Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1776, 2809 aa
1>>>pF1KA1776 2809 - 2809 aa - 2809 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1519+/-0.00154; mu= 19.3323+/- 0.092
mean_var=228.4128+/-43.409, 0's: 0 Z-trim(107.9): 254 B-trim: 11 in 1/51
Lambda= 0.084862
statistics sampled from 9564 (9839) to 9564 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 7.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 21452 2642.5 0
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 14009 1731.3 0
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 12732 1574.9 0
CCDS9831.1 LTBP2 gene_id:4053|Hs108|chr14 (1821) 1604 212.3 2.1e-53
CCDS33177.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1721) 1308 176.0 1.6e-42
CCDS33178.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1395) 1237 167.2 5.9e-40
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 1195 162.3 2.6e-38
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 1171 159.4 2.3e-37
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 1151 156.7 9.4e-37
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 1151 156.7 9.5e-37
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 1151 156.8 9.6e-37
CCDS54345.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1342) 1137 154.9 2.8e-36
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 1099 150.4 7.7e-35
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 1082 148.2 3e-34
CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1303) 959 133.1 1e-29
CCDS8103.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1256) 851 119.9 9.4e-26
CCDS4800.1 SCUBE3 gene_id:222663|Hs108|chr6 ( 993) 762 108.9 1.5e-22
CCDS14048.1 SCUBE1 gene_id:80274|Hs108|chr22 ( 988) 747 107.0 5.5e-22
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 745 106.7 6.3e-22
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 745 106.8 6.4e-22
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 712 102.7 1e-20
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 694 101.1 8.8e-20
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2 (4599) 698 101.9 9e-20
CCDS81553.1 SCUBE2 gene_id:57758|Hs108|chr11 ( 999) 661 96.5 8.2e-19
CCDS46761.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1231) 652 95.5 2e-18
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 643 94.4 4.3e-18
CCDS53599.1 SCUBE2 gene_id:57758|Hs108|chr11 ( 807) 639 93.7 4.7e-18
CCDS7797.2 SCUBE2 gene_id:57758|Hs108|chr11 ( 971) 632 92.9 9.4e-18
CCDS44864.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 815) 628 92.3 1.2e-17
CCDS8746.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 816) 628 92.3 1.2e-17
CCDS53781.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 839) 628 92.4 1.2e-17
CCDS44863.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 866) 628 92.4 1.2e-17
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 612 90.5 5.4e-17
CCDS31888.1 STAB2 gene_id:55576|Hs108|chr12 (2551) 599 89.4 2.8e-16
CCDS54784.1 NPNT gene_id:255743|Hs108|chr4 ( 582) 586 87.0 3.4e-16
CCDS54787.1 NPNT gene_id:255743|Hs108|chr4 ( 536) 581 86.3 5e-16
CCDS34046.1 NPNT gene_id:255743|Hs108|chr4 ( 565) 581 86.4 5.2e-16
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 585 88.2 1.5e-15
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 579 87.1 1.7e-15
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 579 87.1 1.7e-15
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 547 82.6 1.5e-14
CCDS14155.1 EGFL6 gene_id:25975|Hs108|chrX ( 553) 540 81.3 1.7e-14
CCDS55370.1 EGFL6 gene_id:25975|Hs108|chrX ( 554) 540 81.3 1.7e-14
CCDS9898.1 FBLN5 gene_id:10516|Hs108|chr14 ( 448) 537 80.9 1.9e-14
CCDS73268.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11 ( 753) 534 80.8 3.3e-14
CCDS7855.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11 ( 810) 534 80.8 3.5e-14
CCDS73267.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11 ( 838) 534 80.8 3.5e-14
CCDS14069.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 683) 526 79.7 6.2e-14
CCDS43028.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 566) 522 79.2 7.7e-14
CCDS14068.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 601) 522 79.2 8e-14
>>CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809 aa)
