Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1779
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1779, 1210 aa
1>>>pF1KA1779 1210 - 1210 aa - 1210 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8662+/-0.00123; mu= -12.0444+/- 0.073
mean_var=424.5802+/-88.512, 0's: 0 Z-trim(112.8): 53 B-trim: 76 in 1/50
Lambda= 0.062244
statistics sampled from 13454 (13493) to 13454 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72695.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1210) 8130 745.5 1.8e-214
CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201) 8023 735.9 1.4e-211
CCDS76097.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1191) 6972 641.5 3.5e-183
CCDS11131.1 PER1 gene_id:5187|Hs108|chr17 (1290) 1765 174.0 2.2e-42
CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255) 1543 154.0 2.1e-36
>>CCDS72695.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1210 aa)
initn: 8130 init1: 8130 opt: 8130 Z-score: 3964.0 bits: 745.5 E(32554): 1.8e-214
Smith-Waterman score: 8130; 99.8% identity (99.9% similar) in 1210 aa overlap (1-1210:1-1210)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EMKKYFPSERRNKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVSMYSLEELAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EMKKYFPSERRNKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVSMYSLEELAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 IASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVEETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVEETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHVPPPETARDATLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHVPPPETARDATLFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EPWTLNMQPAPLTSEEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYSSYLQQESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EPWTLNMQPAPLTSEEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYSSYLQQESR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATSPGREYAAPGTAPEGLHGPPLSEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS72 SAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATSPGREYAAPGTAPEGLHGLPLSEG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQEEMPRPSESPDRMRRNTCPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS72 PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQEEMPRPSESPDQMRRNTCPQT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 EYQCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EYQCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 TSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 EDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KA1 CGQVLVEDSC
::::::::::
CCDS72 CGQVLVEDSC
1210
>>CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201 aa)
initn: 4573 init1: 3135 opt: 8023 Z-score: 3912.1 bits: 735.9 E(32554): 1.4e-211
Smith-Waterman score: 8023; 99.1% identity (99.2% similar) in 1210 aa overlap (1-1210:1-1201)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EMKKYFPSERRNKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVSMYSLEELAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EMKKYFPSERRNKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVSMYSLEELAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 IASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHH
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AHTARAQLPFWNNWTQRAA-RYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHH
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVEETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVEETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSP
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGE-------CKTFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIP
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHVPPPETARDATLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHVPPPETARDATLFC
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EPWTLNMQPAPLTSEEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYSSYLQQESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EPWTLNMQPAPLTSEEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYSSYLQQESR
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCP
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATSPGREYAAPGTAPEGLHGPPLSEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS89 SAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATSPGREYAAPGTAPEGLHGLPLSEG
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQEEMPRPSESPDRMRRNTCPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS89 PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQEEMPRPSESPDQMRRNTCPQT
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 EYQCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTG
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EY-CVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTG
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 TSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 EDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210
pF1KA1 CGQVLVEDSC
::::::::::
CCDS89 CGQVLVEDSC
1200
>>CCDS76097.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1191 aa)
initn: 7872 init1: 6489 opt: 6972 Z-score: 3402.1 bits: 641.5 E(32554): 3.5e-183
Smith-Waterman score: 7942; 98.3% identity (98.3% similar) in 1210 aa overlap (1-1210:1-1191)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EMKKYFPSERRNKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVSMYSLEELAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EMKKYFPSERRNKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVSMYSLEELAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 IASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVEETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVEETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHVPPPETARDATLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHVPPPETARDATLFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EPWTLNMQPAPLTSEEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYSSYLQQESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EPWTLNMQPAPLTSEEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYSSYLQQESR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATSPGREYAAPGTAPEGLHGPPLSEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS76 SAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATSPGREYAAPGTAPEGLHGLPLSEG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQEEMPRPSESPDRMRRNTCPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS76 PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQEEMPRPSESPDQMRRNTCPQT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 EYQCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTG
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EY-CVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTG------------------
970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 TSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLK
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 EDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210
pF1KA1 CGQVLVEDSC
::::::::::
CCDS76 CGQVLVEDSC
1190
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20 30 40 50 60 70
pF1KA1 GAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERRN
:::. : :...::. ...:.: .: :::.
CCDS11 QSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRG
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120
pF1KA1 K--PSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILS-QNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSK
: .:: .:.::: ::..::::.:..: : ..: : . :.: :.:::: :.::.: .
