Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1568
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1568, 1378 aa
1>>>pF1KA1568 1378 - 1378 aa - 1378 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8432+/-0.00109; mu= 7.9161+/- 0.066
mean_var=278.9014+/-58.995, 0's: 0 Z-trim(112.0): 200 B-trim: 46 in 1/50
Lambda= 0.076798
statistics sampled from 12623 (12844) to 12623 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.395), width: 16
Scan time: 6.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 9310 1046.6 0
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 9179 1032.1 0
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551) 4138 473.6 1.9e-132
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606) 4100 469.4 3.6e-131
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 4053 464.2 1.3e-129
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 3375 389.0 4.9e-107
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 648 86.9 4.5e-16
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 622 84.2 4.2e-15
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 602 82.0 2e-14
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2 (1479) 597 81.2 2.3e-14
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 588 80.2 4.5e-14
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 588 80.2 4.5e-14
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 588 80.2 4.6e-14
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17 (2172) 562 77.5 4.4e-13
CCDS8455.1 ROBO4 gene_id:54538|Hs108|chr11 (1007) 552 76.1 5.6e-13
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8 (1463) 544 75.4 1.3e-12
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 523 72.9 5.3e-12
CCDS73385.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11 ( 858) 504 70.7 2e-11
CCDS61010.1 IGSF9B gene_id:22997|Hs108|chr11 (1437) 507 71.3 2.3e-11
CCDS73386.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11 ( 761) 487 68.8 6.9e-11
>>CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378 aa)
initn: 9310 init1: 9310 opt: 9310 Z-score: 5589.0 bits: 1046.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9310; 100.0% identity (100.0% similar) in 1378 aa overlap (1-1378:1-1378)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEGRPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEGRPTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQVVLEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQVVLEEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 AVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQNLLFPNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQNLLFPNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPII
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 QGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKIWCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKIWCL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 ITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGLSNYAVTFQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGLSNYAVTFQRG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGRGDVLPPVPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGRGDVLPPVPGQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 GDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHELAVDLPDPQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHELAVDLPDPQW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 KSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 PAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 LGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 QRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 PSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
1330 1340 1350 1360 1370
>>CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394 aa)
initn: 9179 init1: 9179 opt: 9179 Z-score: 5510.5 bits: 1032.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9179; 100.0% identity (100.0% similar) in 1358 aa overlap (21-1378:37-1394)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVTRRMWTWAPGLLMMTVVFWGHQGNGQGQGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 VARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 YMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTD
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 TDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTI
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 YLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPT
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 TVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEI
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 KVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNG
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 IIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQP
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 IIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 SNYAVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNYAVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGR
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 GDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHE
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 LAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 NVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 TPPVRGVASSPAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPPVRGVASSPAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 NQPPQPPVPPLGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQPPQPPVPPLGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 SVTGKAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVTGKAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 DEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 QGQFTGEL
::::::::
CCDS54 QGQFTGEL
1390
>>CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551 aa)
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10 20 30 40 50
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.: . ::. :::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
CCDS54 MIAEPAHFYLFGLICLCS-------GSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPATLNCKAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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CCDS54 GRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYVCVARNY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRID
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CCDS54 LGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKKDGSPLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
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CCDS54 DKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVKRPSNLA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
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240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
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CCDS54 ENMVGKAEASATLTVQVGSEPPHFVVKPRDQVVALGRTVTFQCEATGNPQPAIFWRREGS
300 310 320 330 340 350
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::::: :: : .:: ::: ::::::::.::::.::::::.:.:::::..:: ::::::.
CCDS54 QNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYLEVTDVI
360 370 380 390 400 410
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480 490 500 510 520 530
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:::..:.:::::::. . :. :.: :::::::.. ..::::::..::: ...::.::.
CCDS54 TDVSRNTVTLSWQPNLNSGATPTS-YIIEAFSHASGSSWQTVAENVKTETSAIKGLKPNA
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::::.::: : :.:::: .::::.:::. : .:::::.:::.:::.....::::.::.
