Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1448
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1448, 1153 aa
1>>>pF1KA1448 1153 - 1153 aa - 1153 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8678+/-0.00107; mu= 15.8010+/- 0.065
mean_var=115.8013+/-22.802, 0's: 0 Z-trim(106.4): 88 B-trim: 127 in 1/51
Lambda= 0.119184
statistics sampled from 8895 (8983) to 8895 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 7595 1317.9 0
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 4256 743.9 7.7e-214
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 3615 633.7 1.1e-180
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 2258 400.4 2e-110
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 2109 374.6 7e-103
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 1464 263.8 2.5e-69
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 1464 263.8 2.5e-69
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 1464 263.8 2.5e-69
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 1464 263.8 2.6e-69
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 1458 262.8 5.3e-69
CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266) 1310 237.3 1.8e-61
CCDS13122.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1317) 1310 237.3 1.9e-61
CCDS56178.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1392) 1310 237.3 1.9e-61
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 1202 218.8 8.7e-56
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 939 173.3 1.8e-42
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 939 173.3 1.8e-42
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 939 173.3 1.8e-42
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 932 172.3 6.5e-42
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 918 169.9 3.4e-41
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 897 166.2 3.6e-40
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 897 166.2 3.6e-40
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 873 162.0 4.8e-39
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 845 157.3 2.2e-37
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 845 157.3 2.2e-37
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 845 157.3 2.3e-37
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 828 154.4 1.7e-36
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 780 146.1 4.2e-34
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 769 144.2 1.4e-33
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 746 140.2 2.4e-32
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 690 130.5 1.6e-29
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 690 130.6 1.6e-29
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 679 128.7 6.2e-29
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 686 130.2 6.4e-29
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 686 130.2 6.6e-29
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 675 128.1 1.4e-28
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 646 122.9 2.5e-27
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 646 122.9 2.7e-27
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 646 123.0 3e-27
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 646 123.0 3e-27
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 646 123.0 3e-27
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 639 121.7 5.8e-27
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 623 119.0 4.1e-26
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 623 119.0 4.4e-26
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 600 115.1 8.1e-25
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 590 113.4 2.6e-24
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 584 112.4 5.6e-24
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 551 106.6 2.4e-22
CCDS34430.1 KIFC1 gene_id:3833|Hs108|chr6 ( 673) 544 105.4 4.8e-22
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 498 97.5 1.1e-19
CCDS6801.1 KIF12 gene_id:113220|Hs108|chr9 ( 513) 476 93.6 1.3e-18
>>CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153 aa)
initn: 7595 init1: 7595 opt: 7595 Z-score: 7058.2 bits: 1317.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7595; 100.0% identity (100.0% similar) in 1153 aa overlap (1-1153:1-1153)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAIVKMKELCAMYGKKDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAIVKMKELCAMYGKKDPN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDVMATGKGSTDVDDLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDVMATGKGSTDVDDLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSQEQKSPGSHKAKEPVGAGVSSTSENNVSKGDNGELAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSQEQKSPGSHKAKEPVGAGVSSTSENNVSKGDNGELAK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 EERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKNLQQQEITKQLRRQNVPHRFIPPENRKPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKNLQQQEITKQLRRQNVPHRFIPPENRKPRF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PFKSNPKHRNSWSPGTHIIITEDEVIELRIPKDDEARKGNKEESQEKGGKGAFKDPQFPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PFKSNPKHRNSWSPGTHIIITEDEVIELRIPKDDEARKGNKEESQEKGGKGAFKDPQFPW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GSQGMRSQDHIQVSKQHINNQQQPPQLRWRSNSLNNGQPKSTRCQASASAESLNSHSGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSQGMRSQDHIQVSKQHINNQQQPPQLRWRSNSLNNGQPKSTRCQASASAESLNSHSGHP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 TADVQTFQAKRHIHQHRQSYCNYNTGGQLEGNAATSYQKQTDKPSHCSQFVTPPRMRRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TADVQTFQAKRHIHQHRQSYCNYNTGGQLEGNAATSYQKQTDKPSHCSQFVTPPRMRRQF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KA1 SAPNLKAGRETTV
:::::::::::::
CCDS11 SAPNLKAGRETTV
1150
>>CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770 aa)
initn: 4256 init1: 4256 opt: 4256 Z-score: 3952.6 bits: 743.9 E(32554): 7.7e-214
Smith-Waterman score: 4256; 99.7% identity (99.8% similar) in 663 aa overlap (1-663:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQR
.:
CCDS11 YESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLL
670 680 690 700 710 720
>>CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690 aa)
initn: 1975 init1: 1975 opt: 3615 Z-score: 3357.2 bits: 633.7 E(32554): 1.1e-180
Smith-Waterman score: 3615; 76.9% identity (89.9% similar) in 731 aa overlap (1-723:1-725)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
:.::::::::::::::::: :..:::::::.:..:.:.:::.:::.::::::::::::::
CCDS46 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
:::: .:::..:: :::.::: :::::::::::::::::::::::::::::..: ::::
CCDS46 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: .:::. :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
:::::::::.:: ::::.:::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::..:::
CCDS46 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV------SKKKKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::
CCDS46 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSC--SLSSQVGLTSVT
::::: ::.::::.:::::.::: ::::::: : . . . :::: .:::.. .::.
