FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1549, 1858 aa
1>>>pF1KA1549 1858 - 1858 aa - 1858 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6859+/-0.0012; mu= 0.3041+/- 0.072
mean_var=264.9369+/-56.069, 0's: 0 Z-trim(110.8): 32 B-trim: 280 in 2/49
Lambda= 0.078796
statistics sampled from 11864 (11887) to 11864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 6.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47723.2 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1934) 12059 1385.7 0
CCDS56513.1 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1950) 11622 1336.0 0
CCDS44565.2 KIAA1549L gene_id:25758|Hs108|chr11 (1849) 720 96.7 8.8e-19
>>CCDS47723.2 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1934 aa)
initn: 12059 init1: 12059 opt: 12059 Z-score: 7416.7 bits: 1385.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12059; 99.8% identity (99.8% similar) in 1858 aa overlap (1-1858:77-1934)
10 20 30
pF1KA1 MELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PGLWLLLLARPASCAPDELSPEQHNLSLYSMELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSSFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREAVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGPGLGYPTSSTEDLQPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QYGGPGWPSYGEDEAGRREAVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGPGLGYPTSSTEDLQPGH
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1840 1850
pF1KA1 SSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
1910 1920 1930
>>CCDS56513.1 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1950 aa)
initn: 12045 init1: 11609 opt: 11622 Z-score: 7148.1 bits: 1336.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12017; 98.9% identity (98.9% similar) in 1874 aa overlap (1-1858:77-1950)
10 20 30
pF1KA1 MELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PGLWLLLLARPASCAPDELSPEQHNLSLYSMELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSSFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1780 1790 1800 1810
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREA----------------VPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QYGGPGWPSYGEDEAGRREATHMLGHQEYSSSPLFQVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1820 1830 1840 1850
pF1KA1 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
1910 1920 1930 1940 1950
>>CCDS44565.2 KIAA1549L gene_id:25758|Hs108|chr11 (1849 aa)
initn: 792 init1: 201 opt: 720 Z-score: 450.6 bits: 96.7 E(32554): 8.8e-19
Smith-Waterman score: 1487; 27.7% identity (54.9% similar) in 1854 aa overlap (134-1857:154-1848)
110 120 130 140 150
pF1KA1 VSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESAS------HFHTFR
:. ...: :: :: .: :. :.
CCDS44 FQTAESGAIEMTSRKLASATANDSANPLHLSAAPENSRGPALSAEHTSSLVPSLHITTLG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SAFRTSEGIVP-TPGRNLVLYPT------DAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
. : :: .:. . . .:. . .: : .::. . .:: . . ..:
CCDS44 QEQAILSGAVPASPSTGTADFPSILTFLQPTENHASPSPVPEMPTLPAEGSDGSPP-ATR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
.:. .. .:.: .: :. . .::..:... : .. : :
CCDS44 DLL-------LSSKVPNLLSTS------WTFPRWKKDSVTAILGKNEEANV---TIPL--
250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPG--PVD
:: : . : : .:.:. : .::: :.. . .:. : :. ::. ..
CCDS44 -----QAFPRKEVLSLHTVNGFVSDFSTGSVSS-PIITAP--RTNPLPSGPPLPSILSIQ
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 NTHILSP---VSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSI
:. . : :: .: .. :: :: : . .. ::.
CCDS44 ATQTVFPSLGFSSTKPEAYAAAVD-----------------HSGLPASASKQVRASPSSM
340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 SLMSSV-VADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQ
....:. ..:... ...: : ::..:. :: . . ... ...::.
CCDS44 DVYDSLTIGDMKKPATTDVFWSSLSAETG--SLSTESI-ISGLQQQTNYDLNGHTISTTS
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VPPAHGRLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPS-SVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTP
. . : .: .: ... . . : . :::. :: : ...: .:. ....
