Result of FASTA (omim) for
pF1KA1685
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1685, 1435 aa
1>>>pF1KA1685 1435 - 1435 aa - 1435 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4642+/-0.000446; mu= -20.4981+/- 0.028
mean_var=468.9685+/-98.719, 0's: 0 Z-trim(122.2): 47 B-trim: 1632 in 1/60
Lambda= 0.059225
statistics sampled from 40006 (40056) to 40006 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.47), width: 16
Scan time: 17.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060733 (OMIM: 612991) putative Polycomb group p (1435) 9413 819.9 0
XP_011531252 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Po (1434) 9394 818.3 0
XP_016859918 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Po (1407) 9224 803.8 0
XP_011531253 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Po (1377) 9033 787.5 0
XP_006712102 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Po (1313) 8541 745.4 6.5e-214
XP_006712103 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Po (1175) 7718 675.1 8.7e-193
XP_016859919 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Po (1175) 7718 675.1 8.7e-193
XP_011524512 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2192) 767 81.3 9.1e-14
XP_016881503 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2192) 767 81.3 9.1e-14
XP_011524514 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2192) 767 81.3 9.1e-14
XP_011524515 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2192) 767 81.3 9.1e-14
XP_016881502 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2192) 767 81.3 9.1e-14
XP_011524511 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2192) 767 81.3 9.1e-14
XP_011524508 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2222) 767 81.3 9.2e-14
XP_016881501 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2222) 767 81.3 9.2e-14
XP_011524507 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2240) 767 81.3 9.3e-14
NP_085135 (OMIM: 615115,615485) putative Polycomb (2248) 767 81.3 9.3e-14
XP_005258413 (OMIM: 615115,615485) PREDICTED: puta (2249) 767 81.3 9.3e-14
XP_011526954 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1513) 693 74.9 5.3e-12
XP_006723793 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1513) 693 74.9 5.3e-12
XP_016883193 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1513) 693 74.9 5.3e-12
XP_016883194 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1513) 693 74.9 5.3e-12
XP_006723791 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1531) 693 74.9 5.4e-12
XP_006723790 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1540) 693 74.9 5.4e-12
NP_056153 (OMIM: 605039,612990,614286) putative Po (1541) 693 74.9 5.4e-12
XP_011526950 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1628) 693 74.9 5.6e-12
XP_006723795 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1480) 659 72.0 3.9e-11
XP_016883195 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1490) 659 72.0 3.9e-11
XP_006723796 (OMIM: 605039,612990,614286) PREDICTE (1313) 657 71.8 4e-11
NP_001158075 (OMIM: 605039,612990,614286) putative ( 85) 406 49.8 1.1e-05
NP_001290161 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1361) 385 48.5 0.0004
>>NP_060733 (OMIM: 612991) putative Polycomb group prote (1435 aa)
initn: 9413 init1: 9413 opt: 9413 Z-score: 4363.5 bits: 819.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9413; 100.0% identity (100.0% similar) in 1435 aa overlap (1-1435:1-1435)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MREKGRRKKGRTWAEAAKTVLEKYPNTPMSHKEILQVIQREGLKEIRSGTSPLACLNAML
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NP_060 MREKGRRKKGRTWAEAAKTVLEKYPNTPMSHKEILQVIQREGLKEIRSGTSPLACLNAML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 HTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVEN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLI
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NP_060 EKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPI
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NP_060 RIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADI
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NP_060 PQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRV
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NP_060 KAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVP
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NP_060 SETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPAL
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pF1KA1 ISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLP
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910 920 930 940 950 960
pF1KA1 VPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGK
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NP_060 VPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 DVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLL
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pF1KA1 SVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRR
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NP_060 SVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 THSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQ
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NP_060 THSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 VSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKT
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NP_060 VSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 LARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSP
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NP_060 LARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSP
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 TQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQ
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 TIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
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NP_060 TIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
1390 1400 1410 1420 1430
>>XP_011531252 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Polyco (1434 aa)
initn: 9106 init1: 9106 opt: 9394 Z-score: 4354.7 bits: 818.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9394; 99.9% identity (99.9% similar) in 1435 aa overlap (1-1435:1-1434)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MREKGRRKKGRTWAEAAKTVLEKYPNTPMSHKEILQVIQREGLKEIRSGTSPLACLNAML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
XP_011 MREKGRRKKGRTWAEAAKTVLEKYPNTPMSHKEILQVIQREGLKEI-SGTSPLACLNAML
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVEN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKP
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XP_011 KCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKP
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 TAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVS
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XP_011 TAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVS
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610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADI
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRV
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVP
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPAL
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 ISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLP
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 VPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGK
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 DVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQL
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQ
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
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Smith-Waterman score: 9224; 100.0% identity (100.0% similar) in 1407 aa overlap (29-1435:1-1407)
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::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 THSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQ
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pF1KA1 TIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLHTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDGGSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCAD
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pF1KA1 IDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALN
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pF1KA1 NEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLED
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pF1KA1 SKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKR
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pF1KA1 KSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISP
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pF1KA1 MPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGG
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pF1KA1 TIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGP
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pF1KA1 ETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNP
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pF1KA1 TRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNP
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pF1KA1 SASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKT
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pF1KA1 PGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEER
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pF1KA1 GMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSS
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pF1KA1 IDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFML
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pF1KA1 GFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKN
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA1 ATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLAS
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pF1KA1 KNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPEL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KA1 FSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGS
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pF1KA1 QVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMI
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pF1KA1 MCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
1360 1370
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MFREEFYGIPNKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSK
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pF1KA1 KALKQALKQQQQKKQQQQCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KALKQALKQQQQKKQQQQCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQTG
50 60 70 80 90 100
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 SPQNSNSSFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPQNSNSSFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNL
110 120 130 140 150 160
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERL
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350 360 370 380 390 400
pF1KA1 SEGEFTPEMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SEGEFTPEMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKK
230 240 250 260 270 280
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 TPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEP
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pF1KA1 LLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVT
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pF1KA1 SPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEK
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pF1KA1 RPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFP
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pF1KA1 VSITSPNRTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VSITSPNRTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGE
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pF1KA1 GGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQA
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pF1KA1 QPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PSSCRQEKAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PSPLTSLLTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 REEVNERQSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 REEVNERQSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQ
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pF1KA1 DQILQTLIQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDE
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pF1KA1 ESTGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ESTGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTL
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pF1KA1 SKENYLFTRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 QPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIG
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pF1KA1 PSKLCVSCLVVR
::::::::::::
XP_006 PSKLCVSCLVVR
1310
>>XP_006712103 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Polyco (1175 aa)
initn: 7718 init1: 7718 opt: 7718 Z-score: 3582.1 bits: 675.1 E(85289): 8.7e-193
Smith-Waterman score: 7718; 100.0% identity (100.0% similar) in 1175 aa overlap (261-1435:1-1175)
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pF1KA1 SFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKH
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pF1KA1 TFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTP
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pF1KA1 EMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPK
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pF1KA1 SMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALN
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pF1KA1 THELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 THELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKS
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pF1KA1 PGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTEN
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pF1KA1 RQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPN
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pF1KA1 RTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 RGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSG
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pF1KA1 AQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQE
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pF1KA1 KAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSL
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pF1KA1 LTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANN
640 650 660 670 680 690
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pF1KA1 PLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNER
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pF1KA1 QSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTL
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pF1KA1 IQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNIST
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pF1KA1 YGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQ
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pF1KA1 ESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLF
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pF1KA1 TRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 LQTPKLYGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LQTPKLYGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPAS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 QAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 CLVVR
:::::
XP_006 CLVVR
>>XP_016859919 (OMIM: 612991) PREDICTED: putative Polyco (1175 aa)
initn: 7718 init1: 7718 opt: 7718 Z-score: 3582.1 bits: 675.1 E(85289): 8.7e-193
Smith-Waterman score: 7718; 100.0% identity (100.0% similar) in 1175 aa overlap (261-1435:1-1175)
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 SFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKH
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 TFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTP
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 EMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EMQVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPK
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALN
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 THELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 THELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKS
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 PGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTEN
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 RQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPN
340 350 360 370 380 390
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 RTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTA
400 410 420 430 440 450
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSG
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 AQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQE
520 530 540 550 560 570
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 KAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSL
580 590 600 610 620 630
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 LTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANN
640 650 660 670 680 690
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 PLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNER
700 710 720 730 740 750
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 QSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTL
760 770 780 790 800 810
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 IQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNIST
820 830 840 850 860 870
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 YGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEESTGDEQ
880 890 900 910 920 930
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 ESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLF
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1260 1270 1280 1290 1300 1310
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:: :.:: . ..: ...::.. ... . .:.
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