CCDS46 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDMTNALVGMSPSSSLSALSSRA--ASVS
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIRE
:..:::. .::.:::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::
CCDS46 SLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMRE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 DGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::::: :::
CCDS46 DGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVLSGHFIKE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 EHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPE
:::.:::. ...:..::::::: ..::::::.:..: :::::::::::.:::::::::
CCDS46 EHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 QARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADL
::: :::.:: ::::.:::::.:::::::::::::::::::.::::.: :..:.:::
CCDS46 QARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATY
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPI
:::::::: .: .. ... . . .. .:. : ...: ..: : . ..
CCDS46 LLEQQRLDYESKL--EALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAFRK--W
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 KMYQIPQRRRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAIVKMKELCA
: ::. . : :
CCDS46 KWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKD
720 730 740 750 760 770
>>CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
:.::::::::::::::::: :..:::::::.:..:.:.:::.:::.::::::::::::::
CCDS58 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
:::: .:::..:: :::.::: :::::::::::::::::::::::::::::..: ::::
CCDS58 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: .:::. :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
:::::::::.:: ::::.:::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::..:::
CCDS58 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV------SKKKKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::
CCDS58 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS58 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA1 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSM--GS--LTS-----SPSSC--SLS
::::: ::.::::.:::::.::: ::::::: ::. :. ::. :::: .::
CCDS58 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDTNTVPGGPKLTNALVGMSPSSSLSALS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALL
:.. .::.:..:::. .::.:::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS58 SRA--ASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALL
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 AEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDI
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.::::::
CCDS58 AEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDI
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530 540 550 560 570 580
pF1KA1 VLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKN
:::: ::::::.:::. ...:..::::::: ..::::::.:..: :::::::::::.
CCDS58 VLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKS
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 HVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILY
:::::::::::: :::.:: ::::.:::::.:::::::::::::::::::.::::.: :
CCDS58 HVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQY
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 KKEKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLP
..:.::: :::::::: .: .. ... . . .. .:. : ...: ..: :
CCDS58 RREREEATYLLEQQRLDYESKL--EALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELA
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 SSGKKREPIKMYQIPQRRRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALA
. .. : ::. . : :
CCDS58 LWAFRK--WKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPD
720 730 740 750 760 770
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
:.::::::::::::::.::::...::...::::.:::::::. :.:::::.:::::::::
CCDS11 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
: ::: ::::..:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::.:: .: ::.:
CCDS11 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: ....: . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
CCDS11 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
:::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::. ::. :.:..::
CCDS11 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
190 200 210 220 230 240
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pF1KA1 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::....::.:.:::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSDFIPY
250 260 270 280 290 300
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pF1KA1 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
:::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::.:::.:::::::
CCDS11 RDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KA1 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLG----DIIDTSMGSLTSS-PSSCSLSSQVGLTSVT---
.:.:::.:::.::..:: ::::. . . : ::. .. :. : . :. .: :
CCDS11 RLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHN
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KA1 -----SIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMG
:.. : : :::.:::.:.::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS11 GELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 VAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSG
::.::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::.: .:: :.:
CCDS11 VAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVD----MDIKLTG
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 AHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFR
:.:.::.::: . .:::.::::::: .::::::: :..:. :.:::::.::::::::
CCDS11 QFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFR
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 FNHPEQARAEREK--TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKK
:::::::: :::. : :::::::.:::.::::.::::.: :::::::..: :.:
CCDS11 FNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRK
600 610 620 630 640 650
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pF1KA1 EKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSS
:::::::::::::: ::::::::::::::::::.::.::::.:::. .:::::.::::::
CCDS11 EKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSS
660 670 680 690 700 710
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pF1KA1 GKKREPIKMYQIPQRRRLS-KDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAI
::.: : ..:::::::::. :: .:.:..:::.:::::::::::: ::::.: ::::::
CCDS11 GKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810
pF1KA1 VKMKELCAMYGKKD-PNERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDVMATGKGS------TDVD
.::.::: ::: : :. :.::::::::::::: :. ..: :: ..:.
CCDS11 LKMRELCRTYGKPDGPG--DAWRAVARDVWDTVG---EEEGGGAGSGGGSEEGARGAEVE
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 DLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMKDEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSQEQKSP--GSHKAK
::..::::: :::::: ::. ::.:...::..::.::.:.:: ..:... :
CCDS11 DLRAHIDKLTGILQEVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEVPWA
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 EPVG---AGVSSTSENNVS-KGDNGELAKEERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKN
: : : .. :. : . . :.. ::::.::. :::::::::::..:::.:...