initn: 21452 init1: 21452 opt: 21452 Z-score: 14203.1 bits: 2642.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 21452; 99.9% identity (100.0% similar) in 2809 aa overlap (1-2809:1-2809)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTLEGLYLARGPLARLLLAWSALLCMAGGQGRWDGALEAAGPGRVRRRGSPGILQGPNVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTLEGLYLARGPLARLLLAWSALLCMAGGQGRWDGALEAAGPGRVRRRGSPGILQGPNVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GSRFHAYCCPGWRTFPGRSQCVVPICRRACGEGFCSQPNLCTCADGTLAPSCGVSRGSGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSRFHAYCCPGWRTFPGRSQCVVPICRRACGEGFCSQPNLCTCADGTLAPSCGVSRGSGC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SVSCMNGGTCRGASCLCQKGYTGTVCGQPICDRGCHNGGRCIGPNRCACVYGFMGPQCER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVSCMNGGTCRGASCLCQKGYTGTVCGQPICDRGCHNGGRCIGPNRCACVYGFMGPQCER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DYRTGPCFGQVGPEGCQHQLTGLVCTKALCCATVGRAWGLPCELCPAQPHPCRRGFIPNI
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CCDS12 DYRTGPCFGQVGPEGCQHQLTGLVCTKALCCATVGRAWGLPCELCPAQPHPCRRGFIPNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 HTGACQDVDECQAVPGLCQGGSCVNMVGSFHCRCPVGHRLSDSSAACEDYRAGACFSVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGACQDVDECQAVPGLCQGGSCVNMVGSFHCRCPVGHRLSDSSAACEDYRAGACFSVLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGRCAGDLAGHYTRRQCCCDRGRCWAAGPVPELCPPRGSNEFQQLCAQRLPLLPGHPGLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GGRCAGDLAGHYTRRQCCCDRGRCWAAGPVPELCPPRGSNEFQQLCAQRLPLLPGHPGLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PGLLGFGSNGMGPPLGPARLNPHGSDARGIPSLGPGNSNIGTATLNQTIDICRHFTNLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGLLGFGSNGMGPPLGPARLNPHGSDARGIPSLGPGNSNIGTATLNQTIDICRHFTNLCL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NGRCLPTPSSYRCECNVGYTQDVRGECIDVDECTSSPCHHGDCVNIPGTYHCRCYPGFQA
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CCDS12 NGRCLPTPSSYRCECNVGYTQDVRGECIDVDECTSSPCHHGDCVNIPGTYHCRCYPGFQA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TPTRQACVDVDECIVSGGLCHLGRCVNTEGSFQCVCNAGFELSPDGKNCVDHNECATSTM
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CCDS12 TPTRQACVDVDECIVSGGLCHLGRCVNTEGSFQCVCNAGFELSPDGKNCVDHNECATSTM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 CVNGVCLNEDGSFSCLCKPGFLLAPGGHYCMDIDECQTPGICVNGHCTNTEGSFRCQCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CVNGVCLNEDGSFSCLCKPGFLLAPGGHYCMDIDECQTPGICVNGHCTNTEGSFRCQCLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GLAVGTDGRVCVDTHVRSTCYGAIEKGSCARPFPGTVTKSECCCANPDHGFGEPCQLCPA
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CCDS12 GLAVGTDGRVCVDTHVRSTCYGAIEKGSCARPFPGTVTKSECCCANPDHGFGEPCQLCPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KNSAEFQALCSSGLGITTDGRDINECALDPEVCANGVCENLRGSYRCVCNLGYEAGASGK
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDSAEFQALCSSGLGITTDGRDINECALDPEVCANGVCENLRGSYRCVCNLGYEAGASGK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 DCTDVDECALNSLLCDNGWCQNSPGSYSCSCPPGFHFWQDTEICKDVDECLSSPCVSGVC
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CCDS12 DCTDVDECALNSLLCDNGWCQNSPGSYSCSCPPGFHFWQDTEICKDVDECLSSPCVSGVC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RNLAGSYTCKCGPGSRLDPSGTFCLDSTKGTCWLKIQESRCEVNLQGASLRSECCATLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RNLAGSYTCKCGPGSRLDPSGTFCLDSTKGTCWLKIQESRCEVNLQGASLRSECCATLGA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 AWGSPCERCEIDPACARGFARMTGVTCDDVNECESFPGVCPNGRCVNTAGSFRCECPEGL
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CCDS12 AWGSPCERCEIDPACARGFARMTGVTCDDVNECESFPGVCPNGRCVNTAGSFRCECPEGL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 MLDASGRLCVDVRLEPCFLRWDEDECGVTLPGKYRMDVCCCSIGAVWGVECEACPDPESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLDASGRLCVDVRLEPCFLRWDEDECGVTLPGKYRMDVCCCSIGAVWGVECEACPDPESL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 EFASLCPRGLGFASRDFLSGRPFYKDVNECKVFPGLCTHGTCRNTVGSFHCACAGGFALD
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CCDS12 EFASLCPRGLGFASRDFLSGRPFYKDVNECKVFPGLCTHGTCRNTVGSFHCACAGGFALD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 AQERNCTDIDECRISPDLCGQGTCVNTPGSFECECFPGYESGFMLMKNCMDVDECARDPL
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CCDS12 AQERNCTDIDECRISPDLCGQGTCVNTPGSFECECFPGYESGFMLMKNCMDVDECARDPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 LCRGGTCTNTDGSYKCQCPPGHELTAKGTACEDIDECSLSDGLCPHGQCVNVIGAFQCSC
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CCDS12 LCRGGTCTNTDGSYKCQCPPGHELTAKGTACEDIDECSLSDGLCPHGQCVNVIGAFQCSC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 HAGFQSTPDRQGCVDINECRVQNGGCDVHCINTEGSYRCSCGQGYSLMPDGRACADVDEC
