Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1780
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1780, 1140 aa
1>>>pF1KA1780 1140 - 1140 aa - 1140 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5431+/-0.00171; mu= 19.2993+/- 0.103
mean_var=306.0156+/-56.565, 0's: 0 Z-trim(108.5): 241 B-trim: 43 in 2/49
Lambda= 0.073317
statistics sampled from 10023 (10279) to 10023 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 4.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 8809 947.7 0
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 5224 568.4 3.1e-161
CCDS78055.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 ( 567) 4568 498.5 1.8e-140
CCDS30892.1 PEAR1 gene_id:375033|Hs108|chr1 (1037) 3159 350.0 1.7e-95
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 2276 256.9 2.7e-67
CCDS45564.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 ( 569) 950 115.9 2.8e-25
CCDS11007.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 ( 830) 950 116.1 3.4e-25
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 880 109.6 9.6e-23
CCDS46666.1 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 ( 866) 838 104.3 1.3e-21
CCDS13779.2 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 ( 871) 838 104.3 1.3e-21
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 830 103.7 2.7e-21
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 754 95.7 7e-19
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 745 95.1 1.7e-18
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 661 86.3 8.8e-16
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 621 81.9 1.5e-14
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 617 81.8 2.3e-14
CCDS54772.1 FRAS1 gene_id:80144|Hs108|chr4 (1976) 532 72.6 1e-11
CCDS54771.1 FRAS1 gene_id:80144|Hs108|chr4 (4012) 532 73.1 1.5e-11
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075) 519 71.5 3.3e-11
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122) 512 70.8 5.6e-11
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9 (1575) 506 69.7 6.3e-11
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 501 69.1 9.2e-11
>>CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140 aa)
initn: 8809 init1: 8809 opt: 8809 Z-score: 5057.3 bits: 947.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8809; 100.0% identity (100.0% similar) in 1140 aa overlap (1-1140:1-1140)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 NLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 CSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 VSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>>CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044 aa)
initn: 5532 init1: 5092 opt: 5224 Z-score: 3008.2 bits: 568.4 E(32554): 3.1e-161
Smith-Waterman score: 5531; 59.8% identity (79.0% similar) in 1128 aa overlap (1-1126:1-1041)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
::.::.. ..: .. .. :: ::::::::::::.::::::: ::::::::: :
CCDS10 MVLSLTGLIAF------SFLQATLALNPEDPNVCSHWESYAVTVQESYAHPFDQIYYTRC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
:::::::::::::.::.::::.: .:::::.::::::.::::..:.: :...::::::..
CCDS10 TDILNWFKCTRHRISYKTAYRRGLRTMYRRRSQCCPGYYESGDFCIPLCTEECVHGRCVS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
:.::.::::::: .:::.::.:::::::..::::.:::::::::::: :::::::::::.
CCDS10 PDTCHCEPGWGGPDCSSGCDSDHWGPHCSNRCQCQNGALCNPITGACVCAAGFRGWRCEE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
: ::.:. :. :::..::.:: .::: : :::::..::.:::::.:: .:: ::::
CCDS10 LCAPGTHGKGCQLPCQCRHGASCDPRAGECLCAPGYTGVYCEELCPPGSHGAHCELRCPC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
::::.:::.::::.:: :: :.::.:::: : ::.::::.: ::.:: :: .::::::.
CCDS10 QNGGTCHHITGECACPPGWTGAVCAQPCPPGTFGQNCSQDCPCHHGGQCDHVTGQCHCTA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
:: :.:::.::: :..: :.. :.: :::.: ..::: :: :. : ::. :::::::.
CCDS10 GYMGDRCQEECPFGSFGFQCSQHCDCHNGGQCSPTTGACECEPGYKGPRCQERLCPEGLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
: : ::: .:: ::::..: :.:.::::: .:::.: :.::..:: :.::::::
CCDS10 GPGCTLPCPCDADNTISCHPVTGACTCQPGWSGHHCNESCPVGYYGDGCQLPCTCQNGAD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
: :.:: ::::::: : :.. : :::: :::: :.:.: ..::::::::::: ::.:.
