Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1555, 2405 aa
1>>>pF1KA1555 2405 - 2405 aa - 2405 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.5710+/-0.00119; mu= -19.2530+/- 0.070
mean_var=778.5139+/-184.056, 0's: 0 Z-trim(116.5): 17 B-trim: 928 in 1/53
Lambda= 0.045966
statistics sampled from 17147 (17163) to 17147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.527), width: 16
Scan time: 10.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44124.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2405) 16351 1101.8 0
CCDS463.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2406) 16339 1101.0 0
CCDS43510.1 HIVEP2 gene_id:3097|Hs108|chr6 (2446) 1531 119.0 2.9e-25
CCDS43426.1 HIVEP1 gene_id:3096|Hs108|chr6 (2718) 1063 88.0 6.9e-16
>>CCDS44124.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2405 aa)
initn: 16351 init1: 16351 opt: 16351 Z-score: 5878.6 bits: 1101.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16351; 99.8% identity (99.9% similar) in 2405 aa overlap (1-2405:1-2405)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFP
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CCDS44 MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GPSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GPSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LVDPMRPGPSGSFVAPGLHPQSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVDPMRPGPSGSFVAPGLHPQSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 KKERKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KKERKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETSATSGHPAELSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETSATSGHPAELSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPLSHKPEDTHTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPLSHKPEDTHTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IDSVKPRRSSLSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IDSVKPRRSSLSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 HSMPSAACTISTPHHPFRGSYSFDDHITDSEALSRSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HSMPSAACTISTPHHPFRGSYSFDDHITDSEALSHSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 YSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTKKTKKGLKTKGVIYECNICGARYKKRDNYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTKKTKKGLKTKGVIYECNICGARYKKRDNYEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HKKYYCSELQIAKPISAGTHTSPEAEKSQIEHEPWSQMMHYKLGTTLELTPLRKRRKEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKKYYCSELQIAKPISAGTHTSPEAEKSQIEHEPWSQMMHYKLGTTLELTPLRKRRKEKS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LGDEEEPPAFESTKSQFGSPGPSDAARNLPLESTKSPAEPSKSVPSLEGPTGFQPRTPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGDEEEPPAFESTKSQFGSPGPSDAARNLPLESTKSPAEPSKSVPSLEGPTGFQPRTPKP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GSGSESGKERRTTSKEISVIQHTSSFEKSDSLEQPSGLEGEDKPLAQFPSPPPAPHGRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSGSESGKERRTTSKEISVIQHTSSFEKSDSLEQPSGLEGEDKPLAQFPSPPPAPHGRSA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 HSLQPKLVRQPNIQVPEILVTEEPDRPDTEPEPPPKEPEKTEEFQWPQRSQTLAQLPAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HSLQPKLVRQPNIQVPEILVTEEPDRPDTEPEPPPKEPEKTEEFQWPQRSQTLAQLPAEK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LPPKKKRLRLAEMAQSSGESSFESSVPLSRSPSQESNVSLSGSSRSASFERDDHGKAEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPPKKKRLRLAEMAQSSGESSFESSVPLSRSPSQESNVSLSGSSRSASFERDDHGKAEAP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 SPSSDMRPKPLGTHMLTVPSHHPHAREMRRSASEQSPNVSHSAHMTETRSKSFDYGSLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPSSDMRPKPLGTHMLTVPSHHPHAREMRRSASEQSPNVSHSAHMTETRSKSFDYGSLSL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 TGPSAPAPVAPPARVAPPERRKCFLVRQASLSRPPESELEVAPKGRQESEEPQPSSSKPS
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CCDS44 TGPSAPAPVAPPARVAPPERRKCFLVRQASLSRPPESELEVAPKGRQESEEPQPSSSKPS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 AKSSLSQISSAATSHGGPPGGKGPGQDRPPLGPTVPYTEALQVFHHPVAQTPLHEKPYLP
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CCDS44 AKSSLSQISSAATSHGGPPGGKGPGQDRPPLGPTVPYTEALQVFHHPVAQTPLHEKPYLP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 PPVSLFSFQHLVQHEPGQSPEFFSTQAMSSLLSSPYSMPLLPPSLFQAPPLPLQPTVLHP