CCDS54 IYLFLVRAANAYGISDPSQISDPVKTQDVLPTSQGVDHKQVQRELGNAVLHLHNPTVLSS
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....: ::::.: :.::::...:: ... .. :.: .....:.. :.:. .:.:::.::
CCDS54 SSIEVHWTVDQQSQYIQGYKILYRPSGANHGESDWLVFEVRTPAKNSVVIPDLRKGVNYE
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CCDS54 IKARPFFNEFQGADSEIKFAKTLEEAPSAPPQGVTV-SKNDGNGTAILVSWQPPPEDTQN
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:..::::.::::::::.:::::::.. ::.: : :::.: :::::::.:: :::::::
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830 840 850 860 870 880
pF1KA1 PIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG
: . ... : :.. :...::.:::::::::::::.:::.::: :::::: .::::.:
CCDS54 FIQLDAHGNPVSPEDQVSLAQQISDVVKQPAFIAGIGAACWIILMVFSIWLYRHRKKRNG
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
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CCDS54 LTSTYAGIRKVTYQRG-GEAVSSGGRPGLLNISEPAAQPWLADTWPNTGNNHNDCSISCC
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990
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:: : .: . ::: :: ::.. .: : . . .. .: :
CCDS54 TAGN-GNSDSNLTTYSRPGQPTPYATTQLIQSNLSNNMNNGSGD-SGEKHWKPLGQQKQE
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
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CCDS54 VAPVQYNIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNT---GGSYNSSDRGSSTSGSQG-
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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CCDS54 -HKKGARTPKVPKQGGMNWADL-LPPPPAHPPPHSNSEEYNISVDES-YDQEMPCPVPPA
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA1 QTYLHQGLEDELEEDDD-RVPTPPVRGVASSPA-ISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAH
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CCDS54 RMYLQQ---DELEEEEDERGPTPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQPMLQDC
1130 1140 1150 1160 1170
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 LDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP--LGYVSGALISDLETDVAD---DDADD
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CCDS54 PEE-TGHMQHQPDRRRQPV-SPPPPPRPISPPHTYGYISGPLVSDMDTDAPEEEEDEADM
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1230 1240 1250
pF1KA1 EEEALEIPRPL-RALDQTPGSSMDNLDSSVTG----------------------------
: .. : : :.:.:::.::. .:.:::::
CCDS54 EVAKMQTRRLLLRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSGRSSVSSSDGS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1260 1270 1280
pF1KA1 ---------------------------------KAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQ
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CCDS54 FFTDADFAQAVAAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQ
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA1 SQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGST
. :: ::. :.. ::: .::. : :.. :: ..:..
CCDS54 KTRPAKKLKHQPGHL--------RRETYTDDLPPPPVPPPAIKSPTAQSKTQLEVRPVVV
1360 1370 1380 1390 1400
1350 1360 1370
pF1KA1 GPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
CCDS54 PKLPSMDARTDRSSDRKGSSYKGREVLDGRQVVDMRTNPGDPREAQEQQNDGKGRGNKAA
1410 1420 1430 1440 1450 1460
>>CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAE
.: . ::. :::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
CCDS46 MIAEPAHFYLFGLICLCS-------GSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPATLNCKAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNY
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: ::::::::
CCDS46 GRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYVCVARNY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRID
::::::.:::::::.:::::::::.::.::.::::..::::::::::::: :::: .:
CCDS46 LGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKKDGSPLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 DKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQV
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CCDS46 DKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVKRPSNLA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIA
: ....::.:...::: :::::.:::..::..::.:.::.::.:.:. . : :.: :.:
CCDS46 VTVDDSAEFKCEARGDPVPTVRWRKDDGELPKSRYEIRDDHTLKIRKVTAGDMGSYTCVA
