Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1739
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1739, 833 aa
1>>>pF1KA1739 833 - 833 aa - 833 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7487+/-0.000947; mu= 5.7977+/- 0.057
mean_var=182.5425+/-35.604, 0's: 0 Z-trim(112.6): 56 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.094928
statistics sampled from 13273 (13326) to 13273 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 5771 803.0 0
CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 1789 257.7 6.1e-68
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 1700 245.5 2.9e-64
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 1636 236.7 1.1e-61
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 1624 235.1 3.9e-61
CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 1567 227.2 7.5e-59
CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 1395 203.7 1e-51
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 1165 172.2 3e-42
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 1158 171.2 5.3e-42
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 1139 168.6 3.4e-41
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 1132 167.7 6.8e-41
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 1099 163.2 1.6e-39
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 1054 157.0 1.2e-37
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 1049 156.3 1.8e-37
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 967 145.1 4.4e-34
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 963 144.5 6.5e-34
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 940 141.4 5.8e-33
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 927 139.6 1.8e-32
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 913 137.7 7.3e-32
CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 615) 817 124.5 5.6e-28
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 712 110.2 1.4e-23
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 711 110.0 1.6e-23
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 686 106.6 2e-22
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 686 106.7 2e-22
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 649 101.4 3.8e-21
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 649 101.5 4.6e-21
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 649 101.6 7e-21
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 649 101.6 7.1e-21
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 649 101.6 7.2e-21
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 649 101.6 7.5e-21
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 648 101.5 8e-21
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 648 101.5 8.1e-21
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 615 97.0 1.9e-19
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 615 97.0 2e-19
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 615 97.0 2.1e-19
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 594 94.1 1.4e-18
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 579 92.0 5.1e-18
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 557 89.0 4e-17
>>CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 (833 aa)
initn: 5771 init1: 5771 opt: 5771 Z-score: 4280.5 bits: 803.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5771; 100.0% identity (100.0% similar) in 833 aa overlap (1-833:1-833)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 NASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLYFNQLQAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 ERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLYFNQLQAM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HTLQDTSWHNTTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HTLQDTSWHNTTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 THLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQLFDQEPMRSLVLSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 THLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQLFDQEPMRSLVLSQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGGHSGSLLIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGGHSGSLLIQH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 VMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAGPSVTLEARAPLE
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CCDS20 GSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAGPSVTLEARAPLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 NLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 NLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RPCPEPDEKLWDPVGYYYSDGSLKIVPGHARCQPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RPCPEPDEKLWDPVGYYYSDGSLKIVPGHARCQPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KA1 GRNSNANGYVRLQLGGEDRGGLGHPLPELADELRRKLQQRQPLPDSNPEESSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GRNSNANGYVRLQLGGEDRGGLGHPLPELADELRRKLQQRQPLPDSNPEESSV
790 800 810 820 830
>>CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 (843 aa)
initn: 1648 init1: 533 opt: 1789 Z-score: 1333.2 bits: 257.7 E(32554): 6.1e-68
Smith-Waterman score: 1881; 42.8% identity (66.4% similar) in 830 aa overlap (29-821:34-830)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTL
:: :. ::. . :.: . :.. :: :
CCDS75 RLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGT-RHF-KGQAQNYSTLLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 TEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGA---ISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIR
: .. : :::: :::..: . . .:: : ::: : ...: :::::::::::: .:
CCDS75 EEASARLLVGARGALFSLSANDIG-DGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 FLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGE
::: :..:::.:::.:::: :. .. .::: . ::.:: :::::::.: .::..::
CCDS75 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTS-FEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAF-WLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDK
::.:: .: . : : :. :: :..:: . :::. .:: :. : :: .: .:::::
CCDS75 LYTATRYEFRSI-PDIRRSRHPH-SLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KA1 VYFFFRERAVE------SDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAP
::.:: :::.: .. . . :::::::::::.:: . ::.:::.:::::: : :
CCDS75 VYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 NWQLYFNQLQAMHTLQDTSWHNTTFFGVF--QAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYK
:: . :... .:. . : :...: ..:: . ::::.:.: ::: :: :::
CCDS75 ---LY-ETLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYM
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 EYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGP
::.. ...: :: :: :::::::.. : .::.:: .::. .:.::: :::: . : :
CCDS75 EYQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 RWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQL
.::::.:.. .:::.. :: : :: .::.::.:::. ::: :: .:.::: :.
