Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1520
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1520, 766 aa
1>>>pF1KA1520 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5429+/-0.00104; mu= 19.5294+/- 0.063
mean_var=75.1502+/-14.885, 0's: 0 Z-trim(104.6): 77 B-trim: 30 in 1/49
Lambda= 0.147948
statistics sampled from 7927 (8004) to 7927 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 4.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 4951 1066.8 0
CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 4398 948.7 0
CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 4393 947.6 0
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 2973 644.5 1.7e-184
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 1580 347.2 5.2e-95
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 1537 338.1 3.4e-92
CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 1491 328.2 2.6e-89
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 1380 304.5 3.9e-82
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 1250 276.7 7.7e-74
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 1222 270.8 5.4e-72
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 1222 270.8 5.5e-72
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 1082 241.1 8.6e-63
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 1075 239.4 1.5e-62
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 1075 239.6 2.3e-62
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 1075 239.6 2.4e-62
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 1075 239.6 2.4e-62
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 1067 237.9 8.1e-62
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 1050 234.2 9.6e-61
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 803 181.4 5.1e-45
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 754 170.9 6.3e-42
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 754 170.9 6.3e-42
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 754 170.9 6.6e-42
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 754 170.9 6.6e-42
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 613 141.0 1.4e-32
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 586 135.2 7e-31
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 584 134.8 9.9e-31
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 558 129.1 2.8e-29
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 549 127.3 1.7e-28
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 549 127.3 1.7e-28
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 543 126.1 4.3e-28
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 531 123.5 2.5e-27
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 524 122.0 7.2e-27
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 519 121.0 1.5e-26
CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 513 119.6 3.2e-26
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 470 110.5 1.9e-23
CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 464 109.2 5.2e-23
CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 464 109.2 5.2e-23
CCDS55091.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 131) 415 98.1 9.5e-21
CCDS55092.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 126) 410 97.0 1.9e-20
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 376 90.4 2.1e-17
CCDS76643.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 784) 303 74.7 6.5e-13
CCDS45061.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 859) 303 74.7 7e-13
CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17 (1642) 290 72.1 8.1e-12
CCDS13681.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 663) 281 69.9 1.5e-11
CCDS42938.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 666) 281 69.9 1.5e-11
CCDS42937.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 668) 281 69.9 1.5e-11
CCDS13683.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 677) 281 69.9 1.5e-11
CCDS13682.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 678) 281 69.9 1.5e-11
CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480) 285 71.0 1.6e-11
>>CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 (766 aa)
initn: 4951 init1: 4951 opt: 4951 Z-score: 5707.2 bits: 1066.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4951; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATLQKLLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATLQKLLSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 EFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KA1 QGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 QGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
730 740 750 760
>>CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 (681 aa)
initn: 4398 init1: 4398 opt: 4398 Z-score: 5070.0 bits: 948.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4398; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATLQKLLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATLQKLLSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQ
:::::::::::::::::::::
CCDS58 PPVLILDEATSALDAESEYLI
670 680
>>CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 (683 aa)
initn: 4393 init1: 4393 opt: 4393 Z-score: 5064.2 bits: 947.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4393; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATLQKLLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATLQKLLSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
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670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQ
::::::::::::::::::::
CCDS58 PPVLILDEATSALDAESEYLCAG
670 680
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAIYVFSHLDRSLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCL
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALF
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSS
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTL
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCME--------------------
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:::::::::::::::::
CCDS58 -------------------------------------------NVSFSLSPGKVTALVGP
470
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNI
480 490 500 510 520 530
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRN
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQ
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pF1KA1 QGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
660 670 680 690 700
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.:: . . . .. :. . : : :
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: : : .. ::. : : : ... : ::. . .:... .:
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. .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: . . . :..:. ..:
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:...:::..:: ::: :: ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:::
CCDS78 LFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDT
200 210 220 230 240 250
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pF1KA1 TMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRL
:..:. . : ::.::. :::.:. ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:. ....
CCDS78 TLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEV
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pF1KA1 SKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYV
.:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:. : . :.: .: .. :.
CCDS78 LREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERALYL
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pF1KA1 WGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGV
. : ::. .: : . . .:..:.:.:..:.::. .:. .... .:. ....:
CCDS78 LVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNV
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pF1KA1 GAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGK
::::::: ..::::.. :.::: :.: : :..:.:.: .:: ::....:.: ::.
CCDS78 GAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGE
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pF1KA1 VTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFA
:::::::.:::::. . .:.:.: ::.:::: :::: :.: ::: . :.::::::.
CCDS78 VTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVLFS
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pF1KA1 RSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAM
:. .::.::: . . :. ::: :.: ::.:.. : :..::::.::..:::::.:.
CCDS78 GSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAI
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pF1KA1 ARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQ-AIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVV
::::::.: ::::::::::::.. : .:. .:. .:::.:::::.::..:: :.:
CCDS78 ARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGD---RTVLVIAHRLQTVQRAHQILV
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pF1KA1 LDKGRVVQQGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
:..:..
