Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1411, 1515 aa
1>>>pF1KA1411 1515 - 1515 aa - 1515 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0858+/-0.00126; mu= 15.0422+/- 0.076
mean_var=101.4080+/-19.889, 0's: 0 Z-trim(103.0): 26 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.127361
statistics sampled from 7178 (7185) to 7178 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 5.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55028.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1515) 9896 1830.2 0
CCDS34481.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1302) 5854 1087.5 0
CCDS47448.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1319) 5854 1087.5 0
CCDS83104.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1095) 3853 719.8 1.2e-206
CCDS6375.2 FAM135B gene_id:51059|Hs108|chr8 (1406) 1716 327.1 2.3e-88
>>CCDS55028.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1515 aa)
initn: 9896 init1: 9896 opt: 9896 Z-score: 9822.4 bits: 1830.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9896; 100.0% identity (100.0% similar) in 1515 aa overlap (1-1515:1-1515)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 HYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 AIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYETEESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYETEESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSVVLVGYKCLKSTASNDLIKCFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSVVLVGYKCLKSTASNDLIKCFEG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 NPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIENVQPDQFDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIENVQPDQFDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 KCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 THPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 THPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 NSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 GNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 TGTAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGTAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 LGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 QDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 GINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 SADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 ISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 KKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 ALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEI
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510
pF1KA1 FLEKFFLVAALKYFQ
:::::::::::::::
CCDS55 FLEKFFLVAALKYFQ
1510
>>CCDS34481.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1302 aa)
initn: 7343 init1: 5854 opt: 5854 Z-score: 5809.6 bits: 1087.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7769; 82.8% identity (82.8% similar) in 1541 aa overlap (1-1515:1-1302)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPA
::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRG----------------------------------
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ---------KTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
140 150 160 170 180 190
250 260 270
pF1KA1 HYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLEL--------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELAKANMQLLYERLLRRKQLRTQKDNHL
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRIL
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIE
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 CSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTEDLDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYETEESSVAGLSS
:::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTE-----------------------------------
380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 PELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSLKGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNS
CCDS34 ------------------------------------------------------------
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 KDSVVLVGYKCLKSTASNDLIKCFEGNPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEAS
CCDS34 ------------------------------------------------------------
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 CLPTNTERTEQKSPDIENVQPDQFDPLNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNL
:::::::::::::::::::
CCDS34 -----------------------------------------GKLDISQDDSEITQMEHNL
410 420
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 ASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLP
430 440 450 460 470 480
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 NFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIK
490 500 510 520 530 540
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN
550 560 570 580 590 600
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNL
610 620 630 640 650 660
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 GTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDV
670 680 690 700 710 720
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 KSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDR
730 740 750 760 770 780
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 TMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDT
790 800 810 820 830 840
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 CAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINA
850 860 870 880 890 900
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 HYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKF
910 920 930 940 950 960
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVP
970 980 990 1000 1010 1020
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 YFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 DFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 LSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 KNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1480 1490 1500 1510
pF1KA1 VINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ
1270 1280 1290 1300
>>CCDS47448.1 FAM135A gene_id:57579|Hs108|chr6 (1319 aa)
initn: 8597 init1: 5854 opt: 5854 Z-score: 5809.5 bits: 1087.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8209; 87.1% identity (87.1% similar) in 1515 aa overlap (1-1515:1-1319)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTE-
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 THPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSI
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CCDS47 LGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQE
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pF1KA1 QDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRD
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CCDS47 QDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRD
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CCDS47 GINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPK
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pF1KA1 ISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS47 KKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKT
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CCDS47 ALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEI
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1510
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CCDS47 FLEKFFLVAALKYFQ
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CCDS83 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
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CCDS83 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
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CCDS83 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS83 QDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRD
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CCDS83 PQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGN
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pF1KA1 SADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSK
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CCDS83 SADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSK
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pF1KA1 ISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW
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CCDS83 KKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKT
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pF1KA1 ALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEI
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CCDS83 ALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEI
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pF1KA1 FLEKFFLVAALKYFQ
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CCDS83 FLEKFFLVAALKYFQ
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pF1KA1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPA
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CCDS63 MSEIQGTVEFSVELHKFYNVDLFQRGYYQIRVTLKVSSRIPHRLSASIAGQTESSSLHSA
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pF1KA1 SVHDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDG
:::: . :..:::::.:::: .::...:.:..:: ...:..: :..: :..::::::.
CCDS63 CVHDSTVHSRVFQILYRNEEVPINDAVVFRVHLLLGGERMEDALSEVDFQLKVDLHFTDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLI
. . :. . ..::::: ::: :. ::::.: ::::::::::.::::::.::::.::::
CCDS63 EQQLRDVAGAPMVSSRTLGLHFHPRNGLHHQVPVMFDYFHLSVISVTVHAALVALQQPLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRF
:: :: . .::....: .... : .::..::: .: : : .: .: ... ..::...
CCDS63 SFTRPGRGSWLGKGGPDTGQEQSIISLENLVFGAGYCKPTSSEGSFYITSENCMQHAHKW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 HYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELA
: :: :: :..::. .:... ..:: . ::: . :: :..:: :.. ..::...:
CCDS63 HRDLCLLLLHAYRGLRLHFLVIMRDIPELPHTELEALAVEETLSQLCSELQMLNNPEKIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREA
: :. .:: : : .:.:: :::...::: .. :.:::::::::::::::: .:: . :
CCDS63 EQISKDLAWLTSHMMTLWTQFLDTVTLHSQVTTYLTQEHHTLRVRRFSEAFFYMEHQKLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 AIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTED
....:: :.: :. :.:. . .:.:::: :: ..::: :.::.::::::.:
CCDS63 VLTFQENLIQTHSQLSLDIRNSEYLTSMPPLPAECLDIDGDWNTLPVIFEDRYVDC----
370 380 390 400 410
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pF1KA1 LDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYETEESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSL
: : .:: : . .... .: . .. . . :.. . : . ...
CCDS63 ---PATG-HNL-----SVYPNFDVPVTSPTIMNLKDKEDNCMVNSNLSFRED--LVLSTI
420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSVVLVGYKCLKSTASNDLIKCFEG
: .. .:.. .. . ... ..: . ..: : .. ... :. .:. :
CCDS63 KPSQMDSDEEVIRCPEPGENVATQNHMDM----CSESQVYISIGEFQNKAGVPEDECWTG
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 NPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIENVQPDQFDP
. : . : :. . : . :.. : . :. : . :: : .:.. .:
CCDS63 QTSDA---GTYPVA---DVDTS---RRSPGPEDGQAPVLT-YIDVKS---SNKNPSRAEP
530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIK
: . : .: .: ::: : . . : :. . .
CCDS63 LVAFN---------------AQHES------------RSSRDKYGLDRT---GLSKVVVG
570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEA
:... .:... :.. :: . : ......:: . . . .
CCDS63 GSHQNAISSDKTTLH-----EL--------STLG--KGIDQEGKMVLLSLKLTPSEPCDP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]