Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1782, 538 aa
1>>>pF1KA1782 538 - 538 aa - 538 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4950+/-0.000935; mu= 0.2201+/- 0.056
mean_var=272.8809+/-55.485, 0's: 0 Z-trim(115.0): 863 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.077640
statistics sampled from 14546 (15528) to 14546 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44917.1 IKZF4 gene_id:64375|Hs108|chr12 ( 585) 3667 424.1 2.2e-118
CCDS2395.1 IKZF2 gene_id:22807|Hs108|chr2 ( 526) 1487 179.9 6.5e-45
CCDS46507.1 IKZF2 gene_id:22807|Hs108|chr2 ( 500) 1096 136.1 9.6e-32
CCDS75596.1 IKZF1 gene_id:10320|Hs108|chr7 ( 519) 995 124.8 2.5e-28
CCDS58540.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 475) 726 94.6 2.8e-19
CCDS11346.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 509) 720 94.0 4.6e-19
CCDS11349.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 470) 713 93.1 7.5e-19
CCDS75597.1 IKZF1 gene_id:10320|Hs108|chr7 ( 432) 710 92.8 8.9e-19
CCDS59055.1 IKZF1 gene_id:10320|Hs108|chr7 ( 477) 698 91.5 2.4e-18
CCDS11351.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 431) 569 77.0 5.1e-14
CCDS58539.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 436) 552 75.1 1.9e-13
CCDS11348.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 470) 546 74.4 3.2e-13
CCDS11347.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 453) 539 73.6 5.4e-13
CCDS58544.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 422) 537 73.4 6e-13
CCDS58541.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 288) 500 69.1 8e-12
CCDS74055.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 262) 496 68.6 1e-11
CCDS58542.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 327) 496 68.7 1.2e-11
CCDS78233.1 IKZF1 gene_id:10320|Hs108|chr7 ( 432) 498 69.0 1.3e-11
CCDS58543.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 366) 496 68.7 1.3e-11
CCDS58545.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 375) 496 68.8 1.3e-11
CCDS11350.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 ( 414) 496 68.8 1.4e-11
>>CCDS44917.1 IKZF4 gene_id:64375|Hs108|chr12 (585 aa)
initn: 3667 init1: 3667 opt: 3667 Z-score: 2238.9 bits: 424.1 E(32554): 2.2e-118
Smith-Waterman score: 3667; 99.2% identity (99.6% similar) in 528 aa overlap (11-538:58-585)
10 20 30 40
pF1KA1 MDIEDCNGRSYVSGSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQH
. .::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DNLERDPSGGCVPDFLPQAQDSNHFIMESLFCESSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQH
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 SSPSRSLSANSIKVEMYSDEESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPLGYCDGSGPEPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSPSRSLSANSIKVEMYSDEESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPLGYCDGSGPEPH
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 SPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIK
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 LHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHK
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 ERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRST
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 PQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLP
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 PTNCISELTPVISSVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTNCISELTPVISSVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGA
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SPSNGCQDSTDTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPSNGCQDSTDTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLR
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 GTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHS
510 520 530 540 550 560
530
pF1KA1 QDRYEFSSHIVRGEHKVG
::::::::::::::::::
CCDS44 QDRYEFSSHIVRGEHKVG
570 580
>>CCDS2395.1 IKZF2 gene_id:22807|Hs108|chr2 (526 aa)
initn: 1624 init1: 811 opt: 1487 Z-score: 919.8 bits: 179.9 E(32554): 6.5e-45
Smith-Waterman score: 1935; 55.0% identity (75.6% similar) in 542 aa overlap (1-535:1-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDIEDCNGRSYVSGSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQHSSPSRSLSANSIKVEMYSDE
:. : .: :.. ... : :.: . . . ::::.::.:::. :.::.:.:: :::
CCDS23 METEAIDG--YITCDNELSPEREHSNMAIDLTSSTPNGQHASPSHMTSTNSVKLEMQSDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 ESSRL-LGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPLGYCDGSG-PEPHSPGGIRLPNGKLKCDVCG
: .: :. .... .:.. .:. : : :. : .. ::::::::::::::::
CCDS23 ECDRKPLSREDEIRGHDEGSSLEEPLIESSEVADNRKVQELQGEGGIRLPNGKLKCDVCG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 MVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS23 MVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCSYACR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEA--QA
:::::::::::::: :::.:::::::::::.:.:::::::::::::..: :: :.