CCDS78 LQEGKLQKLAQL
680
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10 20 30
pF1KA1 MRLWKAVVVTLAFMSVDICVTTAI-YVFSHLDR
: ..:. : .. . . ::. .:: :
CCDS47 RDRDGVRVPMASSRCPAPRGCRCLPGASLAWLGTVLLL--LADWVLLRTALPRIFSLLVP
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 SLLEDIRHFNIFDSVLDLWAACLYRSCLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLV-ITLVCL
. : .: .. :. ::. .: .: ::.: .:. : . .::. . .
CCDS47 TALPLLR---VWAVGLSRWAVLWLGACGVLRATVG-SKSENAGAQ----GWLAALKPLAA
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 FVGIYAMVKLLLFSEVRRPIRDPWFWALFVWTYI-SLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPG
.:. :. : :: : :. : : .. :: : .: . .. .
CCDS47 ALGL-ALPGLALFRE------------LISWGAPGSADSTRLLHW---GSHPTAFVVSYA
170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KA1 AATEAEGFP---GSGRPPPEQA-SGATLQKLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLP
:: : .. :: : :. :: ...::. .. : ......::: .:
CCDS47 AALPAAALWHKLGSLWVPGGQGGSGNPVRRLLGCLGSETRRLSLFLVLVVLSSLGEMAIP
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 YYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVCLLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLF
..::: : :. . : : :. .... .:.:.:. . ::.. ..... .:.. .:
CCDS47 FFTGRLTDWILQDGSADTFTRNLTLMSILTIASAVLEFVGDGIYNNTMGHVHSHLQGEVF
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 RSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSW
... ::: ::..:.::...::.: ::. .:: .:.:...:: :. .. .:. :
CCDS47 GAVLRQETEFFQQNQTGNIMSRVTEDTSTLSDSLSENLSLFLWYLVRGLCLLGIMLWGSV
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 QLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEE
.:..::.. .:..... . ::.:. : .:...::..:..: :..::: :::::::::
CCDS47 SLTMVTLITLPLLFLLPKKVGKWYQLLEVQVRESLAKSSQVAIEALSAMPTVRSFANEEG
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 EAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYVWGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLI
::. . .:::.. ::.:::.:: : .... ....:.::: ::.:: :: ..::::.
CCDS47 EAQKFREKLQEIKTLNQKEAVAYAVNSWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGAVSSGNLV
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450 460 470 480 490 500
pF1KA1 AFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDF
.:..:.. . . .: . :.: ....::..::.::..:: : .: :.: :::: :.:
CCDS47 TFVLYQMQFTQAVEVLLSIYPRVQKAVGSSEKIFEYLDRTPRCPPSGLLTPLHLEGLVQF
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510 520 530 540 550 560
pF1KA1 ENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLD
..:.:.: .:: . :::...:.: ::.:::::::.:::::. . .:.:.: ::..:::
CCDS47 QDVSFAYPNRPDVLVLQGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLD
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 GKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNISYGLPTVP-FEMVVEAAQKANAHGFI
:::. :.:.:::: .. :.::: .:.::. .::.::: : .: .. :: :..::.::
CCDS47 GKPLPQYEHRYLHRQVAAVGQEPQVFGRSLQENIAYGLTQKPTMEEITAAAVKSGAHSFI
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630 640 650 660 670 680
pF1KA1 MELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQAI
: .::.::. : :.::::::.: ::.::::.:.: :::::.:::::::.:. ..: .
CCDS47 SGLPQGYDTEVDEAGSQLSGGQRQAVALARALIRKPCVLILDDATSALDANSQLQVEQLL
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690 700 710 720 730 740
pF1KA1 HGNLQKHT--VLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQQGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQML
. . .... ::.:...:: ::.: :. :. : . . ::::::. . : : .::
CCDS47 YESPERYSRSVLLITQHLSLVEQADHILFLEGGAIREGGTHQQLMEKKGCYWAMVQAPAD
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750 760
pF1KA1 GLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
CCDS47 APE
>>CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 (653 aa)
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pF1KA1 CLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRP----IRDP
.:: . . . .. :. . : : :
CCDS47 WLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAP
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pF1KA1 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
: : : .. ::. : : : ... : ::. . .:... .:
CCDS47 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
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pF1KA1 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQ--FSTAVVI
. .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: .. ..: :..:. .
CCDS47 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVID--ILGGDFDPHAFASAIFF
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pF1KA1 VCLLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTS
.::...:::..:: ::: :: ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:
CCDS47 MCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSS
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pF1KA1 DTTMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYK
:::..:. . : ::.::. :::.:. ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:. ..
CCDS47 DTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQ
260 270 280 290 300 310
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pF1KA1 RLSKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMY
.. .:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:. : . :.: .: ..
CCDS47 EVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERAL
320 330 340 350 360 370
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pF1KA1 YVWGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQ
:. . : ::. .: : . . .:..:.:.:..:.::. .:. .... .:. ...