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 ENRVGKMEASATLTVRA---PPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGS
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CCDS46 ENMVGKAEASATLTVQVGSEPPHFVVKPRDQVVALGRTVTFQCEATGNPQPAIFWRREGS
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pF1KA1 QNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVL
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CCDS46 QNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYLEVTDVI
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 TDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGT
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CCDS46 ADRPPPVIRQGPVNQTVAVDGTFVLSCVATGSPVPTILWRKDGVLVSTQDSRIKQLENGV
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pF1KA1 LQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATIS--KNYDLSDLPGPPSKPQV
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CCDS46 LQIRYAKLGDTGRYTCIASTPSGEATWSAYIEVQEFGVPVQPPRPTDPNLIPSAPSKPEV
480 490 500 510 520 530
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CCDS46 TDVSRNTVTLSWQPNLNSGATPTS-YIIEAFSHASGSSWQTVAENVKTETSAIKGLKPNA
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CCDS46 IYLFLVRAANAYGISDPSQISDPVKTQDVLPTSQGVDHKQVQRELGNAVLHLHNPTVLSS
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pF1KA1 TTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYE
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CCDS46 SSIEVHWTVDQQSQYIQGYKILYRPSGANHGESDWLVFEVRTPAKNSVVIPDLRKGVNYE
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pF1KA1 IKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQN
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CCDS46 IKARPFFNEFQGADSEIKFAKTLEEAPSAPPQGVTV-SKNDGNGTAILVSWQPPPEDTQN
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CCDS46 GMVQEYKVWCLGNETRYHINKTVDGSTFSVVIPFLVPGIRYSVEVAASTGAGSGVKSEPQ
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pF1KA1 PIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG
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CCDS46 FIQLDAHGNPVSPEDQVSLAQQISDVVKQPAFIAGIGAACWIILMVFSIWLYRHRKKRNG
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pF1KA1 L-SNYA----VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPS-YPWLADSWPATSLPVN-------
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CCDS46 LTSTYAGIRKVTYQRG-GEAVSSGGRPGLLNISEPAAQPWLADTWPNTGNNHNDCSISCC
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pF1KA1 ---NSNSGPNEIGNFGR-GDVLPPVPGQGD--KTATMLSDGAIYSSIDFTTKT----SYN
:.:: : . ...: .: . .: : .: :: ....:...:...: ..:
CCDS46 TAGNGNSDSN-LTTYSRPADCIANYNNQLDNKQTNLMLPESTVYGDVDLSNKINEMKTFN
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pF1KA1 SSSQIT--------QATPYATTQILHSN---SIHELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGY
: . : :::::::...:: .... . : . .:: ::: .. :
CCDS46 SPNLKDGRFVNPSGQPTPYATTQLIQSNLSNNMNNGSGDSGEKHWKPLGQQKQEVAPVQY
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060
pF1KA1 SLPDQNK----------------------GNNGG------KG----GKKKKNKNSSKPQ-
.. .::: :.:: .: :.. ..:.. :.
CCDS46 NIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNTGGSYNSSDRGSSTSGSQGHKKGARTPKV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 -KNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDE
:..: .::.. :::::..: : .. :.: . .:. ::.. :: :.. ::.: ::
CCDS46 PKQGGMNWADL-LPPPPAHPPPHSNSEEYNISVDES-YDQEMPCPVPPARMYLQQ---DE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 LEEDDD-RVPTPPVRGVASSPA-ISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFD
:::..: : :::::::.::::: .:...::::::::::.::.::::: : : .: .
CCDS46 LEEEEDERGPTPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQPMLQ-DCPEETGHMQHQ
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 IAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP--LGYVSGALISDLETDVAD---DDADDEEEALEIPRPL
.. . : ::.: :: ::.:: :.::..::. . :.:: : .. : :
CCDS46 PDRRRQPV-SPPPPPRPISPPHTYGYISGPLVSDMDTDAPEEEEDEADMEVAKMQTRRLL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA1 -RALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAF----TSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTK
:.:.:::.::. .:.:::::. . ..:.. .: :. :......