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CCDS44 PPVSLFSFQHLVQHEPGQSPEFFSTQAMSSLLSSPYSMPPLPPSLFQAPPLPLQPTVLHP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GQLHLPQLMPHPANIPFRQPPSFLPMPYPTSSALSSGFFLPLQSQFALQLPGDVESHLPQ
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CCDS44 GQLHLPQLMPHPANIPFRQPPSFLPMPYPTSSALSSGFFLPLQSQFALQLPGDVESHLPQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 IKTSLAPLATGSAGLSPSTEYSSDIRLPPVAPPASSSAPTSAPPLALPACPDTMVSLVVP
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CCDS44 IKTSLAPLATGSAGLSPSTEYSSDIRLPPVAPPASSSAPTSAPPLALPACPDTMVSLVVP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 VRVQTNMPSYGSAMYTTLSQILVTQSQGSSATVALPKFEEPPSKGTTVCGADVHEVGPGP
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CCDS44 VRVQTNMPSYGSAMYTTLSQILVTQSQGSSATVALPKFEEPPSKGTTVCGADVHEVGPGP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 SGLSEEQSRAFPTPYLRVPVTLPERKGTSLSSESILSLEGSSSTAGGSKRVLSPAGSLEL
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CCDS44 SGLSEEQSRAFPTPYLRVPVTLPERKGTSLSSESILSLEGSSSTAGGSKRVLSPAGSLEL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 TMETQQQKRVKEEEASKADEKLELVKPCSVVLTSTEDGKRPEKSHLGNQGQGRRELEMLS
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CCDS44 TMETQQQKRVKEEEASKADEKLELVKPCSVVLTSTEDGKRPEKSHLGNQGQGRRELEMLS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 SLSSDPSDTKEIPPLPHPALSHGTAPGSEALKEYPQPSGKPHRRGLTPLSVKKEDSKEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLSSDPSDTKEIPPLPHPALSHGTAPGSEALKEYPQPSGKPHRRGLTPLSVKKEDSKEQP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 DLPSLAPPSSLPLSETSSRPAKSQEGTDSKKVLQFPSLHTTTNVSWCYLNYIKPNHIQHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLPSLAPPSSLPLSETSSRPAKSQEGTDSKKVLQFPSLHTTTNVSWCYLNYIKPNHIQHA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 DRRSSVYAGWCISLYNPNLPGVSTKAALSLLRSKQKVSKETYTMATAPHPEAGRLVPSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DRRSSVYAGWCISLYNPNLPGVSTKAALSLLRSKQKVSKETYTMATAPHPEAGRLVPSSS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 RKPRMTEVHLPSLVSPEGQKDLARVEKEEERRGEPEEDAPASQRGEPARIKIFEGGYKSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKPRMTEVHLPSLVSPEGQKDLARVEKEEERRGEPEEDAPASQRGEPARIKIFEGGYKSN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 EEYVYVRGRGRGKYVCEECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPYVCKHCHFAFKTKGNLTKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEYVYVRGRGRGKYVCEECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPYVCKHCHFAFKTKGNLTKH
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 MKSKAHSKKCQETGVLEELEAEEGTSDDLFQDSEGREGSEAVEEHQFSDLEDSDSDSDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MKSKAHSKKCQETGVLEELEAEEGTSDDLFQDSEGREGSEAVEEHQFSDLEDSDSDSDLD
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 EDEDEDEEESQDELSRPSSEAPPPGPPHALRADSSPILGPQPPDAPASGTEATRGSSVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EDEDEDEEESQDELSRPSSEAPPPGPPHALRADSSPILGPQPPDAPASGTEATRGSSVSE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 AERLTASSCSMSSQSMPGLPWLGPAPLGSVEKDTGSALSYKPVSPRRPWSPSKEAGSRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AERLTASSCSMSSQSMPGLPWLGPAPLGSVEKDTGSALSYKPVSPRRPWSPSKEAGSRPP
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 LARKHSLTKNDSSPQRCSPAREPQASAPSPPGLHVDPGRGMGPLPCGSPRLQLSPLTLCP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS44 LARKHSLTKNDSSPQRCSPAREPQASAPSPPGLHVDPGRGMGALPCGSPRLQLSPLTLCP
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 LGRELAPRAHVLSKLEGTTDPGLPRYSPTRRWSPGQAESPPRSAPPGKWALAGPGSPSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGRELAPRAHVLSKLEGTTDPGLPRYSPTRRWSPGQAESPPRSAPPGKWALAGPGSPSAG
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA1 EHGPGLGLAPRVLFPPAPLPHKLLSRSPETCASPWKAESRSPSCSPGPAHPLSSRPFSAL
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EHGPGLGLDPRVLFPPAPLPHKLLSRSPETCASPWKAESRSPSCSPGPAHPLSSRPFSAL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA1 HDFHGHILARTEENIFSHLPLHSQHLTRAPCPLIPIGGIQMVQARPGAHPTLLPGPTAAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HDFHGHILARTEENIFSHLPLHSQHLTRAPCPLIPIGGIQMVQARPGAHPTLLPGPTAAW
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA1 VSGFSGGGSDLTGAREAQERGRWSPTESSSASVSPVAKVSKFTLSSELEGGDYPKERERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VSGFSGGGSDLTGAREAQERGRWSPTESSSASVSPVAKVSKFTLSSELEGGDYPKERERT
