVN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSAAASVDHPLKPRHVKLLSTKMGLKVTWDPPKDATSRPVEHYNIAYGKSLKSLKYIKVN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 AETYSFLIEDVEPGVVYFVLLTAENHSGVSRPVYRAESPPGGEWIEIDGFPIKGPGPFNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AETYSFLIEDVEPGVVYFVLLTAENHSGVSRPVYRAESPP--------------------
100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TVTEKEVPNKPLRVRVRSSDDRLSVAWKAPRLSGAKSPRRSRGFLLGYGESGRKMNYVPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ---EKEVPNKPLRVRVRSSDDRLSVAWKAPRLSGAKSPRRSRGFLLGYGESGRKMNYVPL
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 TRDERTHEIKKLASESVYVVSLQSMNSQGRSQPVYRAALTKRKISEEDELDVPDDISVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRDERTHEIKKLASESVYVVSLQSMNSQGRSQPVYRAALTKRKISEEDELDVPDDISVRV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 MSSQSVLVSWVDPVLEKQKKVVASRQYTVRYREKGELARWDYKQIANRRVLIENLIPDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSSQSVLVSWVDPVLEKQKKVVASRQYTVRYREKGELARWDYKQIANRRVLIENLIPDTV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 YEFAVRISQGERDGKWSTSVFQRTPESAPTTAPENLNVWPVNGKPTVVAASWDALPETEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YEFAVRISQGERDGKWSTSVFQRTPESAPTTAPENLNVWPVNGKPTVVAASWDALPETEG
310 320 330 340 350 360
340
pF1KA1 KVK---------------------------------------------------------
:::
XP_011 KVKEYILSYAPALKPFGAKSLTYPGDTTSALVDGLQPGERYLFKIRATNRRGLGPHSKAF
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390
pF1KA1 ------ASKADVQQNTEDNGKPEKPEPSSPSPRAPASSQHPSVPASPQGRNAKDLLLDLK
.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVAMPTTSKADVEQNTEDNGKPEKPEPSSPSPRAPASSQHPSVPASPQGRNAKDLLLDLK
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 NKILANGGAPRKPQLRAKKAEELDLQSTEITGEEELGSREDSPMSPSDTQDQKRTLRPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NKILANGGAPRKPQLRAKKAEELDLQSTEITGEEELGSREDSPMSPSDTQDQKRTLRPPS
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RHGHSVVAPGRTAVRARMPALPRREGVDKPGFSLATQPRPGAPPSASASPAHHASTQGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RHGHSVVAPGRTAVRARMPALPRREGVDKPGFSLATQPRPGAPPSASASPAHHASTQGTS
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 HRPSLPASLNDNDLVDSDEDERAVGSLHPKGAFAQPRPALSPSRQSPSSVLRDRSSVHPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRPSLPASLNDNDLVDSDEDERAVGSLHPKGAFAQPRPALSPSRQSPSSVLRDRSSVHPG
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 AKPASPARRTPHSGAAEEDSSASAPPSRLSPPHGGSSRLLPTQPHLSSPLSKGGKDGEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKPASPARRTPHSGAAEEDSSASAPPSRLSPPHGGSSRLLPTQPHLSSPLSKGGKDGEDA
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 PATNSNAPSRSTMSSSVSSHLSSRTQVSEGAEASDGESHGDGDREDGGRQAEATAQTLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PATNSNAPSRSTMSSSVSSHLSSRTQVSEGAEASDGESHGDGDREDGGRQAEATAQTLRA
730 740 750 760 770 780
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 RPASGHFHLLRHKPFAANGRSPSRFSIGRGPRLQPSSSPQSTVPSRAHPRVPSHSDSHPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RPASGHFHLLRHKPFAANGRSPSRFSIGRGPRLQPSSSPQSTVPSRAHPRVPSHSDSHPK
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760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LSSGIHGDEEDEKPLPATVVNDHVPSSSRQPISRGWEDLRRSPQRGASLHRKEPIPENPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSSGIHGDEEDEKPLPATVVNDHVPSSSRQPISRGWEDLRRSPQRGASLHRKEPIPENPK
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pF1KA1 STGADTHPQGKYSSLASKAQDVQQSTDADTEGHSPKAQPGSTDRHASPARPPAARSQQHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STGADTHPQGKYSSLASKAQDVQQSTDADTEGHSPKAQPGSTDRHASPARPPAARSQQHP
910 920 930 940 950 960
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 SVPRRMTPGRAPEQQPPPPVATSQHHPGPQSRDAGRSPSQPRLSLTQAGRPRPTSQGRSH