CCDS75 TRGRPLLLKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 F-DQEPMRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSR
: ... ...::.: .. :..:. : ..:::...: .:::: ::.:::::::.:. .:
CCDS75 FRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KA1 CVA---VGGHS-GS--LLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTP--KNITVVAGTDLVLPC
:.: ....: :: ::: . .. . :. .:. . : : :. .:. : :..:::
CCDS75 CAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRG--CE--SSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPC
540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 HLSSNLAHARWTFGGR-DLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARL
::::.: : ..: : : : : . ...:.: :::.:.: : :..::.: :
CCDS75 DQPSNLARALWLLNGSMGLSDGQGG---YRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRT
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680
pF1KA1 AAEGYLVAVV-AGPSVTLEARA-PLENLG-----LVWLAVVALGAVCLVL---LLLVLSL
.: ..: : :. . .: : : .:. : ::..:::..::.: :: : :
CCDS75 LLASYSLTVRPATPAPAPKAPATPGAQLAPDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACL
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 R--RRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPFRPCP-EPDEKLWDPVGYYYSDGS-
: :: :.. . ..:. :. ..: . .: :: : :: : : .::
CCDS75 REGRRGRRRKYSLGRAS-RAGGSAVQL--QTVSG---QCPGEEDEG--DDEGAGGLEGSC
710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 LKIVPGHARCQPGGGPPSPPPG-IPGQPLPSPTRLHLGGGRNSNANGYVRLQLGGEDRGG
:.:.::.. : :: :::. . . . :.:: : :.:.:: :. .. .:
CCDS75 LQIIPGEGAPAPPPPPPPPPPAELTNGLVALPSRL-----RRMNGNSYVLLR---QSNNG
760 770 780 790 800 810
810 820 830
pF1KA1 LGHPLPELADELRRKLQQRQPLPDSNPEESSV
. .:.:: : :..:.
CCDS75 VPAGPCSFAEELSRILEKRKHTQLVEQLDESSV
820 830 840
>>CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 (862 aa)
initn: 1279 init1: 441 opt: 1700 Z-score: 1267.2 bits: 245.5 E(32554): 2.9e-64
Smith-Waterman score: 1700; 44.9% identity (69.7% similar) in 623 aa overlap (20-632:19-629)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTE
:. . . .:: : :. : .: . : .. .: :.:
CCDS66 MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWEHREVHLV--QFHEPDIYNYSALLLSE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 PTGLLYVGAREALFAFS-MEALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQP
::.:::::.:: . .. : : . :.. .::..: .:::..::::.:.:: :::
CCDS66 DKDTLYIGAREAVFAVNALNISEKQHEVYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 YNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSA
.:. :::::: :::: : ..:. .: . :. :::::.::.:::.......:::::::.
CCDS66 LSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFL-GKNEDGKGRCPFDPAHSYTSVMVDGELYSG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 TLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFF
: ::::.:::: :: . : ..::: ::::: :: . . .: : :.::.:::::
CCDS66 TSYNFLGSEPIISRN-SSHSPLRTEYAIPWLNEPSFVFADVIRKSPDSPDGEDDRVYFFF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLYFNQLQA
: .:: . . .. :.:::::::.:: ::::.:::.:::::: :: :. : :: :.
CCDS66 TEVSVEYEFVFRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSRPDSGLVFNVLRD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MHTLQDTSWHNTTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVF-EGPYKEYHEEAQ---KW
. .:.. . . .:...: : ... :::.: :.: ..:: .: : . : ::
CCDS66 VFVLRSPGLKVPVFYALFTPQLNNVGLSAVCAYNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 DRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVK
::. :::.::::.::.. : .:::::.:::. :.::: ::::...: : .:: :.:
CCDS66 VRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 KGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQLF-DQEPMRS
: .:.:..:.::. .:::..: :.:..: : : ::.:: ::.::: ::: : ::...