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CCDS12 HAGFQSTPDRQGCVDINECRVQNGGCDVHCINTEGSYRCSCGQGYSLMPDGRACADVDEC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 EENPRVCDQGHCTNMPGGHRCLCYDGFMATPDMRTCVDVDECDLNPHICLHGDCENTKGS
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CCDS12 EENPRVCDQGHCTNMPGGHRCLCYDGFMATPDMRTCVDVDECDLNPHICLHGDCENTKGS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 FVCHCQLGYMVRKGATGCSDVDECEVGGHNCDSHASCLNIPGSFSCRCLPGWVGDGFECH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FVCHCQLGYMVRKGATGCSDVDECEVGGHNCDSHASCLNIPGSFSCRCLPGWVGDGFECH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 DLDECISQEHRCSPRGDCLNVPGSYRCTCRQGFAGDGFFCEDRDECAENVDLCDNGQCLN
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLDECVSQEHRCSPRGDCLNVPGSYRCTCRQGFAGDGFFCEDRDECAENVDLCDNGQCLN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 APGGYRCECEMGFDPTEDHRACQDVDECAQGNLCAFGSCENLPGMFRCICNGGYELDRGG
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CCDS12 APGGYRCECEMGFDPTEDHRACQDVDECAQGNLCAFGSCENLPGMFRCICNGGYELDRGG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 GNCTDINECADPVNCINGVCINTPGSYLCSCPQDFELNPSGVGCVDTRAGNCFLETHDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GNCTDINECADPVNCINGVCINTPGSYLCSCPQDFELNPSGVGCVDTRAGNCFLETHDRG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 DSGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCELCPMANTTEYRTLCPGGEGFQPNRITVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCELCPMANTTEYRTLCPGGEGFQPNRITVI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 LEDIDECQELPGLCQGGDCVNTFGSFQCECPPGYHLSEHTRICEDIDECSTHSGICGPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEDIDECQELPGLCQGGDCVNTFGSFQCECPPGYHLSEHTRICEDIDECSTHSGICGPGT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 CYNTLGNYTCVCPAEYLQVNGGNNCMDMRKSVCFRHYNGTCQNELAFNVTRKMCCCSYNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CYNTLGNYTCVCPAEYLQVNGGNNCMDMRKSVCFRHYNGTCQNELAFNVTRKMCCCSYNI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 GQAWNRPCEACPTPISPDYQILCGNQAPGFLTDIHTGKPLDIDECGEIPAICANGICINQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GQAWNRPCEACPTPISPDYQILCGNQAPGFLTDIHTGKPLDIDECGEIPAICANGICINQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 IGSFRCECPAGFNYNSILLACEDVDECGSRESPCQQNADCINIPGSYRCKCTRGYKLSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IGSFRCECPAGFNYNSILLACEDVDECGSRESPCQQNADCINIPGSYRCKCTRGYKLSPG
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 GACVGQNECREIPNVCSHGDCMDTEGSYMCLCHRGFQASADQTLCMDIDECDRQPCGNGT
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GACVGRNECREIPNVCSHGDCMDTEGSYMCLCHRGFQASADQTLCMDIDECDRQPCGNGT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 CKNIIGSYNCLCFPGFVVTHNGDCVDFDECTTLVGQVCRFGHCLNTAGSFHCLCQDGFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CKNIIGSYNCLCFPGFVVTHNGDCVDFDECTTLVGQVCRFGHCLNTAGSFHCLCQDGFEL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 TADGKNCVDTNECLSLAGTCLPGTCQNLEGSFRCICPPGFQVQSDHCIDIDECSEEPNLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TADGKNCVDTNECLSLAGTCLPGTCQNLEGSFRCICPPGFQVQSDHCIDIDECSEEPNLC
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 LFGTCTNSPGSFQCLCPPGFVLSDNGHRCFDTRQSFCFTRFEAGKCSVPKAFNTTKTRCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFGTCTNSPGSFQCLCPPGFVLSDNGHRCFDTRQSFCFTRFEAGKCSVPKAFNTTKTRCC
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 CSKRPGEGWGDPCELCPQEGSAAFQELCPFGHGAVPGPDDSREDVNECAENPGVCTNGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CSKRPGEGWGDPCELCPQEGSAAFQELCPFGHGAVPGPDDSREDVNECAENPGVCTNGVC
2050 2060 2070 2080 2090 2100
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CCDS12 VNTDGSFRCECPFGYSLDFTGINCVDTDECSVGHPCGQGTCTNVIGGFECACADGFEPGL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
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CCDS12 MMTCEDIDECSLNPLLCAFRCHNTEGSYLCTCPAGYTLREDGAMCRDVDECADGQQDCHA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RGMECKNLIGTFACVCPPGMRPLPGSGEGCTDDNECHAQPDLCVNGRCVNTAGSFRCDCD
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CCDS12 EGFQPSPTLTECHDIRQGPCFAEVLQTMCRSLSSSSEAVTRAECCCGGGRGWGPRCELCP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPGTSAYRKLCPHGSGYTAEGRDVDECRMLAHLCAHGECINSLGSFRCHCQAGYTPDATA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TTCLDMDECSQVPKPCTFLCKNTKGSFLCSCPRGYLLEEDGRTCKDLDECTSRQHNCQFL
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CCDS12 LQLGRRRPGPGTYRLEVVSHMAGPWGVQPEGQPGPWGQALRLKVQLQLL
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:.: ::: : .:::: .: :..:. ::::. ::::.