CCDS10 CHSITGGCTCAPGFMGEVCAVSCAAGTYGPNCSSICSCNNGGTCSPVDGSCTCKEGWQGL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
::.. :::::::..:: .: : ::.::. .::.:.:.::: :. ::::: :::.::::.:
CCDS10 DCTLPCPSGTWGLNCNESCTCANGAACSPIDGSCSCTPGWLGDTCELPCPDGTFGLNCSE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
.::::::::: :.:::: :: ::.:..:::.: ::::::::. : :.::.::::.:: :
CCDS10 HCDCSHADGCDPVTGHCCCLAGWTGIRCDSTCPPGRWGPNCSVSCSCENGGSCSPEDGSC
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
:::::::: ::::: :::::: :.: :: ::::: :::::.:.:.:::::.:::::.::
CCDS10 ECAPGFRGPLCQRICPPGFYGHGCAQPCPLCVHSSRPCHHISGICECLPGFSGALCNQVC
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
.: ::..:: .:.:.:::::.::: ::::.:::::.:::: :::. ::: :.:.:.:::
CCDS10 AGGYFGQDCAQLCSCANNGTCSPIDGSCQCFPGWIGKDCSQACPPGFWGPACFHACSCHN
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
:: ::: :: :.::::::::.:::::: .:.::::. .:::::::.::::::.:::::::
CCDS10 GASCSAEDGACHCTPGWTGLFCTQRCPAAFFGKDCGRVCQCQNGASCDHISGKCTCRTGF
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
:.::::.: ::.::::.:.:.:.:::::::.:::::::::.:: :::::.... .::
CCDS10 TGQHCEQRCAPGTFGYGCQQLCECMNNSTCDHVTGTCYCSPGFKGIRCDQAALMME-ELN
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890
pF1KA1 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSM-PAVTYTPAM
.. : :: :. ...::..::..:..... ::.:: .:..:: : .. : :.:::::
CCDS10 PYTKISPALGAERHSVGAVTGIMLLLFLIVVLLGLFAWHRRRQKEKGRDLAPRVSYTPAM
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 RVVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLF
:....::..::. :. ::
CCDS10 RMTSTDYSLSGA------------------------CGM-------DR------------
900 910
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 VNLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSS
... :. : :..:: :.: .::
CCDS10 -------------------------RQNTYI------------MDKGFKDYMKESVCSSS
920 930
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 NCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEP
.:::.:::::::::::::.: : : .:::::::.. :::... . ...:.:.:::::
CCDS10 TCSLNSSENPYATIKDPPILTCKLPESSYVEMKSPVHMGSPYTDVPSLSTSNKNIYEVEP
940 950 960 970 980 990
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 TVSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDS-SSSPKQEDSGGSSSNSSSS
:::::: ..:. :. ::::.::::: ::::::::.: ...:.:.
CCDS10 TVSVVQEGCGHNSSYIQNAYDLPRNSHIPGHYDLLPVRQSPANGPSQDKQS
1000 1010 1020 1030 1040
1140
pF1KA1 SE
>>CCDS78055.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (567 aa)
initn: 5753 init1: 4568 opt: 4568 Z-score: 2635.5 bits: 498.5 E(32554): 1.8e-140
Smith-Waterman score: 4568; 99.8% identity (100.0% similar) in 566 aa overlap (1-566:1-566)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
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CCDS78 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
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pF1KA1 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
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pF1KA1 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
:::::::::::::::::::::::::.
CCDS78 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGLF
550 560
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: : : . : :::.::. :: .:.. ::: ::::: .::: ::..:::
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:::.::: ::: ::: : .::: : :::.: . :.: :.. :.: .:.: : .:..