CCDS66 KDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGALHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 LVLSQSK--KLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGG-
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CCDS66 LLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHGTCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVALHQT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 HSGSL-LIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWTF
.: : :::. :..:.: .: : . . .. : : : .::::.. : :
CCDS66 ESPSRGLIQE-MSGDAS-VC----PDKSKGSYRQHFFKHGGTAELKCSQKSNLARVFWKF
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 GGRDLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAGPS
. : ::.: :. . :... . .:.:.:.:::.
CCDS66 QNGVLKAESPKYGLMGRK--NLLIFNLSEGDSGVYQCLSEERVKNKTVFQVVAKHVLEVK
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLE
CCDS66 VVPKPVVAPTLSVVQTEGSRIATKVLVASTQGSSPPTPAVQATSSGAITLPPKPAPTGTS
650 660 670 680 690 700
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10 20 30 40 50 60
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:. . . .:: : :. : .: . : .. .: :.:
CCDS47 MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWEHREVHLV--QFHEPDIYNYSALLLSE
10 20 30 40 50
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pF1KA1 PTGLLYVGAREALFAFS-MEALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQP
::.:::::.:: . .. : : . :.. .::..: .:::..::::.:.:: :::
CCDS47 DKDTLYIGAREAVFAVNALNISEKQHEVYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQP
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 YNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSA
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CCDS47 LSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFL-GKNEDGKGRCPFDPAHSYTSVMVDGELYSG
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 TLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFF
: ::::.:::: :: . : ..::: ::::: :: . . .: : :.::.:::::
CCDS47 TSYNFLGSEPIISRN-SSHSPLRTEYAIPWLNEPSFVFADVIRKSPDSPDGEDDRVYFFF
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 RERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLYFNQLQA
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CCDS47 TEVSVEYEFVFRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSRPDSGLVFNVLRD
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pF1KA1 MHTLQDTSWHNTTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVF-EGPYKEYHEEAQ---KW
. .:.. . . .:...: : ... :::.: :.: ..:: .: : . : ::
CCDS47 VFVLRSPGLKVPVFYALFTPQLNNVGLSAVCAYNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKW
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 DRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVK
::. :::.::::.::.. : .:::::.:::. :.::: ::::...: : .:: :.:
CCDS47 VRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIK
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 KGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQLF-DQEPMRS
: .:.:..:.::. .:::..: :.:..: : : ::.:: ::.::: ::: : ::...
CCDS47 KDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGALHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQT
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 LVLSQSK--KLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGGH
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CCDS47 LLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHGTCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVAL---
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 SGSLLIQHVMTSDTSG-ICNLRGSKKVRP--TPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWT
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CCDS47 -------HQTESPSRGLIQEMSGDASVCPASSPKPLPPPGSSSLSCLGHVGDRRLSSPWT
540 550 560 570 580
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pF1KA1 FGGRDLPAEQ--PGSFLYDARLQALVVMAAQPRHA-GAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVV
:: : : . : .. :: :: : .. : . :
CCDS47 ----PWPASGAGPDSSSRVSLLPPFLSDQAQHVHALGNFYLFCQATGPADIRFVWEKNGR
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pF1KA1 AGPSVTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLV
CCDS47 ALETCVPVQTHALPDGRAHALSWLQDAIRESAEYRCSVLSSAGNKTSKVQVAVMRPEVTH
650 660 670 680 690 700
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFL
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60 70 80 90 100 110
pF1KA1 TLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGA----ISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTEC
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CCDS45 ALLLSRDGRTLYVGAREALFALSSNLSFLPGGEYQELLWGADAEKKQQCSFKGKDPQRDC
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120 130 140 150 160
pF1KA1 FNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGE-----FEDGKGKCPYDPAK
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CCDS45 QNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKGNVLLEDGKGRCPFDPNF
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170 180 190 200 210 220
pF1KA1 GHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVGSAYVPESV
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CCDS45 KSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPT-KTESSLNWLQDPAFVASAYIPESL
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230 240 250 260 270 280
pF1KA1 GSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLAC
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CCDS45 GSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRWTSFLKAQLLC
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290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SAPNWQLYFNQLQAMHTLQDT--SWHNTTFFGVFQAQW--GDMYLSAICEYQLEEIQRVF
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pF1KA1 EGPYKEYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLME
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CCDS45 SGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVLNFLKDHFLMD
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pF1KA1 EQVGPRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLI
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CCDS45 GQV--R-SRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHH-TYDVLFLGTGDGRLHKAVSVGPRVHII
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pF1KA1 EELQLFDQ-EPMRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWS
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CCDS45 EELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSLYRSCGDCLLARDPYCAWS
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CCDS45 --GSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQFQPN
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pF1KA1 TDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSE
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CCDS45 TVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNASASCHVLPTGDL--LLVGTQQ---LGEFQCWSL
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pF1KA1 EQGARLAAEGYLVAVVA---------GPSV-----TLEARAPL---ENLGL---VW----
:.: . . .: :: : :: : .. :: . : :
CCDS45 EEGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVIISTSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFL
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670 680 690 700 710 720
pF1KA1 -LAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPFRPCPE
. .. . :: : .:.:. : .. :..: :. . . :. :: : . :.