CCDS23 RRDALTGHLRTHSV-----GKPHKCNYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQNVSMEAAGQV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LAGQ--PGDEIRDLEMVPDSMLHSSS-ERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFS
.. . : .. .. : . :. . :::. :..:.... ::: :::::::::: ::::
CCDS23 MSHHVPPMEDCKEQEPIMDNNISLVPFERPAVIEKLTGNMGKRKSSTPQKFVGEKLMRFS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 LSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVIS
:. .:.: :::..::. : .. .........::: :.:: : . :.:..::::
CCDS23 YPDIHFDMNLT-YEKEAELMQSHMMDQAINNAITYLGAEALHPLMQHPPSTIAEVAPVIS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGASPSNGCQDSTDTE
:.:.:. :.:.: : :::.... :. :: : ::.. . :::::.: ::::.:
CCDS23 SAYSQVYH-PNRIERPISRETADSHENNMDGPISLIRPKSRPQEREASPSNSCLDSTDSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVV
:.:.:. . :: : : ..:::: ::: : . .. : :.. .:
CCDS23 SSHDDHQSY-----QGHPALNPKR----KQSPAYMKEDVKALD-TTKAPKGSLKDIYKVF
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRG
. :: ..::::::::.:::::::.::::::::.:::.:::::::.::::::::::::::
CCDS23 NGEGEQIRAFKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGYRDPLECNICGYRSQDRYEFSSHIVRG
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 EHKVG
::
CCDS23 EHTFH
>>CCDS46507.1 IKZF2 gene_id:22807|Hs108|chr2 (500 aa)
initn: 1380 init1: 567 opt: 1096 Z-score: 683.4 bits: 136.1 E(32554): 9.6e-32
Smith-Waterman score: 1681; 50.2% identity (70.8% similar) in 542 aa overlap (1-535:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDIEDCNGRSYVSGSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQHSSPSRSLSANSIKVEMYSDE
:. : .: :.. ... : :.: . . . ::::.::.:::. :.::.:.:: :::
CCDS46 METEAIDG--YITCDNELSPEREHSNMAIDLTSSTPNGQHASPSHMTSTNSVKLEMQSDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 ESSRL-LGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPLGYCDGSG-PEPHSPGGIRLPNGKLKCDVCG
: .: :. .... .:.. .:. : : :. : .. ::::::::
CCDS46 ECDRKPLSREDEIRGHDEGSSLEEPLIESSEVADNRKVQELQGEGGIRLPNG--------
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 MVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS46 ------------------ERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCSYACR
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEA--QA
:::::::::::::: :::.:::::::::::.:.:::::::::::::..: :: :.
CCDS46 RRDALTGHLRTHSV-----GKPHKCNYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQNVSMEAAGQV
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LAGQ--PGDEIRDLEMVPDSMLHSSS-ERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFS
.. . : .. .. : . :. . :::. :..:.... ::: :::::::::: ::::
CCDS46 MSHHVPPMEDCKEQEPIMDNNISLVPFERPAVIEKLTGNMGKRKSSTPQKFVGEKLMRFS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 LSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVIS
:. .:.: :::..::. : .. .........::: :.:: : . :.:..::::
CCDS46 YPDIHFDMNLT-YEKEAELMQSHMMDQAINNAITYLGAEALHPLMQHPPSTIAEVAPVIS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGASPSNGCQDSTDTE
:.:.:. :.:.: : :::.... :. :: : ::.. . :::::.: ::::.:
CCDS46 SAYSQVYH-PNRIERPISRETADSHENNMDGPISLIRPKSRPQEREASPSNSCLDSTDSE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVV
:.:.:. . :: : : ..:::: ::: : . .. : :.. .:
CCDS46 SSHDDHQSY-----QGHPALNPKR----KQSPAYMKEDVKALD-TTKAPKGSLKDIYKVF
390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRG
. :: ..::::::::.:::::::.::::::::.:::.:::::::.::::::::::::::
CCDS46 NGEGEQIRAFKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGYRDPLECNICGYRSQDRYEFSSHIVRG
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 EHKVG
::
CCDS46 EHTFH
500
>>CCDS75596.1 IKZF1 gene_id:10320|Hs108|chr7 (519 aa)
initn: 1444 init1: 694 opt: 995 Z-score: 622.0 bits: 124.8 E(32554): 2.5e-28
Smith-Waterman score: 1697; 51.1% identity (72.5% similar) in 546 aa overlap (1-536:1-515)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MDIEDCNGRSYVSGS-----GDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNS-QHSSPSRSLSANSIKV
:: .. . : :::. .:. : . :. ..:: .. :.:: : . :...::
CCDS75 MDADEGQDMSQVSGKESPPVSDTPDEGDE-PMPIPEDLSTTSGGQQSSKSDRVVASNVKV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 EMYSDEESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPL-GYCDGSGPEPHSP-GGIRLPNGKL
: ::::..: . . .: .. :. .: . : .: : ::::::::::
CCDS75 ETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRML--DASGEKMNGSHRDQGSSALSGVGGIRLPNGKL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPF
:::.::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: .