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: . : : :: :. ::::. :: :: :: : :: :: :. : : : :
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pF1KA1 QRCPCQNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQ
. :::::: . : :::: :::::.:. ::::: : ::::::.::::: :: :::
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:.:.:::::.::..::::: .: :::::.:. ..:. ..:::::: ::.:.:: :::
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:.:.::..:. : : :.. :::::.:::.: :::.::.:::.: .: .::. : :
CCDS30 PDGFYGLSCQAPCTCDREHSLSCHPMNGECSCLPGWAGLHCNESCPQDTHGPGCQEHCLC
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pF1KA1 QNGADCDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKA
.:. :....: : ::::. : :.. :: :::.:::.::.:.: .:::.:: :.::
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::. .::. :: :::::.:: .::: . ..:. :.:::.:::.: .:.::: : .:
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pF1KA1 DDGICECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGAL
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CCDS30 ENGNCVCAPGFRGPSCQRSCQPGRYGKRC-----------------------VP------
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pF1KA1 CNEVCPSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHT
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CCDS30 -----------------CKCANHSFCHPSNGTCYCLAGWTGPDCSQPCPPGHWGENCAQT
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pF1KA1 CNCHNGAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCT
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CCDS30 CQCHHGGTCHPQDGSCICPLGWTGHHCLEGCPLGTFGANCSQPCQCGPGEKC--------
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CCDS30 --------HPE---------------------------TGACVCPPGHSGAPCR------
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pF1KA1 VGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTY
.: . .. :. :. ..::. :: .: .:. :.:::: ::: ::::: ::.:
CCDS30 IGIQEPFTVMPTT-PVAYNSLGAVIGIAVLGSLVVALVALFIGYRHWQKGKEHHHLAVAY
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pF1KA1 TPAMRVVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKN
. . :. ...:.. . : . :::..:::::::.::. .: :.
CCDS30 SSG-RLDGSEYVMPDVPP------SYSHYYSNPSYHTLSQCSPNPPPPNK--------VP
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pF1KA1 NQLFVNLKNVN-PGKRGPVG-DCTGTLPADWKH-----GGYLNELGAFGLDRSYM-----
. ::..:.: . :: : : : :::::::: : :.. :. :::::
CCDS30 GPLFASLQNPERPG--GAQGHDNHTTLPADWKHRREPPPGPLDR-GSSRLDRSYSYSYSN
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pF1KA1 GKSL---KDLGKNSEYNSSNCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSP
: . : : .. : ..: :::: :::::::.: : : : .:.:::.: . :
CCDS30 GPGPFYNKGLISEEELGASVASLSS-ENPYATIRDLPSLPGGPRESSYMEMKGPPSGSPP
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pF1KA1 YAEINNSTSANRNVYEVEPTVSVVQGVFSNNGRL--------SQDP---------YDLPK
. : : .: . .:.. . . : :: : :: ::
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pF1KA1 NSHIPCHYDLLPVRDSSSSP-KQEDSGGSSSNSSSSSE
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CCDS30 NSHIPGHYDLPPVRHPPSPPLRRQDR
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pF1KA1 GWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCEDRCEQGTYG
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CCDS41 PDCSHPCNCSAGHGSCDAISGLCLCEAGYVGPRCEQQCPQGHFGPGCEQRCQCQHGAACD
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CCDS41 HVSGACTCPAGWRGTFCEHACPAGFFGLDCRSACNCTAGAACDAVNGSCLCPAGRRGPRC
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pF1KA1 QDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLYGIKCDKR
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CCDS41 AETCPAHTYGHNCSQACACFNGASCDPVHGQCHCAPGWMGPSC-LQACPAGLYGDNCRHS
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pF1KA1 CPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGADCDSVTGK
: : .: .: :.::.::: ::.:: :.. : : .:.. .: ::. :: ::.
CCDS41 CLC--QNGGTCDPVSGHCACPEGWAGLACEKECLPRDVRAGCRHSGGCLNGGLCDPHTGR
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CCDS41 CLCPAGWTGDKCQSPCLRGWFGEACAQRCSCPPGAACHHVTGACRCPPGFTGSGCEQACP
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pF1KA1 SGTWGFGCNLTCQCLN-GGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAERCDCSH
:..: : ::: . . ::. :::.:: :..: .:. : : :: .: . : : .