CCDS45 VMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGECASVHPKTCPVVLP--PETRPLNGLGP
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730 740 750 760 770 780
pF1KA1 PDEKLWDPVGYYYSDGSLKIVPGHARCQPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLGGGRNSN
:. : : ::
CCDS45 PSTPL-DHRGYQSLSDSPPGSRVFTESEKRPLSIQDSFVEVSPVCPRPRVRLGSEIRDSV
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pF1KA1 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTL
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CCDS55 EEASARLLVGARGALFSLSANDIG-DGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
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pF1KA1 FLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGE
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CCDS55 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTS-FEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGG
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pF1KA1 LYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAF-WLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDK
::.:: .: . : : :. :: :..:: . :::. .:: :. : :: .: .:::::
CCDS55 LYTATRYEFRSI-PDIRRSRHPH-SLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDK
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 VYFFFRERAVE------SDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAP
::.:: :::.: .. . . :::::::::::.:: . ::.:::.:::::: : :
CCDS55 VYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP
240 250 260 270 280 290
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.. :... .:. . : :...: ..:: . ::::.:.: ::: :: :::
CCDS55 ----LYETLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYM
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 EYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGP
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CCDS55 EYQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVP
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pF1KA1 RWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQL
.::::.:.. .:::.. :: : :: .::.::.:::. ::: :: .:.::: :.
CCDS55 TRGRPLLLKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQV
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pF1KA1 F-DQEPMRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSR
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CCDS55 FRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHA
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pF1KA1 CVA---VGGHS-GS--LLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGT---DLVLP
:.: ....: :: ::: . .. :: .. : : . . : :. . :
CCDS55 CAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGN-------RGCESSRDTGRALQVHMGSMSPPSAWP
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pF1KA1 CHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARL
: :
CCDS55 CVLDGPETRQDLCQPPKPCVHSHAHMEECLSAGLQCPHPHLLLVHSCFIPASGLGVPSQL
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pF1KA1 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLT
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CCDS19 PGPGQPTASPFPLLLLAVLSGPVSGRVPRSVPRTSLPISEADSCLTRFAVPHTYNYSVLL
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pF1KA1 LTEPTGLLYVGAREALFAFSME-ALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRF
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CCDS19 VDPASHTLYVGARDTIFALSLPFSGERPRRIDWMVPEAHRQNCRKKGKK-EDECHNFVQI
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pF1KA1 LQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGEL
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CCDS19 LAIANASHLLTCGTFAFDPKCGVIDVSRFQ-QVERLESGRGKCPFEPAQRSAAVMAGGVL
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 YSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHS-MKTEYLAFWLNEPHFVGS-AYVPESVGSFTGDDDK
:.::..:.::::::: : .: .. ..:. : ::: : ::.. : : :. :::.
CCDS19 YAATVKNYLGTEPIITRAVGRAEDWIRTDTLPSWLNAPAFVAAVALSPAEWGDEDGDDE-
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VYFFFRERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLYF
.:::: : . : : . : :::::: ::.:: .:::..::::::: : : .:.