CCDS44 WETHLAPTAPPNGLTSAADAIKSQDFKDTAGHSVTAEGFS-IQDLVLGTSIEQPVQQSDM
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 SLAVRDPSVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSIS
.. : . .: :. ... : . . . ..: . : : :.:
CCDS44 TM------VGSHIDLWPTSNNNHSRDFQTAEVAYYSPT-----TRHSVSHPQLQL-----
500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 SPSEAPASLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPS
:.. :: :.:.. .: .. :.. . : :..: .:..: :. : :. . .
CCDS44 -PNQ-PAH-PLLLTSPGPTSTGSLQEM-----LSDGTDT-GSEIS--SDIN---SSPERN
540 550 560 570 580
630 640 650 660 670
pF1KA1 SELPLNTIMLLPSRSEVSPWSS-FPSDSLEFVEAS------TVSLTDSEAHFTSAFIETT
. :...:. : .: : .: :: : . ..:: :.. ..:... :.: .:
CCDS44 ASTPFQNILGYHSAAESSISTSVFPRTSSRVLRASQHPKKWTADTVSSKVQPTAA-AAVT
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720
pF1KA1 SYLESSLISHESAVTALVPPGSESFDILTA-GIQATSPLTTVH--------TTPILTESS
.:..: : . .::: :. : . .: : .: .::. . : : ..
CCDS44 LFLRKS--SPPALSAALVAKGTSSSPLAVASGPAKSSSMTTLAKNVTNKAASGPKRTPGA
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LFSTLTPPDDQISALDGHV-SVLASFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTE
. ... . : ::. :. .... . :.. :.. .::: . : .: ::.
CCDS44 VHTAFPFTPTYMYARTGHTTSTHTAMQGNMDTASGLLSTTYLPRKPQ--AMHTGLPNPTN
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTTSTGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLR
: :.: :.: :: : :: : : : :: ::
CCDS44 L----------EMPR------------ASTPRPLTVT----AALTSITASVKATRLPPLR
770 780 790
850 860 870 880 890
pF1KA1 PVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYVCDITVPDAYLITTVL--ARRAVQ-----EY-IITAI
.. .. .... ...:.: . . . :. ::: ..: :: .. : ..
CCDS44 AENTDAVLPAASAAVVTTGKMASNLECQMSSKLLVKTVLFLTQRRVQISESLKFSIAKGL
800 810 820 830 840 850
900 910 920 930 940
pF1KA1 KEVLRIHFNR---AVELKVYELFTDFT--FLVTSGPFVYTAISVINVL-------INSKL
..:: :.. .... . : . : . .:.: .:: ::..: ... :
CCDS44 TQALRKAFHQNDVSAHVDILEYSHNVTVGYYATKGKLVYLPAVVIEMLGVYGVSNVTADL
860 870 880 890 900 910
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 VRDQTPLILSV----KPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQRIEKGLMTALFE
...:: . :: .: : . ::..:::::: . . :.:.: .:. :. :. .
CCDS44 -KQHTPHLQSVAVLASPWNPQPAGYFQLKTVLQFVSQADNIQSCKFAQTMEQRLQKAFQD
920 930 940 950 960 970
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 V-RKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGSEVSELLRNLSV
. :: . :::.::.. . .:. :: ....: . . ::::. .: :: .::.
CCDS44 AERKVLNTKSNLTIQIVSTSNASQAVT-------LVYVVGNQSTFLNGTVASSLLSQLSA
980 990 1000 1010 1020
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 VEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQ--LQNEVFQAEMERK
.::: :: : ::::..::.:..:. .. :: ::: :: .. :.:. : ::..
CCDS44 ELVGFYLTYPPLTIAEPLEYPNLDISETTRDYWVITVLQGVDNSLVGLHNQSFARVMEQR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 LAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQDGERLSAVK
::::. . . : ..:::. :. .::.:...:. : .:..: :.. .:. : ..