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA1 GGGPGRPPDWTPHGTGAPAEPTPTHSPCTPPDTLPRPPQGRRAAQSWSPRLESPRAPANP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS44 GGGPGRPPDWTPHGTGAPAEPTPTHSPCTPPDTLPRPPQGRRAAQSWSPRLESPRAPTNP
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA1 EPSATPPLDRSSSVGCLAEASARFPARTRNLSGEPRTRQDSPKPSGSGEPRAHPHQPEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EPSATPPLDRSSSVGCLAEASARFPARTRNLSGEPRTRQDSPKPSGSGEPRAHPHQPEDR
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA1 VPPNA
:::::
CCDS44 VPPNA
>>CCDS463.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2406 aa)
initn: 14435 init1: 14435 opt: 16339 Z-score: 5874.3 bits: 1101.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16339; 99.8% identity (99.8% similar) in 2406 aa overlap (1-2405:1-2406)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GPSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GPSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LVDPMRPGPSGSFVAPGLHPQSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LVDPMRPGPSGSFVAPGLHPQSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 KKERKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKERKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETSATSGHPAELSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETSATSGHPAELSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPLSHKPEDTHTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPLSHKPEDTHTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IDSVKPRRSSLSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IDSVKPRRSSLSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 HSMPSAACTISTPHHPFRGSYSFDDHITDSEALSRSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HSMPSAACTISTPHHPFRGSYSFDDHITDSEALSHSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 YSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTKKTKKGLKTKGVIYECNICGARYKKRDNYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTKKTKKGLKTKGVIYECNICGARYKKRDNYEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HKKYYCSELQIAKPISAGTHTSPEAEKSQIEHEPWSQMMHYKLGTTLELTPLRKRRKEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HKKYYCSELQIAKPISAGTHTSPEAEKSQIEHEPWSQMMHYKLGTTLELTPLRKRRKEKS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LGDEEEPPAFESTKSQFGSPGPSDAARNLPLESTKSPAEPSKSVPSLEGPTGFQPRTPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS46 GSGSESGKERRTTSKEISVIQHTSSFEKSDSLEQPSGLEGEDKPLAQFPSPPPAPHGRSA
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CCDS43 AQVLGQHAGLEKYPIWKAPQTLPLGLESSIPL-CLPSTSDSVATLGGSKRMLSPASSLEL
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: ...::::::.:::.::::.::: :::..:.: .:::::.:::: ::: :
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..::..:.:::::::.. : ::.:. .: .:.:. ::. : ..:... :. : . .
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.. :. .:. .:. . : .:.. :: :::::::::::::.::::::::::::.::
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CCDS43 ECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPYVCKLCNFAFKTKGNLTKHMKSKAHMKKCLELGVSM
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... :.::. . .:: . .: . : .::::: :.::. :.. :.:::::. .
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.: .:. . :.. : :: : .: :. .: : .: .... : : . .:
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: .. : : .: : : . . : :.:. . : .. .
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.. :::. ::. : : :: .: : .: .: : ::: .::: :
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:. :.:.:: .. . : . :: :: : :::. . :. : . ..
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.:. : :.: :... . : : : .: :.. :. : . . :
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: :: . .:. .:::::::::. .::: :..:.::::::.. : :
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CCDS43 ------SLIKSEPRRIKIFDGGYKSNEEYVYVRGRGRGKYICEECGIRCKKPSMLKKHIR
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: ... . :: :. : : :.. : :: .: : : :.:...
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pF1KA1 ARPGAHPTLLPGPTAAWVSGFSGGGSDLTGAR-EAQERGRWSPTESSSASVSPVAKV---
: :::.:. . . :. . :. .. ... .: : .: ..: ::.. :...
CCDS43 I---ALPTLIPSVSQVAVD--AQGAPEMPASQSKACET---QPKQTSVASANQVSRTESP
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