CCDS11 KGRSGTLATLQYALACVKQVQANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQ
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQL
: ::: .. :::.::.:.::::::..: :.::. ...: .::::::. :::. :: ..:
CCDS11 NQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRL
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVH-HPAQPELE
: :.. .. ... . . : ::::::: :: ..:::. ::. ... . :
CCDS11 PTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAP---
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTS
..:::: ..:.::::::::::: .:::::: :::.:.: .:::.:.::::::::::.:.
CCDS11 AQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAP
340 350 360 370 380 390
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRK
.: .:::::: ::.:::.:.:. ::.: :.:::::::..::.:. .:.::..::.:::::
CCDS11 VLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLAGQP-FDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRK
400 410 420 430 440 450
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGS
..:..:::::::.:::::::. . . : :: ::.:::..::::::: .: .
CCDS11 VAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCG
460 470 480 490 500 510
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKS
.:. : : : .:::...: .: .:.::. .:. .:. ::::.::: ..
CCDS11 VGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARP
520 530 540 550 560 570
490 500 510 520 530
pF1KA1 SFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHS
. .: : : .:.. :. : :. .:. .. : : :.. :
CCDS11 QSRPRL-----PATGTFKAKAL-PCQ---SPDPELEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASS
580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 PSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDV
:::::::.::..:::.: :.:. :::: : .. ::::.:..:.: . : :
CCDS11 CSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPP
630 640 650 660 670 680
600 610 620 630 640
pF1KA1 QALQAGLQIPAIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHV---
.: .: : :..: :. : : .: :.. :. : :::..:::::::
CCDS11 SAALSGEG--ATPRKE-PVVG-----GTLSPLALANKAESVVSVTSQCSFSSTIVHVGDK
690 700 710 720 730
650 660 670 680 690
pF1KA1 PPPETARDATLFCEPWTLNMQPAPLTS-----------EEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQ
:::. : .. . : ::: . . .. :::: :::: :::::::
CCDS11 KPPES--DIIMMEDLPGLAPGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQ
740 750 760 770 780 790
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 NYVDKFREKILSSPYSSYLQQESRSKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPP
....::. . ..: ..:. . :: ..: :. : ::
CCDS11 AFLSRFRD--------------------LGRLRGLDSSSTAPSALGERGCHHG---PAPP
800 810 820
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pF1KA1 DSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCPSAASSPHTSSPTFP-PAAMVPSQAPYLVPAFPLPAA
. ... : ::: . : .: : :. : :. . . : .: .:::.
CCDS11 SRRHHCRSKAKRSRHHQNPRAEAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPAVVQPYPLPVF
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 TSPGREYAAPGTAPEGLHGPPLSEGLQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLP
. : .:. : :: .. : ::: : . .... ::. . : .:: :
CCDS11 S--------PRGGPQPL--PPAPTSVPP-AAFPAPLVTPMVALVLPNY-LFP--TPSSYP
890 900 910 920 930
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 CPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLDPPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQL
:: . : .: .. ::. . : . : .. .. :...:: ::::::
CCDS11 ---YGALQTPAEGPPTPASHSPSPSLPALAPSPPHRPDS--------PLFNSRCSSPLQL
940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 NLLQ-EEMPRPSESPDRMRRNTCPQTEYQCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHP
:::: ::.:: .: :.:. :: ..: :: . ..:
CCDS11 NLLQLEELPR---------------AEGAAVAGGPGSSAGPP---------PPSAEAAEP
990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 TASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLS
: . .. ::: :: . . : . : : . . .. .
CCDS11 EARLAEVTESSNQD-------ALS-GSSDLLELLLQEDSRSGTGSAASGSLGSGLGSGSG
1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 TGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIW
.:: . : : . . .: :: .: :. .:. ::. .. .. ... : ..:::
CCDS11 SGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYF-GSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIW
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 RMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQ
.. .. .:..:::::: : :::.: :.:..:..:::.::. :..::. :..:...
CCDS11 LLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1180 1190 1200 1210
pF1KA1 TVTQEIDIQACVTCENEDSADGAATSCGQVLVEDSC
. . .:..::: : . . :
CCDS11 QLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGC
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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10 20 30 40
pF1KA1 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPE-FHLQRKLADSSH-----
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CCDS25 SSGHETNENCSTGRDSQGSDCDDSGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLM--MAKSEHNPSTS
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90
pF1KA1 ---SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERR--NKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFF
:.:... . .::: ...:.: ..:.... .: ::: .:.:::: :..:.:: :..