CCDS11 PPEGSEAAEEAAPSDRMPSARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQG
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 LQQQEITKQ-LRRQNVPHRFIPPENRKPRFPFKSNPKHRNSWSPGTHIIITEDEVIELRI
:: . ::: : ::.::.. : ::::::::.::.:: ::
CCDS11 LQGSGGRGGGLRRP--PARFVPPHDCKLRFPFKSNPQHRESW-PGM--------------
960 970 980 990
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 PKDDEARKGNKEESQEKGGKGAFKDPQFPWGSQGMRSQDHIQVSKQHINNQQQPPQLRWR
:.: : : .:. . . ..::. : :
CCDS11 ------------------GSGEAPTPLQP----------PEEVTPHPATPARRPPSPR-R
1000 1010 1020
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 SNSLNNGQPKSTRCQASASAESLNSHSGHPTADVQTFQAKRHIHQHRQSYCNYNTGGQLE
:. .:. : . .....: .. :..: . : :: :.: .::
CCDS11 SH-----HPR--RNSLDGGGRSRGAGSAQP--EPQHFQPKKH-----NSY----------
1030 1040 1050 1060
1120 1130 1140 1150
pF1KA1 GNAATSYQKQTDKPSHCSQFVTPPRMRRQFSAPNLKAGRETTV
. : : . ..:::::::: :::.::
CCDS11 PQPPQPYPAQRPPGPRYPPYTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV
1070 1080 1090 1100
>>CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749 aa)
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Smith-Waterman score: 1851; 49.0% identity (71.0% similar) in 679 aa overlap (1-659:1-622)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSI-INPKNPKEA----PKSFSFDYS
:: ..:::::::::.: :: ..::...:.::.: . :.: :.. :: :.:::
CCDS47 MSDTKVKVAVRVRPMNRRELELNTKCVVEMEGNQTVLHPPPSNTKQGERKPPKVFAFDYC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 YWSHTSPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQ
.:: . .:.:. :.. .:. .: .::.:::.:::::::::.:::..:::. : :
CCDS47 FWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAFQGYNACIFAYGQTGSGKSFSMMGHAE--Q
70 80 90 100 110
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pF1KA1 AGIIPQLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPK-NKGNLRVREHPLL
:.::.:: ::..:. . :: ....::::::::: :.:::::.:: .. .:.:::: .:
CCDS47 LGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQSLKVREHKVL
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 GPYVEDLSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNET
::::. ::.:::::. :: .::. :::.:::::::::: ::::::::.:..:: .: ..
CCDS47 GPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIIITQTLYDLQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKK
. : :::::.::::::::::...::: : :::::.:::::::::: :::.::. . : :
CCDS47 GNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSLADQAAGKGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
. :.:::::::::::..::::::.:.:.:..::: ::.:::::::::::::.: .::.
CCDS47 SKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRAKRIVNHAVV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSI
:::::::..:::.::: .:.. :
CCDS47 NEDPNAKVIRELREEVEKLREQLS------------------------------------
360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDG
: . :..: : :.:.::::.: ::. :::::::::: : .::. : ::.... .:
CCDS47 QAEAMKAP---ELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSG
390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEH
.: .::::: :: ..: :.::.:: :::: :. ::: : : :. .:
CCDS47 IKVG----DDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDH-TRVG---ADTSQDIQLFGIGIQPQH
440 450 460 470 480 490
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pF1KA1 CIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQA
: . . ...:.: :: : : ... ::: : . .:: :.::. :.:: ::.: :..
CCDS47 C--EIDIASDGDV--TLTPKENARSCVNGTLVCSTTQLWHGDRILWGNNHFFRINLPKRK
500 510 520 530 540
600 610 620 630 640
pF1KA1 RA------EREKTP-------SAETPSEP-VDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEME
: :.: : ..:. ::: .. ::: :.. : .. .. ... .: .:
CCDS47 RRDWLKDFEKETGPPEHDLDAASEASSEPDYNYEFAQMEVIMKT-LNSNDPVQNVVQVLE
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 ILYKKEKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKC
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CCDS55 HCFWSMDESVKEKYAGQDIVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTAD-
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CCDS55 -QPGLIPRLCSGLFERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHS
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CCDS55 VLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDV
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CCDS55 KSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGK
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pF1KA1 QAR-AERE---KTPSA--ETPSEPVD----------------WTFAQRELLEKQGIDMKQ
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CCDS55 KKKKAEREDEDQDPSMKNENSSEQLDVDGDSSSEVSSEVNFNYEYAQMEVTMK-ALGSND
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CCDS55 PMQSILNSLEQQHEEEKRSA---LERQRLMYEHELEQLRRRLSPEKQNCRSMDRFSFHSP
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]