CCDS41 PGSFGEDCAQMCQCPGENPACHPATGTCSCAAGYHGPSCQQRCPPGRYGPGCEQLCGCLN
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pF1KA1 ADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGICECAPGF
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CCDS41 GGSCDAATGACRCPTGFLGTDCNLTCPQGRFGPNCTHVCGCGQGAACDPVTGTCLCPPGR
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pF1KA1 RGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVCPSGRFG
:. :.: : . .: : .:: .: ...: :: .: :.: :.:: :. .:: ::.:
CCDS41 AGVRCERGCPQNRFGVGCEHTC-SC-RNGGLCHASNGSCSCGLGWTGRHCELACPPGRYG
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pF1KA1 KNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHNGAFCSA
: :.: ::.::.: .:.: ::. :. : .::::. : .: : :..:: :.
CCDS41 AACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFYGQACEHPCPPGFHGAGCQGLCWCQHGAPCDP
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KA1 YDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGFMGRHCE
.:.: : :. : .: . : : .:. : :.:..:: :: ..: : : : : :.
CCDS41 ISGRCLCPAGFHGHFCERGCEPGSFGEGCHQRCDCDGGAPCDPVTGLCLCPPGRSGATCN
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KA1 QKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLNSLSRTS
: : .: .: ::: ... :: ..: :.: :. : : ..: . . . ::.. :
CCDS41 LDCRRGQFGPSCTLHCDCGGGADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREGGPLRLPENPSLAQGS
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KA1 TA-LPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMRVVNAD
.. :::.:
CCDS41 AGTLPASSRPTSRSGGPARH
1530 1540
>--
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pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQ
::. :.::.. : : .. . ...
CCDS41 AAGRAVVLALVLLLLPAVPVGASVPPRPLLPLQPGMPHVCAEQELTLVGRRQPCVQALSH
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 ---IYYTSCTDILNWFKCTRH--RVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESG--EMCVP
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CCDS41 TVPVWKAGC-GWQAW--CVGHERRTVYYMGYRQVYTTEARTVLRCCRGWMQQPDEEGCLS
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CCDS41 AECSASLCFHGGRCVPGSAQPCHCPPGFQGPRCQYDVDECRTHNGG-CQHRC------VN
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pF1KA1 NPITGACHCAAGFR----GWRCE--DRCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPP
.: . :.: ::: . : . : :. : :...: : : : .:.: :
CCDS41 TPGSYLCECKPGFRLHTDSRTCLAINSCALGNGG--CQHHC-VQLTIT-RH---RCQCRP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 GYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPCQN-GGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRF
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CCDS41 GFQ--LQED----GRH---CVRRSPCANRNGSCMH---RCQVVRGLA-------------
240 250 260
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pF1KA1 GKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSPGYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCY
.:.:: : :: :. : ::: .: ::..: :
CCDS41 ------RCECHVGYQL-AADGKA-CED-------VDECAAGL--------AQCAHG--CL
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CCDS41 NTQGSFKCVCHAGYE----------LGADGRQCYR---IEMEIVNSCEANNGGCSHGCSH
310 320 330 340
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CCDS41 TSAGPLC--TCPRGYELDTDQRTCIDVDDCADSPCCQQV---CTNNPG--GYECG--CYA
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pF1KA1 GTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCT--CKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLN
: : .. .. :::.. :. :.: : . .:: : .: :. :.
CCDS41 G-YRLSADG-CGCEDVDECASSRGGCEHHCTNLAGSFQCS--CEAGYRLHEDRRGCSPLE
400 410 420 430 440 450
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. ::: . : . ::: :: : . : .. : : : .