CCDS75 KCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 CNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLST
:::::::::::::::::::: :::.::.::::::::.:.::::::::::::.:..
CCDS75 CNYACRRRDALTGHLRTHSV-----GKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLESMGL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRF
. .: .: ::. : . . .::: .::::....::: : ::::.:.:
CCDS75 PG-TLYPVIKEETNHSEMAED-LCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFLGDK----
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 SLSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPL-RLPPTNCISELTPV
.::: ::: .:..:::. :.. : .. ...... ..::: :::: . :: . ::..::
CCDS75 GLSDTPYD-SSASYEKENEMMKSHVMDQAINNAINYLGAESLRPLVQTPPGG--SEVVPV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ISSVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLA-DGGPLLYRPRGPLTDPGASPSNGCQDST
:: .: .:: :. ..... .: : .. :: . . .. :::::.:::::
CCDS75 ISPMYQLHKPLA-----EGTPRSNHSAQDSAVENLLLLSKAKLVPSEREASPSNSCQDST
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 DTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVL
:::::.:.. .:.. : . :. . . .. :: :::.. :...:
CCDS75 DTESNNEEQRSGLIYLTNHIAPHARNGLSLKEEHRAY---------DLLRAASENSQDAL
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 RVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHI
:::. ::: .:..::::::.:::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS75 RVVSTSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHI
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VRGEHKVG
.::::.
CCDS75 TRGEHRFHMS
510
>>CCDS58540.1 IKZF3 gene_id:22806|Hs108|chr17 (475 aa)
initn: 1261 init1: 550 opt: 726 Z-score: 459.7 bits: 94.6 E(32554): 2.8e-19
Smith-Waterman score: 1410; 46.8% identity (68.8% similar) in 513 aa overlap (33-536:4-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 IEDCNGRSYVSGSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQHSSPSRSLSAN-SIKVEMYSDEE
..: .:. .:. :. :.::. ::
CCDS58 MEDIQTNAELKSTQEQSVPADDSMKVK---DEY
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KA1 SSRLLGPDERLLEKDDSVIVED-----SLSEPLGYCDGSGPEPH--SPGGIRLPNGKLKC
: : :: .:... .:. : :. . .. : : : . : .::..:
CCDS58 SER----DENVLKSEPMGNAEEPEIPYSYSREYNEYENIKLERHVVSFDSSRPTSGKMNC
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCN
::::. ::. ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::: .::
CCDS58 DVCGLSCISFNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHTGEKPFKCHLCN
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 YACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEA
:::.:::::::::::::: :::::..:::::::.:.::::::::...::: .
CCDS58 YACQRRDALTGHLRTHSVE-----KPYKCEFCGRSYKQRSSLEEHKERCRTFLQSTD---
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 QALAGQPGDEIR-DLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFS
::: . . . : .::: .::::....::: : ::::.:::. :
CCDS58 ------PGDTASAEARHIKAEM---GSERALVLDRLASNVAKRKSSMPQKFIGEKRHCF-
200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 LSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVIS
:. :. .: :::. ::. . .. .........::: :::: : ::..::::
CCDS58 --DVNYN-SSYMYEKESELIQTRMMDQAINNAISYLGAEALRPLVQTPPAPTSEMVPVIS
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGASPSNGCQDSTDTE
:.: :. : .. .. .:..: . : . : .. : ::.:. .:::::.
CCDS58 SMY----PI----ALTRAEMSNGAPQELEKKSIHLPEKSVP-SERGLSPNNSGHDSTDTD
310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVV
::::.: . . : .. .:.. :: :. : ::. : .. ..:.
