Result of FASTA (omim) for
pF1KA1549
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1549, 1858 aa
1>>>pF1KA1549 1858 - 1858 aa - 1858 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5780+/-0.000465; mu= 1.2682+/- 0.029
mean_var=320.8981+/-67.451, 0's: 0 Z-trim(118.9): 89 B-trim: 493 in 1/55
Lambda= 0.071596
statistics sampled from 32297 (32391) to 32297 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16
Scan time: 15.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065961 (OMIM: 613344) UPF0606 protein KIAA1549 (1934) 12059 1261.2 0
NP_001158137 (OMIM: 613344) UPF0606 protein KIAA15 (1950) 11622 1216.1 0
XP_011514744 (OMIM: 613344) PREDICTED: UPF0606 pro (1923) 6748 712.6 9.2e-204
XP_005252904 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1894) 735 91.5 8.5e-17
XP_016872973 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1855) 732 91.2 1e-16
XP_005252905 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1854) 725 90.5 1.7e-16
NP_036326 (OMIM: 612297) UPF0606 protein KIAA1549L (1849) 720 90.0 2.4e-16
XP_011518272 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1416) 706 88.4 5.4e-16
XP_016872975 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1415) 699 87.7 8.9e-16
XP_016872974 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1662) 693 87.1 1.5e-15
XP_011518271 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 pro (1235) 685 86.2 2.2e-15
NP_001035194 (OMIM: 608424) mucin-17 precursor [Ho (4493) 395 56.7 6.1e-06
XP_011514548 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3313) 309 47.7 0.0023
NP_005951 (OMIM: 158371) mucin-3A precursor [Homo (3323) 309 47.7 0.0023
XP_016867720 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3143) 302 47.0 0.0036
NP_060876 (OMIM: 158372) mucin-4 isoform a precurs (5412) 306 47.6 0.0041
XP_011514549 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3296) 297 46.5 0.0054
>>NP_065961 (OMIM: 613344) UPF0606 protein KIAA1549 isof (1934 aa)
initn: 12059 init1: 12059 opt: 12059 Z-score: 6743.9 bits: 1261.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12059; 99.8% identity (99.8% similar) in 1858 aa overlap (1-1858:77-1934)
10 20 30
pF1KA1 MELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGLWLLLLARPASCAPDELSPEQHNLSLYSMELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSSFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
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NP_065 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
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NP_065 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREAVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGPGLGYPTSSTEDLQPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QYGGPGWPSYGEDEAGRREAVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGPGLGYPTSSTEDLQPGH
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1840 1850
pF1KA1 SSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
1910 1920 1930
>>NP_001158137 (OMIM: 613344) UPF0606 protein KIAA1549 i (1950 aa)
initn: 12045 init1: 11609 opt: 11622 Z-score: 6499.9 bits: 1216.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12017; 98.9% identity (98.9% similar) in 1874 aa overlap (1-1858:77-1950)
10 20 30
pF1KA1 MELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGLWLLLLARPASCAPDELSPEQHNLSLYSMELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSSFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
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1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
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pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
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pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
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pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
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pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
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pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
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pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
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1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
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1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
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pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
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1780 1790 1800 1810
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREA----------------VPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYGGPGWPSYGEDEAGRREATHMLGHQEYSSSPLFQVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
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pF1KA1 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
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pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
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100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
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pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
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pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
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280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
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pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
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pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
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460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
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pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
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pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
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pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
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700 710 720 730 740 750
pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
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760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
:::::: :::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFSKAI---------------------------PTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
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pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
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pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
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pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
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pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
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1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
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1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
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pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
1340 1350 1360 1370 1380 1390
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pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
1400 1410 1420 1430 1440 1450
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pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
1460 1470 1480 1490 1500 1510
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pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
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1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
1580 1590 1600 1610 1620 1630
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pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
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1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
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pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
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1780 1790 1800 1810
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREA----------------VPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_011 QYGGPGWPSYGEDEAGRREATHMLGHQEYSSSPLFQVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
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pF1KA1 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
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>>XP_005252904 (OMIM: 612297) PREDICTED: UPF0606 protein (1894 aa)
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Smith-Waterman score: 1485; 27.2% identity (54.6% similar) in 1881 aa overlap (111-1857:173-1893)
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pF1KA1 MDNFLPDTHWTTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTT
... : .. :. : . . .:.. ...
XP_005 SKTHHRTRAHADFSSSLYQGSGHSASLEPSKDSTESLVQPG-PKGGQEAADVSA--PENS
150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KA1 RQPAAYAESAS------HFHTFRSAFRTSEGIVP-TPGRNLVLYPT------DAYSHLSS
: :: :: .: :. :. . : :: .:. . . .:. . .: :
XP_005 RGPALSAEHTSSLVPSLHITTLGQEQAILSGAVPASPSTGTADFPSILTFLQPTENHASP
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RTLPEIVASLTEGVETTLFLSSRSLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYT
.::. . .:: . . ..:.:. .. .:.: .: :. .
XP_005 SPVPEMPTLPAEGSDGSPP-ATRDLL-------LSSKVPNLLSTS------WTFPRWKKD
260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DVTTVLSQSLEETISPRTYPTVTASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFL
.::..:... : .. : : :: : . : : .:.:. : .::: :..
XP_005 SVTAILGKNEEANV---TIPL-------QAFPRKEVLSLHTVNGFVSDFSTGSVSS-PII
310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PSDSSKTSELHSNSALPG--PVDNTHILSP---VSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLM
. .:. : :. ::. .. :. . : :: .: .. ::
XP_005 TAP--RTNPLPSGPPLPSILSIQATQTVFPSLGFSSTKPEAYAAAVD-------------
360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSSV-VADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRS
:: : . .. ::.....:. ..:... ...: : ::..:
XP_005 ----HSGLPASASKQVRASPSSMDVYDSLTIGDMKKPATTDVFWSSLSAETG--SLSTES
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 MEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHGRLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPS-SVTTA
. :: . . ... ...::. . . : .: .: ... . . : . :::.
XP_005 I-ISGLQQQTNYDLNGHTISTTSWETHLAPTAPPNGLTSAADAIKSQDFKDTAGHSVTAE
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDPSVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKP
:: : ...: .:. .... .. : . .: :. ... : . . . ..:
XP_005 GFS-IQDLVLGTSIEQPVQQSDMTM------VGSHIDLWPTSNNNHSRDFQTAEVAYYSP
520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
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