Result of FASTA (omim) for
pF1KA1448
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1448, 1153 aa
1>>>pF1KA1448 1153 - 1153 aa - 1153 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9078+/-0.000436; mu= 15.7436+/- 0.027
mean_var=128.0555+/-25.233, 0's: 0 Z-trim(113.9): 325 B-trim: 311 in 1/52
Lambda= 0.113338
statistics sampled from 23133 (23471) to 23133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 13.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_904325 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1153) 7595 1254.4 0
NP_055889 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1770) 4256 708.5 8.9e-203
NP_004312 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61425 (1690) 3615 603.7 3.1e-171
XP_005247084 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1698) 3615 603.7 3.1e-171
XP_016859879 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1699) 3615 603.7 3.1e-171
XP_006712668 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1782) 3615 603.7 3.2e-171
XP_005247081 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1791) 3615 603.7 3.2e-171
NP_001307634 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1699) 2258 381.8 1.9e-104
NP_001317218 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1708) 2258 381.8 1.9e-104
NP_001230937 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1791) 2258 381.8 2e-104
XP_016859880 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1799) 2258 381.8 2e-104
XP_011509666 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1800) 2258 381.8 2e-104
XP_005247079 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1800) 2258 381.8 2e-104
NP_001317219 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1724) 2225 376.4 8.1e-103
XP_016859877 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1732) 2225 376.4 8.2e-103
XP_016859876 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1733) 2225 376.4 8.2e-103
XP_016859875 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1816) 2225 376.5 8.5e-103
XP_016859874 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1824) 2225 376.5 8.5e-103
XP_016859873 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1825) 2225 376.5 8.5e-103
XP_016859872 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1825) 2225 376.5 8.5e-103
XP_005256481 (OMIM: 603060,611302) PREDICTED: kine (1103) 2109 357.3 2.9e-97
NP_006603 (OMIM: 603060,611302) kinesin-like prote (1103) 2109 357.3 2.9e-97
XP_011509669 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1465) 1785 304.4 3.3e-81
XP_011509668 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1465) 1785 304.4 3.3e-81
NP_001099038 (OMIM: 605433) kinesin-like protein K (1749) 1464 252.0 2.4e-65
NP_001099037 (OMIM: 605433) kinesin-like protein K (1757) 1464 252.0 2.4e-65
XP_016866681 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1762) 1464 252.0 2.4e-65
NP_001099036 (OMIM: 605433) kinesin-like protein K (1770) 1464 252.0 2.4e-65
XP_016866679 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1784) 1464 252.0 2.4e-65
XP_016866678 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1792) 1464 252.0 2.4e-65
XP_016866677 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1797) 1464 252.0 2.4e-65
NP_071396 (OMIM: 605433) kinesin-like protein KIF1 (1805) 1464 252.0 2.4e-65
XP_016868746 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1490) 1458 251.0 4.1e-65
XP_005273515 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1805) 1458 251.0 4.8e-65
NP_056069 (OMIM: 607350) kinesin-like protein KIF1 (1826) 1458 251.0 4.8e-65
XP_011542760 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1826) 1458 251.0 4.8e-65
XP_011542759 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1847) 1458 251.0 4.9e-65
XP_016866680 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1771) 1321 228.6 2.6e-58
XP_011542762 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1783) 1301 225.4 2.5e-57
XP_011542761 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1783) 1301 225.4 2.5e-57
XP_011542763 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1783) 1301 225.4 2.5e-57
XP_016858496 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1459) 1202 209.1 1.6e-52
XP_011508537 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1524) 1202 209.1 1.7e-52
XP_016858495 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1605) 1202 209.1 1.7e-52
XP_011508535 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1620) 1202 209.1 1.7e-52
XP_011508534 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1648) 1202 209.2 1.8e-52
XP_016858494 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1648) 1202 209.2 1.8e-52
XP_011508533 (OMIM: 611279,616258) PREDICTED: kine (1648) 1202 209.2 1.8e-52
NP_055690 (OMIM: 611279,616258) kinesin-like prote (1648) 1202 209.2 1.8e-52
XP_016866682 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1694) 1113 194.6 4.4e-48
>>NP_904325 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kinesin- (1153 aa)
initn: 7595 init1: 7595 opt: 7595 Z-score: 6714.8 bits: 1254.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7595; 100.0% identity (100.0% similar) in 1153 aa overlap (1-1153:1-1153)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 ADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAIVKMKELCAMYGKKDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 RRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAIVKMKELCAMYGKKDPN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDVMATGKGSTDVDDLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 ERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDVMATGKGSTDVDDLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSQEQKSPGSHKAKEPVGAGVSSTSENNVSKGDNGELAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 DEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSQEQKSPGSHKAKEPVGAGVSSTSENNVSKGDNGELAK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 EERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKNLQQQEITKQLRRQNVPHRFIPPENRKPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 EERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKNLQQQEITKQLRRQNVPHRFIPPENRKPRF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PFKSNPKHRNSWSPGTHIIITEDEVIELRIPKDDEARKGNKEESQEKGGKGAFKDPQFPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 PFKSNPKHRNSWSPGTHIIITEDEVIELRIPKDDEARKGNKEESQEKGGKGAFKDPQFPW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GSQGMRSQDHIQVSKQHINNQQQPPQLRWRSNSLNNGQPKSTRCQASASAESLNSHSGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 GSQGMRSQDHIQVSKQHINNQQQPPQLRWRSNSLNNGQPKSTRCQASASAESLNSHSGHP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 TADVQTFQAKRHIHQHRQSYCNYNTGGQLEGNAATSYQKQTDKPSHCSQFVTPPRMRRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_904 TADVQTFQAKRHIHQHRQSYCNYNTGGQLEGNAATSYQKQTDKPSHCSQFVTPPRMRRQF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KA1 SAPNLKAGRETTV
:::::::::::::
NP_904 SAPNLKAGRETTV
1150
>>NP_055889 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kinesin- (1770 aa)
initn: 4256 init1: 4256 opt: 4256 Z-score: 3761.5 bits: 708.5 E(85289): 8.9e-203
Smith-Waterman score: 4256; 99.7% identity (99.8% similar) in 663 aa overlap (1-663:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQR
.:
NP_055 YESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLL
670 680 690 700 710 720
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pF1KA1 SIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIRE
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>>NP_001307634 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,614255 (1699 aa)
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>>NP_001317218 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,614255 (1708 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
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NP_001 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
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NP_001 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
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NP_001 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
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pF1KA1 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSM--GS--LTS-----SPSSC--SLS
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pF1KA1 SQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALL
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NP_001 SRA--ASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALL
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pF1KA1 AEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDI
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NP_001 AEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDI
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pF1KA1 KKEKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]