CCDS46 LRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSGRSSVSSSDGSFFTDADFAQAV
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA1 KHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVL
CCDS46 AAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQKTRPAKKLKHQ
1370 1380 1390 1400 1410 1420
>>CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651 aa)
initn: 4052 init1: 2501 opt: 4053 Z-score: 2440.2 bits: 464.2 E(32554): 1.3e-129
Smith-Waterman score: 4748; 55.1% identity (77.6% similar) in 1351 aa overlap (21-1279:58-1397)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
:::::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS54 IPDPEDVERGNDHGTPIPTSDNDDNSLGYTGSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPATL
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :::
CCDS54 NCKAEGRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYVC
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 VARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKD
:::::::::::.:::::::.:::::::::.::.::.::::..::::::::::::: ::::
CCDS54 VARNYLGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKKD
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
.:::.:::.::::::::. ::::::: :.::::::::::.:. :::::.:::.:..:
CCDS54 GSPLDDKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVKR
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGT
: : .: ....::.:...::: :::::.:::..::..::.:.::.::.:.:. . : :.
CCDS54 PSNLAVTVDDSAEFKCEARGDPVPTVRWRKDDGELPKSRYEIRDDHTLKIRKVTAGDMGS
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 YMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
: :.::: ::: ::::::::. ::.:::.::::.:: :::::: ::. ::::::.::..:
CCDS54 YTCVAENMVGKAEASATLTVQEPPHFVVKPRDQVVALGRTVTFQCEATGNPQPAIFWRRE
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTD
::::::: :: : .:: ::: ::::::::.::::.::::::.:.:::::..:: :::::
CCDS54 GSQNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYLEVTD
390 400 410 420 430 440
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pF1KA1 VLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQ
:..:::::.: :::.:::.::::: .:.: :::.:.:.: : :.: .: : :.
CCDS54 VIADRPPPVIRQGPVNQTVAVDGTFVLSCVATGSPVPTILWRKDGVLVSTQDSRIKQLEN
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480 490 500 510 520
pF1KA1 GTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATIS--KNYDLSDLPGPPSKP
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CCDS54 GVLQIRYAKLGDTGRYTCIASTPSGEATWSAYIEVQEFGVPVQPPRPTDPNLIPSAPSKP
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 QVTDVTKNSVTLSWQPG-TPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRP
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CCDS54 EVTDVSRNTVTLSWQPNLNSGATPTS-YIIEAFSHASGSSWQTVAENVKTETSAIKGLKP
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590 600 610 620 630 640
pF1KA1 NTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVL
:.::::.::: : :.:::: .::::.:::. : .:::::.:::.:::.....::::.::
CCDS54 NAIYLFLVRAANAYGISDPSQISDPVKTQDVLPTSQGVDHKQVQRELGNAVLHLHNPTVL
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pF1KA1 TPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVT
. ....: ::::.: :.::::...:: ... .. :.: .....:.. :.:. .:.:::.
CCDS54 SSSSIEVHWTVDQQSQYIQGYKILYRPSGANHGESDWLVFEVRTPAKNSVVIPDLRKGVN
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pF1KA1 YEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDH
::::.::.:::::: ::: : ..: :::::::::.::: . .. :.:.: :::.::: :
CCDS54 YEIKARPFFNEFQGADSEIKFAKTLEEAPSAPPQGVTV-SKNDGNGTAILVSWQPPPEDT
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pF1KA1 QNGIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSE
:::..::::.::::::::.:::::::.. ::.: : :::.: :::::::.:: :::::
CCDS54 QNGMVQEYKVWCLGNETRYHINKTVDGSTFSVVIPFLVPGIRYSVEVAASTGAGSGVKSE
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830 840 850 860 870 880
pF1KA1 PQPIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKR
:: : . ... : :.. :...::.:::::::::::::.:::.::: :::::: .::::
CCDS54 PQFIQLDAHGNPVSPEDQVSLAQQISDVVKQPAFIAGIGAACWIILMVFSIWLYRHRKKR
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pF1KA1 KGL-SNYA-------------VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPS-YPWLADSWPATS
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CCDS54 NGLTSTYAGIRKVPSFTFTPTVTYQRG-GEAVSSGGRPGLLNISEPAAQPWLADTWPNTG
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940 950 960 970
pF1KA1 LPVN----------NSNSGPNEIGNFGR-GDVLPPVPGQGD--KTATMLSDGAIYSSIDF
: :.:: : . ...: .: . .: : .: :: ....:...:.