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: .:: :: :::.:...:: . ::. .:: : :: : :.::..: . .: :
CCDS34 IGTIPEACPVRGSEEYRRLCMDGLPMGGIPGSAGSRPG--GTGGNGFAPSGNGNGYGPGG
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pF1KA1 VDECIVSGGLCHLGRCVNTEGSFQCVCNAGFELSPDGKNCVDHNECATSTMCVNGVCLNE
.:::: .: ::. ::::::.:::::.:::::::. ::::::::.::.:..::.::.:.::
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::::.:.:::::.:::.:.:: :.:::::::::.:::: :.::::::.: ::::: :::
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::::::.::::::.:.:: :.:::::.::::::::::::.::::::: :::::::::..:
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::::.:::.::::::::::::..::::.:::::::::: :: ::: :::..: :.:::
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.:.:::.:. .: .:.:: ::::::.::.::::::..::.:.::::::::::::::::::
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pF1KA1 EIDPACARGFARMTGVTCDDVNECESFPGVCPNGRCVNTAGSFRCECPEGLMLDASGRLC
:.: :: ::.::. ::::.:::::: ::::::::::::. :::.::::::: ::..::.:
CCDS34 ELDTACPRGLARIKGVTCEDVNECEVFPGVCPNGRCVNSKGSFHCECPEGLTLDGTGRVC
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.:.:.: :.:.:::::: .:::.:::.:::..::.::.::: :: : . :. .:::::
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pF1KA1 LGFASR-DFLSGRPFYKDVNECKVFPGLCTHGTCRNTVGSFHCACAGGFALDAQERNCTD
:::.: : :.:::::::.::::.:::.::.: ::::.:::.: : .::::: .::::::
CCDS34 AGFANRGDVLTGRPFYKDINECKAFPGMCTYGKCRNTIGSFKCRCNSGFALDMEERNCTD
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::::::::::::.: ::::::::::::: :::::::.::::::.::: :.:::::::::.
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::.::..:.:: ::::. . : ::.::::::.:: .:.:::.::..::::. :.:.::
CCDS34 NTEGSFQCDCPLGHELSPSREDCVDINECSLSDNLCRNGKCVNMIGTYQCSCNPGYQATP
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CCDS34 DRQGCTDIDECMIMNGGCDTQCTNSEGSYECSCSEGYALMPDGRSCADIDECENNPDICD
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:.:::.:: .::::::::::. ::.::.::.::::: .::. :.::::::::.::::::
CCDS34 GGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLG
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: :.::.:::.::::::.:.:::: :::::::::::.: : ::.:.:..: ::::: .
CCDS34 YSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCLNIPGSFKCSCREGWIGNGIKCIDLDECSNG
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pF1KA1 EHRCSPRGDCLNVPGSYRCTCRQGFAGDGFFCEDRDECAENVDLCDNGQCLNAPGGYRCE
:.:: ..:.:.::::::.: .::.:::: : : ::::::..::.::::::.::.::::
CCDS34 THQCSINAQCVNTPGSYRCACSEGFTGDGFTCSDVDECAENINLCENGQCLNVPGAYRCE
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pF1KA1 CEMGFDPTEDHRACQDVDECAQGNLCAFGSCENLPGMFRCICNGGYELDRGGGNCTDINE
::::: :. : :.:::.:::. :.:.::.:.::::::.:::. :::::: :::::::.:
CCDS34 CEMGFTPASDSRSCQDIDECSFQNICVFGTCNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDE
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::::.::.::.:.:::: : :.:: ::.:::.::::::.:.:::.:. :::...::..