CCDS25 GCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYY
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 QIL-SQNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALIL
:.: :..: : ::: :..::. ...::: ::.: :... :..::....::.:.: :.
CCDS25 QLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIF
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 NRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIR
. :.:......::..:::.:. ::.. :. .::.:. . . :: : ::::.
CCDS25 HCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 GGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHHPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIF
.....: . :::. :::..:. : ::. ::: ..:..:::::::::: .::::
CCDS25 VRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD--QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIF
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 TTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPP
::::::.:.: .:::.::::::::::::: : .: ::: :: ::.:::.:.:. .:.:
CCDS25 TTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQP-
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA----TKI
:..::::: ..::.:: ::.:::::.:::::::::::::::::..:::::::: :.
CCDS25 FDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEE
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 KKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE
: .. . : :: :::..:::::: : :::::::::.::.:.:.: .:::...:: :
CCDS25 KALHPS---IQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGH--E
460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECK
... .. .. . :: :: .. . :: ... : :: .:.: . : :
CCDS25 DSRRRRA---EICKNGNKTKNRSHYSH-ESGEQKK-KSVTEMQTNPPA---------EKK
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 TFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPA-LKRKCISC
. ... :.. . : : ... . :::::.:.:::::::.: : : :::::
CCDS25 AVPAME---KDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFP
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620
pF1KA1 TNTTSSSSEEDKQNHKADDVQALQAGLQIPAIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAM--
.:. . : ::. :: . .:: : : :.. :.: :: :. .. : :.
CCDS25 ANVPALRSS-DKR--KATVSPGPHAG---EAEPPSRV--NSR---TGVGT-HLTSLALPG
620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KA1 --LSLGSGISQCGYSSTIVHV----PPPETARDATLFCEPWTLNMQPAP-----LTSEE-
:..: :::.:::::::: : :: : .:. .: :..:.
CCDS25 KAESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKE
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pF1KA1 -FKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFRE----KILSSPYSSYLQQESRSKAKYSYFQGD
::..::: ::.::::::::....::.: .:..: :::..:... . :
CCDS25 PFKKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGL
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780
pF1KA1 STSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPE-PPDSSSSNTGSGPRRGAHQ-----NAQPCCPSAASS
... : . ::... : . : .:: .:::: .:. :: :: .:
CCDS25 RNTSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTS-
780 790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATS-----PGREYAAPGTAPEGLHGPPLSEG
..: :. : : :: : : .:.:: :.... : ...:.. . : . .
CCDS25 -QSSCPAVPFPAPVP--AAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQH----QFA
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLD
.:: : :: : : :. .::. : .:. :: :. . . :...: :. . .
CCDS25 VQP-PPFPAP-LAPVMAFMLPSYSF-PSGTPN-LPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQ
900 910 920 930 940
910 920 930 940
pF1KA1 PP-PSVTSQRREEEKWEA------QSEGH---PFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPRPSESP
: :: :: :. : .. :. :.. ::::::::::::: :: :. . .
CCDS25 PEFPSRTSIPRQPCACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTG-
950 960 970 980 990 1000
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 DRMRRNTCPQTEYQCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPRENPSHPTASALSTGSPPMKNP
. :..:. . :. . . :. ..:. : :. : .
CCDS25 ---------------AMGTTGATETAAVGADCKPGTSRDQQPKAP----LTRDEPSDTQN
1010 1020 1030 1040
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 SHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPP---SESPSRT
: .::::.: . :.. : . . .:. : :: . ::: .
CCDS25 S----DALSTSS-----------GLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSGSLGCDASPSGA
1050 1060 1070 1080 1090
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 GSAASGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPN-VAEEPIWRMIRQTPERIL
:: : .: .: :. .:. ::. ....... ....: : . : ..::: .. .. ..
CCDS25 GS--SDTSHTSKYF-GSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLMADADSSVM
1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 MTYQVPERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQAC
::::.: : :.::::: :::. ... ::.:...::.:: .:..:.:. . ::. :
CCDS25 MTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLPAAIDVAEC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190 1200 1210
pF1KA1 VTCENEDSADGAATSCGQVLVEDSC
: :::.....
CCDS25 VYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
1210 1220 1230 1240 1250
1210 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:49:44 2016 done: Fri Nov 4 01:49:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]