CCDS54 NNHNDCSISCCTAGNGNSDSN-LTTYSRPADCIANYNNQLDNKQTNLMLPESTVYGDVDL
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pF1KA1 TTKT----SYNSSSQIT--------QATPYATTQILHSN---SIHELAVDLPDPQWKSSI
..: ..:: . : :::::::...:: .... . : . .::
CCDS54 SNKINEMKTFNSPNLKDGRFVNPSGQPTPYATTQLIQSNLSNNMNNGSGDSGEKHWKPLG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1030 1040 1050
pF1KA1 QQKTDLMGFGYSLPDQNK----------------------GNNGG------KG----GKK
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CCDS54 QQKQEVAPVQYNIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNTGGSYNSSDRGSSTSGSQ
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pF1KA1 KKNKNSSKPQ--KNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPV
..:.. :. :..: .::.. :::::..: : .. :.: . .:. ::.. :: :.
CCDS54 GHKKGARTPKVPKQGGMNWADL-LPPPPAHPPPHSNSEEYNISVDES-YDQEMPCPVPPA
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pF1KA1 QTYLHQGLEDELEEDDD-RVPTPPVRGVASSPA-ISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAH
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CCDS54 RMYLQQ---DELEEEEDERGPTPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQPMLQ-D
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1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 LDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP--LGYVSGALISDLETDVAD---DDADD
: : .: . .. . : ::.: :: ::.:: :.::..::. . :.::
CCDS54 CPEETGHMQHQPDRRRQPV-SPPPPPRPISPPHTYGYISGPLVSDMDTDAPEEEEDEADM
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pF1KA1 EEEALEIPRPL-RALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAF----TSSQRPRPTSPFSTDSNTSAA
: .. : : :.:.:::.::. .:.:::::. . ..:.. .: :. :.....
CCDS54 EVAKMQTRRLLLRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSGRSSVSSSDGS
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1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA1 LSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSK
.
CCDS54 FFTDADFAQAVAAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQ
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pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPT
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50 60 70 80 90 100
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CCDS44 TLPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPDEGVY
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110 120 130 140 150 160
pF1KA1 VCVARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWK
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CCDS44 TCVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWR
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pF1KA1 KDKVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFL
:: .:. ..: ::.:::::::.:.: :::::::.::..::.:::.: ::. :.:::.::
CCDS44 KDGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLERPSFL
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230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RRPINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDE
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CCDS44 RRPVNQVVLADAPVTFLCEVKGDPPPRLRWRKEDGELPTGRYEIRSDHSLWIGHVSAEDE
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CCDS44 GTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAPGESVAFQCETKGNPPPAIFWQ
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CCDS44 KEGSQVLLFPSQSLQPTGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAGYYVCQAVSVAGSILAKALLEI
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pF1KA1 TDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQ
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CCDS44 KGASLDGLPPVILQGPANQTLVLGSSVWLPCRVTGNPQPSVRWKKDGQWLQGDDLQFKTM
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470 480 490 500 510 520
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CCDS44 ANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDPPTEPSSPPGAPSQ
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:: ::.: ::.: ...: : . .::: . . : : ::::::: : . :
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CCDS44 AQEP-------RGSCCPSNPDPDDR---YYNEAGISLYLAQTARGTAAPGEGPVYSTIDP
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CCDS44 AGEELQTFHGGFPQHPSGDL-GP-WSQ------------YAPPEWSQGDSGAKGGKVKL-
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.:: . . .: .. ::::: :. :: . :. :.. . . ::::.: ...
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
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CCDS44 LTE------PSSSGGCLVTPSRRETPSPTPSYGQQSTATLTPSPPDPPQPPTDMPHLHQM
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CCDS44 PRRVPLGPSSPL----SVSQPMLGIREARPAGLGAGPAASPHLSPSPAPSTASSAPGRTW
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. :. :: : : . . . ... . .: : : : ... . : .