CCDS44 LAQLFMMSQQQGRRFKRATTL-GSYTVQMVKMQRVPGPKDPAELTYYTL-YNGKPLLGTA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 SSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVVIPVLVVMVI
.. ... .: :: :. : ... . :.:: :: : : ::::.:..:. :. :: ::
CCDS44 AAKILSTIDSQRMALTL-HHVVLLQADPV--VKNP-P----NNLWIIAAVLAPIAVVTVI
1150 1160 1170 1180 1190
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 VVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKDD--ILIIHE
..:. ::: .: ::.:::. :. :: : : :.:::.:::::::.. :. : . .:
CCDS44 IIIITAVLCRKNKNDFKPDTMINLPQRAK---P-VQGFDYAKQHLGQQGADEEVIPVTQE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 PAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPS-KNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSERDAGDK
. :: :..: .:.: :: . : : . :... : :::. :..:.::.. ..: .
CCDS44 TVVLPLPIRD--APQER-DVAQDGSTIKTAKSTETRKSRSPSENGSVISNESGKPSSGRR
1260 1270 1280 1290 1300
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 TPGAV-NDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKIQLIAM
.: : . . . .:.: .:. .: .:.. .... : . ...::::.
CCDS44 SPQNVMAQQKVTKEEARKRNVPASDEEE--GAVLFDNSSKVAAEPFDTSS--GSVQLIAI
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 QPIPAPPVQRPSPADRVAESNKI-NKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYEFPVV
.: : : : .:: ::. . : :.. ::..::.:::.:::.::.:::.:.:.::.:
CCDS44 KPTALPMV--PPTSDRSQESSAVLNGEVNKALKQKSDIEHYRNKLRLKAKRKGYYDFPAV
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 DDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQVNGC
. :.: : ::...:..: .....::: . . . : : .. ...: : :. .
CCDS44 ET-SKGLT-ERKKMYEKAPKEMEHVLDPDSELCAPFTESKNRQQMKNSVYRSRQSLNSPS
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA1 PADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPAD-----VQTPSSVELGRYPA
:...: : :.: . :: :..::.: ..:.. . : : . .: .
CCDS44 PGETEMDLLVTRERP---RR--GIRNSGY---DTEPEIIEETNIDRVPEPRGYSRSRQ-V
1490 1500 1510 1520 1530
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KA1 LPFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALV----APSSQPASTAGVGPGVPPGLPAN
.. . ::::.:.:: :: ::..::.:. : .:. . : . .: . ..
CCDS44 KGHSETSTLSSQPSIDEVRQQMHMLLEEAFSLASAGHAGQSRHQEAYGSAQHLPYSEVVT
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA1 STPSQEER-RA-TQWGSFYSPAQ---TANNPCSRYE---DYGMTPPTGPLPRPGFGP---
:.:. : :: .:: : : . . : :. .. : : :.: : ::
CCDS44 SAPGTMTRPRAGVQWVPTYRPEMYQYSLPRPAYRFSQLPEMVMGSPPPPVP-PRTGPVAV
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 -GLLQST----------ELVPPDPQQPQASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGS
.: .:: : . :.: : . :: .:: : . . . . .:.
CCDS44 ASLRRSTSDIGSKTRMAESTGPEPAQLHDSASFTQMSRGPVS----VTQLDQSALNYSGN
1660 1670 1680 1690 1700
1750 1760 1770 1780 1790
pF1KA1 QIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGSQYGGPGWPSY-GEDE-----------AGRREAV
. . . :.: : :: . :.: . .: :: ::.: : ::
CCDS44 TVPAVFAIPAANRPGFTGYFIP-TPPSSYRNQAWMSYAGENELPSQWADSVPLPGYIEAY
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1800 1810 1820 1830
pF1KA1 PRTSGREPSAPSGNLPHRGLQG----PGLGY-PTSSTEDLQ-------PGH------SSA
::. : :.. . ::.. : :.: :. :: : :. :.:
CCDS44 PRS--RYPQSSPSRLPRQYSQPANLHPSLEQAPAPSTAASQQSLAENDPSDAPLTNISTA
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1840 1850
pF1KA1 SLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
.:.::::::. .:..::. . .:.
CCDS44 ALVKAIREEVAKLAKKQTDMFEFQV
1830 1840
1858 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:24:48 2016 done: Wed Nov 2 21:24:50 2016
Total Scan time: 6.120 Total Display time: 0.440
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]