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVPRRMTPGRAPQQQPPPPVATSQHHPGPQSRDAGRSPSQPRLSLTQAGRPRPTSQGRSH
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pF1KA1 SSSDPYTASSRGMLPTALQNQDEDAQGSYDDDSTEVEAQDVRAPAHAARAKEAAASLPKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSSDPYTASSRGMLPTALQNQDEDAQGSYDDDSTEVEAQDVRAPAHAARAKEAAASLPKH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 QQVESPTGAGAGGDHRSQRGHAASPARPSRPGGPQSRARVPSRAAPGKSEPPSKRPLSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QQVESPTGAGAGGDHRSQRGHAASPARPSRPGGPQSRARVPSRAAPGKSEPPSKRPLSSK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 SQQSVSAEDEEEEDAGFFKGGKEDLLSSSVPKWPSSSTPRGGKDADGSLAKEEREPAIAL
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQQSVSAEDDEEEDAGFFKGGKEDLLSSSVPKWPSSSTPRGGKDADGSLAKEEREPAIAL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 APRGGSLAPVKRPLPPPPGSSPRASHVPSRPPPRSAATVSPVAGTHPWPRYTTRAPPGHF
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.::::::::::
XP_011 APRGGSLAPVKRPLPPPPGSSPRASHVPSRLPPRSAATVSPVAGTHPWPQYTTRAPPGHF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 STTPMLSLRQRMMHARFRNPLSRQPARPSYRQGYNGRPNVEGKVLPGSNGKPNGQRIING
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STTPMLSLRQRMMHARFRNPLSRQPARPSYRQGYNGRPNVEGKVLPGSNGKPNGQRIING
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KA1 PQGTKWVVDLDRGLVLNAEGRYLQDSHGNPLRIKLGGDGRTIVDLEGTPVVSPDGLPLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PQGTKWVVDLDRGLVLNAEGRYLQDSHGNPLRIKLGGDGRTIVDLEGTPVVSPDGLPLFG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 QGRHGTPLANAQDKPILSLGGKPLVGLEVIKKTTHPPTTTMQPTTTTTPLPTTTTPRPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGRHGTPLANAQDKPILSLGGKPLVGLEVIKKTTHPPTTTMQPTTTTTPLPTTTTPRPTT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA1 ATTRRTTT------RRPTTTVRTTTRTTTTTTPKPTTPIPTCPPGTLERHDDDGNLIMSS
:::::::: ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATTRRTTTTRRTTTRRPTTTVRTTTRTTTTTTPTPTTPIPTCPPGTLERHDDDGNLIMSS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA1 NGIPECYAEEDEFSGLETDTAVPTEEAYVIYDEDYEFETSRPPTTTEPSTTATTPRVIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGIPECYAEEDEFSGLETDTAVPTEEAYVIYDEDYEFETSRPPTTTEPSTTATTPRVIPE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA1 EGAISSFPEEEFDLAGRKRFVAPYVTYLNKDPSAPCSLTDALDHFQVDSLDEIIPNDLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGAISSFPEEEFDLAGRKRFVAPYVTYLNKDPSAPCSLTDALDHFQVDSLDEIIPNDLKK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA1 SDLPPQHAPRNITVVAVEGCHSFVIVDWDKATPGDVVTGYLVYSASYEDFIRNKWSTQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDLPPQHAPRNITVVAVEGCHSFVIVDWDKATPGDVVTGYLVYSASYEDFIRNKWSTQAS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KA1 SVTHLPIENLKPNTRYYFKVQAQNPHGYGPISPSVSFVTESDNPLLVVRPPGGEPIWIPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVTHLPIENLKPNTRYYFKVQAQNPHGYGPISPSVSFVTESDNPLLVVRPPGGEPIWIPF
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KA1 AFKHDPSYTDCHGRQYVKRTWYRKFVGVVLCNSLRYKIYLSDNLKDTFYSIGDSWGRGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFKHDPSYTDCHGRQYVKRTWYRKFVGVVLCNSLRYKIYLSDNLKDTFYSIGDSWGRGED
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KA1 HCQFVDSHLDGRTGPQSYVEALPTIQGYYRQYRQEPVRFGNIGFGTPYYYVGWYECGVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HCQFVDSHLDGRTGPQSYVEALPTIQGYYRQYRQEPVRFGNIGFGTPYYYVGWYECGVSI
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1770
pF1KA1 PGKW
::::
XP_011 PGKW
1870
>>NP_115921 (OMIM: 609991) fibronectin type III domain-c (1894 aa)
initn: 9211 init1: 6972 opt: 9750 Z-score: 3901.0 bits: 735.1 E(85289): 1.5e-210
Smith-Waterman score: 11653; 95.8% identity (96.1% similar) in 1811 aa overlap (32-1773:84-1894)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 GLKVTWDPPKDATSRPVEHYNIAYGKSLKSLKYIKVNAETYSFLIEDVEPGVVYFVLLTA