CCDS47 YLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLS
380 390 400 410 420 430
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pF1KA1 GVGAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSP
.:::::::: ..::::.. :.::: :.: : :..:.:.: .:: ::....:.: :
CCDS47 NVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRP
440 450 460 470 480 490
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pF1KA1 GKVTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVL
:.:::::::.:::::. . .:.:.: ::.:::: :::: :.: ::: . :.:::::
CCDS47 GEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVL
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pF1KA1 FARSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRV
:. :. .::.::: . . :. ::: :.: ::.:.. : :..::::.::..:::::.
CCDS47 FSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRL
560 570 580 590 600 610
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pF1KA1 AMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIV
:.::::::.: ::::::::::::.. :
CCDS47 AIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQAKTLWKFMIF
620 630 640 650
>>CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 (738 aa)
initn: 1336 init1: 552 opt: 1380 Z-score: 1588.1 bits: 304.5 E(32554): 3.9e-82
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120 130 140 150 160
pF1KA1 RDPWFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEA-----EGFPGS-GRPP
:: : :. :: . ::. ::
CCDS15 LLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPGGPAAAAWAGDEAWRRGPAAPPGDKGRLR
90 100 110 120 130 140
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pF1KA1 PEQASGATLQKLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQF
: :. .:::. . :. :.:: :: .... :.. :. :: : . ..: .
CCDS15 PAAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVD-Y
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 STAVVIVCLLAIGSSFAAG-----IRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDEN
: .. .:: .... : : :: .. :. :::. :: :.. ::..:::..
CCDS15 SDNLTRLCL-GLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKT
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RTGDLISRLTSDTTMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIM
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CCDS15 RTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVS
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350 360 370 380 390 400
pF1KA1 MVSNIYGKYYKRLSKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYK
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CCDS15 IIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQ
330 340 350 360 370 380
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pF1KA1 LNRKEAAAYMYYVWGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCME
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CCDS15 LARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIG
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KA1 SVGSVYSGLMQGVGAAEKVFEFIDRQPTM-VHDGS-LAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPH
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CCDS15 GLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPE
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pF1KA1 TQVLQNVSFSLSPGKVTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYL
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CCDS15 VPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWL
510 520 530 540 550 560
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pF1KA1 HRVISLVSQEPVLFARSITDNISYGL--PT-VPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTE
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CCDS15 RSKIGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTV
570 580 590 600 610 620
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pF1KA1 TGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVL
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CCDS15 VGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVL
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pF1KA1 IIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQQGTHQQLLAQ-GGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAG
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CCDS15 VIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
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760
pF1KA1 HNEPVANGSHKA
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CCDS64 NVQIPLLLGQLVEVVAKYTRDHV--GSFMTESQN-LSTHLLI--LYGVQGLLTFGYLV-L
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CCDS64 SCTQVAGCLVSLSMLSTRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARAMGVAD
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CCDS64 EALGNVRTVRAFAMEQREEERYGAELEAC-RCRAEELGRGIALFQGLSNIAFNCMVLGTL
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CCDS64 FIGGSLVAGQQLTGGDLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEYMALNPC
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CCDS64 IPLSGGCCVPKEQLRGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQSGGGKT
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pF1KA1 SCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLH-RVISLVSQEPVLFARSITDNISYGLP
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CCDS64 TVASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENIRFGKL
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pF1KA1 TVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRNPPVLI
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CCDS64 EASDEEVYTAAREANAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALIKQPTVLI
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pF1KA1 LDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQQGTHQ
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CCDS64 LDEATSALDAESERVVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRVWEAGTHE
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pF1KA1 QLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
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CCDS64 ELLKKGGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
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CCDS59 SAVRYSDGYRSSSLLRAVAHLRSQLWAHLPRAPLAPRWSPSAWCW----VGGALLGPMVL
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CCDS59 SK-HPHLCLV---ALCEAEEAPPASSTPHVVGSRFNWKLFWQFLHPHLLVLGVAVVLALG
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CCDS59 AALVNVQIPLLLGQLVE-VVAKYTRDHVGSFMTESQNLSTHLLILYGVQGLLTFGYLVLL
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pF1KA1 --IFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLVSQNINVFLRN
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CCDS59 SHVGERMAVDMRRALFSSLLRQDITFFDANKTGQLVSRLTTDVQEFKSSFKLVISQGLRS
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pF1KA1 TVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQNALARASNTAEE
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CCDS59 CTQVAGCLVSLSMLSTRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARAMGVADE
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CCDS59 ALGNVRTVRAFAMEQREEERYGAELEAC-RCRAEELGRGIALFQGLSNIAFNCMVLGTLF
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CCDS59 IGGSLVAGQQLTGGDLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEYMALNPCI
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pF1KA1 -VHDGSLAP-DHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGPSGSGKSS
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CCDS59 PLSGGCCVPKEQLRGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQSGGGKTT
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pF1KA1 CVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLH-RVISLVSQEPVLFARSITDNISYGLPT
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CCDS59 VASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENIRFGKLE
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CCDS59 DEATSALDAESERVVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRVWEAGTHEE
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pF1KA1 LLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
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CCDS59 LLKKGGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
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766 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 11:14:53 2016 done: Thu Nov 3 11:14:54 2016
Total Scan time: 4.030 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]