CCDS34 CADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGNCYLKFGPRGDGSLSCNT
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::::::.:.:::::::.::::::: :: .:.::: :::::::::.:: ::.:::::::::
CCDS34 EIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTEYYTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQ
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CCDS34 ELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEDTRICEDIDECFAHPGVCGPGTCYNTLGNY
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CCDS34 TCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTTCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKP
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pF1KA1 CEACPTPISPDYQILCGNQAPGFLTDIHTGKPLDIDECGEIPAICANGICINQIGSFRCE
:: :::: . :.. .::: ::: :::::: .::::: :::.:::::.:::::::::::
CCDS34 CEPCPTPGTADFKTICGN-IPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCE
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pF1KA1 CPAGFNYNSILLACEDVDECGSRESPCQQNADCINIPGSYRCKCTRGYKLSPGGACVGQN
::.::.::..::.:::.:::.. .. ::.:::::: ::::::.:. :.::::.:::: .:
CCDS34 CPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRN
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pF1KA1 ECREIPNVCSHGDCMDTEGSYMCLCHRGFQASADQTLCMDIDECDRQPCGNGTCKNIIGS
:: ::::::::: :.: .:::.:.:: ::.:: :::.:::.:::.:.::::::::: .::
CCDS34 ECLEIPNVCSHGLCVDLQGSYQCICHNGFKASQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGS
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CCDS34 YNCLCYPGFELTHNNDCLDIDECSSFFGQVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTPDGKNC
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CCDS34 IDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSENCIDINECDEDPNICLFGSCTN
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CCDS34 NECAQNPLLCAFRCMNTFGSYECTCPIGYALREDQKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKN
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pF1KA1 LIGTFACVCPPGMRPLPGSGEGCTDDNECHAQPDLCVNGRCVNTAGSFRCDCDEGFQPSP
::::: :.::::: : .::::.:.:::...: .: :::::: ::.::.:.:::: :
CCDS34 LIGTFMCICPPGMARRP-DGEGCVDENECRTKPGICENGRCVNIIGSYRCECNEGFQSSS
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pF1KA1 TLTECHDIRQGPCFAEVLQTMCRSLSSSSEAVTRAECCCGGGRGWGPRCELCPLPGTSAY
. ::: : ::: ::::::::.:. ::: . ::..:::: :::::: .:::::::::. :
CCDS34 SGTECLDNRQGLCFAEVLQTICQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGHQCELCPLPGTAQY
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2520 2530 2540 2550 2560 2570
pF1KA1 LVSSGHGCEDVNECDGPHRCQHGCQNQLGGYRCSCPQGFTQHSQWAQCVDENECALSPPT
: ..: .::::.::.: ::::::::: .::::::::::. :: :: :::::::: ::
CCDS32 LDQTGSSCEDVDECEGNHRCQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENEC-LSAHI
2560 2570 2580 2590 2600 2610
2580 2590 2600 2610 2620 2630
pF1KA1 CGSASCRNTLGGFRCVCPSGFDFDQALGGCQDVDECAGRRGPCSYSCANTPGGFLCGCPQ
::.:::.::::...:.::.::...: :::::..::.. ..::::.:.:: ::.:::::
CCDS32 CGGASCHNTLGSYKCMCPAGFQYEQFSGGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYLCGCPP
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2640 2650 2660 2670 2680 2690
pF1KA1 GYFRAGQGHCVSGLGFSPGPQDTPDKEEL----LSSEACYECKINGLSPRDRPRRSAHR-
:::: ::::::::.:.. : . : . :. :: :::::::::: : : :::...
CCDS32 GYFRIGQGHCVSGMGMGRGNPEPPVSGEMDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNET
2680 2690 2700 2710 2720 2730
2700 2710 2720 2730 2740
pF1KA1 -----------DHQVNLATLDSEALLTLGLNLSHLGRAERILELRPALEGLEGRIRYVIV
. .:.::. : : ...:.::.. ::::: ::: : .. ::.:
CCDS32 DASNIEDQSETEANVSLASWDVEKTAIFAFNISHVSNKVRILELLPALTTLTNHNRYLIE
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pF1KA1 RGNEQGFFRMHHLRGVSSLQLGRRRPGPGTYRLEVVSH--MAGPWGVQPEGQ------PG
:::.:::.... .:.: :.. ...: ::: :.. : . : : . :
CCDS32 SGNEDGFFKINQKEGISYLHFTKKKPVAGTYSLQISSTPLYKKKELNQLEDKYDKDYLSG
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2800