CCDS41 EPMVD-LDGELPFVRPLPHIAVLQDELPQLFQDDDVGADEEE----AELRGEHTLTEKFV
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:: :: .: .::: : :.::..: :: :.: :. : :.. :
CCDS41 CLD-------DS------FGHDCSLTCDDCRNGGTCLLGLDG-CDCPEGWTGLICNETCP
520 530 540 550
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pF1KA1 PGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVCPSGRFGKNCAGICTCT
: .:. :: .: .: ...: : .:: : : :: .:. :.. ::.: .::.: :.:.
CCDS41 PDTFGKNCSFSC-SC-QNGGTCDSVTGACRCPPGVSGTNCEDGCPKGYYGKHCRKKCNCA
560 570 580 590 600 610
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pF1KA1 NNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNC---HNGAFCSAYDGECKC
: : :. . .: : :: : : ::: .::.: . :.: :. . :. :: :.:
CCDS41 NRGRCHRLYGACLCDPGLYGRFCHLTCPPWAFGPGCSEECQCVQPHTQS-CDKRDGSCSC
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pF1KA1 TPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQC--TCRTGFMGRHCEQKCPS
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CCDS41 KAGFRGERCQAECELGYFGPGCWQACTCPVGVACDSVSGECGKRCPAGFQGEDCGQECPV
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pF1KA1 GTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLNSLSRTSTALPA
::.: .: . :.: ... : .:: : : :: : :.
CCDS41 GTFGVNCSSSCSC-GGAPCHGVTGQCRCPPGRTGEDCEADCPEGRWGLGCQEICPACQHA
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pF1KA1 DSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMRVVNADYTISGT
CCDS41 ARCDPETGACLCLPGFVGSRCQDVCPAGWYGPSCQTRCSCANDGHCHPATGHCSCAPGWT
800 810 820 830 840 850
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. :. :.:.::. :..::: : :..::: : : :. . :.: ::::.: : : ::
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: : : .: :: .:: :.: ::. .. :. : ::.
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.. :...:: : : :: .:. :: .:.:: :. :. .:.: :
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::. : .::..: .:: : .: .:: : : :: : ::: :: :
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.:..: . : : .... : : .: : .:.:::.: :.. : :: .::.:.: : :
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..: :. ::.: : ::. : : ::: ::.: .:.: : .. :. : :.:.:.
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::. : .:. ::.: : .:.. :.: .: :. ..:.: . : : .:
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:: : : : : . . :. .:. . . . :: . .:::
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: : : .: :: .:: :.: ::. .. :. : ::.
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.. :...:: : : :: .:. :: .:.:: :. :. .:.: :
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..: :. ::.: : ::. : : ::: ::.: .:.: : .. :. : :.:.:.
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::. : .:. ::.: : .:.. :.: .: :. ..:.: . : : .:
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:: : : : : . . :. .:. . . . :: . .:::
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:.:. : : .:.:.::..::.:. : . : :.::..: .
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:.:: : ::. . :: :: :. :..: . .: : :.:::
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CCDS90 IDI-------DDCSST-PCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDP---DP-
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.: ::.:. : : .:: . : :. .: :: : .: .: ::::. :
CCDS90 NGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG---ICMDGINRYSC-------VCSPGFTG
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pF1KA1 GWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCN-PITGACHCAAGFRGWRCE-DRCEQGT
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CCDS46 PLLPSLLLLLLLWMLPDTVAPQELNPRGRNVCRAPGSQVPTCCAG---WRQQGDECGIAV
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CCDS46 ----CEGNSTCSENEVCVR-PGECRCRHGYFGANCDTKCPRQFWGPDCKELCSCHPHGQC
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CCDS46 EDVTGQCTCHAR-------------RWGARCEHACQCQHG-TCHPRSGACRCEPGW----
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CCDS46 ---------WGAQCASACYCSATSRCDPQTGACLCHAGWWGRSCNNQCACNSSPCEQQSG
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CCDS46 RCQCRERTFGARCDRYCQCF---RGRCHPVDGTCACEPGYRGKYCREPCPAGFYGLGCRR
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