CCDS44 QGNGEMTPPL----QGPRARFRKKPKALPYRRENSPGDLPPPPLPPPEEEASWALELRAA
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pF1KA1 QRPRPTKKHKGGRMDQQPALP--HRREGMTDEEALVPYSKPSFPS----------PGGHS
.....:. :.: .: :::: .:::.::: : :..:
CCDS44 GSMSSLERERSGERKAVQAVPLAAQRVLHPDEEAWLPYSRPSFLSRGQGTSTCSTAGSNS
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pF1KA1 SSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
: :..::.:: :: ..
CCDS44 SRGSSSSRGSRGPGRSRSRSQSRSQSQRPGQKRREEPR
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pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEGRPT
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CCDS11 KPDEGLYQCEASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPM
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pF1KA1 PTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEA
:::.: :. . . : : ..::::.: . :. : : : : : ::: :
CCDS11 PTIHWQKNQQDLTPIPGDSRV--VVLPSGALQISRLQPG-----DIGIYRCSARN---PA
170 180 190 200 210
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pF1KA1 VSRNAS-LEVALLRDD-------FRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDK
::... :: .: : : : :..::. :. :.::: :.: :.. : . .
CCDS11 SSRTGNEAEVRILSDPGLHRQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVS-GYPPPSFTWLRGE
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:. . .. :. ::. :.:::. .:.:::::: : . .: : :::::. : :: .
CCDS11 EVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNVTDDDSGMYTCVVT-YKNENISASAELTVLVPPWFLNH
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pF1KA1 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKD-DADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEG
: : . : .::.: :.: : ::: : :. :. .: ..: .::: ....:::
CCDS11 PSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEG
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:.:.:::..:. ..:: : : : :. : ::: .....: : . : :.:
CCDS11 FYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAK
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pF1KA1 GNPQP-AVFWQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVS---PTGDLTITNIQRSDAG-------
:: : .::...::.. : : . . .:. : . :. . .. :
CCDS11 GNIQTFTVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQP
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 -YYICQA-LTVAGSI--LAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPAN--------------QTL
: : : : . : .. :..: :: .::.. :..
CCDS11 IKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNI
520 530 540 550 560 570
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pF1KA1 AVDGTAL------------LKCKA--------TGDPLPVI--------------------
::: . :. : . : . :.
CCDS11 EVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNS
580 590 600 610 620 630
450 460 470 480
pF1KA1 -----SWL------KEGFT--FPGRDPRATIQ-EQGTLQIKNLRISDTG-------TYTC
::: ..:: . : ..: . :. ::. .:: :: ..
CCDS11 RSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHRKTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQV
640 650 660 670 680 690
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VATSSSGE---TSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPG
: . .: ..: .. : .. : :..: ::. .: : : . .:: :
CCDS11 SAMTVNGTGPPSNWY-------TAETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQT-NCIIMSWTPP
700 710 720 730 740
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSW-QTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINPQGLS
.. . .::: . .:.. . .:: : :... :. .. :.. ..:.: :
CCDS11 LNPNIVVRGYII---GYGVGSPYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAG--
750 760 770 780 790 800
610 620 630 640 650
pF1KA1 DPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNP---------VVLTPTTVQVT
. :. . . :..:. :.. ::. . .. . : .: :.:: .:.:.
CCDS11 EGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVS
810 820 830 840 850 860
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 WTVDRQPQFIQGYRV-MY--RQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKV
:. . :. . .: .: : ....:...... :. : : . ..:: .. ::..:
CCDS11 WADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDT---TSLSYTATGLKPNTMYEFSV
870 880 890 900 910 920
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGII
:. .. : . . : : ::.. :...::.: . . .. :::.:: . :: :
CCDS11 MVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREG-KPRAVIVSWQPP--LEANGKI
930 940 950 960 970
780 790 800 810 820
pF1KA1 QEYKI-WCLGNETRFH--INKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQ
: . . : .. . : .:... . : : .: .. : .: ::: :.:
CCDS11 TAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPI
980 990 1000 1010 1020 1030
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 PIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG
CCDS11 LFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSN
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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10 20 30 40 50
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:: :.:. :. .:: .::..: :...:
CCDS42 DHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKG
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pF1KA1 RPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYL
: ::: : : . . . : .:. :.. . . . . : : : :.: :
CCDS42 TPLPTITWTLDDDPI-LKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVR-DGGVYRCTANNSA
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVA-AGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRID
: .: .: ..: : : ..: ::. . ..:. :.: .: : :.. .