pF1KA1 PWGQALRLKVQLQLL
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CCDS32 ELGDNLKMKIQVLLH
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CCDS98 LCENVEGSFLCLCASDLEEYDAQEGHCRPRGAGGQSMSEAPTGDHAPAPTRMDCYSGQKG
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CCDS98 HAPCSSVLGRNTTQAECCCTQGASWGDACDLCPSEDSAEFSEICPSGKGYIPVEGAWTFG
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.. : ::: . :::: .: :.:: .. : : ::.: . . ::: :::. . :
CCDS98 QTMYTDADECVIFGPGLCPNGRCLNTVPGYVCLCNPGFHYDASHKKCEDHDECQDLA--C
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CCDS98 ENGECVNTEGSFHCFCSPPLTLDLSQ-QRCMNSTSSTEDLPDHDIHMDICWKKVTNDVCS
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pF1KA1 NEL-AFNVTRKMCCCSYNIGQAWNRPCEACPTPISPDYQILCG------NQAPG--FLTD
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CCDS98 EPLRGHRTTYTECCCQD--GEAWSQQCALCPPRSSEVYAQLCNVARIEAEREAGVHFRPG
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pF1KA1 IHTGK-PLDIDECGEIPAICANGI-CINQIGSFRCECPAGFNYNSILLACEDVDECGSRE
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CCDS98 YEYGPGPDDLHYSIYGP----DGAPFYNYLGP-EDTVPEPAFPNT---AGHSADRTPILE
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pF1KA1 SPCQQNADCINIPGSYRCKCTRGYKLSPGGACVGQNECREIPNVCSHGDCMDTEGSYMCL
:: : :. . . . .. :.: : : : : : .: :. .. .: :
CCDS98 SPLQ--------PSELQPHYVASHPEPPAGFEGLQAEECGILNGCENGRCVRVREGYTCD
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pF1KA1 CHRGFQASADQTLCMDIDECD--RQP---CGNGTCKNIIGSYNCLCFPGFVVTHNGDCVD
: .::: .: . :.:..::: : : .: :.: ::: : : ::.:
CCDS98 CFEGFQLDAAHMACVDVNECDDLNGPAVLCVHGYCENTEGSYRCHCSPGYVAEAGPPHCT
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pF1KA1 FDECTTLVGQVCRFGHCLNTAGSFHCLCQDGFELTADGKNCVDTNECLSLAGTCLPGTCQ
CCDS98 AKE
1820
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pF1KA1 CRNLAGSYTCKCGPGSRLDPSGTFCLDSTKGTCWLKIQESRCEVNLQGASLRSECCATLG
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CCDS33 PVQKTQTIHSTYSHQQVIPHVYPVAAKTQLGRCFQETIGSQCGKALPGLSKQEDCCGTVG
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CCDS33 TSWGFNKCQKCPKKPSYHGYNQMMECLPGYKRVNNTFCQDINECQ-LQGVCPNGECLNTM
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CCDS33 GSYRCTCKIGFGPDPTFSSCVPDPPVISEEKGPCYRLVSSGRQCMHPLSVHLTKQLCCCS
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CCDS33 VGKAWGPHCEKCPLPGTAAFKEICPGGMGYTVSGVHRRRPIHHHVGKGPVFVKPKNTQPV
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pF1KA1 CRNT-------------VGSFHCACAGGFA---------------LDAQERN--------
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CCDS33 AKSTHPPPLPAKEEPVEALTFSREHGPGVAEPEVATAPPEKEIPSLD-QEKTKLEPGQPQ
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pF1KA1 ----------------------------------------------CTDIDECRISPDLC
:.:.:: ..::.:
CCDS33 LSPGISTIHLHPQFPVVIEKTSPPVPVEVAPEASTSSASQVIAPTQVTEINECTVNPDIC
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CCDS33 GAGHCINLPVRYTCICYEGYRFSEQ-QRKCVDIDECTQVQHLCSQGRCENTEGSFLCICP
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pF1KA1 PGHELTAKGTACEDIDECSLSDGLCPHGQCVNVIGAFQCS-CHAGFQSTPDRQGCVDINE
: . .:: : :.::: : .: .:.:::..:::.: : .:.. : .: : ::.:
CCDS33 AGFMASEEGTNCIDVDEC-LRPDVCGEGHCVNTVGAFRCEYCDSGYRMT-QRGRCEDIDE
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pF1KA1 CRVQNGGC-DVHCINTEGSYRC-SCGQGYSLMPDGRACADVDECEENPRVCDQGHCTNMP
: .. . : : .:.:. :::.: : .:. .:. : ::::: : : :: .: :.:.
CCDS33 C-LNPSTCPDEQCVNSPGSYQCVPCTEGFRGW-NGQ-CLDVDECLE-PNVCANGDCSNLE
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pF1KA1 GGHRCLCYDGFMATPDMRTCVDVDECDLNPHICLHGDCENTKGSFVCHCQLGYMVRKGAT
:.. : :. :. ::: . : :.:::. . ..:..:.:.::.::: : : ::.. .
CCDS33 GSYMCSCHKGYTRTPDHKHCRDIDECQQG-NLCVNGQCKNTEGSFRCTCGQGYQLSAAKD
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pF1KA1 GCSDVDECEVGGHNCDSHASCLNIPGSFSCRCLPGWVGDGF--ECHDLDECISQEHRCSP
: :.:::. : : .:..: : :::.: : :. ..:. .:.:..::. .. :.