CCDS58 SNHEERQNHIYQ-------QNHMVLSRARNGMPLLKEVPRSYE-LLKPPPICPRDSVKVI
360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRG
.. :: . ...:.:::.::::.:::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::.::
CCDS58 NKEGEVMDVYRCDHCRVLFLDYVMFTIHMGCHGFRDPFECNMCGYRSHDRYEFSSHIARG
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 EHKVG
::.
CCDS58 EHRALLK
470
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20 30 40 50 60 70
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.. ..... .:.::. :: : : ::
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.:... .:. : :. . .. : : : . : .::..:::::. ::.
CCDS11 NVLKSEPMGNAEEPEIPYSYSREYNEYENIKLERHVVSFDSSRPTSGKMNCDVCGLSCIS
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::: .:::::.:::::
CCDS11 FNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHTGEKPFKCHLCNYACQRRDAL
130 140 150 160 170 180
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::::::::: :::::..:::::::.:.::::::::...::: . :::
CCDS11 TGHLRTHSVE-----KPYKCEFCGRSYKQRSSLEEHKERCRTFLQSTD---------PGD
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. . . : .::: .::::....::: : ::::.:::. : :. :. .
CCDS11 TASAEARHIKAEM---GSERALVLDRLASNVAKRKSSMPQKFIGEKRHCF---DVNYN-S
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pF1KA1 SGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPL
: :::. ::. . .. .........::: :::: : ::..:::::.: :
CCDS11 SYMYEKESELIQTRMMDQAINNAISYLGAEALRPLVQTPPAPTSEMVPVISSMY----P-
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. : .. .. .:..: . : . : .. : ::.:. .:::::.::::.:
CCDS11 ---IALTRAEMSNGAPQELEKKSIHLPEKSVP-SERGLSPNNSGHDSTDTDSNHEERQNH
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pF1KA1 VVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVVGESGEPVKA
. . : .. .:.. :: :. : ::. : .. ..:... :: . .
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..:.:::.::::.:::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::.::::.
CCDS11 YRCDHCRVLFLDYVMFTIHMGCHGFRDPFECNMCGYRSHDRYEFSSHIARGEHRALLK
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.. ..... .:.::. :: : : ::
CCDS11 SVPAESAAVLNDYSLTKSHEMENVDSGEGPANEDEDIGDDSMKVK---DEYSER----DE
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pF1KA1 RLLEKDDSVIVED-----SLSEPLGYCDGSGPEPH--SPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIG
.:... .:. : :. . .. : : : . : .::..:::::. ::.
CCDS11 NVLKSEPMGNAEEPEIPYSYSREYNEYENIKLERHVVSFDSSRPTSGKMNCDVCGLSCIS
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::: .:::::.:::::
CCDS11 FNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHTGEKPFKCHLCNYACQRRDAL
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 TGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGD
::::::::: :::::..:::::::.:.::::::::...::: . :::
CCDS11 TGHLRTHSVE-----KPYKCEFCGRSYKQRSSLEEHKERCRTFLQSTD---------PGD
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pF1KA1 EIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNS
.:::. : :. :. .:
CCDS11 -----------------------------------------TGEKRHCF---DVNYN-SS
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:::. ::. . .. .........::: :::: : ::..:::::.: :
CCDS11 YMYEKESELIQTRMMDQAINNAISYLGAEALRPLVQTPPAPTSEMVPVISSMY----P--
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. : .. .. .:..: . : . : .. : ::.:. .:::::.::::.: .
CCDS11 --IALTRAEMSNGAPQELEKKSIHLPEKSVP-SERGLSPNNSGHDSTDTDSNHEERQNHI
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. : .. .:.. :: :. : ::. : .. ..:... :: . ..
CCDS11 YQ-------QNHMVLSRARNGMPLLKEVPRSYE-LLKPPPICPRDSVKVINKEGEVMDVY
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.:.:::.::::.:::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::.::::.
CCDS11 RCDHCRVLFLDYVMFTIHMGCHGFRDPFECNMCGYRSHDRYEFSSHIARGEHRALLK
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CCDS75 KCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHL
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:::::::::::::::::::
CCDS75 CNYACRRRDALTGHLRTHS-----------------------------------------
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::.