CCDS42 G-VVLYQARINV---RGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVI-GYPYYSIKWYKNSNLLP
500 510 520 530 540
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......... : : .:...: : : ::: . :. ...:: : .: :
CCDS42 FNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFP
550 560 570 580 590 600
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pF1KA1 RRPINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIK-D--DYT--LRIKKT
: :.: :. .: :.:: :. :.:: .: : . : :.: :::..
CCDS42 RFSIGQRVFIPCVV-----VSGDLPITITWQKDGRPIP-GSLGVTIDNIDFTSSLRISNL
610 620 630 640 650
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.:.: :::.:... .: .. : ::.::.:::.:::: :..: . : ..: : :
CCDS42 SLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVP
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.. :. ..:. : :: :.: .: .:.: : .. . :.:::.:.. . .:. ..
CCDS42 TIVWKFSKGAGVPQF--QPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVS
720 730 740 750 760 770
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 KAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTAL-LKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGR
:.. :: . : .: . : : :::..: ..: : :. .. : :: . .
CCDS42 KSM-----YLTVKIPAMITSYP-NTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE
780 790 800 810 820 830
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pF1KA1 DPRATI--QEQGTLQIKNLRI-----SDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISK
: . .: : :..:.: :.: ..: : .: :: : : :
CCDS42 MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEP------
840 850 860 870 880
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pF1KA1 NYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTV--A
: :: . .. :: ..:: : : :. : ..: :: .. :.::... .
CCDS42 -------PDPP-EIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIEC--KNKSDSWDSAQRT
890 900 910 920 930
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. :. : :. ..:.. : . . : : : :.:: .. . : : . : .: ..:
CCDS42 KDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPS--NELTITADEAAP-DG-PPQEV
940 950 960 970 980 990
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pF1KA1 QKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR---QPQFIQGYRVMYRQ-TSGLQATSSWQN
. : :. . ...::: . . : .:.::.. ::. ..: . . .
CCDS42 HLE----------PI--SSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIIS
1000 1010 1020 1030
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pF1KA1 LDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVL
.:.. .: .: ::.: . : . :. : .:. . : :..:: ::..: ..
CCDS42 VDTSGDSE-VYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAI
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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.. . :::.::. . :::.: ... : . .. :.. .. :. . ::
CCDS42 AT---SPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGL
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pF1KA1 FPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSE----------PQP-----IIIGRRNEVVITE----NN
.: ..: : : :: ::.:: : : . . : .. .
CCDS42 EKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKL
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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pF1KA1 NSITEQITDVVKQP------AFIAGIGGACWVILM-----GFSIWLYWRRKKRKGLSNYA
:.: .. : ..: : :. . . : .:.:. . .: :.
CCDS42 NGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEI
1220 1230 1240 1250 1260 1270
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pF1KA1 VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGRGDVL
.: . : . .: : .: . ::. : :: . ::
CCDS42 ITVE----PLAKAPARI-LTFSGTVTTPWMKD----IVLPCKAV------------GDPS
1280 1290 1300 1310
960 970 980 990 1000
pF1KA1 PPVPGQGDK--TATMLS-DG--AIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIH
: : . :. : .... :: .:.:. .: .: .: . :... .. :
CCDS42 PAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCI--ANNNWGSDEIIL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 ELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTW
.: :..: : . .... :. :: :.:::.. . . : ..:. :
CCDS42 NLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLP----GDNGGSSIRGYILQYS----EDNSEQW
1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KA1 ANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRV
.. :. :
CCDS42 GSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELF
1430 1440 1450 1460 1470 1480
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CCDS83 TSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKG
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: ::. : : : . : . :.... . .:. . : : . . : : : :.::: .
CCDS83 APPPTVTWALDDEPIVRD-GSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIR-DGGVYRCTARNLV
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CCDS83 GSA-EYQARINV-------RGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVI-GYPYYSIKWYKDA
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. . :..... ...: : .....:. : : : : . .. . : . : . : .