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 GLKVTWDPPKDATSRPVEHYNIAYGKSLKSLKYIKVNAETYSFLIEDVEPGVVYFVLLTA
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70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ENHSGVSRPVYRAESPPGGEWIEIDGFPIKGPGPFNETVTEKEVPNKPLRVRVRSSDDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 ENHSGVSRPVYRAESPPGGEWIEIDGFPIKGPGPFNETVTEKEVPNKPLRVRVRSSDDRL
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130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SVAWKAPRLSGAKSPRRSRGFLLGYGESGRKMNYVPLTRDERTHEIKKLASESVYVVSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SVAWKAPRLSGAKSPRRSRGFLLGYGESGRKMNYVPLTRDERTHEIKKLASESVYVVSLQ
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SMNSQGRSQPVYRAALTKRKISEEDELDVPDDISVRVMSSQSVLVSWVDPVLEKQKKVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SMNSQGRSQPVYRAALTKRKISEEDELDVPDDISVRVMSSQSVLVSWVDPVLEKQKKVVA
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SRQYTVRYREKGELARWDYKQIANRRVLIENLIPDTVYEFAVRISQGERDGKWSTSVFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SRQYTVRYREKGELARWDYKQIANRRVLIENLIPDTVYEFAVRISQGERDGKWSTSVFQR
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340
pF1KA1 TPESAPTTAPENLNVWPVNGKPTVVAASWDALPETEGKVK--------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TPESAPTTAPENLNVWPVNGKPTVVAASWDALPETEGKVKEYILSYAPALKPFGAKSLTY
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350
pF1KA1 -------------------------------------------ASKADVQQNTEDNGKPE
.:::::.::::::::::
NP_115 PGDTTSALVDGLQPGERYLFKIRATNRRGLGPHSKAFIVAMPTTSKADVEQNTEDNGKPE
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360 370 380 390 400 410
pF1KA1 KPEPSSPSPRAPASSQHPSVPASPQGRNAKDLLLDLKNKILANGGAPRKPQLRAKKAEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 KPEPSSPSPRAPASSQHPSVPASPQGRNAKDLLLDLKNKILANGGAPRKPQLRAKKAEEL
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 DLQSTEITGEEELGSREDSPMSPSDTQDQKRTLRPPSRHGHSVVAPGRTAVRARMPALPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 DLQSTEITGEEELGSREDSPMSPSDTQDQKRTLRPPSRHGHSVVAPGRTAVRARMPALPR
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 REGVDKPGFSLATQPRPGAPPSASASPAHHASTQGTSHRPSLPASLNDNDLVDSDEDERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 REGVDKPGFSLATQPRPGAPPSASASPAHHASTQGTSHRPSLPASLNDNDLVDSDEDERA
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 VGSLHPKGAFAQPRPALSPSRQSPSSVLRDRSSVHPGAKPASPARRTPHSGAAEEDSSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VGSLHPKGAFAQPRPALSPSRQSPSSVLRDRSSVHPGAKPASPARRTPHSGAAEEDSSAS
660 670 680 690 700 710
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 APPSRLSPPHGGSSRLLPTQPHLSSPLSKGGKDGEDAPATNSNAPSRSTMSSSVSSHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 APPSRLSPPHGGSSRLLPTQPHLSSPLSKGGKDGEDAPATNSNAPSRSTMSSSVSSHLSS
720 730 740 750 760 770
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 RTQVSEGAEASDGESHGDGDREDGGRQAEATAQTLRARPASGHFHLLRHKPFAANGRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RTQVSEGAEASDGESHGDGDREDGGRQAEATAQTLRARPASGHFHLLRHKPFAANGRSPS
780 790 800 810 820 830
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RFSIGRGPRLQPSSSPQSTVPSRAHPRVPSHSDSHPKLSSGIHGDEEDEKPLPATVVNDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RFSIGRGPRLQPSSSPQSTVPSRAHPRVPSHSDSHPKLSSGIHGDEEDEKPLPATVVNDH
840 850 860 870 880 890
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 VPSSSRQPISRGWEDLRRSPQRGASLHRKEPIPENPKSTGADTHPQGKYSSLASKAQDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VPSSSRQPISRGWEDLRRSPQRGASLHRKEPIPENPKSTGADTHPQGKYSSLASKAQDVQ
900 910 920 930 940 950
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 QSTDADTEGHSPKAQPGSTDRHASPARPPAARSQQHPSVPRRMTPGRAPEQQPPPPVATS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_115 QSTDADTEGHSPKAQPGSTDRHASPARPPAARSQQHPSVPRRMTPGRAPQQQPPPPVATS