CCDS33 QCEDIDECQ-HRHLC-AHGQCRNTEGSFQCVCDQGYRASGLGDHCEDINECLEDKSVCQ-
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pF1KA1 RGDCLNVPGSYRCTCRQGFA-GDGFFCEDRDECAENVDLCD-NGQCLNAPGGYRCECEMG
::::.:. ::: ::: .:: :. :.: .:: :. :: .:.:::. :...: :..:
CCDS33 RGDCINTAGSYDCTCPDGFQLDDNKTCQDINEC-EHPGLCGPQGECLNTEGSFHCVCQQG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KA1 FDPTEDHRACQDVDECAQGNLC-AFGSCENLPGMFRCICNGGYELDRGGGNCTDINECAD
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CCDS33 FSISADGRTCEDIDECVNNTVCDSHGFCDNTAGSFRCLCYQGFQAPQDGQGCVDVNECEL
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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CCDS33 LSGVCGEAFCENVEGSFLCVCADENQEYSPMTGQCRSRTSTDLDVDVDQPKEEKKECY--
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA1 THDRGDSGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCEL--CPMANTTEYRTLCPGGEGFQ
.. .:... :. .. .::. :::. : .::. ::. ::. .:.:. .:: :.::
CCDS33 -YNLNDASL-CDNVLAPNVTKQECCCTSGVGWGDNCEIFPCPVLGTAEFTEMCPKGKGFV
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1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 PNRITVI------LEDIDECQELPG--LCQGGDCVNTFGSFQCECPPGYHLSEHTRICED
: . .: ::: : : .:..: :.:: ...: : : . . : :
CCDS33 PAGESSSEAGGENYKDADECL-LFGQEICKNGFCLNTRPGYECYCKQGTYYDPVKLQCFD
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 IDECSTHSGICGPGTCYNTLGNYTCVCPAEYLQVNGGNNCM------------DMRKSVC
.:::. :. : : : :: :.:.: : .. . . :. :. ...:
CCDS33 MDECQDPSS-CIDGQCVNTEGSYNCFCTHPMVLDASEKRCIRPAESNEQIEETDVYQDLC
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KA1 FRHYNG--TCQNELAFN-VTRKMCCCSYNIGQAWNRPCEACPTPISPDYQILC-------
..: . .:. :. . .: ::: : :.::. : :: : :: ::
CCDS33 WEHLSDEYVCSRPLVGKQTTYTECCCLY--GEAWGMQCALCPLKDSDDYAQLCNIPVTGR
1530 1540 1550 1560 1570 1580
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pF1KA1 ----GNQA-------------PGFLTD--IHTGKPLDIDECGEIPAICANGICINQIGSF
: .: : :. : ... . :. .::: : : :: :. ..
CCDS33 RQPYGRDALVDFSEQYTPEADPYFIQDRFLNSFEELQAEECG-ILNGCENGRCVRVQEGY
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pF1KA1 RCECPAGFNYNSILLACEDVDEC---GSRESPCQQNADCINIPGSYRCKCTRGYKLSPGG
:.: :.. .. ..: ::.:: ..: : :. :: ::: :::.: : ::
CCDS33 TCDCFDGYHLDTAKMTCVDVNECDELNNRMSLCK-NAKCINTDGSYKCLCLPGYVPSDKP
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1710 1720
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CCDS33 AKSTHPPPLPAKEEPVEALTFSREHGPGVAEPEVATAPPEKEIPSLD-QEKTKLEPGQPQ
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:.:.:: ..::.:
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: : :.: : . : :. ::. . . ...:.:.:::.. :: : : ::.::. : ::
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: . .:: : :.::: : .: .:.:::..:::.: : .:.. : .: : ::.:
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: .. . : : .:.:. :::.: : .:. .:. : ::::: : : :: .: :.:.
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:.. : :. :. ::: . : :.:::. . ..:..:.:.::.::: : : ::.. .
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: :.:::. : : .:..: : :::.: : :. ..:. .:.:..::. .. :.
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::::.:. ::: ::: .:: :. :.: .:: :. :: .:.:::. :...: :..:
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CCDS33 -YNLNDASL-CDNVLAPNVTKQECCCTSGVGWGDNCEIFPCPVLGTAEFTEMCPKGKGFV
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: . .: ::: : : .:..: :.:: ...: : : . . : :
CCDS33 PAGESSSEAGGENYKDADECL-LFGQEICKNGFCLNTRPGYECYCKQGTYYDPVKLQCFD
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CCDS33 TCDCFDGYHLDTAKMTCVDVNECDELNNRMSLCK-NAKCINTDGSYKCLCLPGYVPSDKP
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CCDS33 NYCTPLNTALNLEKDSDLE
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. :: ::.: : :: :::.: :: : : : ..: :: : . : . .
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.::.::.. : : .: ::.:..:::::.:..:.. . :.: .:.: . :.
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: ::. .: .: .:.::: .. :. :
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. : ..:: :.:: ::. : : ::. : : :: .:: .: : : : .
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. . .::: :. . . : :...:: : :: :.::.. ..: : : :.
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CCDS34 DSGPSYFCHCPPGFQ-GSL---CQDHVNPCESR--PCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYD-
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CCDS34 SPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSC-GFHHCHH-GGLCLPSPKPGFPP--RCACLSGYG-
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CCDS34 -GPDCLTPPAPKGCGP-PSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRCSCPH----SSPGPRCQKPGA
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CCDS34 KGCEGRSGDGACDAG-----------CSG-PGGNWDGGDCSLGVPDPWKGCPSHSR-CWL
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: : ::.: : .: :.: .:: . : . . .:: : . .