CCDS83 LLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLC--SVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQ
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pF1KA1 PIN-QVVLEEEAVEFRCQVQ-GDPQPTVRWKKDDADLPRGR-YDIKDDY---TLRIKKTM
:.. . . . . : :. :: . :.:: . : :.. .:.:...
CCDS83 PFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVS
670 680 690 700 710 720
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.:.: ::: : .. . : ::.::.:::.: .: :.. .. : . : : :
CCDS83 LKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPK
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:.:.. .:: : :.: : ..: .. :...: : .. . : :::.::: . .:. .
CCDS83 VMWKHAKGSGN---PQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDI
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pF1KA1 AKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTAL-LKCKATGDPLPVISWLKEGFTF-P
.:... :: . : .: . : : :.:. : : :.: : :. .: : : .. :
CCDS83 SKSMF-----LTVKIPAMITSHP-NTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDP
840 850 860 870 880 890
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pF1KA1 GRDPRATI--QEQG-----TLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATI
: : .: ...: ::..: .:. ..: : .: :: : : :
CCDS83 DRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEP----
900 910 920 930 940
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pF1KA1 SKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVA
: :: . .. .: :..: : :. ... :: ..: : ... .
CCDS83 ---------PDPP-ELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQST
950 960 970 980 990
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pF1KA1 NHVKTTLY--TVRGLRPNTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQV
... :. .. :.: ..: . . ..: : :.:: . :.. .: . .:
CCDS83 RNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELT-ISTEEAAPDGPPMD----
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KA1 QKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR---QPQFIQGYRVMYRQTS-GLQATSSWQN
: :. :: : ..:::: . . : :.::.. ::..: : .. : .
CCDS83 --------VTLQ-PV--TSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVE
1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KA1 LDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVL
. : .: .: :::: . : . :. . : .: .. : :..:: ::..: .:
CCDS83 MKATGDSE-VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRAL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KA1 TVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKI--WCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGL
.. .: .::. :: . ::... :.. : : . .. ... .. . : . :.
CCDS83 SI---TSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGM
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pF1KA1 FPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAG
.: :.: : :.:: ::.:
CCDS83 EKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKP
1220 1230 1240 1250 1260 1270
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pF1KA1 KDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC-VARNYLGEAVSRNASLEVALLRD
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CCDS46 LRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERP
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140 150 160 170 180 190
pF1KA1 DFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEE-RISI-RGGKLMIS
. ..: :. :..:. . . :. .:.:.: : : ... ... : . :... : :::.
CCDS46 RITSEPQDADVTSGNTVYFTCRA-EGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQ
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240
pF1KA1 NTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVF---ERPTFLRRPINQVVLEEEAVEFRCQV
::...: :.: :.. :..:: .. . : : ::::. .: : :: :.: ..:..
CCDS46 NTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSA
310 320 330 340 350 360
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QGDPQPTVRWKKDD-ADLPRG-RYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASA
: : : . : . : . :: : .: . : :..... : : : : : : . ...:.:
CCDS46 TGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATA
370 380 390 400 410 420
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQNLLFPNQPQQPNS
. :.: :::.: :.:..: .:.:: : ::.:::: :.. : : ::: . .
CCDS46 FIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQ--------LSVDR
430 440 450 460 470
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPAN
: : .: : :... : : : :::... :: . :.: : : :.. . :..
CCDS46 RHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQP----RVTPVFASIPSD
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRISDTGTY
:. : ... : :.. :.: :.:.: :.: .. . :. .: : :... .:.: :
CCDS46 TTVEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVT-ESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRY
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYD----LSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSW
::: .. : .: : ::.:. .:.: : : . . . .. . :.. . :
CCDS46 ECVARNTIGSASVSMVLSVNVPD--VSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDS-
600 610 620 630 640
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pF1KA1 QPGTPGTL------PASAYIIE-AFSQSV-SNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFM
.: .:. : : . : .: : . . . : . .::. :
CCDS46 RPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLV
650 660 670 680 690 700
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 VRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQV
CCDS46 SPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKS
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