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900 910 920 930 940 950
pF1KA1 QHHPGPQSRDAGRSPSQPRLSLTQAGRPRPTSQGRSHSSSDPYTASSRGMLPTALQNQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 QHHPGPQSRDAGRSPSQPRLSLTQAGRPRPTSQGRSHSSSDPYTASSRGMLPTALQNQDE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 DAQGSYDDDSTEVEAQDVRAPAHAARAKEAAASLPKHQQVESPTGAGAGGDHRSQRGHAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 DAQGSYDDDSTEVEAQDVRAPAHAARAKEAAASLPKHQQVESPTGAGAGGDHRSQRGHAA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 SPARPSRPGGPQSRARVPSRAAPGKSEPPSKRPLSSKSQQSVSAEDEEEEDAGFFKGGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_115 SPARPSRPGGPQSRARVPSRAAPGKSEPPSKRPLSSKSQQSVSAEDDEEEDAGFFKGGKE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 DLLSSSVPKWPSSSTPRGGKDADGSLAKEEREPAIALAPRGGSLAPVKRPLPPPPGSSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 DLLSSSVPKWPSSSTPRGGKDADGSLAKEEREPAIALAPRGGSLAPVKRPLPPPPGSSPR
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 ASHVPSRPPPRSAATVSPVAGTHPWPRYTTRAPPGHFSTTPMLSLRQRMMHARFRNPLSR
::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 ASHVPSRLPPRSAATVSPVAGTHPWPQYTTRAPPGHFSTTPMLSLRQRMMHARFRNPLSR
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 QPARPSYRQGYNGRPNVEGKVLPGSNGKPNGQRIINGPQGTKWVVDLDRGLVLNAEGRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 QPARPSYRQGYNGRPNVEGKVLPGSNGKPNGQRIINGPQGTKWVVDLDRGLVLNAEGRYL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 QDSHGNPLRIKLGGDGRTIVDLEGTPVVSPDGLPLFGQGRHGTPLANAQDKPILSLGGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 QDSHGNPLRIKLGGDGRTIVDLEGTPVVSPDGLPLFGQGRHGTPLANAQDKPILSLGGKP
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 LVGLEVIKKTTHPPTTTMQPTTTTTPLPTTTTPRPTTATTRRTTT------RRPTTTVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_115 LVGLEVIKKTTHPPTTTMQPTTTTTPLPTTTTPRPTTATTRRTTTTRRTTTRRPTTTVRT
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 TTRTTTTTTPKPTTPIPTCPPGTLERHDDDGNLIMSSNGIPECYAEEDEFSGLETDTAVP
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TTRTTTTTTPTPTTPIPTCPPGTLERHDDDGNLIMSSNGIPECYAEEDEFSGLETDTAVP
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA1 TEEAYVIYDEDYEFETSRPPTTTEPSTTATTPRVIPEEGAISSFPEEEFDLAGRKRFVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TEEAYVIYDEDYEFETSRPPTTTEPSTTATTPRVIPEEGAISSFPEEEFDLAGRKRFVAP
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA1 YVTYLNKDPSAPCSLTDALDHFQVDSLDEIIPNDLKKSDLPPQHAPRNITVVAVEGCHSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 YVTYLNKDPSAPCSLTDALDHFQVDSLDEIIPNDLKKSDLPPQHAPRNITVVAVEGCHSF
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA1 VIVDWDKATPGDVVTGYLVYSASYEDFIRNKWSTQASSVTHLPIENLKPNTRYYFKVQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VIVDWDKATPGDVVTGYLVYSASYEDFIRNKWSTQASSVTHLPIENLKPNTRYYFKVQAQ
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 NPHGYGPISPSVSFVTESDNPLLVVRPPGGEPIWIPFAFKHDPSYTDCHGRQYVKRTWYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 NPHGYGPISPSVSFVTESDNPLLVVRPPGGEPIWIPFAFKHDPSYTDCHGRQYVKRTWYR
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA1 KFVGVVLCNSLRYKIYLSDNLKDTFYSIGDSWGRGEDHCQFVDSHLDGRTGPQSYVEALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 KFVGVVLCNSLRYKIYLSDNLKDTFYSIGDSWGRGEDHCQFVDSHLDGRTGPQSYVEALP
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1740 1750 1760 1770
pF1KA1 TIQGYYRQYRQEPVRFGNIGFGTPYYYVGWYECGVSIPGKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TIQGYYRQYRQEPVRFGNIGFGTPYYYVGWYECGVSIPGKW
1860 1870 1880 1890
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.. : . . .: :: : : . ..: : :.. .
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.. :::. : :.:::.:::: ::::.::.: .:.:: : : : .: .. :
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