CCDS75 ---------GDK------------------------------------------------
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.::: ::: .:..:::. :.. : .. ...... ..::: :::: . :: . ::..::
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:: .: .:: :. ..... .: : .. :: . . .. :::::.:::::
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:::::.:.. .:.. : . :. . . .. :: :::.. :...:
CCDS75 DTESNNEEQRSGLIYLTNHIAPHARNGLSLKEEHRAY---------DLLRAASENSQDAL
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pF1KA1 RVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHI
:::. ::: .:..::::::.:::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::
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.::::.
CCDS75 TRGEHRFHMS
430
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:: .. . : :::. .:. : . :. ..:: .. :.:: : . :...::
CCDS59 MDADEGQDMSQVSGKESPPVSDTPDEGDE-PMPIPEDLSTTSGGQQSSKSDRVVASNVKV
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pF1KA1 EMYSDEESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPL-GYCDGSGPEPHSP-GGIRLPNGKL
: ::::..: . . .: .. :. .: . : .: : ::::::::::
CCDS59 ETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRML--DASGEKMNGSHRDQGSSALSGVGGIRLPNGKL
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 KCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPF
:::.::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: .
CCDS59 KCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHL
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pF1KA1 CNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLST
:::::::::::::::::::: ..: : :.
CCDS59 CNYACRRRDALTGHLRTHSV-----------------------IKE--ETNHS-------
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pF1KA1 EAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRF
::. : . . .::: .::::....::: : ::::.:.:
CCDS59 ----------------EMAED-LCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFLGDK----
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pF1KA1 SLSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPL-RLPPTNCISELTPV
.::: ::: .:..:::. :.. : .. ...... ..::: :::: . :: . ::..::
CCDS59 GLSDTPYD-SSASYEKENEMMKSHVMDQAINNAINYLGAESLRPLVQTPPGG--SEVVPV
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pF1KA1 ISSVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLA-DGGPLLYRPRGPLTDPGASPSNGCQDST
:: .: .:: :. ..... .: : .. :: . . .. :::::.:::::
CCDS59 ISPMYQLHKPLA-----EGTPRSNHSAQDSAVENLLLLSKAKLVPSEREASPSNSCQDST
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pF1KA1 DTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVL
:::::.:.. .:.. : . :. . . .. :: :::.. :...:
CCDS59 DTESNNEEQRSGLIYLTNHIAPHARNGLSLKEEHRAY---------DLLRAASENSQDAL
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pF1KA1 RVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHI
:::. ::: .:..::::::.:::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS59 RVVSTSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHI
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pF1KA1 VRGEHKVG
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CCDS59 TRGEHRFHMS
470
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CCDS11 SVPAESAAVLNDYSLTKSHEMENVDSGEGPANEDEDIGDDSMKVK---DEYSER----DE
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pF1KA1 RLLEKDDSVIVED-----SLSEPLGYCDGSGPEPH--SPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIG
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CCDS11 NVLKSEPMGNAEEPEIPYSYSREYNEYENIKLERHVVSFDSSRPTSGKMNCDVCGLSCIS
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::: .:::::.:::::
CCDS11 FNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHTGEKPFKCHLCNYACQRRDAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 TGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGD
::::::::
CCDS11 TGHLRTHS----------------------------------------------------
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CCDS11 ------------------------------------------GEKRHCF---DVNYN-SS
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pF1KA1 GGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPLP
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CCDS11 YMYEKESELIQTRMMDQAINNAISYLGAEALRPLVQTPPAPTSEMVPVISSMY----P--
220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGASPSNGCQDSTDTESNHEDRVAGV
. : .. .. .:..: . : . : .. : ::.:. .:::::.::::.: .
CCDS11 --IALTRAEMSNGAPQELEKKSIHLPEKSVP-SERGLSPNNSGHDSTDTDSNHEERQNHI
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAF
. : .. .:.. :: :. : ::. : .. ..:... :: . ..
CCDS11 YQ-------QNHMVLSRARNGMPLLKEVPRSYE-LLKPPPICPRDSVKVINKEGEVMDVY
330 340 350 360 370
490 500 510 520 530
pF1KA1 KCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRGEHKVG
.:.:::.::::.:::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::.::::.
CCDS11 RCDHCRVLFLDYVMFTIHMGCHGFRDPFECNMCGYRSHDRYEFSSHIARGEHRALLK
380 390 400 410 420 430
538 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]