CCDS19 IYFFFTETSRAFDSYERIKVPRVARVCAGDLGGRKTLQQRWTTFLKADLLCPGPEHGRAS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 NQLQAMHTLQDTSWHNTT-FFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQ
. :: . .:. .: :.:.:..:: .::.: .. ..:. :..::..: ... .
CCDS19 SVLQDVAVLRPELGAGTPIFYGIFSSQWEGATISAVCAFRPQDIRTVLNGPFRELKHDCN
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pF1KA1 KWDRYTD-PVPSPRPGSCI-NNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRP
. .: ::.:::: :: :: . :: . ::: ::: .:.:.. ::::.. : : ..:
CCDS19 RGLPVVDNDVPQPRPGECITNNMKLRH-FGSSLSLPDRVLTFIRDHPLMDRPVFPADGHP
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 LLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQLFDQ-E
::: : . ..:: :::.:.: : ::..:: :: : .:: .: . ..:.: :: . .
CCDS19 LLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVLYLGTEDGHLHRAVRIGAQLSVLEDLALFPEPQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KA1 PMRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVA-V
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CCDS19 PVENMKLYHS--WLLVGSRTEVTQVNTTNCGRLQSCSECILAQDPVCAWSFRLDECVAHA
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 GGHSGSLLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWT
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CCDS19 GEHRG--LVQDIESADVSSLCPKEPGE--RPVVFEVPVATAAHVVLPCSPSSAWASCVW-
550 560 570 580 590
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pF1KA1 FGGRDLPAEQP-GSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAG
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CCDS19 --------HQPSGVTALTPRRDGLEVVVT-PGAMGAYACECQEGGAAHVVAAY--SLVWG
600 610 620 630 640
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pF1KA1 PSVTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYP
. .:: . ::. . . :.: ..:. . ::: :: : . :. . :
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. .:: : :: ::.: :.. :. : : ::: . .
CCDS19 SGTTSYSQDPP-SPSPE-DERL--PLAL-------------AKRGSGFGGFSPPFLL--D
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: :::....: :
CCDS19 PCPSPAHIRLTGAPLATCDETSI
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. . .: .. .: ::::.: .. .. :. . ::...::...:::: . :
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:.: : : :......:.... :...: ...: . :. : .:::: ::::::
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:::. .. :: .: . . . : : .. : .:. . . ... :::.
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: :. : : ..: : : : . :: :.:.. : : : : : .
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640 650 660 670 680 690
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CCDS82 ENNFKHVVTRVQLHVLGRDAVHAALFPPLSMSAPPPPGAGPPTPPYQELAQLLAQPEVGL
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CCDS82 MYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASP
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CCDS82 AGPPTPPYQELAQLLAQPEVGLIHQYCQGYWRHVPPSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRR
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CCDS74 VDPASHTLYVGARDTIFALSLPFSGERPRRIDWMVPEAHRQNCRKKGKKEDVS-----RF
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CCDS74 QQ---------------------VERL---------ESGRGKCPFEPAQRSAAVMAGGVL
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CCDS74 YAATVKNYLGTEPIITRAVGRAEDWIRTDTLPSWLNAPAFVAAVALSPAEWGDEDGDDE-
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CCDS74 IYFFFTETSRAFDSYERIKVPRVARVCAGDLGGRKTLQQRWTTFLKADLLCPGPEHGRAS
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CCDS74 SVLQDVAVLRPELGAGTPIFYGIFSSQWEGATISAVCAFRPQDIRTVLNGPFRELKHDCN
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CCDS74 RGLPVVDNDVPQPRPGECITNNMKLRH-FGSSLSLPDRVLTFIRDHPLMDRPVFPADGHP
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CCDS74 LLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVLYLGTEDGHLHRAVRIGAQLSVLEDLALFPEPQ
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CCDS74 SGTTSYSQDPP-SPSPE-DERL--PLAL-------------AKRGSGFGGFSPPFLL--D
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CCDS74 PCPSPAHIRLTGAPLATCDETSI
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833 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]