CCDS34 LFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDC-ETPPACTPAYDQYCHDHFHNGHCEKGCNTAEC-GWD
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: .: :
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::. .:. : : .: . : : : : :: : .: : . : : . : :
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.:. .. :. ::::: . : . : : : : :: :.: :.: :: : :
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. : : ::: .: : . ..: .: . :: .: .. ::::: :
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: .:. :.: ..:.: :: : : : ...:: :. : :.: . :..: :
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.: : .. : :: .. :. :. .. ::: : .
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: . .. :. : . :. .. .::::. : : : : :...:... :.:
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: .: : ...: : .::.. : : . :. :: : :. :.. : :
CCDS90 LPYTGKNCQTVLAPCSP--------NPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQ---GQRCT
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. .:: : . .:: : .:.::::: : :: .. : : :::.: .:: :: .:
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. .....:::.:::. :: : .:..:: ... :. : : . ..:. : :: ::
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:: .: .. ::: ..:. : :: . .:: :.:: :: .. :. .:.:::
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..: :. :.. ..:: ..:::. .: . : . . . :.:: : : .:.
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. .:.:: : . : : .: . :: ..: : ::. .:: : : ::: ..: :
CCDS90 ENIDDCARGPH-C-LNGGQCMDRIGGYSCRCLPGF-----AGERCEGDINECLSNP--CS
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. : :.. .... : : .: : : ::. : ..: ::
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. : : .. : : :. . :::: .:: : .. . : :: :
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pF1KA1 RDVDECRMLAHLCAHGECINSLGSFRCHCQAGYTPDATATTCLDMDECSQVPKPCTFLCK
:. . : .: ... ::. .. :.. .:::.. :.. : .:
CCDS90 RQPPY-----YSC---QCAPPFSGSRCELYTA-PPSTPPATCLSQ-YCAD--KARDGVCD
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CCDS90 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELC-NTV-----EC-----
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pF1KA1 QHHQACFDNDECSAQPGPCGAHGHCHNTPGSFR-CECHQGFTLVSSGHGCEDVNECDGPH
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CCDS90 -----LFDNFECQGNSKTCKYDKYCAD---HFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAA-DQPE
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CCDS90 NLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAM
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.. : .. : : . .: . . : : .
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: : : . :..:.:.: ::.. . : ::::: . ::. : :.: ::. : ::
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:: : : .. :::
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::: . :: :. :: :. : : .:: :.
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:..:. :: ::.: .: : :.:::: . : :::.:.:. :.:.::: :... :
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CCDS74 PGPCADVNEC-LEGDFCFPHGECLNTDGSFACTCAPGYRPGPRGASCLDVDECSEED-LC
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..: ::: :. .:.: : : ::. .:.::::: . .: .: :::. ::. :
CCDS74 QSGICTNTDGSFECICPPGHRAGPDLASCLDVDECRERGPALCGSQRCENSPGSYRCVRD
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CCDS74 CDPGYHA--GPEGTCDDVDECQEYGPEICGAQ-RCENTPGSY------------------
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::.: : :: : : : :.: ::: .: ..: .. : :
CCDS74 --------RCTPACD----PG------YQPTPGGG--CQDVDEC-RNRSFCGAHAVCQNL
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::...: :..:.. ..: : : ::.:: :: .:. . :::. : : :.: :. :.:
CCDS74 PGSFQCLCDQGYEGARDGRHCVDVNECETLQG-VCGAALCENVEGSFLCVCPNSPEEFDP
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pF1KA1 GGGNCTDINECADPVNCINGVCINTPGSYLCSC---PQDFELNPSGV--GCVDTRAGNCF
: :. : . . : ..:.: . : . :: : : . .:.
CCDS74 MTGRCVPPRTSA---GTFPGSQPQAPASPVLPARPPPPPLPRRPSTPRQGPVGSGRRECY
1070 1080 1090 1100 1110
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..: . .:. .. .:: :::..:..::. :.. :: ..:.::..::: :.:
CCDS74 FDTA----APDACDNILARNVTWQECCCTVGEGWGSGCRIQQCPGTETAEYQSLCPHGRG
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. :. . .:.:::: . .:..: :::: ...: : ::. . : : :::
CCDS74 YLAPSGDLSLRRDVDECQLFRDQVCKSGVCVNTAPGYSCYCSNGYYYHTQRLECIDNDEC
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. . : : : ::.:.: :.: : :. :.. .. .: .::... .. .
CCDS74 ADEEPACEGGRCVNTVGSYHCTCEPPLVLDGSQRRCVSNESQSLDDNLGVCWQEVGADLV
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